BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-324L17
Chromosome17 (Build37)
Map Location 94,168,367 - 94,381,285
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043746, LOC100043747, LOC100043748, LOC100043907, Adcyap1, LOC676157, LOC627503
Downstream geneLOC668885, LOC668886, Mettl4, 2700099C18Rik, LOC100043754, LOC668888, LOC100038868
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-324L17.bB6Ng01-324L17.g
ACCGA112971GA112972
length808850
definitionB6Ng01-324L17.b B6Ng01-324L17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(94,380,479 - 94,381,285)(94,168,367 - 94,169,217)
sequence
gaattctttatttcttgctcgtttcttaaatttccttgacttaacattcc
ttgagtagaaatgcctaattgttacagattttacccttaatttttgccac
agttagaaatctttactcaaatattaactgccaataccaaagtattatac
ggtgaacattaatgaggtgattgggtttatctgtccccatcacagtggaa
ttctgacaaaaaggataaattcagccagacatgcatatctctgtaatact
ccatctctttttgctgtaccttccatcatttatgttttaatgtagcacca
gatgcctctcttgtttcaaattctgggcctttgcactgcccagaatcaaa
cccatgatccaaagttcactttgtgtaaaatacattgtgtccagtattct
gttgtagttagagaaaatagacaacaacaaataactcctatacaggattt
gtgttttgggtattttattttgaattctgggctaatgatacttcactaga
gaagacaaagaggtctttaatccatctagagttcatttatgtatacaaga
tctattaggacatagtgttatatttctctgtggggaatggtcacattccc
agcaacttatagtcaacattatttacttccctatctattgaggtggctgt
catatgcttcatggaggctaacatatatttctgtcagttaatgatgttgt
attgctgtatttgcctacccctcctttggacgacatatcaagtttgaggt
tttgtttctctaggtttaagaaataggtttgttggtttggtttttttttg
gtttgttt

gaattccataaatctctaaattgcaagccatactgtaaatatagagggct
cattcatacccctgcagtccctgtggatgatgtctcagtatcagcgagtt
cctatatgctttaaaaacaaaattaacaaataaaactcttcttcttcata
aaccacaattttctggactcagctgtttcctgtcagtagaaatactagag
caagaaatcctgaaaacttaagtggaaattagtacagctctacattgtca
tggatacggaccacataaaaggatattacaataatttattcacatcctct
tagtgtttggcctttgtagaagtatctgtgcttatagtcacagagagtag
cttattaggtgtttgtctaagtaatgcttgcacagtaatgaacccataat
ccatttctagcactatgtagcatcctaagcataacttagagttaacaaaa
aaacttctatatatttctcccttaattctttaaatctaaaaccatttcag
gctaagtatgattaatggtaatgtgtataaagtttaaatatttttagttt
gacaaaattaacctttctgtttaggataacttttattctttaaacctaaa
actatttcaggctaagtatgattaacattaatgtgtataaagtttaaata
tttttagtttgacaaaatttaacctttttgtttaggataacttttattta
tatcagcccaacatttattacatttacattagatggattcagtggtttat
gtaaactaaaactaaatcatagatttcaaaaggagattgactgggagaca
ggatgggtggtgggcaaataggattatgatggagatatatacatttgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr17_94380479_94381285
seq2: B6Ng01-324L17.b_45_852 (reverse)

seq1  AAACAAACC-AAAAAAAACCAAACCAACAAACCTATTTCTTAAACCTAGA  49
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAACCAAAAAAAAACCAAACCAACAAACCTATTTCTTAAACCTAGA  50

seq1  GAAACAAAACCTCAAACTTGATATGTCGTCCAAAGGAGGGGTAGGCAAAT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAAAACCTCAAACTTGATATGTCGTCCAAAGGAGGGGTAGGCAAAT  100

seq1  ACAGCAATACAACATCATTAACTGACAGAAATATATGTTAGCCTCCATGA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAATACAACATCATTAACTGACAGAAATATATGTTAGCCTCCATGA  150

seq1  AGCATATGACAGCCACCTCAATAGATAGGGAAGTAAATAATGTTGACTAT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATATGACAGCCACCTCAATAGATAGGGAAGTAAATAATGTTGACTAT  200

seq1  AAGTTGCTGGGAATGTGACCATTCCCCACAGAGAAATATAACACTATGTC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGCTGGGAATGTGACCATTCCCCACAGAGAAATATAACACTATGTC  250

seq1  CTAATAGATCTTGTATACATAAATGAACTCTAGATGGATTAAAGACCTCT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAGATCTTGTATACATAAATGAACTCTAGATGGATTAAAGACCTCT  300

seq1  TTGTCTTCTCTAGTGAAGTATCATTAGCCCAGAATTCAAAATAAAATACC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTTCTCTAGTGAAGTATCATTAGCCCAGAATTCAAAATAAAATACC  350

seq1  CAAAACACAAATCCTGTATAGGAGTTATTTGTTGTTGTCTATTTTCTCTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACACAAATCCTGTATAGGAGTTATTTGTTGTTGTCTATTTTCTCTA  400

seq1  ACTACAACAGAATACTGGACACAATGTATTTTACACAAAGTGAACTTTGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACAACAGAATACTGGACACAATGTATTTTACACAAAGTGAACTTTGG  450

seq1  ATCATGGGTTTGATTCTGGGCAGTGCAAAGGCCCAGAATTTGAAACAAGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGGGTTTGATTCTGGGCAGTGCAAAGGCCCAGAATTTGAAACAAGA  500

seq1  GAGGCATCTGGTGCTACATTAAAACATAAATGATGGAAGGTACAGCAAAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCATCTGGTGCTACATTAAAACATAAATGATGGAAGGTACAGCAAAA  550

seq1  AGAGATGGAGTATTACAGAGATATGCATGTCTGGCTGAATTTATCCTTTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGGAGTATTACAGAGATATGCATGTCTGGCTGAATTTATCCTTTT  600

seq1  TGTCAGAATTCCACTGTGATGGGGACAGATAAACCCAATCACCTCATTAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGAATTCCACTGTGATGGGGACAGATAAACCCAATCACCTCATTAA  650

seq1  TGTTCACCGTATAATACTTTGGTATTGGCAGTTAATATTTGAGTAAAGAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCACCGTATAATACTTTGGTATTGGCAGTTAATATTTGAGTAAAGAT  700

seq1  TTCTAACTGTGGCAAAAATTAAGGGTAAAATCTGTAACAATTAGGCATTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAACTGTGGCAAAAATTAAGGGTAAAATCTGTAACAATTAGGCATTT  750

seq1  CTACTCAAGGAATGTTAAGTCAAGGAAATTTAAGAAACGAGCAAGAAATA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTCAAGGAATGTTAAGTCAAGGAAATTTAAGAAACGAGCAAGAAATA  800

seq1  AAGAATTC  807
      ||||||||
seq2  AAGAATTC  808


seq1: chr17_94168367_94169217
seq2: B6Ng01-324L17.g_67_916

seq1  GAATTCCATAAATCTCTAAATTGCAAGCCATACTGTAAATATAGAGGGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATAAATCTCTAAATTGCAAGCCATACTGTAAATATAGAGGGCT  50

seq1  CATTCATACCCCTGCAGTCCCTGTGGATGATGTCTCAGTATCAGCGAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCATACCCCTGCAGTCCCTGTGGATGATGTCTCAGTATCAGCGAGTT  100

seq1  CCTATATGCTTTAAAAACAAAATTAACAAATAAAACTCTTCTTCTTCATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATATGCTTTAAAAACAAAATTAACAAATAAAACTCTTCTTCTTCATA  150

seq1  AACCACAATTTTCTGGACTCAGCTGTTTCCTGTCAGTAGAAATACTAGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACAATTTTCTGGACTCAGCTGTTTCCTGTCAGTAGAAATACTAGAG  200

seq1  CAAGAAATCCTGAAAACTTAAGTGGAAATTAGTACAGCTCTACATTGTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAAATCCTGAAAACTTAAGTGGAAATTAGTACAGCTCTACATTGTCA  250

seq1  TGGATACGGACCACATAAAAGGATATTACAATAATTTATTCACATCCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATACGGACCACATAAAAGGATATTACAATAATTTATTCACATCCTCT  300

seq1  TAGTGTTTGGCCTTTGTAGAAGTATCTGTGCTTATAGTCACAGAGAGTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGTTTGGCCTTTGTAGAAGTATCTGTGCTTATAGTCACAGAGAGTAG  350

seq1  CTTATTAGGTGTTTGTCTAAGTAATGCTTGCACAGTAATGAACCCATAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTAGGTGTTTGTCTAAGTAATGCTTGCACAGTAATGAACCCATAAT  400

seq1  CCATTTCTAGCACTATGTAGCATCCTAAGCATAACTTAGAGTTAACAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTCTAGCACTATGTAGCATCCTAAGCATAACTTAGAGTTAACAAAA  450

seq1  AAACTTCTATATATTTCTCCCTTAATTCTTTAAATCTAAAACCATTTCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTCTATATATTTCTCCCTTAATTCTTTAAATCTAAAACCATTTCAG  500

seq1  GCTAAGTATGATTAATGGTAATGTGTATAAAGTTTAAATATTTTTAGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAGTATGATTAATGGTAATGTGTATAAAGTTTAAATATTTTTAGTTT  550

seq1  GACAAAATTAACCTTTCTGTTTAGGATAACTTTTATTCTTTAAACCTAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAAATTAACCTTTCTGTTTAGGATAACTTTTATTCTTTAAACCTAAA  600

seq1  ACTATTTCAGGCTAAGTATGATTAACATTAATGTGTATAAAGTTTAAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTTCAGGCTAAGTATGATTAACATTAATGTGTATAAAGTTTAAATA  650

seq1  TTTTTAGTTTGACAAAATTTAACCTTTTTGTTTAGGATAACTTTTATTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAGTTTGACAAAATTTAACCTTTTTGTTTAGGATAACTTTTATTTA  700

seq1  TATCAGCCCAACATTTATTACATTTACATTAGATGGATTCAGTGGTTTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAGCCCAACATTTATTACATTTACATTAGATGGATTCAGTGGTTTAT  750

seq1  GTAAACTAAAACTAAATCATAGATTTCAAAAGGAGATTGACTGGGAGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACTAAAACTAAATCATAGATTTCAAAAGGAGATTGACTGGGAGACA  800

seq1  GGATGGGTGGTGGGCAAATAGGATTATGATGGAGATATATACATTGTGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGATGGGTGGTGGGCAAATAGGATTATGATGGAGATATATACATT-TGTG  849

seq1  T  851
      |
seq2  T  850


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |