BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-397G01.T7 (MSMg01no397_g01.b1) | MSMg01-397G01.TJ (MSMg01no397_g01.g1) |
ACC | AG497732 | AG497733 |
length | 780 | 813 |
length of high quality (start - end) | 398 (44 - 441) | 244 (77 - 320) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no397_g01.b1 PHD_FILE: MSMg01no397_g01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:09:47 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no397_g01.g1 PHD_FILE: MSMg01no397_g01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:09:48 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCTTAAGTTACCAGGTGCTGGTTTACATCCAATAGCCTCACAGCAATTC
TCAGGGCTACATCTAGAGAAGTGATCTAGGGTCTAAATTAATAAACATCA
CCAGACTCTCCCCCTCCAAAGAAGCCACAGACAGATGCTAATAGGCTAAT
TTACAGCGATGTAAAGTGCTGCCATTCACTAGTTTTGCCCTGTAGAAGTT
CAGGGGGGTTTCCTCAGTCAAGTGACCAGACCTTGAGAGTTGATTTATAC
TCCCAAGTGAATGTTACATCTCATCATTTAAATCCTCAGGGCCCTTGGGA
TGGCCATGACTGTGGCATGTCTTGTCCTAGTTAAATCATCCCTCCTGCCT
GGTTAACCCTGCCCACTAAGCACAACACGCAAGACAGAGTAAGATAGAGA
TAAGGCAGACCGACTAATTTAACTGCCCGAAGCACTTGCATAGAGGTAGG
AACTTCGGTTCTACTGTCAATGACGTTGTCTCAATCCCTCTGCTCCGCCT
CGTTGTGCCTCATTCCTTTTTCTGTTTCTACCATTCCCTCCCCTTGTGCC
CCCCTCCCGCCTACATAGCTTTGCCATTCTCCTTACATCCAAACTCTTAT
CCCCCCATCCTCCCTCCTTTCTTCTGCCCTCTTCATCACTTTTCCCCTTC
TATAATCCCTCTCTTCCGTATTACTTCCCGCCTGTCATCCCTTTACCTTT
TTTTTCCCTTTCTCTCCATCCTTTTCTCCN
| GATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAAGCCAGCCAGGGACACATAATG
AAACCCTGTCTCAAAAAAATAATTAATTAATTAACTAATTAATCGTTAAA
GGACTTAGAAAATGTCTGATGTGCGTTATGTAGTGGTTAAATTTGGCTGT
CACTCCTGTGTCAGTGTGTCCTGGGACAAGAGAGGATCTACCTAGGAGTA
GGTTGTAGTAACCAAGGGGAGATGGTTTAGCCAGCTCGTTTTCCAGGAGT
CTGGGTGGCAGTCTCTACTCCTTCTTCAGGCAGTCTCTGTAACCCCACCC
TCCATTCTCCTGTCTCCATGACTCAGTGGTCCTTCGGCCTCTCCAGCCCC
CAGCCTGTCTTGTCCAGCTCTTACTCTTTGATGCTTAGTTCCGCTCCCCC
TCTCGATAGACAGCCTTGTTTTCTTATTTCCCCCTCTCCCCTCCCCCTCT
GTTTCCCGCCCCCCTTTTTCCTTCTCATCTTCTCTTCTTCTTCTACTTTC
TTCTTTCTTCTAAATTATCCCTTTATTCTTCTCCTTTTTTTTATCTCCTC
CCCTTTTTCTCTTTCCTCCTCCTCTTTTTATTTTCCACACCCTGCTCTAC
CTCTTCCCTCTTTTTTTTTCTTCCCCCTCTCTCCCCCGTCCCTTCCCTTC
TTTTTCTTCTCCTCTAATCCCTTTTCCCCCTCTTCTCTCATCTCCATCTC
CCCCCCCCCCACTTTCCTTTTCTTTTTTTCTCCCTCGCCCTCTCTTTTTA
TATTTCTCTTATG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 8 19 21 39 37 37 37 37 37 36 43 22 30 13 13 11 21 19 9 8 8 12 11 11 8 17 8 9 9 8 8 8 12 12 22 21 28 30 33 33 39 44 41 35 30 28
28 33 33 59 59 59 41 23 19 11 8 8 8 8 8 8 12 14 28 28 39 39 43 48 36 36 36 36 36 36 42 43 50 50 59 59 59 48 57 47 47 47 48 48 50 54 68 68 57 53
50 50 48 50 50 68 68 50 50 43 43 41 48 46 43 43 44 46 46 48 48 47 41 41 50 50 46 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 57 57 57
54 57 54 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 52 52 52 52 57 59 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 62 62 62 62 43 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 43 43 35 35 27 43 43 35 35 43 44 59 54 50 50 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 52 52 46 44 43 43 37
43 43 32 44 33 43 43 43 43 43 43 32 30 18 14 14 18 32 36 35 35 37 42 35 30 28 37 32 27 18 24 24 44 44 57 57 44 44 37 37 37 37 39 43 36 36 36 36 43 59
47 47 47 39 43 36 43 43 44 57 48 48 48 42 42 32 32 30 30 28 25 28 29 29 28 28 24 22 22 22 23 20 28 28 22 22 28 22 18 12 10 10 8 8 8 8 10 10 20 20
15 18 13 14 14 18 19 14 11 11 11 15 10 10 10 10 11 14 16 16 17 16 24 24 19 19 18 16 15 21 16 15 13 15 15 12 10 10 10 10 10 10 11 10 13 13 10 10 11 12
12 14 12 10 10 10 10 10 8 8 8 8 9 8 10 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 12 9 10 12 15 15 15 13 13 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10
13 9 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 12 19 22 18 16 11 11 11 12 10 10 8 10 10 10 10 10 8 8 8 13 8 9 10 10 10 10 11 8 8 8 10 10 15
15 16 11 12 10 9 8 10 10 10 10 9 9 9 9 8 8 8 8 10 12 10 10 10 8 9 8 9 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8
8 9 12 10 12 8 8 6 7 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 14 13 10 10 9 9 10 10 8 8 8 10 11 12 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 13 11 11 8 11 8 8
8 6 8 8 8 10 8 8 8 10 12 14 10 14 8 8 6 8 8 8 9 9 9 9 11 11 12 8 6 6 8 12 10 10 10 10 9 9 12 12 22 10 10 8 7 8 8 8 12 12
10 10 8 9 8 10 12 10 10 12 16 16 21 18 12 12 9 9 9 13 15 13 12 11 11 12 12 13 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 6 6 8 13 17 29 32 37 41 41 41 37 37 43 39 39 39 39 37 32 32 37 34 25 25 11 11 9 9 9 9 15 17 22 22 22 33 27 44 48 50 53 53 53 53
50 50 50 53 53 53 53 35 27 15 9 9 10 10 10 24 24 36 36 40 29 41 42 42 41 42 41 41 41 50 50 50 50 50 50 68 68 50 48 48 48 48 48 68 68 68 68 68 68 68
68 57 59 57 59 57 57 59 59 51 51 51 50 50 68 68 57 51 50 50 50 50 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 57 57 57 59 59
57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 54 54
59 59 68 68 59 59 59 52 52 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 50 50 50 57 57 43 43 43 50 50 50 50 50 57 57 57 57 59 59 57 68 68 57 57 43
43 43 47 47 46 59 43 43 43 46 48 46 39 39 39 47 44 47 47 47 47 42 43 39 37 37 39 44 35 35 35 42 42 48 48 46 57 43 43 44 43 42 39 39 36 36 39 43 59 59
59 59 47 32 32 20 20 20 32 28 36 39 47 41 30 26 10 8 8 8 8 9 11 11 12 22 15 14 8 8 15 17 22 24 33 33 47 30 30 17 17 19 32 37 47 35 35 28 43 37
39 39 42 43 57 57 43 48 48 43 43 43 43 48 48 48 43 43 43 43 46 32 27 15 11 11 11 12 11 11 11 12 16 11 11 11 11 15 15 22 20 17 16 15 11 9 9 10 10 10
10 13 15 13 16 12 18 18 21 16 14 15 15 13 10 10 13 8 8 13 8 8 8 9 9 10 10 10 10 12 15 15 12 12 11 10 10 10 10 10 11 11 13 16 18 16 12 10 10 12
8 8 8 8 8 8 13 11 11 10 9 9 8 8 10 8 8 8 8 14 9 9 8 10 8 10 10 13 13 15 11 15 12 12 11 11 12 12 12 10 10 10 10 10 16 21 12 9 9 8
8 8 16 16 8 8 6 6 6 8 9 8 8 10 10 12 12 9 9 10 8 13 7 7 10 8 9 9 9 9 9 10 10 10 19 26 10 8 8 8 8 12 8 8 8 8 10 8 10 10
10 10 10 12 12 13 13 26 18 16 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 12 18 13 11 9 9 10 9 11 18 21 19 10 10 10 10 14 18 18 13 10 8 8 8 8 8 10 11 7 6
8 8 12 13 10 11 11 13 19 16 22 14 13 9 10 10 10 10 8 8 10 10 11 8 9 10 10 8 8 6 6 7 7 9 11 9 12 12 12 10 10 10 8 8 8 10 10 8 7 7
7 7 9 13 15 15 13 11 8 8 8 10 8 11 13 11 10 9 9 7 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 11 11 9 9 9 9 8 8 10 10 9 9 12 12 10 10 10 10 8 8
8 8 11 8 8 13 12 14 10 16 13 11 11 11 10 10 10 10 10 15 14 16 12 10 10 10 10 10 19 8 8 8 6 10 6 6 8 8 8 9 8 10 12 14 8 6 6 10 8 10
12 24 15 15 20 29 34 23 23 11 9 9 8 8 7 7 10 8 8 6 6 8 6 6 10 13 8 10 10 9 9 10 10 10 10 9 9 10 12 17 22 13 13 10 9 11 8 15 10 11
10 10 10 11 8 10 13 13 12 10 7 7 7 |