BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-066E14.T7 (MSMg01no066_e14.b1) | MSMg01-066E14.TJ (MSMg01no066_e14.g1) |
ACC | AG291294 | AG291295 |
length | 724 | 1,791 |
length of high quality (start - end) | 316 (40 - 355) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no066_e14.b1 PHD_FILE: MSMg01no066_e14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:12:01 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no066_e14.g1 PHD_FILE: MSMg01no066_e14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:12:02 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCGAAAGGATCCGCGGAATTC
AGGGCTCTTGCGCATCCCCGTTCCAGTGCCTGGAAGTGGCAGGGAGTTTT
CTCCCCAGAGACTCCCTGTGGGTGGTCATTAACTGGTGGGATCTTGGCTG
TTTGGCAAGGGCTCACTCACCATAAAGAACACCCCTAAGGTGGGTGCAGA
AAGTATTGTGGGCATCTATTTAGATGGATCCAAGGCAATAGAATGGTCAA
GAAAGCCCACATGCTCCACCCTGTCTTGACCTGCTGAAGGTACCACTCAG
GCATCAGGGCTGGGTGCTTGCTCTCTGTTGCCCCTTATAGCAGCTGGCAT
CCTGATGGCACTCAGCAAATGTTTGTTGAGTGACTTTGTGCCCATATAGA
TACTGGATGCTATTTCACCAACCCCCTGACCACTCCTAACCTGGCTCCTG
GTCTGATCTGCAGTCTTTTACTGAGCACCTACTATGTGCTGGCACAAGCT
CCAACTCCAGAGTGATCAAATCAGTTTATGATCTGTCCTCTTGCCTGAGA
GCTGCCCACAGGCCTTGCCTTTTTGTCTCAGTCTTCAACCCCATGCTCCT
GATCATGGATCCATGCTTGGCCAATTGGACGCTTGAACAAGCTGAATATT
GTGTTGTCTCATTTCTGCTATAGGTTCTGCCTTGCCCATTATTTTCCCTC
CCCGTATTTAGTGACGAATCCTTG
| TCACCGCCTTTTTTTTCTTTANTCTCTATCNTTCTCTCGTCTTNNNTTCT
CATCGCGTTTGTGCGTTGCGCCTCCTCTCCGCGCTTAGTCTGTCGTCTTN
GTGGTCCGCTGCCCGCGGTGACTGTGTGTGGCGGTNCGTACGCGTCGCTA
NCATTTATTATCTTCGCTTCATTCACATCGGCGTTTGTATTNCTCTTCAT
CCCGCGCTGCGTTATCCAAGGTGTAAATCTTCCGTCCGGTAGCTGCGCGT
TCTGTATATGTGTGATACGGCTGTATGTTTGCGCGCGACCCGCTGTGCTT
TCTCGTCCGGCCGCGTCGCGAGTCGTGATATAGTAGTACCCACCGGCGCA
CGTCGACACATATAGCCGTACATCTATCGCGAGATACTATTGAGAGTACT
GTATCGTATCTCGACTGCAGCGTGTTGTCGCGCGGCGCGTATGTGCGGCG
CGCGCTATANTTGTCACTATATTTACTTTCTCTCGGTCTGCCTGTATATA
TCGTCGTGCTCGTATATATNATAANCACGGACCAGCGTAGGTATACTAAC
GTAAACATCATCTATTTATCGCGCGATAATATTGCTGCTTATATGCGCGA
CATTANTATGGCGCGCGACTATTTGATTGCTACGCGCGCGCGCGCGCTGA
TATTAACTATGTGATAATGTGTAGACGCGTCGGCATAGATATCACTCGCG
ACATTATCGCGTGCGGCGTGTGTTGTGTGACGGCGCGTGTACTATAATTN
CGCTATTGCTAGTGCGATCTCGGTGGATATACGTGCGGTTCTGCAGTATA
TNCATGCTGCTTTCTATGCGCCGTNATATTCGACGCGCATATATAATACC
GGTTGAGTGCTCTAAACTANACGGGAATTATGTGCATCATACGAGTTCAT
CGTGCCAATCACCGCGGATGTGCAGTAGATATATATCGCACACTTGTGTG
TCAATCAGCGTGTGCGAGTATAATATCGGCTGTGCACGGGATATATGCGG
TCGAGTTGCCGGTATTAATATCGGCGTTGATCCCGGATCACGCGAGTGAT
TGACTATATTACTGTGTGTTGATAGAGAGCATACGACGTTGTATACGACG
CCGCGACTTATCAGCTATTAGCCCGCGATCGTATATTAACGCGTACGCAT
TAGTAGATGTGCTAGTACGGTATGTGTCCCATGTAATGTACTTGGTATGT
GCGCCGCTATTCGCGTGGTGGCGTGCATGTCTATGNCGTATAAGCGCAAC
ATTGGTACTCGCACGTGTATTACGCCCTCCGCGCGCGCATCGAGACTTGT
GTGTCGTGTAACATCACGAGCGTCTACGTGATCAGGTCTTGATGTATGCG
GCGGCGGCGTGTATATTATCGCGCACGATTCGTTCGTCCACCGCACACGT
ATTAGACACATATATATGTGTAGGATTGCGGGCGCGTGCGACGTACGGCG
CGGTGTGGTTTTATATAGCTCTACGTGGGCGAGACGGAGTCATATTACGT
GGTGCGTTCTTGAATACGAGTTATGACATATTGTATAATTATTCTGGTCG
GCGTCAGTGACTATATATTGCACGCCGCGCGTAATAATTCATGTGNCGAT
AATATNCGGTTCATCGGTGATCACATTATTACAGTTCATGACGGNGNACA
TTATATATGAGCATACAGACGNTACCTGTCACACATATTATTGTGATAGA
GAGCTCAGATANCATGCGCGTGAGTCGTCATGAGTGATACTGGCGGGACG
AGATGGCGCACGACGGNCTGTTATATCTATGATGGTACGCG
|
quality values | Open.Hide.41 44 59 59 47 37 37 32 31 31 28 30 30 30 33 33 33 33 43 48 30 28 26 25 22 19 25 15 17 21 11 10 10 12 10 9 10 10 15 15 22 28 32 37 36 36 36 36 36 36
42 47 47 41 41 23 25 23 16 13 10 10 10 23 28 43 46 47 47 59 57 42 42 47 50 48 48 59 59 47 59 41 37 37 43 44 57 54 54 54 34 32 19 19 19 32 35 57 59 59
68 59 59 50 50 48 36 36 22 29 28 40 44 57 57 57 59 54 43 43 33 33 33 43 43 47 47 57 57 57 68 68 57 57 57 57 52 43 37 37 37 50 40 42 43 32 33 44 43 52
52 57 57 59 59 57 43 43 43 37 37 57 57 57 52 52 57 52 52 57 52 52 52 52 44 43 33 33 28 28 28 33 39 42 43 43 44 44 42 39 35 35 35 43 43 43 43 35 35 39
43 43 45 52 57 52 52 43 43 35 27 43 26 43 43 62 62 62 57 38 38 14 14 14 38 26 39 39 43 43 35 35 35 43 43 45 45 43 43 52 52 52 57 57 57 57 39 39 43 43
57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 52 57 57 57 57 57 59 52 52 50 50 50 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 43 57 57 27 38 13 12 12 24 24
37 37 37 39 43 35 35 32 41 20 26 24 13 24 24 11 18 18 36 27 28 33 36 44 44 57 42 42 37 42 42 43 47 44 57 48 43 43 41 36 28 25 25 25 28 25 28 28 37 37
43 43 28 27 12 12 11 12 12 15 23 28 28 17 17 17 19 19 20 31 31 34 43 30 30 25 28 22 18 12 12 12 25 28 39 26 23 10 10 10 10 12 28 28 37 32 25 15 12 12
24 24 24 32 32 32 32 31 23 25 31 32 32 23 20 20 20 19 23 24 23 25 22 33 32 37 24 27 15 15 13 19 19 28 37 39 39 39 43 37 28 21 14 14 18 21 33 37 37 23
23 23 32 32 30 32 32 39 32 31 24 26 15 28 24 27 23 30 30 39 39 27 30 14 14 14 28 28 43 43 43 43 41 41 41 31 18 13 8 7 7 8 9 12 21 20 13 11 11 11
11 20 12 14 14 21 21 17 19 16 23 15 10 11 12 22 18 20 20 20 21 22 17 22 19 19 19 23 28 28 28 34 24 15 10 10 10 10 16 16 25 28 24 24 30 22 21 11 11 11
11 11 15 11 6 6 6 8 8 8 12 23 19 19 19 15 15 14 14 18 9 9 9 22 19 22 11 11 8 8 8 8 8 15 10 9 9 10 9 11 13 11 13 13 12 9 11 10 10 12
21 17 13 11 10 10 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 9 16 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 12 11 11 10 9 9 9 9 9 9 11 10 10
12 12 15 10 10 10 17 22 12 12 9 11 13 16 17 16 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 9 9 10 8 8 8 8 11 8 12 12 6 8 7 6 8 8 17 16 15 14 14 10
9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 8 8 8 7 7 7 12 10 19 11 11 | Open.Hide. 6 6 6 8 8 6 6 10 7 9 9 9 9 7 11 8 8 8 8 13 3 0 3 6 6 6 7 8 10 3 0 3 9 9 14 12 8 8 6 6 6 6 3 0 0 0 3 9 6 6
6 6 6 6 6 6 6 8 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 9 9 14 13 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 3 0
3 6 8 6 6 6 7 6 8 9 9 8 8 8 8 8 8 10 9 10 8 6 6 8 10 6 6 6 8 12 8 7 6 6 3 0 3 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 11 3
0 3 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 11 10 9 8 7 6 7 6 6 6 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 3 0 3 6 8 7 8 8 8 8
10 10 11 10 10 9 10 9 10 8 8 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 10 8 10 9 15 17 13 8 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 6 6 8 8 12 9 9 9 6 6 6 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 6 6 6 6 8 10 12 10 7 6 6 6 8 6 8
8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 7 6 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 10 8 6 8 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8
8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 6 6 6 6 6 6 8 10 11 10 10 10 10 9 10 10 10 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 9 10 8 9 11 7 9 9 12 10 10 10 10 10 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 11 11 13 13 12 6 8 6 6 6 8 11 10 10 15 12
8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 6 7 7 7 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 6 7 10 8 10 9 9 9 9 12 13
13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 7 8 3 0 3 13 10 8 8 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6
6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 6 6 6 6 9 11 10 14 14 13 13 7 7 7 7 8 8 6 7 8 8 8 8 10 8 8 8 6
6 7 9 10 3 0 3 8 6 7 8 8 8 8 8 11 8 11 8 6 6 6 10 8 8 8 10 10 9 9 9 11 11 13 9 9 9 8 8 6 6 6 8 8 9 9 7 7 7 7
8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 11 10 10 8 8 6 6 10 8 11 8 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 8 13 16 11 11 11 8 8 8 8 8 8
8 10 8 8 11 11 11 10 10 10 10 10 9 9 10 12 10 10 8 10 8 7 6 8 8 6 6 6 7 6 6 8 6 11 7 8 6 6 8 8 6 6 8 7 6 8 6 6 3 0
3 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 6 8 8 8 8 8 10 10 13 12 11 8 8 8 6 11 10 6 8 6 7 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 19 10
3 0 3 8 8 6 6 8 7 7 6 6 6 6 6 7 9 13 10 10 9 8 8 3 0 3 10 17 10 6 8 6 6 8 7 11 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6
6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 9 9 9 9 9 13 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6
8 6 9 9 10 7 8 8 8 8 9 12 12 10 9 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 10 10 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 6 7 6 6 6 6 6 6 6 8 8
11 8 10 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 10 11 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 8 7 7 8 8 8 6 6 6 6 6 8 9 9 9 10 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 7 7 7 8 8 10 12 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 8 6
9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 8 8 6 6 6 6 8 6 7 7 9 9 9 10 8 8 11 15 12 8 6 6 6 6 6 6 7 10 11 13 8 8 8 8 8
8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 6 8 6 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 9 9 12 10 10 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8
8 9 9 10 10 10 10 13 13 9 11 9 6 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 7 7 7 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 13 15
18 9 6 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 8 10 10 8 6 6 6 8 8 6 6
6 6 6 8 8 8 8 10 20 25 10 10 8 6 6 6 6 8 12 12 15 10 10 9 9 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8
8 8 11 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 14 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 6 6
11 6 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 6 6 6 6 10 6 9 8 12 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6
8 8 8 14 11 8 8 8 8 10 18 19 22 17 13 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8
8 8 10 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 8 9
9 9 8 8 8 8 8 7 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 11 11 6 6 6 6 6 6 6 8 6 10 9 9 9 8 8
8 8 6 6 6 6 7 10 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 9 9 6 10 7 7 7 6 8 10 13 15 3 0 3 6 8 8
8 8 8 8 3 0 3 6 8 8 10 9 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 7 8 9 10 12 12 10 11 9 9 6 6 6 6 6 6 10 8 8 6 6 3 0 3 0 3 6 6
6 7 7 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 10 8 8 8 9 9 9 3 0 3 6 8 8 6 6 8 10 7 9 12 10 11 8 8 6 7 6 6 6 6 8 6 6 6 8 10 9
9 9 8 8 8 8 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 10 8 8 8 6 8 9 9 10 10 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 9 9 10 8 6 6 6 6 6 7
7 10 12 9 9 9 15 18 15 10 10 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 |