seq1: chr17_70943033_70944043
seq2: B6Ng01-331M07.b_50_1068
seq1 GAATTCAGAGACTTGGATTTTCAGAAAATTATATAATATGAGGGCAATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCAGAGACTTGGATTTTCAGAAAATTATATAATATGAGGGCAATGG 50
seq1 TTCTATCAGAGAATTTTATAGAGCGATGTTATGCTGGGAAACTGGGTAGT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCTATCAGAGAATTTTATAGAGCGATGTTATGCTGGGAAACTGGGTAGT 100
seq1 ATATATCACAATTCTTAATATGCATGTTTGAATCTGGATTCCATACATAT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATATATCACAATTCTTAATATGCATGTTTGAATCTGGATTCCATACATAT 150
seq1 TACAGTTTGTAAGACCTTAAAAGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TACAGTTTGTAAGACCTTAAAAGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGG 200
seq1 GGGGAAAAATATGAGTATAAGTGTTTACAGTTGTGCTATTTGGAGAAAAA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGGGAAAAATATGAGTATAAGTGTTTACAGTTGTGCTATTTGGAGAAAAA 250
seq1 CAATTTTTTCTCCAAAGGAAACAAAAGTAAAACTCACTTTTTTTTTTTTG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAATTTTTTCTCCAAAGGAAACAAAAGTAAAACTCACTTTTTTTTTTTTG 300
seq1 AGACAAGGTCTCACTATGTTGCCCTAGCTGGCCTGATGCAAACTGTATAG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGACAAGGTCTCACTATGTTGCCCTAGCTGGCCTGATGCAAACTGTATAG 350
seq1 TCCAGGCTAGCCCTGAGATCCACCTGCCTCTGCCTCCTGAATGCTAGGAT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCAGGCTAGCCCTGAGATCCACCTGCCTCTGCCTCCTGAATGCTAGGAT 400
seq1 TAAAGGCATTGCTACCACACCCAGCCCAAACACTGATTATTTCAAAAAGA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAAAGGCATTGCTACCACACCCAGCCCAAACACTGATTATTTCAAAAAGA 450
seq1 CCTGTCTTTTATATATTTTTCTAGAGGGTAAATCAGAGCCCTGGAATATA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTGTCTTTTATATATTTTTCTAGAGGGTAAATCAGAGCCCTGGAATATA 500
seq1 GATCTATTTGTGTCTAAAGGATATGTTTGAGGTAATTAGTGTTTTTAAAG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GATCTATTTGTGTCTAAAGGATATGTTTGAGGTAATTAGTGTTTTTAAAG 550
seq1 TACTCTCTTTATGAAATGCATGTGACTAATACTATTTATGCACTTGAATT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TACTCTCTTTATGAAATGCATGTGACTAATACTATTTATGCACTTGAATT 600
seq1 AGGTTACAGAGTGAAATATTAAGAGGCAAATGAAAGAGAAAAGGACAAAG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGTTACAGAGTGAAATATTAAGAGGCAAATGAAAGAGAAAAGGACAAAG 650
seq1 CAGTTAGGTTAAAAATACAAATCAGATTACTGATCAAAAACATTGAAGAG 700
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGTTAGGTTAAATATACAAATCAGATTACTGATCAAAAACATTGAAGAG 700
seq1 CAGCTGCCTGATCTGTAACAAGAATCATTTAAAATAGTGGAGGACATAAA 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGCTGCCTGATCTGTAACAAGAATCATTTAAAATAGTGGAGGACATAAA 750
seq1 ATCTGGACAGGAAAATCTACTCTTGGATCCCTTTCAAGGGGCCATATGGT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATCTGGACAGGAAAATCTACTCTTGGATCCCTTTCAAGGGGCCATATGGT 800
seq1 ATGGTTCTGAAACCTTTTAAATTGAACATTAACAATTATATATTAGTTTC 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGGTTCTGAAACCTTTTAAATTGAACATTAACAATTATATATTAGTTTC 850
seq1 CTAAGCCACAGAGGGAAGCCATTCTCTCTCACCT-CCCATCCCGTGTTC- 898
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2 CTAAGCCACAGAGGGAAGCCATTCTCTCTCACCTCCCCATCCCGTGTTCT 900
seq1 TCTC-TCTCTCTCTGCTTTGTGTGTTTGCTGATCTCAGA-GCTATC-TTC 945
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||
seq2 TCTCTTCTCTCTCTGCTTTGTGTG-TTGCTGATCTCAGAGGCTATCTTTC 949
seq1 ACAACCTTAACACAAAC-AACTAGTCCATTGCTTCCTATCACAGGGA--G 992
||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||
seq2 ACAACCTTAACACAAACAAACTAGTCCATTGCTCCTTATCACAGGGAAGT 999
seq1 TTAGAGGTGT-GGGGCTGCA 1011
|||||||||| |||||||||
seq2 TTAGAGGTGTGGGGGCTGCA 1019
| seq1: chr17_71099995_71100063
seq2: B6Ng01-331M07.g_76_145 (reverse)
seq1 CCCCCCCCCCACACACACACACACACTTTTAATCTGCTGACTACACCCTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCCCCCCCCACACACACACACACACTTTTAATCTGCTGACTACACCCTC 50
seq1 CTCTGCAGGGT-TGTTTTTG 69
||||||| ||| ||||||||
seq2 CTCTGCAAGGTGTGTTTTTG 70
|