BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-393M05.T7 (MSMg01no393_m05.b1) | MSMg01-393M05.TJ (MSMg01no393_m05.g1) |
ACC | AG494980 | AG494981 |
length | 773 | 1,175 |
length of high quality (start - end) | 473 (60 - 532) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no393_m05.b1 PHD_FILE: MSMg01no393_m05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:38:51 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no393_m05.g1 PHD_FILE: MSMg01no393_m05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:38:51 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCGAGGATCCGCGGAATTCCTTAAG
GATTACCTTGGAGTGGTAGCTGGAGGCACAGTCTTTGGGGCTTGCTTATC
CTAAAACTTGAGAGATGATGGGGGAAACCCATCATTCCACCTATGGTGAT
GGAGGATTCTTGGTTTGCTACTATCAGGCAAAGAGAAAAGAACAAAGACA
GAAAAGAGGGAGAAAGAATCTATCGAATGCCTGTAAGCATAAAGAAGCAA
AGCAAGCCCAGAGCTTTGACTAGGCACTCTGCATTGTTGGGATGGGATGA
CATATTGGCATATATGAGAGTGGTCGGACATGGGAGTTAAGCGTGAGAAG
AGCTGTGGTGGGTTCAGCCTGGGGTGTTGCTGAGTTTGGAAGGACCAGGG
GCATGTACATAAAAGGCTAGGATAAAATCTTCCAGATGCCAGAGAGACAG
GAAGCTCTTCCCTGATGTCAGGGATCTGTTCTAAAAGACAGCAGGATTCA
AGAGTTTCCAAACCCCACGGCATCCTTTTTCCTATGGTCACAGCGTTAGC
TCTGGTCTCATTTTATAGCCATCCATCCTTTTACTTTATACTAACAACAT
TTTTTTCCCATCTGCCAAGGAGGCTTGATTATTCCTTTATTTCAAAAGCA
TCTCTGAACTCCCGGACCCCAGCGAACCTTGACTGGGACACCATCTTACC
TCAATTTATCTTTCACTATCATATTCTTTACATTCGTTTGTTCCTTTCTC
TCCCCTTCCCCATATTTATTTTN
| TATTTCTATTTTATATTCCTCTGTTTATACCATCTTCTGGTCTGCCCTCT
CTCTCCACCTTCTTCCCCTATCTCCTCATTTACCACATAATCTCTACATC
CGACTAAATACACATAATCCCATCACCTATCATCATTCATTTTACAGCCT
CACACCCTTGACGCCTCTCCCTCTATTCCTCCCTCTATCACCTCTCTTCC
TTTAATCTCTTCCCCTCGCCGTATCCTTCGCCTTCGTCGCCGTTCCTTAC
GTTTCGCCAGTTCATTCGCGTCGCTCCTTCTCTTACATCTCANCTCCACC
CTACTTATTCACCACTATCTCAACTCTACCAATATATCCCCTACCTAATA
TTATTACATGTTNACTTATTTCCTCTAATATCTCTATCTCTTCTTNTACT
TCCTTTCTCTGCTTTCTTTTCACCTCACTTTTATATTTCGTTATATTCTC
CTTATTCTATCTATACACTCTCCTTTCTATTCTCTCATCTCACTTTCATT
TCTTAATCTAAACTCTCTTGCCCATCCTATGTTCTTACCTTCTCTATTCA
CTCTCTTTCTACTCACTTATCCATCTTCATTTCCACAACTATCCTATCAC
ATCTCTCCCTATTTCCTCCTCCTCCTCATTCTCTATTTATTTTCTGTCAT
AAATTTTCCTTTCACCCACCTCTATTATCCTTCATTAAGCGCCCTTCATT
TTTTCCTTATTCTTTTCATTCCACCATTCACTCTCCTTGCTATTCTTCGA
CAACTTCTACTACACCTTATATTACTATTACAATATCTCACATCCTCTAT
CATCTATGTCTATACTTCCATACACACAATTTATCAGCACCTTCCAAATC
CATTATCCTCACCCATATTTCTACTAAATATATATACTACCATACCGATA
ATCATATACACATACTCTAATACATTAATACATATTCATAACCACAAATC
ACGACCACCTAATACACCACCACTCTATACTCTAATACCTCATAACTCCA
TTCTTACATATCACACTCAACATCTCTACACTGACTCACACTATATTATA
CGTCATACTACACACTATCATANTCACACCATCCTTCTCAATGATACCTC
TCTCGCTCAATCTCATCTCACTACCACCACCACTATTCTCCATCTCTCTA
TTNTACTTCCATTAATCAAACACTA
|
quality values | Open.Hide.12 14 15 12 15 19 9 9 10 19 19 30 44 48 33 33 33 33 33 33 28 27 18 10 10 12 9 9 9 13 13 10 10 10 21 25 47 59 33 33 33 33 37 30 39 39 39 39 21 25
11 10 8 8 8 8 10 15 15 16 23 32 37 33 37 47 47 50 50 57 57 57 57 57 53 57 57 57 57 50 50 50 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
54 57 54 57 57 54 57 57 57 57 59 57 57 57 57 47 46 50 50 46 50 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 47 48 50 50 57 50 57 57 59 57 57 29 23 35 30
29 29 52 30 46 32 33 33 46 50 44 43 44 44 38 47 43 52 52 59 59 54 52 50 59 50 52 52 41 43 29 29 38 44 44 42 35 31 31 43 43 50 57 57 57 57 50 50 37 37
37 50 43 52 57 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 50 50 50 50 50 51 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 54 57 43 47 41 41 41
43 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 57 57 57 44 44 35 35 35 59 59 68 68 68 59 59 54 54 48 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 44 39 39
39 39 39 59 39 37 35 43 37 37 30 25 20 12 11 11 12 16 18 30 30 37 41 41 59 59 43 48 48 48 43 43 43 43 48 48 57 57 59 48 48 48 48 48 48 57 54 54 54 57
57 57 57 48 48 43 48 59 48 43 43 43 37 37 40 37 43 43 37 44 41 44 48 48 48 48 48 47 57 44 42 47 42 37 37 37 47 43 42 42 42 37 37 44 37 37 35 33 28 27
26 33 36 47 47 42 32 27 20 15 21 21 21 30 42 32 39 37 43 43 44 39 37 32 30 30 44 42 48 54 44 44 37 35 35 42 39 43 43 43 47 43 43 43 40 34 34 23 23 23
28 24 28 23 33 33 37 28 32 23 20 20 20 28 20 32 28 41 41 34 28 14 12 12 19 19 23 24 24 28 32 32 25 24 24 28 28 25 25 25 23 28 28 13 10 10 16 19 16 22
25 22 28 28 30 26 26 27 21 18 15 14 17 21 28 20 20 20 23 24 24 30 30 33 47 39 39 34 25 30 14 14 14 16 19 13 12 9 9 15 13 15 12 18 13 8 8 8 9 10
13 23 19 12 8 8 8 8 10 10 10 19 17 24 17 24 18 15 15 15 15 13 17 10 10 10 15 15 20 21 16 11 11 10 11 17 9 9 9 9 10 13 10 10 10 8 8 8 8 10
22 11 10 8 10 8 11 16 13 19 22 9 8 8 9 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 13 8 9 9 15 14 15 14 19 13 15 11 11 11 12 16 12 12 11 11 10 10 10 13
13 13 15 13 14 13 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 12 18 9 11 11 11 11 12 11 8 8 6 8 6 6 8 6 9 8 12 10 8 8 8 8 14 13 11 10 10 13 16
10 10 9 10 8 8 7 6 8 8 12 12 12 11 11 11 10 10 8 10 10 8 9 8 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 13 10 8 8 6 6 9 9 19 3 0 | Open.Hide. 9 9 10 9 7 8 7 6 6 6 9 10 10 10 12 10 9 9 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8
10 13 14 12 12 8 10 10 10 10 10 9 9 9 9 12 12 15 21 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 6 6 7 8 6 6 6 8 10 10 12 10 10 8 8 8 8 8 6 6
6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 9 11 11 11 11 10 8 11 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 7 7 12 9 7 7 6 11 11 11 8 8 7 6 8 6 6 6 6 6
6 6 8 9 9 10 11 17 16 13 8 8 6 6 6 6 8 6 7 6 6 8 6 6 8 8 7 7 8 8 10 10 17 19 13 8 8 8 8 8 8 9 11 8 8 6 6 6 6 10
10 13 9 8 6 6 6 6 8 8 6 7 10 8 10 9 9 9 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 9 11 10 10 9 10 8 8 7 7 6 6 6 8 10 10 8 8 6 6
8 8 10 10 9 6 8 6 6 6 8 12 15 16 8 8 7 8 8 11 8 8 8 10 17 14 9 9 8 10 8 6 6 8 6 9 9 10 19 13 8 3 0 3 8 10 16 21 19 13
19 9 9 8 9 8 8 8 11 11 9 7 7 6 6 8 6 7 9 9 8 9 9 9 10 9 10 9 9 9 9 9 8 11 8 8 8 8 9 9 8 8 7 7 12 12 10 8 8 6
6 6 8 9 8 12 8 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 6 10 7 7 10 11 6 6 6 6 8 8 8 10 10 9 9 11 11 13 9 9 9 9 8 10 3 0 3 8 6 8
8 8 6 6 8 8 8 7 7 9 9 9 10 12 21 31 23 18 10 12 6 9 9 7 8 8 8 8 10 15 10 13 8 9 9 9 9 9 10 8 10 8 8 8 8 8 8 10 11 12
12 10 8 8 10 10 10 10 10 9 12 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 10 12 9 9 12 10 10 9 10 9 9 9 9 13 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 10
10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 9 10 8 6 6 6 6 7 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 14 12 6 6 6 6 8 8 12 14 10 10 9 12 13 13 9 9
10 10 10 8 10 8 10 7 8 8 9 8 8 10 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 10 10 9 9 9 10 10 10 6 7 6 6 6 6 8 11 8 10 9 9 9 8 8 8 8
8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 10 9 13 11 15 15 9 9 8 8 11 12 15 12 12 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 7 8 8 8
8 8 9 9 12 15 10 8 8 8 12 12 10 10 10 11 15 10 8 8 8 10 12 7 9 10 6 8 8 8 6 10 6 6 8 8 8 7 7 9 9 9 13 16 18 18 11 10 9 9
11 11 11 6 6 6 6 8 8 9 9 9 10 17 11 8 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 8 8 10 13 15 10 13 9 9 9 10 9 9 9 9 9 9 8 10 8 7 9 6 6
6 6 8 8 8 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 11 12 13 17 15 15 11 10 10 10 12 11 13 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 10 8 6 6 10
8 11 9 8 6 6 6 6 6 10 17 21 13 12 8 8 8 11 16 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 15 15 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 15
10 10 10 13 15 10 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 9 12 7 8 7 6 6 10 6 6 8 12 8 8 8 8 12 8 7 7 10 10 8 8 8 8 10 10 10 10 8
7 6 8 6 8 6 8 8 7 8 10 8 8 9 10 12 13 9 7 10 8 6 6 10 10 8 9 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 10 7 7 10 8 10 11 11
11 11 10 6 6 7 6 7 7 8 8 8 10 7 6 6 6 7 7 13 9 10 10 15 10 12 7 6 6 6 8 8 8 8 10 13 9 9 9 9 7 8 12 10 10 10 10 10 10 11
11 11 8 8 8 9 10 8 8 8 8 13 8 7 7 10 10 9 7 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 13 10 8 8 13 15 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 9 7
9 9 6 6 6 8 8 10 9 9 8 8 8 8 9 8 8 8 7 8 8 3 0 3 8 6 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 12 16 9 9 6 6 6 7 6 6 8
8 7 8 7 7 7 8 7 9 9 9 9 19 10 10 10 15 13 6 6 8 8 6 6 6 6 12 10 8 8 8 8 11 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 8 6 6 6 7
9 3 0 3 6 6 7 7 12 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 |