BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313L06.T7 (MSMg01no313_l06.b1) | MSMg01-313L06.TJ (MSMg01no313_l06.g1) |
ACC | AG435556 | AG435557 |
length | 1,289 | 1,300 |
length of high quality (start - end) | 252 (501 - 752) | 377 (71 - 447) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_l06.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_l06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:42 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_l06.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_l06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:42 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNCCGCGCACTGGGCGCCATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAA
TTCTTTCTGTGTTCCTATGCCTCAGTGCCCTGATCTGTAAAATGGGAACT
GTCACAACAGTACTTAGCTACAGACCCCTCAGGAGAATTACATGCACTTT
GAGGAGGCTGAACAGGGCTGGGCCTGGCCCTTAGCAACTGTTACCTAAGT
ATTAGGTTATTGTTACAGAACACATGTTTGCCATTATGATGATGTGGACA
AAAGGTTTAGGCTCAGTGCTGGTTTATAAACCCGGGGATCCAGGATGAAT
CAATCAATAAGATCCTCAGATTCAGGCCAAATCAATTGATAAAATCCACA
GACTCACATGACCAATCCTTACAGCTAGGATAGCCCTGGAATAGAGGCAC
AGGGCATTGTGCTGGCTTTTGTTCCAGTGTCTCAGGACGGTCAGCCCTCC
TTTTTTTCTTGCCCCGCTCATGGCCTGTGCACGGTCACAAGAAAACTGGA
CTGTTGACTGCTGAATCTCGCTCCTGGGGAGCACACAGGGCTGGGTTCCT
GTGAGCCTCTGCTCAGAGCATCTTTATCAAGTGATCAATGCATACCCTTG
TTCTTTGTGTGTTTTTGCTTGTTTAAAATGTATTGTGGACTTGTTAGTAA
TGAACTCATGACCAGTAGTTGTATAATCTCCAGAAAAAAAGCTAATTTAT
TTTTTTCTGTAAGGCACATGCCGACAGCTAGGAATGGATGAGATAGGAGG
TCAGGTTAAAAAAACAAAAAACAACAACAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAA
AAAAACCCAAATCACTTGCTACCCAAATTTTGATGGTGTCCAGTTAATCC
TTAGCAAGGACAGAACCTCTCCCTAAACACACCCATGCCTGCATGATCAG
CATGCATGTGCATGCACCCCTTGCCCACACTCCTGCCCAGATACGTGCAC
TTCCAACCCCTGAACAGGAAACCCGTTCCTGTACTCCCCCCCCTATTTTC
CCCCTATCCCCCCCCCCTAATAATAAAAAACATTTTAGAATTTATTTTTG
GGGAACAAACCTTTTCCCTCGTATGGCTCGCCCGTGCCCCCCTAGGATAA
AAAAAAGGGGCCCAACCCCTTTTTCCCGGAATTTTTCTTTTACCCACCCT
GGCGCGCGCGTTTATCAAAAGAGCCCCCCTCTCAAAATTTAATGTTTCTT
CAACTCACACCCTTCTCCACACCCAACTTTTTTTTCCATCTGGGCACCCT
ACCGTTCACTTCCTCTCCCCTCTTCATTATTCATTCACT
| NNNCCCTGACTGGTAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAATCAAACAAGAACCATGAGACTACATTT
GTGAGCCTAGAGCCCGTGTAGCACCACGAAGCTAAGTACTACTGTTCTCA
CTGCCCCTGTTTCAGGAACCACTTTCACACATTTCCCCATAACTGAAGCC
AGTCAGAAGGAGTCAAAGGAGGCACCTTGTTTTGTTTTGGTTTTTTAAGA
CAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCGCTCTGTAGACC
AGACTGGCCTCGAACTCAGAGACCTGCCTGCTTCTGCTCTCCAAGTGCTA
GGATAAAAGGCGTGCACCACCACTGCCTAGCAGAAGGCATTATTTTTAGT
ACTCTAAGAAGTATGTGCTTGTAGGTGTGGGTATTTGTAGGTATGTGTTT
TTTTTCCCCCCCCCACNTATCTCCACCCCCCCTTTAAAAAAAAGGGGGGA
TTGAATTCAAGACACCAGGCTCGTGTGGCAAACACCTTTCCCATTGAGCC
ATCTCATTGGTCCAGGTCTGTTTATAATAATGTAAACTCTGTACTAGCTA
TTTTAGAGGCTGCGAGGAAAAGATCTTTAAGTGGTTTAGAACACTTAGTG
CTGTCAGTGTCACTGTTGACTGGAGGGTCAAGCATGCTCCACCTGCACCC
CTGTCCTCTTCGTGCAGCACTCACTGTTACCCTGGTCACAAGCCAAAATT
CTCCCCTCCCAGGTCTCTGTCCCGGTGAACTTGCCTACTATCTCACTGAA
CAGTCTCTCTGTCCTGAATCAACGGTACAAACCCCTTTTCTTATGCCTTG
ATATCCTTCCTGCGAAATTCCAGGAACTCAATCCCAATCCGTCCTCAACG
GTATGTCTATTTATACTTCTCTGCTAAATCCTGTTACCCTTCCTTTAATA
TATTCCCTTTGATCATTTCATTCTTTTACCTTTCACCCTTCTCCATTTTC
TATTTTCTTCTTCTAACTCTTCTAATTCCTCCCACTTTCTCCCTCCTTTC
ATTTATTTCATCCTTTTTTCCTCTCTCACTTACTCTTCACATACTCCTCT
TCTCTTCTTTTCCTACTTTCCTACTTTATCCCATCTTCACCTACATCTTC
TCCCTCTCCTCTTTTCTCCTTCAATAAAACCTGTCCCGTCTCATTCTTCT
TATCTCTCTCCTACCTCTCCCTCTTCTTCTTATTCTTTTATCATCTGTNC
TACCTCTTTTTTTTCTCACTCATCTACATTCTCTACTCTTCTACCTCATC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 9 9 9 9 10 10 16 15 16 12 8 8 8 8 8 13 16 10 8 8 15 12 14 24 24 37 33 33 33 33 36 42 48 48 48 42 43 43 43 30 42 42
42 51 48 57 57 57 50 68 50 50 50 50 50 48 29 38 35 37 37 37 35 29 25 23 32 32 41 41 50 53 68 68 68 68 51 50 47 47 47 47 54 54 54 50 50 68 57 53 50 50
48 50 50 50 59 43 43 32 31 31 28 28 24 27 27 31 29 28 28 28 22 21 12 12 14 17 19 12 12 12 22 22 41 41 50 50 50 50 53 53 50 50 57 57 57 57 57 53 53 53
53 53 50 57 50 53 53 53 53 53 57 59 57 57 57 57 53 53 53 53 53 50 50 50 50 28 25 12 9 16 11 11 9 9 18 22 34 39 39 37 33 22 19 11 11 11 19 22 39 41
42 50 50 50 53 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 57 53 53 53 53 53 57 59 59 57 57 50 50 50 50 50 39 34 22 22 15 13 13 13
12 15 15 26 32 41 47 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 50 50 50 50 57 57 48 48 59 59 59 46 30 27 21 15 12
8 8 8 8 9 9 14 13 13 9 13 15 10 11 10 10 10 25 25 59 59 59 59 59 59 59 59 59 39 25 25 18 22 18 15 16 15 15 11 11 11 11 14 14 15 12 12 11 15 15
15 28 24 41 39 53 53 53 53 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 68 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59
57 68 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 59 59 48 57 59 57 57 59 59 59 68 68 59 59 57 50 48 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 54 52 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 54 54 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 59 59 59 59
59 68 68 57 57 57 54 54 47 57 50 50 46 46 43 48 43 43 43 59 57 57 57 57 40 46 43 43 39 37 37 35 35 43 43 57 57 57 59 59 59 48 47 47 47 47 47 43 43 48
48 48 50 42 41 41 43 39 28 25 24 22 25 25 39 41 40 40 46 46 46 43 43 43 43 39 41 41 41 39 30 19 11 11 16 14 17 39 39 39 20 20 12 19 18 29 34 25 23 11
11 11 25 25 23 23 15 14 12 18 26 27 20 19 23 23 23 17 17 15 15 17 16 21 19 19 22 22 14 12 22 19 20 21 33 39 33 33 33 29 25 25 28 34 34 37 34 19 19 25
25 30 25 20 30 25 24 13 12 16 14 14 14 14 16 24 19 22 22 16 18 10 10 10 15 22 23 23 19 14 14 19 15 14 11 9 9 9 10 10 13 21 26 30 30 24 23 24 24 30
14 12 8 8 8 9 9 14 19 10 8 8 8 8 9 10 9 9 9 10 10 9 9 10 7 6 8 8 8 8 13 20 30 27 28 19 22 14 14 16 24 29 32 22 17 10 10 10 13 11
13 15 22 22 12 10 9 8 8 8 10 10 10 21 9 8 8 8 8 10 8 8 9 9 10 10 10 10 10 11 15 15 15 15 12 12 9 10 8 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 9
14 14 16 22 22 24 24 17 16 16 22 16 13 10 9 9 11 10 10 8 8 10 10 12 13 10 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 11 18 21 15 12 11 8 8 8 9 9 9 8 8
9 9 10 8 8 6 6 10 12 12 11 11 10 19 9 14 14 10 10 8 8 8 10 15 12 16 22 21 12 15 10 15 12 15 13 9 8 8 8 12 10 10 9 9 10 13 25 21 15 13
11 12 12 10 9 9 9 10 10 12 11 11 11 10 9 7 7 6 6 6 6 8 10 10 10 10 10 10 8 8 6 8 6 6 6 6 8 9 14 15 17 11 11 8 6 6 7 8 7 8
8 8 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 12 10 12 11 7 10 7 7 7 8 10 10 12 13 10 11 10 13 15 20 23 11 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 7 7 10 8 6
6 6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 12 10 10 11 11 12 11 8 8 6 6 8 8 11 16 11 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 14 8 8 8 10
8 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 11 11 14 10 13 17 11 10 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 15 15 16 10 8 7 6 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8
6 6 8 8 9 8 8 8 8 12 12 14 17 18 15 15 9 9 9 8 11 8 8 8 8 12 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 6 6 6 6 6 7 7 8 15 6 6 6 7 9 12 15 9 6 6 7 7 7 15 21 21 10 10 15 23 21 33 32 32 30 32 34 36 36 37 36 37 37
37 42 43 42 59 59 59 59 59 59 43 39 37 42 42 57 57 43 44 44 37 37 37 43 42 41 43 57 48 68 68 68 57 48 48 42 41 36 42 40 26 26 42 31 42 32 32 36 42 42
42 43 43 47 44 34 31 31 22 36 36 57 43 47 31 31 31 30 30 17 17 9 11 11 11 9 9 11 21 27 33 33 33 33 33 33 47 36 38 38 42 42 42 50 47 47 47 48 48 48
48 57 57 57 57 68 50 50 50 50 47 47 50 48 48 50 57 46 50 47 47 47 50 48 50 48 48 47 47 47 47 47 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57
57 54 57 57 48 48 48 59 59 68 68 59 59 54 54 50 57 50 54 50 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52
57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 59 59 59 59 57 57 57 52 57 57 38 38 57 57 68 59 59
57 57 57 59 59 59 59 57 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 44 44 57 57 59 59 57 57 59 57 57 57 59 59 68 59 59 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59
57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 44 44 59 59 57 68 68 68 68 57 57 54 48 59 59 59 59 59 59 34 24 12 12 15
32 32 57 57 44 48 48 48 54 54 54 68 57 57 57 57 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 53 53 59 59 59 59 59 31 31 22 22 11 10 10 17 17
23 14 13 15 12 9 10 13 14 14 14 17 12 7 7 3 0 3 25 29 47 30 30 17 17 17 30 24 31 25 28 14 13 11 11 11 16 16 23 19 11 9 9 9 9 9 11 17 16 11
12 18 24 34 39 50 53 53 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 44 48 43 43 43 43 48 48 48 48 48 48 54 54 54 59 59 57 50 50 48 48 48 48 48 48 57 44 44 37
36 43 44 44 48 59 44 57 57 57 48 48 57 42 30 20 20 20 36 42 43 43 43 43 43 47 47 59 59 48 48 48 48 57 41 41 41 41 41 32 28 30 30 28 28 13 13 13 28 28
59 59 47 59 32 32 30 30 30 39 30 30 15 15 15 24 24 27 26 33 28 20 20 15 12 14 23 23 22 18 19 19 15 16 16 25 25 24 19 18 17 23 28 28 20 23 12 13 21 28
34 43 47 34 28 23 23 23 21 18 14 15 15 32 24 34 33 39 37 34 34 20 20 28 21 13 13 10 10 10 10 24 30 30 30 27 27 17 24 17 24 23 28 31 24 23 25 19 25 25
17 15 10 10 10 13 12 12 10 13 9 19 15 16 17 10 10 10 10 15 13 18 15 24 24 37 37 33 33 25 25 28 24 16 10 10 10 12 15 16 16 12 10 10 10 10 13 13 17 17
15 16 10 10 10 17 15 19 12 10 9 9 9 9 7 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 11 15 13 9 9 9 9 9 9 11 11 11 9 11 11 13 11 11 11 11 10 11 11
13 9 11 9 9 9 10 11 13 12 12 8 10 10 8 8 8 8 10 8 10 6 6 8 8 8 6 6 6 6 11 12 12 18 21 28 24 25 19 8 8 8 8 8 10 15 11 12 12 12
8 8 6 6 8 8 13 8 8 8 8 9 9 11 12 13 8 8 18 12 9 9 10 8 8 8 10 11 11 11 11 14 17 19 11 10 10 8 8 8 6 6 10 8 8 6 7 8 10 10
8 9 10 10 10 9 9 9 9 8 10 8 8 8 6 6 8 10 11 11 11 12 10 10 12 10 10 10 8 8 8 6 8 8 8 8 10 11 11 15 10 8 11 13 15 12 12 12 11 8
8 8 8 10 10 11 13 8 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 7 6 8 8 9 10 10 10 13 10 12 19 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 15 13 8
8 8 8 8 8 13 12 14 11 11 17 8 10 6 6 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 11 11 8 8 6 8 10 8 15 12 8 8
8 7 8 7 9 8 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 15 15 18 18 22 28 26 16 11 11 8 8 8 8 8 8 12 13 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 10 10 10
10 11 10 10 10 11 13 19 15 19 10 11 8 8 8 8 8 8 12 15 12 8 13 12 8 8 8 10 8 8 8 6 7 8 8 13 11 9 10 12 11 10 10 8 6 7 8 8 10 13
13 8 8 8 11 8 8 10 9 10 10 10 10 11 11 11 10 10 9 8 8 8 8 9 9 10 11 12 12 18 15 11 9 9 17 12 9 6 6 6 6 8 8 11 13 10 11 13 12 12
8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 9 9 9 8 6 6 6 8 8 10 7 6 8 8 10 16 15 15 10 13 13 16 12 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 11 9 9 3 0 3
8 8 8 9 16 12 11 9 8 8 8 8 10 13 10 10 9 9 10 15 17 11 11 11 8 6 6 6 8 6 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 10 9 9 9 9
|