| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-088D07.T7 (MSMg01no088_d07.b1) | MSMg01-088D07.TJ (MSMg01no088_d07.g1) |
|---|
| ACC | AG307025 | AG307026 |
|---|
| length | 706 | 690 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 464 (122 - 585) | 495 (106 - 600) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no088_d07.b1 PHD_FILE: MSMg01no088_d07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:40:36 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no088_d07.g1 PHD_FILE: MSMg01no088_d07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:40:36 2005 |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (28,152,449 - 28,152,912) | (28,275,622 - 28,276,116) |
|---|
| sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCTGTTAGGGGCATAGATGGCGGCATCCTTATCTCAGGAAGGAAGTTCCC
ATGAGTTCATCATATGACCAGGATTCTAAGACAAAAGAAGGGGTTCAGAA
TTGCTAAGGAAGAGAGTCAGCAGCCGGCCTGCGGTCGTTGGTCGGGTGTA
AAGGAAGTCCGGTGGTGAGCACTCATGTGAGGCCCTACCACAGGGAACTT
GCCTCTTGTGGCTTACATGCGTCCATGCAGGACCTGGCACATCTCACATG
CACGCCCAGGAACATGGTGTGCCTTACGTGCATCCTTCCAGGGCCCGGTG
CATCTTATCTACATCCACTGGGACATGATATATTTTGCATACACATCCCA
AGGAGGCTGACCCTGGGTTACAAATAGTTCACCACAGCCAGGTGCAGAAC
TCTGAGATCTAGAGACTGCAGTCATCCTCTGGGCCTGGAGTTTGTAGGTC
TACACACAGTAGGAGATTCTTAGGGACCAGAGATGATGTCCTCAGACAAG
TTTAACTGGCACTGTTAAATTGGTGGGGGTGGGGGCGGGAACAAACCTTT
TCTTATACAACTCCAGGAGAGCAATTCATGCAGCTCGAGTTGGCTTCCTT
AGGAATCGGCAGCACAGGGCTTTCTACTCCCCTGGGGTCTCTAACAGTTC
AGGTCA
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXAGAGATCCTCCTGCCTCTGCCTCTGCACCCTGCTGCAGCCTTCTC
CCTATGGGTTCTGTAGAAGAACTGGGTCCTCACCTGACCATTGGCGGCGG
CGTCTCCTCAGCCCTCAGCCCCGTTACATACATGACCTCTGCCCTGCTTT
ATTTTCTCCTCTGACCAGAGACATAACAGCCTCCCAGGGTTCACAGCGGG
AAACACCTGGCACACTCAGGCATCCGATAGAGGTCATGGTTACCACCTCC
AGCACCCGGGCAGGAACAAAGGGCCCCAGTGTTGGATGGTTGAGCAGTCT
AGCAGTGCCTGGGACGAATCGGCCCGGGGTCAGGCTAGGCTTTGATGTTT
GGGGTACTGGCAAGGTCACTTGGGCTAGTGTCTTTCCACCCCTAACAGGT
CCCTGTCTGTCACACATTCCTACCGAGAAGGTTCCAAAAATTCCATGCAT
TCCAGTGCACAGCCTTAATCTGTGGCCTTCCATTTTACAGAGAACGCAGA
ACAGCGGAAGGAGCTTACCTGACCCTCCTGCCCTGCATCCTTGTGCCCCA
GACCCCACCTTAGGAAGATGCAGATACCAGGACTCAAATTAGAGCCACTA
CTCACTGAGGGCAGCTTACATGGCAACCCTCTACCGAACA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 8 6 9 9 9 23 30 25 20 18 21 16 17 17 10 9 9 19 22 33 33 28 23 10 12 12 26 23 33 29 29 33 40 47 57 57 42 42 23 30 30 42 35 57 68 47 47 47 42
42 41 41 41 41 41 50 50 47 47 54 57 50 51 50 50 47 50 48 54 54 68 68 57 57 48 57 57 57 57 57 57 40 40 33 32 33 37 57 57 57 57 42 42 37 37 32 36 48 48
48 48 48 48 48 39 40 37 37 19 13 8 8 8 8 15 23 21 11 11 10 17 22 37 37 37 41 48 48 36 36 36 50 36 36 59 57 57 57 59 57 50 47 48 48 48 47 48 48 48
48 50 48 54 48 57 57 59 57 57 57 57 57 53 53 53 48 48 48 54 57 47 57 43 43 44 57 43 43 57 44 44 57 57 48 48 48 48 48 48 57 48 47 47 47 35 35 42 47 57
57 68 57 59 57 57 57 50 47 50 46 50 50 54 57 57 57 57 57 57 52 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 57 57 52 57 52 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 68 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 68 68 68 68 59 59 52 59 57 43 43 43
44 44 52 44 44 43 43 31 29 19 26 12 15 36 38 32 35 27 28 18 14 14 14 16 24 32 50 50 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 57 59 59 59 59 59
54 54 57 44 57 48 48 48 57 57 57 57 44 44 35 35 42 36 36 42 35 35 42 39 57 44 43 43 37 43 39 43 41 43 43 43 43 46 43 47 47 48 48 46 46 43 43 43 57 57
54 54 43 43 35 35 35 40 43 43 47 39 37 39 39 48 48 43 47 59 59 48 37 37 31 34 34 41 37 28 20 14 26 26 37 39 41 41 46 48 59 59 59 48 46 43 43 39 37 32
32 28 20 20 23 24 37 37 39 42 42 42 42 33 33 39 42 42 43 37 40 36 43 43 43 40 43 43 43 24 23 12 12 23 25 28 37 37 39 35 39 32 28 23 28 21 14 14 26 30
39 39 37 26 26 27 27 23 31 43 41 39 39 41 41 50 41 39 37 37 30 20 19 18 15 12 22 22 28 23 33 28 22 21 15 15 16 11 11 10 11 9 9 9 9 25 26 39 23 29
16 12 12 25 25 17 19 12 10 10 12 11 15 11 13 13 20 10 15 15 25 23 28 19 16 11 10 10 9 9 9 10 13 13 18 19 17 22 22 17 17 16 15 15 15 23 21 24 25 30
22 18 18 15 15 19 18 15 11 10 10 10 10 10 13 23 31 33 39 32 32 26 26 19 18 18 18 18 13 13 11 11 11 11 11 14 10 10 14 9 11 10 13 12 8 8 8 8 8 8
8 8 17 11 11 11 | Open.Hide.24 25 30 30 30 30 25 27 39 37 25 19 8 8 8 8 11 22 25 11 12 12 22 21 36 35 35 30 21 21 10 10 12 26 21 33 25 21 10 10 11 11 11 18 19 28 26 37 36 33
33 36 36 35 35 28 28 28 37 37 43 48 48 57 57 57 57 48 48 48 57 48 48 48 57 57 57 43 39 39 44 44 47 39 47 47 41 43 37 33 33 25 21 11 9 9 9 9 9 13
14 11 11 9 16 18 20 28 37 33 33 33 28 36 36 50 57 57 57 43 43 39 43 43 44 43 43 39 37 37 36 36 36 36 43 57 41 41 42 42 42 47 47 43 43 43 47 47 48 48
48 48 48 48 57 57 57 50 50 48 48 47 47 57 57 57 57 57 48 57 57 57 48 57 57 57 57 68 57 57 57 39 39 46 57 57 57 57 57 57 54 57 57 50 50 43 57 59 57 57
68 68 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 57 59 57 52 57 57 57 57 57 57 50 57 57
57 57 57 57 57 54 50 57 43 57 57 57 47 46 57 57 57 54 57 57 57 57 48 57 54 54 57 57 54 54 54 59 59 48 48 48 47 47 57 57 57 57 46 47 43 37 37 36 25 23
23 28 28 35 39 39 41 41 41 47 47 47 47 47 48 48 47 57 57 48 57 43 47 40 40 43 43 43 35 35 35 59 59 47 36 32 32 24 18 17 17 25 18 21 18 24 23 24 31 28
23 25 23 28 28 30 30 37 37 37 37 35 40 40 57 57 57 57 48 43 39 42 35 35 37 34 31 35 35 39 47 48 59 57 57 48 47 46 43 43 37 44 37 41 35 35 35 42 42 32
27 15 14 14 15 27 27 28 23 32 32 46 42 42 35 33 33 33 33 42 41 41 43 43 57 57 57 44 44 43 43 43 57 59 57 57 50 50 39 43 43 50 42 47 41 44 39 42 35 47
42 47 43 47 42 35 35 42 42 42 57 57 48 54 54 54 57 59 57 57 57 48 48 48 57 57 57 54 48 48 48 47 46 46 43 48 48 48 48 48 48 42 42 42 43 39 39 32 31 31
31 33 28 30 28 30 30 30 39 37 34 32 25 25 31 34 37 37 36 33 37 37 34 28 25 25 28 37 39 39 39 37 36 35 27 29 28 25 23 34 34 37 31 25 31 19 19 11 12 12
18 28 35 35 35 32 32 24 24 28 34 32 39 39 41 39 32 29 29 24 24 22 22 20 28 35 32 31 37 34 25 25 31 34 28 37 32 28 23 28 28 34 28 30 30 29 29 25 21 10
10 10 16 15 14 12 12 12 14 16 21 16 14 25 29 22 24 25 21 21 15 9 8 8 8 10 9 13 14 14 14 14 24 24 37 20 20 12 19 10 8 11 10 14 11 12 12 23 19 19
21 25 23 27 30 29 29 20 18 15 15 21 15 13 14 13 24 21 25 18 25 14 20 23 23 23 12 12 16 13 13 12 12 10 16 13 10 10 10 10 |
|---|
