BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-127G15.T7 (MSMg01no127_g15.b1) | MSMg01-127G15.TJ (MSMg01no127_g15.g1) |
ACC | AG335964 | AG335965 |
length | 710 | 1,683 |
length of high quality (start - end) | 353 (40 - 392) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no127_g15.b1 PHD_FILE: MSMg01no127_g15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:40:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no127_g15.g1 PHD_FILE: MSMg01no127_g15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:40:08 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCC
ACATACTACGTGTTAAACTACCCAAACTCTCTTCCTATTTAGAAGCTGAA
TTTCGAGACATTACCATTACCTCTCCAGAATTTCGGAATCACCGAGAGAA
GCAAAAGTCAGCTTGTCAGCTTTAACACAGTATAGTGACATGGAGCGGGG
ATCAGTGTAATAAATGTGTACAAACCATGGCTTAAAGTCACGGGCTTAAA
CAAGAAGAACCCATGATCTCAGCTGACAGATAGCAGGTTCCTAGGCAACA
AAATCTTTTACCAAGATGGCCAAGTAAAGGATGTTCACAGTTCAAAATCC
AAGTGTATCAAAAAAATCTTTAGCGTATCAAAGTCAGTAAGTCATACCAG
TAGAGCCCACCCCAGGAAAAACCAAGCACTTAGAAGATTTTTTTTCCCAA
GAACTTAAACTCTATAATGAAAATCCCAAGGAGATGTAAAATAGATGAAA
AATATCCATATTTTCAATTACACATGTAAGGGTTAATGAATGGATTTGGG
GAAAGGCTATAAAAGCCTTGTAGCAAATATTCTTTCTCTCATTCTGAATT
ATTGGCCGTTGTACAAATGATGTTCACTCTTCCTGAATACTGTTTCTATT
ACCCCAAATACTTTGCCTCACATTTTCATCCACCTTTTCATCTACCATTG
CTCGTTACAN
| CTTTTTTTTTTTTTGNTTNCNTTTNNNTTTCCCTNNTTNNTCTTCCTGTT
NCTCCTCTTCGTGTNNCTATCTTTTTTTTTTTTTNNNTTTATTCTGNTCT
NTTTTTTTTTCCTCTTCGTCTCTTCTGTTTTTTCTCCTGCTTATNCTGTT
TTCGCTCTTNCTTGTCTCTTNTGCTTNTCNCCCTGCCNNGCGATNNCTCG
NACCTACTANCNTTGCTACTATNTTTTTNCTNCTTNTTTNTTGATNTTAA
TTCGTACACACTACCGTACCCGCACCATNTNCATACGCGCGTNCTGCGCA
CCCCTCGCTACCATGCGCCATNCGTCTATACACTACTACATAAACCATCA
CACNCATAACATCCTATCATCANACTACATCACTGACTTACTGATACCAT
CTATACATATTACATCCGTAGTATACTATNTATATCATACTGACTCCATA
NCCTAGATCGACCGACTGTAACCGCANTAGTCTACCGCTCNTATATTACT
ATATACTTCANCACACCNCCACTCGTAATATGTACATCTGATACATCAGC
TGTACGGGTTCGCNTNACTCGTGGCANGCGACGTTAGTGTTACGCGATAT
ACACTNTCGACTCGCCGGCCTGTCACCTGACCTCCACGAGTCTGTAGACG
ATTGTTGCATGCAGCTACTCATCACGTATATCTGACGTACCGTGATACGC
CGAATATCAAGGCCGCCAGATAGTNGAGTGATTGCCGCGTCGTNGTCTGN
GCGACCGCTNATTACGCGCGCGTGTGCATATATCCTGTAGTATGCTCGTT
GTCATGGTCTCGTGTGTTGTGTTGTGATGTGCCGTAGCTGGGCTCGTAAC
TCGTACATGCGTGNCGCCGTACGTATGCGCTCGAGTGCCAGTCGATACTG
CTGGTGTATCGATATGTGTGTNTGGATACTNTNNCGCCGACTGTGTATGT
GTATTGCTCGCGCGCGACTTTGACGCGNACGCTGTTAGTATATGTAGTCG
CGCTCGTCTCGTNGTACGGTATCACTGTATTGTGATCATCCGCCGAGCTA
TAGATTTGCTCGCTCGCCATCGTCCCNGATATGTGTAGTCTAGTTTGCTC
GCGTGTGCCTGTCTAGTTTGCTGTGCANGCGTGTCGTGTACGTTAGATGC
GCGAGCGACGTANCGAGNTGTACAGAGTGCGTCATGTGTGGAGAGTGCTG
AGATGTGTGCGCACGTGTGCGATGCGTACAGTACTGTGTAGTNATTGTAC
TANAGTNAGATATCACAGCGTGACTGAGNCAGATGAACACAGCTGACACG
TCTGCGATGCCTGCGTCGTACCTGTGTTCTGATGTTGCGTCGATGTCACA
CGCCGCACGNGCGCGATGATCTCACTATGTGTCTACCGCACTCCGTCGAT
ATACTGCGCGCTGCGCGCTCGTGTGTGTATCAACACGTACTCNTGGCGTG
TGGCAGTCGCGTACAACAGCGTGTATACGTGATGCCGGACGCNGTCGTAC
GTCATGTTTGACGNCNTCGCTAGTATGTGATTATTGTCGCGACACGNCGC
GTATGATTGGTGCTGTCGGCAGCGTGTGTANGTGCGTGTGNCTCGTGCGC
GATTGCTAGACACGTCGTNGCGCGTCGTTGTGTGATCGCCGTACTACTTG
CTACTATCGCTGACTCTGNCAACTGACCGACCN
|
quality values | Open.Hide.37 41 41 41 30 31 30 30 21 13 8 8 8 8 8 21 21 33 33 23 19 10 10 10 19 9 11 10 15 11 11 11 17 21 23 20 24 25 26 28 37 48 53 36 36 36 33 29 30 26
31 30 23 19 11 6 6 6 6 10 11 13 19 28 33 33 33 48 48 48 33 33 34 34 34 34 43 43 57 57 57 57 57 50 50 50 50 68 47 47 51 47 42 42 48 42 48 48 48 48
57 48 48 54 54 54 50 48 47 47 47 47 47 50 50 47 47 42 57 47 47 47 57 40 40 38 38 38 38 47 50 48 48 47 43 37 37 39 42 42 43 43 43 43 43 43 50 44 44 33
33 33 29 29 26 36 36 46 41 41 50 47 52 57 52 52 52 52 52 52 44 44 42 35 35 44 43 57 52 37 37 43 57 43 43 43 43 43 35 32 39 33 33 35 43 34 33 23 24 34
39 39 46 47 52 57 57 52 52 52 52 52 47 45 47 47 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 43 43 35 35 43 47 43 52 52 43 43 31 31 31 41 44 35 35 35
35 35 35 39 39 42 42 35 43 43 52 52 52 52 57 57 57 43 38 27 20 20 38 32 38 32 43 32 32 32 27 20 16 19 19 23 28 43 43 50 42 41 32 24 20 18 18 18 32 32
37 43 43 43 50 43 43 32 32 12 12 12 16 12 13 18 38 24 28 32 23 19 20 18 18 17 20 20 32 32 30 32 20 20 20 31 32 42 39 33 32 20 20 20 23 27 34 24 28 20
30 30 37 25 25 25 25 31 37 35 35 39 47 43 48 48 54 48 57 42 42 32 34 23 23 23 28 32 39 35 35 35 39 39 30 30 14 13 13 18 18 26 19 11 11 11 13 19 28 21
21 13 12 12 11 11 9 9 7 7 9 8 8 11 12 13 26 24 28 32 32 32 37 39 39 35 35 35 39 27 28 14 18 12 21 15 20 28 32 39 43 48 39 39 32 24 24 24 24 32
32 37 39 44 37 37 30 32 32 36 44 32 32 28 22 23 31 31 43 39 39 35 37 36 33 29 25 25 25 28 32 25 20 20 24 23 20 19 19 22 16 24 17 15 15 19 15 21 14 14
14 21 21 28 28 28 32 32 28 34 30 37 19 17 11 11 11 15 19 18 12 11 11 12 12 19 19 17 12 12 12 12 12 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 10 26 23 24 18 14 14
14 14 26 29 25 18 18 15 24 13 12 12 15 10 10 9 10 13 11 10 10 10 10 10 10 13 18 18 14 14 16 30 34 34 34 23 14 12 16 11 11 13 18 15 24 22 17 17 15 24
14 12 12 12 13 13 12 11 13 10 10 8 12 9 10 10 10 11 10 8 8 8 8 8 12 14 17 10 12 9 9 8 9 11 10 9 9 9 10 8 10 9 8 8 8 9 10 8 8 8
8 8 11 19 13 13 12 12 11 10 10 10 10 13 16 19 15 18 12 11 11 10 13 15 14 21 12 15 10 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 10 13 10 10 8 8 11 8 8 8
8 10 10 10 13 10 10 11 3 0 | Open.Hide. 7 7 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 3 0 3 3 0 3 0 3 7 3 0 0 0 3 7 6 6 6 8 3 0 0 3 3 0 0 3 8 8 9 8 7 6 6 6 3
0 3 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 10 3 0 0 3 10 8 8 8 8 8 9 12 12 12 12 12 9 9 7 7 3 0 0 0 3 7 6 9 6 7 6 6 3 0 3 6 3
0 3 7 7 9 9 9 9 7 7 6 8 6 6 6 8 6 6 6 10 10 12 11 8 8 10 8 8 8 9 8 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 11
11 8 8 8 8 8 6 6 3 0 3 6 8 8 6 6 6 6 6 3 0 3 13 10 10 3 0 3 3 0 3 6 6 6 6 6 3 0 0 3 6 6 6 3 0 0 3 8 8 3
0 3 8 8 8 10 10 9 3 0 3 0 3 8 8 9 8 8 8 7 7 3 0 3 7 7 7 3 0 3 3 0 3 8 3 0 3 7 3 0 3 6 6 6 3 0 3 8 8 8
8 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 7 9 10 8 8 8 8 8 11 9 9 9 9 9 3 0 3 0 3 6 6 8 6 9 9 9 8 8 3 0 3 6 8 8 8 8 8
8 8 8 7 9 9 12 10 10 9 10 10 9 12 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 9 6 6 6 6 7 6 6 6 8
12 18 3 0 3 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 8 6 9 9 9 9 10 7 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 12 8 7 6 6 6 6 6 11 11 9 9 9 3 0 3 12 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 10 3
0 3 9 8 8 6 6 6 6 11 10 9 9 8 13 6 8 8 10 8 6 6 6 6 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 7 7 10 8 6 3 0 3 8 8 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 8 13 10 8 3 0 3 12 15 13 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 11 11 11 9 11 9
9 9 9 9 11 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 0 3 6 6 6 11 9 9 11 11 3 0 3 8 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 11 11 9 10
8 8 7 8 3 0 3 6 6 6 6 8 6 10 10 10 10 10 12 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 9 9 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12
11 12 12 13 9 8 8 8 8 8 6 8 7 6 8 8 8 8 8 8 9 9 7 7 6 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 10 10 9 12 9 8
6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 10 8 3 0 3 7 7 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 3 0 3 8 8 8 3 0
3 8 8 8 11 10 10 9 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 8 6 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 6
6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 8 6 8 7 6 6 6 6 8 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 7 6 6 7 8 8 8 7 6
6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 8 3 0 3 6 6 6 12 11 12 6 6 6 6 8 6 11 9 8 10 10 10 10 10 11 15 11 11 11 9 9 9 9 6 6 8 6 8 8
10 8 8 8 6 10 6 6 6 6 8 6 7 7 8 8 8 6 6 6 3 0 3 6 8 6 6 6 6 3 0 3 0 0 3 6 6 6 6 6 6 10 8 8 9 9 8 8 8 8
8 8 8 8 10 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 3 0 3 8 8 6 6 6 6 6 7 9 7 6 6 6 6 7 6 8 8 8 9 9
10 10 6 6 6 6 8 10 10 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9 15 12 12 9 7 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 10 10 8 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 3 0 3 10 10 9 11 8 6 6 6 6 8 11 8 8 8 6 7 7 7 6 6 8 8
8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 9 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 9 11 12 12 12 8 8 7 7
8 7 8 8 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 10 10 3 0 3 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8
8 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 3 0 3 6 6 6 6 7 6
8 3 0 3 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 8 10 11 14 8 8 9 9 8 8 8 8 10 10 12
10 10 10 8 8 7 9 9 13 11 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 11 12 6 6 6 6 8 6 6 9 10 16 9 9 9 12
10 10 10 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 10 10 8 8 8 10 10 9 9 9 8 6 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 9 9 6 6 6 6 6 8 8
8 10 11 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 7 9 9 9 6 8 6 6 6 6 11 13 10 11 10 10 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 6 7 8 10 12 11 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 9 9 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 6 6 8 8 8 8
8 6 6 6 6 6 6 7 6 6 8 10 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 3 0 3 8 8
8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 12 10 15 16 10 3 0 3 6 6 6 9 9 9 9 3 0 3 9 9 8 11 8 8 8 13
10 8 8 8 9 9 9 6 8 6 6 6 6 11 12 12 9 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 10 9 9 9 9 9 11 11 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 9 9 9 6 8 6 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 3 0 |