BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305J20.T7 (MSMg01no305_j20.b1) | MSMg01-305J20.TJ (MSMg01no305_j20.g1) |
ACC | AG430524 | AG430525 |
length | 1,308 | 1,258 |
length of high quality (start - end) | --- | 700 (125 - 824) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_j20.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_j20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_j20.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_j20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:46 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCCATTTNNNNNNGACATTGGGCCTAAGACTCCTATGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCCATCAATGAGATAATTCTTTAAGAGATGTAAAGCTAAGACCA
TGATGGCTTTGCCTCTTTAAGATTTGATTCTTGAGCTTTATGAGCCCACT
AAGGATTCTTGAATTTCTTTTAATACTCTCAATCACTCCCACCGTTTCTG
TTTCCCTCAAGCCAATGTTTGGCTTGCAATTATTCTGACATCTTTGAGGA
AAATGACCTCAATGACTGGAATTACAATTATGACTCTCTGTTCACCCAAG
ACACTCCAATGTACTCCACAACCAGATGCTTTCAATCCCTGCGAAAATAT
TATGGGCTATGCCTTCCTTAGGATGTTGATTTGACTAAGTAATATACTAC
CCGTCTTTTTCTTCTAGACCGCCCTCTTTGGTCTCCTGACCTATCGTTAT
AAACTGATTTTTTTCCGCTCCCTCCTGGGTAATCTCTCCTTTGCAAATAA
AGCATGGGAATCTACCTGCTGGTCATTGCCTCAATAGACTCCCAAACAAG
ATGCCAGAACTATAGCCACTCCATATACTGCCACACATATAGTGGTTGCA
GTGCACCTGACTTCTTTACTGTGCTCGCCAATGAAATTACTGTCTATACC
ATTACAGTCATCACTCTGGAAAGGTGGCCCATCATCACCTATGCTGTTCA
GCTGGACCAGAAGATGACGATGACACATGGCTTCCCAATTATGCTCGGAG
CATGCATTTTTTCTACCCTGACGGCCACATTGTACCTTGTGAGAGCTAAT
CGATAATTGACTGTCAGCATCTGCCTCGCCATGGGAGTCCAATCCACTCT
GTCACAAATCGACATATTATCCATCTTGCTCCTCACTGCACGATCTTTGC
TGGCATCAGTGCTTGCTACTTGATCAAATCTTTCCGGTTAAAATCCAGAA
ATGACCTGTTCTAACAGGGATTCTGTCCTTTTTACAAGGATGAAATTTTT
TGTATTACAAAATTCCATGGAAGCCGCCCATCTCATTCTTTGCACTTCAA
GGTCTTCCAGTTCCCCTTTTCCTGGAACGACCTAATAGTCTTGTTGGGCT
TTTTTAACTCCAATCTTTTGGCGAACCTTTTTTAAAAAAAGGGGAAAAGG
GTTTCTCAAAAAAAAATTACCCTATACCAAAATTTTGGGTTCCGCCCACT
CTCAATTTTAAAAAAGGAGATTGTGTGTTCTTCTTATCTTAAAATTTAGG
ATACCTGGTTTACTTTCTTACAATATTAGATAGGTTCTCACCCATCATAA
CAAATATA
| CCGCCTCTTTNNNNTCCCATGGATGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTTAAAGATGCTTCTCTCTCAT
TTTCAGTTCTCCCAATACCTTCATGAAAACGCATCGTATGTCCGCCCCCT
TGAGGAAGGAATGCTGCACTTATTCGAGAGCATTACAGAGGCTACTGTGA
CTGTCCTGGTAATTCCCTCCTTGTTTTACAGCAGAAAATGGGAGCTCTTA
TTGGCCGGTAACGCTTTTAACTGTGAAATTACTTTTTTATCCAGGAGACA
ACTGTGAAATTGAAAACGTTTTCAGATCATCTAACTTCCTACGTACGCTT
CCTGAGGAAGATCCTTCCTTATCAGTTAAAAAGGTATGCATTCCCCTAGA
GGCCGGGAGTTGATGAAGCTGCAGATGGGACCTGGCTTGCCCTGGAGTTA
ATAGTCCGAGTGGTCAGTCAGTCAGTCAGCTGTGGTTCTCAACTGCCCTC
TACTCTGCTGACTGTTAGCATTGCACAAGGCCATAAGCAGTGGTTTTTAT
AATTGAGAAGGCCACATTTTTTTGGAAGAAAAATTTTGGCTTTGAGTTCA
TATTATTCCTTTGTTGTTAATATCTTCGTGGGAGTTAGAATATTTAACAT
CTGCATTTGAATCTTAATCCTTAGGTATTTTTGAAATGATATCTTTTAAT
TGTTATTATTGTTACCTTATTTAAATTATAAAGTAAAATATTTATCTACA
CTGAACCTAGGTCCTTTAATATTTTACCCTAAATATTCAGTAACCTTTAC
TACACATGTTAAATTTCTAGAAATTACAATGTAGACTAGCCTAACCATGA
ATTTATAGAGACCCACCTGCCTCAGCTTTCTGAATGGGAGCATTAAAGGG
GAAAAAGGGCCATCTGGCAAGTTTTATACTTTGATATTTTATCGAAAAAC
ACCAAGTTATCTTTATTGGTTTTTTTTTTTTAAGAAAAATAACATGGGAG
CAAAAATTTTCTTGTGTTAATAAAGATTTCCAAATTAAAAACTCCCCAAT
TTGCTTTTGATATTTTAAAAAAAAAATCCCTTTTTTAAAAAAAAAAATTT
TTTTGGGTCTTTTTTTGAATTCAAACTTTCCCCCATTGGGAAAACAAGAA
CAAAGTTTTTGTTTTAAAAAATATAAAACTTTTTACAGGGCTAAAGAAAA
GGTCCCCGAAAAAACTTGGTGCTTTCCAAACCGGATTTTTTATTCCCCAA
GGGTTCAT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 9 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 7 7 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 15 9 8 8 8 8 8 8 21 19 19 24 20 23 23 37 43 53 53 53
43 43 26 26 14 13 13 18 19 21 11 13 12 21 12 13 8 19 13 26 22 17 17 11 11 12 11 13 9 12 12 9 9 8 14 15 19 13 10 10 10 10 10 16 10 10 10 15 15 14
14 18 21 21 14 14 15 15 16 15 10 10 9 7 7 8 9 8 8 8 8 8 9 13 16 14 14 12 20 21 22 19 28 17 19 18 13 17 13 10 10 10 15 23 17 20 19 16 23 23
11 11 11 12 24 30 22 27 19 19 21 24 22 28 28 33 24 24 15 16 15 12 12 12 18 24 16 12 11 11 13 22 18 15 15 11 12 12 12 13 13 16 16 13 12 12 21 21 24 17
17 17 24 24 32 26 21 15 13 13 13 13 13 15 17 24 23 25 21 15 11 14 13 11 13 14 10 8 8 8 10 16 17 31 26 19 14 14 14 27 15 23 23 23 22 22 14 14 14 23
28 26 25 13 13 13 13 12 15 25 21 20 18 15 12 12 10 10 9 12 9 15 15 12 8 8 8 23 19 30 26 22 13 12 10 10 14 19 18 35 19 23 10 11 11 11 11 10 10 10
12 23 18 23 23 24 28 25 25 25 30 30 21 21 21 19 25 12 12 11 12 12 15 11 11 11 16 16 37 36 37 28 28 20 20 20 31 26 26 18 12 12 11 12 12 21 21 28 28 24
24 16 18 12 15 18 27 16 12 12 11 18 20 24 24 25 30 20 23 11 10 10 10 10 10 14 18 24 15 20 14 12 12 8 8 8 12 13 15 13 13 15 24 32 28 12 10 10 12 8
8 8 12 16 27 23 34 21 16 12 15 12 12 12 12 15 12 12 12 14 14 15 18 24 32 24 24 11 9 9 10 13 12 15 18 18 15 18 12 12 11 11 10 10 10 15 15 16 12 12
12 18 18 12 15 10 10 8 8 10 9 10 9 9 9 9 9 10 10 9 17 14 16 18 16 12 11 10 10 10 19 22 22 25 15 14 17 28 28 14 12 12 12 11 10 8 8 8 8 8
8 9 9 9 12 11 23 13 18 18 19 24 28 28 25 19 21 11 11 10 10 10 12 19 24 30 33 30 30 30 28 23 11 11 8 10 8 9 12 26 32 28 24 14 12 13 10 10 8 8
8 8 8 8 19 21 17 17 20 28 28 23 19 10 10 10 17 15 9 9 9 19 25 12 10 10 10 10 13 12 11 12 15 12 12 23 12 14 14 13 24 19 21 18 12 12 18 21 34 34
15 13 12 15 12 12 12 17 16 11 11 11 16 15 14 13 15 13 28 15 15 15 11 11 11 11 11 21 24 15 12 12 11 12 12 12 12 12 10 10 10 10 10 15 20 20 32 21 19 11
12 12 22 22 11 11 11 15 15 32 32 28 28 28 28 19 24 13 11 11 14 17 11 12 12 12 11 11 13 13 13 15 10 10 10 15 15 26 26 33 33 36 36 26 26 17 22 12 15 8
8 8 15 15 13 13 8 8 6 6 6 13 10 10 8 8 6 6 8 10 12 17 12 10 10 16 21 10 9 8 10 8 9 9 10 11 11 11 11 15 16 13 13 15 15 18 16 11 11 11
12 12 11 10 10 10 13 13 23 30 24 24 20 29 22 22 14 18 15 18 11 11 11 10 11 11 16 17 12 16 18 15 12 12 12 24 26 28 24 14 10 8 8 8 10 8 11 11 12 12
12 12 12 12 12 10 10 10 13 10 11 11 13 27 23 11 11 10 13 13 15 15 12 10 8 6 6 6 6 8 8 12 11 9 9 9 10 9 9 9 9 9 9 10 14 15 20 15 21 19
13 13 16 16 14 9 8 8 11 8 8 8 8 7 7 12 10 10 8 8 8 8 8 15 20 21 14 11 11 11 15 22 19 11 8 8 6 6 10 8 9 9 10 10 10 14 13 23 15 12
8 8 8 8 8 9 12 16 9 9 11 23 10 10 10 9 9 9 16 10 8 8 8 8 8 11 9 8 8 9 9 12 13 12 13 12 12 14 14 15 20 32 37 21 9 8 8 8 8 8
8 8 13 11 11 10 10 13 10 8 8 10 8 8 8 10 8 9 11 14 15 10 11 11 16 10 9 9 10 9 10 8 7 7 10 10 10 12 10 10 10 9 11 9 9 10 10 10 10 10
11 6 6 6 6 10 8 16 15 12 10 14 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 9 9 9 9 11 8 10 10 10 10 12 11 11 11 11 10 16 11 11 11 10 11 10 10 6 8 8
6 6 10 9 9 14 16 10 11 11 13 8 8 8 8 8 10 10 12 12 8 9 9 9 11 10 10 13 9 9 10 8 11 11 11 12 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8
15 18 16 12 10 10 11 15 15 11 11 13 15 10 8 8 8 8 11 6 8 6 6 8 15 13 15 22 31 25 28 32 28 24 29 19 15 15 10 10 10 10 11 12 12 11 10 9 9 11
9 9 9 14 15 14 16 14 14 17 24 22 16 15 11 11 15 12 11 10 10 8 8 6 6 6 6 11 12 8 8 10 8 8 8 9 9 9 9 13 15 11 15 11 11 13 13 13 8 8
6 6 8 8 13 13 16 11 10 8 8 9 9 8 10 6 6 6 6 10 13 10 10 10 8 8 6 6 8 6 8 8 6 7 7 9 12 9 9 11 8 11 8 10 8 8 8 8 6 6
8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 9 8 8 6 6 6 7 10 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 11 11 11 11 10 13 11 6 6 7
6 6 6 8 10 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 7 8 8 7 7 8 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 13 8 8 9 9 16 12 19 22 15 15 8 10 10 19 19 10 10
19 26 30 35 35 37 37 37 35 35 32 30 35 36 36 50 50 50 50 47 41 29 27 9 9 9 9 9 6 7 6 6 6 6 10 10 17 18 28 30 31 31 31 31 36 36 38 38 42 53
53 53 53 50 50 36 36 31 31 33 33 33 29 21 15 10 10 10 10 11 9 11 12 19 21 19 26 32 47 59 48 57 57 53 50 50 50 50 50 53 53 53 57 59 59 59 57 57 47 47
47 47 50 50 57 59 59 68 59 59 59 68 68 68 50 50 50 68 50 50 51 51 51 51 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 57 57 44 44 22 19 9 11 10 24 24 38 43 57 57 68
68 68 68 68 68 57 57 50 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 59 59 59 59 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48
50 50 50 59 41 23 20 11 12 12 12 12 11 12 16 21 32 34 47 47 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 54 54 54 54 54 68 68
68 68 68 68 59 59 47 48 54 48 48 42 42 35 37 37 37 39 32 28 15 15 14 14 14 17 18 30 30 46 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59
59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59
59 59 59 59 57 54 54 54 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 48 48 32 35 27 28
28 44 44 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 59 57 57 57 57 43 59 43 43 43 43 43 48 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 57 57 48 50 50 50 59 59 59 59 47 43 41 36 36 44 59 59 59 59 47 47 48 48 48 48 57 57 59 59 59 57 57 57 48 48 48 48 41 41 59 59 59 59 44 39 39 44
44 44 47 47 47 47 32 37 21 21 14 14 30 34 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 46 41
41 43 43 41 41 44 41 39 39 40 40 41 48 50 50 50 53 50 48 48 48 48 48 47 59 59 36 29 18 18 14 21 27 41 41 39 39 36 36 36 30 26 27 24 24 28 44 44 47 59
34 34 28 28 28 34 34 40 40 39 37 37 30 25 27 27 32 37 37 28 21 15 15 15 12 13 17 15 17 19 26 26 17 19 19 28 32 25 25 22 29 34 32 32 32 28 32 35 32 29
31 27 30 25 25 25 29 29 20 24 23 20 20 15 17 17 30 30 34 29 19 18 13 11 9 9 10 15 12 15 15 21 21 25 22 11 11 11 9 10 10 13 11 10 10 11 12 10 13 8
9 8 11 9 9 9 8 8 8 10 10 9 10 13 13 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 16 22 22 11 10 10 10 15 10 15 15 22 13 9 9 6
8 6 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 7 6 9 9 9 9 8 8 9 8 10 10 19 19 24 21 21 25 18 12 11 9 8 8 8 11 8 9 11 10 10 10 10 11 12 11 11 11
13 12 18 20 20 16 12 12 8 6 6 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 9 10 13 11 11 10 13 14 11 11 9 10 10 17 8 8 10 8 8 8 10 10 9 12 8
8 8 8 8 12 21 12 11 11 11 11 18 22 25 23 10 9 8 15 9 10 10 8 10 9 10 10 8 8 8 8 8 15 10 12 11 9 11 9 12 10 11 17 15 22 14 14 14 26 21
20 8 6 6 6 6 6 10 10 9 9 9 10 13 13 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 10 10 11 11 11 11 11 11 11 18 9 9 6 7 6 6 6
6 6 7 9 12 12 14 10 8 8 8 10 15 10 9 10 17 15 13 15 10 6 6 6 8 15 8 8 10 10 9 11 12 12 8 6 6 8 8 12 12 11 11 8 6 6 6 7 6 6
6 8 8 10 10 10 9 10 10 11 16 9 12 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 11 10 10 10 8 8 10 10 10 13 12 15 24 25 19 19 11 8 8 7 6 8 8 10 10 13
11 13 11 11 10 10 9 9 |