BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-474L21.T7 (MSMg01no474_l21.b1) | MSMg01-474L21.TJ (MSMg01no474_l21.g1) |
ACC | AG556732 | AG556733 |
length | 750 | 750 |
length of high quality (start - end) | 487 (77 - 563) | 236 (327 - 562) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no474_l21.b1 PHD_FILE: MSMg01no474_l21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:53:18 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no474_l21.g1 PHD_FILE: MSMg01no474_l21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:53:18 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NTTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAGAGAACCCGC
GGAATTCAGAACTCTTTCCCTGGACAACAGGGTACCCGTAAGTATAGCTT
TACAAGGTAAGTCTGGTCTTGAACTTTCTAACGAAATTCAAGACAGTCTA
TCAGAAGTAAAGTGGGAAATAGCTTTACAAGGTATGTTTGGCCTTGGACT
TTCTCTAGTGTTAGGAGCCTTTTTGTTCCTTTTCACATGTTATCAAGTGG
TTAAGGCAGGGCTGAAAATTCTGGATGAAATTCAGGGCAATCTATCAGAA
GTAAAGCGGGGAGAGAGAGTAGGATTTTATGAGGAAATATGGTTCACAAA
ATAAGTATATAGGCCTTTCCACGGGTCTTGAACCCGAGGAAAAGTTTAGG
TCAGGTAAGAATACCTGGGGAGAGATTGGAAGGAAGGAGAAGGAAAAAGA
AAAGAAAAAAGATCAATCAGCGGAGGGTTCTAGGAGAAGGAGCCTATACT
CATCACTAGATGAGCTCAAGGAGCCAGTTCTTAATAGTTCTGAATCAGAT
GAAAAGGCTATTAGGGCCTGGAAGGCGCTCTCCCGAGCAGGTGAAACCAC
TGGACAACTAACAAAGATCGTCCCGAGAACGCAGGAAACCCTCTCAGATT
TTGTGTCCGAATGGCCGAGGCCCCACAACGATTTTTTGTGAATCACAAAC
AGCCCCACCTCCGTGAAAAAAATTTATTTTTGAAACCCCCCCCCCCAAAG
| NCGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXCAGAAATTCTCACTTGTTGATGAAAGGTAAGATTAC
ACACCTGGCACTGGCTGCTTGGCTGACTGCAGTGAAGCAGCGCTTTGCTC
TGGCCCTTTCTAAATGTGTTTGTTATGTTGGCTTACACAGAGGTGCTATT
CACGGCGGTGCTGAGCCTCCTTCTCGCTTGCTATGGACGGGTGCCGGAGC
CTGGTCTAAAGTAGATTTGAGTCTCCTGGGAACTCCACCCTGAATGTGGA
CACGTTGGCTAATATTTTATATTTTAGTAAACATCAGGTGCCTTTTGTTG
TCTAAAACCAAAGACACACAAGGGAATGAGAGAAGGAAAGAGTCCAGGCA
GGTGAGCCCCTCATGGGTGGGACCGGGTATCTCTGTGTGCAATTGGCATC
TAGGCAGGTCACCGATCTTGGTTTCTACCAATCACCATGAGCTGCCCTAT
GCCCCAGGTAAGGAGATGCTGGCTCTGAAGGTCTTGGGACTATCTGGAAA
TACCCATAAGCCCACCTGTGTCCCTGAAGAACTTACCTGCCTCTTGGTAA
CTTCCTGTGAACTGCCACCGAGGCTTTCCTCTGAACTCCAGCCCTCTATC
TCCAGTCCCACAGGAAACCTCCAACAAAATTTCCCCCTTAAAAAGGCTTT
TACCTTTTTCAAAAGTTCAATCTCCTCTCCACCCAAGGGATTCCCTGCCN
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 8 11 13 18 30 39 22 21 10 10 10 21 28 30 26 24 35 25 30 39 46 28 28 28 28 25 21 21 10 9 9 12 9 9 9 9 6 6 6 6 8 12 13 25
25 30 31 31 31 31 31 31 31 31 25 25 16 18 8 7 6 6 6 7 11 8 8 6 6 6 15 19 37 37 37 46 50 50 50 53 53 59 57 57 57 57 57 53 53 53 53 59 57 59
47 47 40 40 40 47 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 44 44 48 48 48 48 47 47 48 48 57 57 59 59 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 50 50 50 54 50 50 50 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 44 47 35 33 33 35 33 42 44 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57
57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 53 59 59 59 59 41 30 18 12 11 12 14 8 8 8 8 8 8 8 16 30 36 47 50 50 50 53 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 48 48 48 59 59 57 57 54 54 46 46 43 46 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59
48 48 48 59 59 59 59 59 68 57 48 43 42 36 36 47 47 46 43 43 59 59 59 57 50 50 23 23 11 12 12 28 25 40 39 39 39 41 37 37 41 41 37 34 41 41 41 43 47 47
40 40 40 43 43 39 39 39 43 36 39 39 40 39 37 43 36 31 31 39 29 37 32 29 29 32 35 29 27 32 27 25 25 22 32 27 27 23 22 28 34 35 31 31 34 31 19 19 11 11
8 9 9 11 17 18 31 35 36 37 21 21 13 13 12 22 15 15 17 14 14 24 17 21 13 13 12 19 16 23 23 18 22 20 20 12 11 10 13 12 14 14 13 9 8 9 9 9 10 16
31 19 17 14 12 12 12 12 10 10 10 9 9 15 10 10 9 14 14 10 9 9 12 10 10 10 10 10 11 10 10 10 10 10 11 10 9 9 9 9 9 11 10 10 9 9 9 9 11 11
8 6 6 6 6 6 10 11 11 6 7 6 6 6 6 10 13 11 12 11 10 12 10 8 6 6 7 6 9 9 10 8 8 9 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6
6 10 8 9 7 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 16 10 11 11 22 11 12 8 8 6 6 6 6 8 10 9 9 18 23 24 11 10 10 9 9 9 9
| Open.Hide. 0 3 6 6 10 12 11 9 9 23 3 0 3 9 12 14 43 43 44 41 41 39 39 44 39 39 43 43 39 25 25 9 7 7 7 10 7 9 9 12 11 11 11 16 22 25 23 11 11 11
21 21 50 50 50 42 30 25 16 8 6 6 6 6 6 7 7 10 10 15 15 28 29 33 37 37 47 47 57 57 59 53 53 53 53 53 53 59 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 47 51
51 51 51 68 51 68 68 68 68 68 68 68 68 48 48 43 46 47 57 57 43 43 43 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 44
44 24 12 10 10 10 21 23 59 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 53 50 50 50 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 53 53 50 50 50 50 47 30 36 16 18 11 12 12 16 12 13 11 11 19 27 41 50 50 50 50 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 68 59 43 39 39 32 35 35 37 43 46 43 47 43 46 43 48 46 48 59 54 54 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68
68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 57 47 47 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59
57 48 57 57 48 48 54 59 48 42 48 48 48 48 57 57 48 57 57 48 48 48 43 44 43 48 48 43 43 40 40 59 47 48 48 59 48 46 46 46 41 39 39 39 34 34 39 43 47 39
39 34 34 37 37 38 37 37 39 39 41 31 31 31 31 28 34 34 39 37 30 30 32 37 37 39 32 29 25 25 25 32 30 37 32 31 24 26 14 24 24 35 39 37 37 22 24 26 26 25
25 30 24 24 28 32 22 21 11 11 11 15 11 13 13 21 28 18 18 17 26 20 30 13 17 13 9 8 8 8 8 8 13 21 14 14 14 23 23 26 18 19 19 18 12 16 12 12 11 12
12 12 11 10 10 9 9 9 9 13 9 9 9 10 9 10 9 9 9 8 8 8 8 8 12 19 9 9 9 9 9 13 13 17 12 11 11 14 12 10 10 8 8 8 6 8 8 8 8 8
8 9 9 8 7 8 8 9 10 10 10 10 10 15 17 22 21 17 13 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 11 14 16 15 18 15 20 10 9 9 13 10 10 8 8 8 10 9 10 9 8
8 8 8 8 8 8 10 10 11 12 13 10 8 8 8 8 8 8 8 10 7 8 8 6 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 11 11 12 10 9 9 8 8 8 10 10 8 8 8 3 0
|