BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-106I14.T7 (MSMg01no106_i14.b1) | MSMg01-106I14.TJ (MSMg01no106_i14.g1) |
ACC | AG320596 | AG320597 |
length | 1,281 | 1,288 |
length of high quality (start - end) | 568 (79 - 646) | 648 (91 - 738) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_i14.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_i14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_i14.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_i14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:07 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTGGTTATCATTCGCGCTAAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CTCTGCTTAGCTCTATTTCCATTATTTATAGGGTTATTTGGTTCTCTAAT
TTCTTGACCCTTTTTGTATTTGTTGATATTAGCCCTCTATTGGATGTGAG
ACTGGTAAAGATCTTCTCCCTAACTGTTGGTTGCTGTCTTGTCCTATTGA
CAGTGTCCTTTGCCTTATAGAAGCTTTGCAATTTTATGAGGTCCTTTTGT
CAATTCTTGATCTTAGAGCATAAGCCATTGGTGTTTTGTACAGGAAATTT
TCCCCTTTCCCCATGTGTTCAAGGCTGTTCCCCAATTTCTCTTCTATTAG
TTTCAGTGTATCTGATTTTATGTGGAGGTCCTTGATCCACCTGGACATGA
TTTTCATACAGGGAGATAAGATTGGGTCAATTTGCATTCATCTATATGTT
GACTTCCAGTTGAACCAGCACCATTTGTTGAAAATGCTGTCTTTTTTCCA
CTGGTTTAGCTCCTTTGCCAAAGATCAAGTGATCATAAGTGTGTGGGTTA
ATTTCTGGGTTTTCAATTCTATTCCATTGACATACCTGCCTGTTACTGTA
CCAAAATCATGCAGTTTTTATCACTATTGCTCTGTAGTACAGCTTGAGAT
CAGGGATGGTGATTCCCTCAGAAATTCTTTTATTGTTGAGAATAGTTTTC
CCTATCCACCTTTTTCTGTTATTCCAGATGAATTTGCAAATTGCTCTTTC
TCACTCTATGAATAATAGAGTTGGAATTTTGATGGGGATTGCACTGAATC
TGTTGATTGCTTTCACCAGAATATCCATTTTGACTTATTTAATCCTGTTA
TCCCACCTACCATGTGAAATGTTTCCATCTTCTGAATTCTTCTTTCATTT
CTTTCTTCCAAAATTTGAATTTCTGTCCTACAATTCTTTTACTTACTTAA
ATCCCCGTCATCATATTGGTTATTATTTTGTGTACCCTTGGTAAGTATGT
TGTTCCCTCAATTTTCTTTTCACATTTGTTTTTACCTTTTAATTTAAGAT
AAGCCCACGTGTCTTATTTGCAATAAATTTTATTTTTTCGGCCTCTTTTG
TCTATATTCTTCTTATTCCTTTTCTAATCTCCCCTCTGGTTATATTCTTG
CTGTTTCTCATTATGGTCCTATTTCAACTCCTTCCCTCTTTGTGTGAAAT
TTTTTATCCTTCTCTTGTATAAATTTCTATCATTTTCTCTCTCTTCTGTT
TTCGTCTATCTTCCATCAATATATATCCTTA
| NCCCAATAATTTTTNNAAGCATGGAGNCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTATTTCTAAAAAGCTA
CAATTTGCCAGAACACACAGGACCCTGCTTCCCACCCAGTGTTATGACTT
ACGTAATTCCCAAGCTCCTCAATGGCCCATTTTTCTGCCTAACAAAATGA
CAAGCACTTTGCAAGTAAGCACATCTATACTTATTTGATGTGGCCCATGC
TTCTTTGTTTCTTTGTCTCCTGGTGGAAATGTTGTGAGATGTTCAATGCA
AAAGCCTGCCAATTTGGCCATTTGAGAAAGCTCCTAGACAACTAGGCATA
CTCTGTTGATCCACCTGCATATTAAGTAAGCCCTGACCAGAAACTGTCAA
AGCATCATCTAATCCCTGCTCCTTGATGAACATGGGCCATCTTATTGGTC
ACGACCCCAAAATATATGAGATACAATTTAATAATGCCACTTTGTTAATC
CTTTGCTTAATATATTTTGAACAAATTCCCTGTTGTAAAAGCAGTGTGTA
ACTGGCATCAGGACTTGAGGTGACCCAACCGCTGGTGGAAACAGCTGCAA
CTTTGCTCTCATGCTAAATGACCTAAGCGGCTTGCATTTCTTAAAGCTTT
CCATTTGGATTTGGGGGAATAACTTTATATTATTGTGAGATTTACCCAGA
ACTAAAAGAAATGATGTGTTAAGTTTAGTATCTGCTAATTAACAAATTAC
TTGCACATCATTGAGAACTGATTCATAAAAACTTATAATATAAAGCAGTT
TTATTCTGTAATTCTCATACCACTATGAAAGAGAGATTATTAATATCCCA
TTTGACTGAAGGCCCTAAAAGACTGTTGTTTCCTTTTGTTTTTTATCACT
AANGGCTGAACATATTTTGTAAATTGCCCCATAGAATTAAATTCTAGGAT
TTAACTTTATTTACTTAAGCTTTATAAAAATATCACAGTGATTTATTTGG
ACCGGAAAAAGAGTACATATTTAATTTTAAGTCTTGTTTTCCTGGTCCCT
TTAACCCTAAGGTATTCTTGTTTAGAAATCTCTTACCTCCACCTAAAATT
TTGTACAAATGTGTAAAGGTTCAAAAAATTTTTCTTAANCTAAATGTCAT
TCTCATGTTTATAAGAATGTGGACCAAAACAATATCTCCGAAAATTTCTC
TTATAACAAAACAATTTTCTCTGTGTGATGCAACAAGAAACACCCCCCTA
TAAAAATAAAATTCAAATNATCTTTGTCCTCTAACACC
|
quality values | Open.Hide. 6 8 8 8 19 8 8 8 10 7 7 8 8 9 12 10 8 8 8 8 8 13 19 24 28 15 15 8 8 8 13 21 33 28 30 30 32 37 42 42 42 47 48 50 50 50 53 53 53 53
53 53 53 42 38 35 35 35 30 31 28 33 33 28 23 19 11 10 10 10 10 11 11 11 10 10 10 8 8 19 21 48 53 53 53 53 53 53 57 57 53 53 53 53 38 38 36 36 33 41
50 50 42 32 32 23 18 16 16 18 19 19 32 23 29 28 28 30 30 36 48 48 48 57 50 50 53 53 47 47 47 47 43 57 57 47 47 47 51 51 51 68 68 68 68 68 59 59 59 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 44 42 33 42 42 43 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 59 59 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 59 59 68 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68
68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 44 44 52 52 52 39 39 23 27 23
23 35 39 43 39 39 39 43 39 44 43 62 62 62 62 62 62 62 39 39 39 62 62 62 52 43 43 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 43 35 35 31 39 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 52 52
52 57 52 52 57 57 59 59 59 59 47 47 57 57 59 59 57 57 57 52 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 59 59 57 57 59 59 59 59 57 52 52 52 43 50 50
54 52 59 52 52 43 44 43 57 50 59 47 50 43 43 57 57 68 68 68 68 57 48 42 37 41 42 44 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 47 47 44 59 43 43 43 57 57 46
43 43 37 37 43 44 48 41 41 29 24 18 17 20 32 32 48 57 68 59 59 57 57 54 57 57 41 34 23 23 23 32 34 30 32 38 32 20 32 31 39 36 28 28 19 19 10 10 12 21
11 11 17 13 18 19 29 23 28 28 31 25 28 28 28 28 25 25 25 35 30 19 16 17 22 18 19 19 28 33 26 17 10 10 10 10 12 16 12 13 19 28 34 37 30 30 37 32 39 39
39 35 37 37 28 28 19 19 11 12 13 10 10 10 17 17 28 28 28 26 30 19 21 18 16 11 11 11 12 13 11 14 16 26 25 25 18 12 10 10 11 23 22 21 11 10 10 10 19 16
19 14 15 15 10 10 10 24 24 26 22 15 11 11 12 21 11 10 11 17 21 27 20 16 15 24 24 29 22 21 25 26 22 21 12 12 11 11 11 11 10 10 10 10 15 19 17 11 11 11
15 13 8 8 8 8 8 9 10 14 11 15 18 11 11 18 16 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 11 11 11 9 11 10 10 10 10 13 13 13 12 10 10 10 15 9 10 12 11 10
10 10 10 11 16 13 8 8 8 8 11 13 14 8 8 8 8 8 8 7 8 8 9 9 13 10 16 11 16 16 11 11 12 17 17 8 8 8 11 11 14 12 10 11 8 12 12 17 8 9
10 10 8 8 9 10 17 8 8 8 8 8 10 12 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 10 13 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 15 11 12 14
12 11 10 10 10 8 8 8 8 9 7 8 8 8 10 10 10 9 8 8 10 10 15 15 12 15 12 16 15 18 13 10 9 9 8 12 10 10 8 8 9 8 9 8 8 8 10 8 8 8
11 8 8 12 17 13 10 10 10 10 13 19 24 16 12 12 13 7 10 9 6 6 8 8 9 8 8 8 8 20 22 10 10 10 10 10 10 11 18 10 10 9 9 10 10 10 9 6 6 6
6 8 10 7 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 12 15 13 8 8 8 8 8 8 11 18 13 6 6 6 10 8 9 9 9 10 10 9 10 13 10 13 14 14 12 8 8
6 6 8 8 6 6 8 7 7 8 8 10 10 9 9 10 8 10 9 9 8 11 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 7 8 8 8 8 6 7 8 13 12 11 11 8 6 6 6 6 6
13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 6 9 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 9 10 10 10 9 9 10 9
10 10 7 10 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 12 8 9 8 8 8 8 8 8 10 13 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 7 7 8 8 9 11
13 10 8 8 8 10 12 10 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 8 8 12 12 12 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 12 11 9 9 11 17 17 21 3 0 0 3 8 6 6 6 6 6 6 8 3 0 3 8 7 15 8 11 12 13 7 6 6 6 6 7 8 12 13 14 18 19 28 28 28
24 24 15 15 24 29 35 35 37 37 37 37 37 42 35 42 42 53 53 53 53 44 44 50 50 37 23 21 9 13 10 11 8 13 8 8 8 8 10 13 15 19 21 37 47 39 31 36 36 36
36 42 57 57 57 57 53 57 48 48 48 48 48 48 59 59 59 47 37 30 26 19 8 9 10 8 8 12 19 29 29 37 39 48 48 48 36 36 36 36 35 37 43 43 50 40 50 47 47 47
47 47 47 47 47 47 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 50 53 48 48 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 59 59 54 47 47
47 59 59 59 57 54 57 57 57 57 68 68 57 57 57 68 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 44 43 33 33 33 43 44 57 57 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 38 32 19 19 19 34 34 39 44 44 62 62 62 62 62 62 62 62 44 43 31 31 43 44 62 68 43 43 31 18 18 33 33 62 43
44 39 39 39 57 44 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 44 38 34 14 14 14 24 36 39 59 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 43 43 35 44 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 54 54 59 59 59 57 48 47 44 43 43 37 36 39 39 47
57 57 59 57 57 54 32 27 12 11 11 18 24 37 46 44 57 48 48 57 57 44 57 44 43 46 43 43 48 57 48 54 48 57 43 43 43 43 43 47 47 47 43 43 43 47 59 43 46 43
48 59 43 43 32 30 30 24 26 26 35 30 30 36 48 41 41 37 37 37 37 32 28 28 16 14 22 22 34 34 37 37 32 37 28 28 37 28 27 14 12 10 16 16 20 20 20 20 28 28
28 26 25 23 30 39 27 19 24 24 20 23 28 28 31 25 22 18 20 24 30 37 32 34 28 28 28 37 37 32 35 24 24 24 24 33 30 24 12 12 18 28 37 43 39 32 32 16 16 11
12 12 25 24 31 31 25 25 25 36 36 37 36 32 24 26 14 12 12 16 21 22 37 31 32 31 23 23 23 32 32 37 37 30 19 13 8 8 10 17 11 11 10 10 10 16 15 17 24 25
34 34 37 37 30 30 30 35 33 24 24 15 15 10 10 10 17 17 22 19 18 14 14 14 12 13 23 21 20 24 24 25 28 29 28 28 22 30 24 30 24 28 22 21 19 19 11 15 8 8
8 10 11 12 10 8 8 8 8 10 13 14 12 12 15 19 18 19 12 12 10 13 13 19 19 16 14 12 12 10 10 9 11 11 12 12 21 15 23 23 32 23 18 12 22 19 24 24 15 17
10 10 10 16 16 24 22 20 18 17 20 16 12 9 10 10 14 14 16 10 11 13 18 16 18 8 6 6 6 10 8 8 8 7 8 8 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8
6 3 0 3 6 8 15 11 8 8 8 8 12 12 28 30 25 14 9 9 8 11 11 9 10 8 9 8 8 8 8 8 7 8 7 7 8 9 9 10 15 16 16 11 11 11 10 10 10 10
10 8 10 11 11 8 8 10 8 8 8 17 15 20 15 12 8 8 8 10 10 21 13 10 8 8 8 8 9 9 11 8 8 6 9 11 8 8 9 10 10 13 15 10 10 8 11 10 10 11
11 11 10 10 10 8 8 13 10 9 9 10 10 10 10 8 8 6 6 7 7 14 16 12 10 9 8 9 9 11 11 11 8 6 6 8 10 11 10 10 8 8 8 11 11 9 11 11 10 10
8 8 8 8 10 8 12 12 10 8 8 8 8 6 6 6 7 7 7 6 6 8 8 10 10 10 10 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 7 7 8
10 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 9 9 10 11 11 10 8 6 6 11 8 8 8 9 10 12 15 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 8 8 10 8 8 13 8 8 8
8 8 8 8 10 10 11 10 10 11 6 6 8 8 9 8 8 11 8 8 11 12 14 10 12 12 9 8 9 8 8 8 6 6 8 9 8 10 7 8 8 8 15 16 11 7 6 6 6 6
6 9 13 10 14 9 9 8 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 6 8 6 6 8 6 6 8 6 6 8 8 10 8 6 6 6 8 6 14 10 10 8 8 8
8 10 21 15 13 9 9 8 8 11 7 6 6 6 6 8 8 3 0 3 9 10 10 10 10 10 6 10 7 7 8 8 11 11 11 12 16 14 |