BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-056A04.T7 (MSMg01no056_a04.b1) | MSMg01-056A04.TJ (MSMg01no056_a04.g1) |
ACC | AG283525 | AG283526 |
length | 718 | 727 |
length of high quality (start - end) | 253 (59 - 311) | 231 (132 - 362) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no056_a04.b1 PHD_FILE: MSMg01no056_a04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:57:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no056_a04.g1 PHD_FILE: MSMg01no056_a04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:57:33 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCACTGTTTT
TCCTAACTATGGAATTAGAAGTAACTCATCGTCTCTTACTGTCTTCAGGC
GTCTCTAGACATTCATGTCATCAGAGTCAGCAGCTGTGTAGCTGCTGTTT
CCTGACAGTATGCTGGGACTCCGAGTGAAGACAGGGCTAGAAAGAAAAAG
AATGTTGTATGCTGAGATTGTATCTCTGTCCTTTTGTCAATTGCATATGT
TTCTGTGTTGTATCATTGCATGTATTACTTTGTTACCCACATACACAGTG
AGATGATTCTTCGGGTAGCAGGTTAGCAGACTCCTCCATCTCAGCTTATC
CATTGTCTCCGCAGCCTTTGGTGGGCATCTCTTCTCCCAGACTGCCCTGT
TCCATGAAGCCCCCAGAGCATTAAGTGACTTGAGCCACACCCTGAGGAGG
ATAGATAGATCTTGGATTCTTTTTGAAGGGCTGGTGTTTTTCACTGATAA
GCACTAAATTTCTCCTCAGAGAAATGAGGTCCTATCGGCTAACTCCGTAC
AGCCTTGGCCCCTAAAACTGGATGTCTACCCCCTGGTGCTCTCCCATGGT
CAAGTCTCCATTGAAAAAACCACCTCTCATAATAATGTCTTGCACAGGGC
TTTCTTCTTGCATACTCTCTGGTCCTATGGCCTCCTCTTCCGTCTGAGGT
TAATCCCCATAATTCCTC
| CGATGACACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTGCACGCTCTAACTTTTTACAC
GGGCCATCTCTGGGGCTGGCGGCTCCCTTAGTGAGCGAGAGCCCTTGCTG
CACAAGCATGAGGACCTGAGAACAAATTCCCGGCATCAGGTAAAATGCTG
GGTATGGCCACATAGGCCTCTAACCCAGCATTGCATGGTGGTGGTGGGGG
GCACAGATGGATGATAAACATTGTGGGCAGAGATGGATGATAAACATTGT
GAGGCCTCTGGCCGCACAGCCTATTCAAAACAGTGAGCTTCTGCTTTGGT
GACAGACCCTGCCTCATGGCACTCACCCACAGAGCAAGAGAGAGGACACC
AATGTTCTCCTCTGGCCTCTGCATGCACATTCATGGGAGCACAGCCCACG
CCCACCCCATCATGCACACACACACAATCTTGCACTAACAGGTTAGAGCT
CAATCTCCCTCCTCCAGGAAATCAGCAGGGTTCTCATAACTGAGAGTATG
GGTCTCTACCCCACCTGCAGTTCCCCCCTTACTGTTCATGGAAATGTCTT
TCAAACCTCACACCTAGCAATCTCCCCCCCAAAAATCAAGGGGCTCCTGA
CCTGTGTTTAGTACAAAGTGAAAATACCCCACGCTCTTCTATTAAACCCT
CCACTAGCGCCTCCACCTTTAAAAATT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 15 17 9 6 8 8 25 22 39 28 24 24 19 27 21 21 10 10 8 8 8 8 19 24 20 20 17 20 17 25 30 59 57 53 53 47 33 33 33 33 33 30 47 23 23 12 12
12 12 9 9 10 10 10 16 20 28 28 30 37 37 32 37 28 28 28 31 37 39 39 37 39 39 32 32 39 39 48 48 48 57 57 57 59 57 48 46 46 43 43 42 43 42 54 48 47 47
47 37 37 32 36 24 19 11 11 11 11 11 16 23 27 44 47 57 47 47 42 42 37 37 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 47 47 43 42 43 35 35 35 43 43 50 50 48 48 57 48
48 54 52 50 57 43 52 52 52 52 57 46 47 52 52 36 36 35 36 36 50 37 37 43 50 52 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 43 43 29 31 31 43 43 52 52 52 52 52 52 52
47 50 42 37 32 35 32 33 35 43 43 52 43 43 32 32 32 43 43 29 29 32 43 43 43 43 43 33 35 43 43 50 48 44 40 29 29 29 36 36 42 42 43 44 57 57 57 57 48 44
44 43 43 43 42 42 44 44 47 47 47 48 57 47 48 48 48 48 57 57 54 54 54 54 57 57 57 54 54 48 59 48 43 39 42 39 43 39 43 43 48 43 43 40 40 36 36 36 39 43
40 39 37 37 37 37 37 30 28 28 21 12 12 11 11 12 12 13 20 28 28 35 37 37 35 35 25 25 18 18 30 32 43 48 48 48 48 43 43 39 31 31 31 28 30 28 23 23 11 11
11 11 18 23 18 18 12 12 12 18 16 15 12 12 12 27 27 47 47 37 30 26 13 13 13 13 16 24 28 30 30 39 37 32 22 19 15 19 12 15 15 30 30 43 43 43 46 46 43 59
37 37 28 28 28 30 32 30 30 21 26 21 18 16 11 11 11 15 15 24 28 26 14 14 15 18 25 28 37 39 36 28 25 25 29 25 21 16 13 17 13 13 16 18 12 12 9 9 11 16
12 12 11 12 11 12 13 15 15 24 24 19 27 24 16 19 25 32 42 31 31 25 28 24 24 12 11 11 10 10 20 22 10 10 10 15 13 13 13 15 15 17 18 23 26 21 18 15 13 10
11 11 12 12 16 18 15 15 19 18 25 30 28 28 19 14 9 9 9 9 17 13 13 13 13 18 11 11 11 12 12 18 18 12 12 12 11 9 9 10 10 11 15 17 13 10 10 10 10 10
11 13 13 15 15 19 17 20 19 19 19 13 12 11 11 11 16 19 19 13 13 11 11 11 11 15 13 12 15 14 14 17 12 12 11 10 9 9 8 8 8 8 8 8 12 10 10 8 9 9
9 9 12 11 12 12 22 11 11 11 8 11 6 6 8 8 8 11 18 18 18 11 13 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 10 6 7 8 8 11 13 11
12 12 15 15 15 10 19 11 11 12 10 10 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 9 12 10 10 10 10 13 10 10 10 9 9 9 9 12 9 8 8 8 8 10 8 11 11 11
11 12 12 13 13 12 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 6 | Open.Hide. 8 8 8 8 10 9 10 9 9 9 15 18 25 28 32 32 31 41 39 39 39 40 40 39 43 39 41 41 41 34 21 15 10 10 10 9 10 10 10 10 10 10 21 17 28 20 28 34 37 33
33 33 28 28 33 34 34 39 25 15 11 9 9 10 9 10 9 9 9 9 10 16 19 22 25 22 22 24 23 32 39 39 47 39 47 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 48 42 37 34 34
37 40 33 33 37 28 36 36 48 48 43 47 43 43 39 47 32 34 25 16 10 8 8 8 8 8 15 25 27 19 13 13 21 28 37 48 48 48 48 47 47 43 48 48 48 48 48 48 48 48
48 48 48 48 48 42 42 43 42 43 42 36 36 39 42 41 30 32 31 28 29 42 42 54 54 48 57 48 48 54 46 57 44 43 43 42 42 32 42 42 43 43 57 57 54 54 54 54 48 48
48 48 48 48 57 57 54 47 46 43 43 43 43 43 43 43 39 39 43 43 43 43 43 48 36 37 30 30 32 37 40 43 43 43 43 43 39 37 39 35 35 32 33 30 30 32 37 34 39 36
20 18 9 9 9 17 18 34 33 35 30 35 35 43 39 40 43 43 43 43 39 39 35 35 35 35 35 35 42 37 35 35 35 39 39 43 59 57 57 54 54 57 57 57 57 48 32 32 19 19
19 32 35 57 48 57 43 43 43 43 43 44 47 47 48 47 47 47 47 39 32 24 12 8 8 8 9 10 21 23 28 28 35 35 35 42 39 46 47 59 47 47 43 43 41 37 30 28 28 20
20 32 32 37 37 37 37 34 34 28 21 13 12 12 12 12 12 12 14 13 18 8 8 6 6 8 8 10 11 11 11 11 12 24 24 36 34 39 35 37 35 35 35 39 30 34 25 23 23 34
31 36 36 39 47 35 43 39 43 43 43 40 42 42 37 43 43 48 48 54 54 47 42 32 30 30 24 19 14 14 14 24 25 30 21 14 14 18 21 24 30 36 36 22 22 17 22 19 36 36
43 42 42 33 33 28 28 28 28 28 28 31 27 43 32 32 15 15 13 24 21 21 13 13 12 15 26 38 50 50 50 43 43 22 19 19 19 19 23 28 24 14 15 15 12 12 13 21 21 27
27 17 17 21 29 32 42 32 31 10 10 8 8 8 8 10 15 16 16 25 10 10 10 10 13 16 31 20 16 10 10 9 9 9 23 12 14 14 24 24 23 23 14 9 8 8 8 8 12 19
19 20 17 19 26 31 23 19 12 9 9 12 12 22 21 32 24 19 17 9 9 9 9 9 13 21 22 19 22 16 10 10 13 10 10 10 10 10 13 10 10 10 16 15 23 23 23 18 26 15
15 10 10 9 12 19 10 9 9 10 8 8 8 10 14 10 10 10 10 10 12 14 28 29 34 34 26 26 20 18 18 21 21 18 10 10 10 10 10 11 10 9 8 10 10 10 12 16 12 13
11 10 11 19 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 10 10 10 11 10 19 10 10 10 11 11 10 8 8 13 8 8 8 10 9 9 9 12 11 16 11 8
8 8 8 8 11 8 8 6 6 6 8 6 6 7 13 10 19 15 23 12 11 11 11 10 10 9 9 |