BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-007N18
Chromosome18 (Build37)
Map Location 31,581,055 - 31,582,191
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC666100, EG666111, EG666114, LOC433168, Rit2, EG666130
Downstream geneSyt4, LOC383420, Slc25a46, Sap130, LOC640549, Ammecr1l, Polr2d, EG626327, Wdr33, Sft2d3, Lims2, Gpr17, Myo7b, Iws1, Proc, LOC546710, Map3k2, Ercc3, Bin1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-007N18.b
ACCDH844306
length1,105
definitionDH844306|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007N18, 5' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattctatgtatcctgtcaatactaaaaggtcttgaaaaccagataagc
atgcctattgatgtggtccttgttccagtctttttaaggcagccatgttg
atgaaactttatgggcatagcttctctgacatttctaggaaataccatct
ccaagaaaatgtcctgttcctctcactcatgcaatctttcctccctctca
ttcacaatgatccatgagccttaggtgtaggcatagtgctgtagatgtgt
cggttgggacaaggtatcacataatctcttgttctctgcatttaacctgt
gttgggtttttgtaatgtcctctaccagttacagagaactatacttatct
gtgggtttaagataaatgcttagaatattgctagagattatgcttgttta
gtaaagtggctgttgtagattctcctttaaaatctaggactttattagca
ctgagtagtcagctaggtttttagtactaggaatggtttttgtcttgttg
aatggcccttaagttcaactaaacatctgttgattgctgccaaagatgca
tgccactattgtacccttcaggttctcatgctgttctagtcattgttgtg
tttcataggcagcatagctggatagaactggtggtagcttccctccacca
gaaggttgcatggcatcttctggtactacaaaagctaatcctcatggaag
aagcattcttgtctattccaggtaaggtactctgggtcctaggtcacctt
cagcaatagggacttaccttccacctctaggaggcaagtgagagcaataa
tctaatcctaatttggtcagacaacttcgtacaactaattcattcaacaa
ctttacctactgggtctcaaagcccatatcgagcactcttttagtcttta
gtatatcccatacatatattgtgaagataattgattatgtgactgggagc
agccatgagactcactctttctcagctcaaacttggtgactttgagctcc
tcataatgtacatatttttatcaaaacatttgcttaacatcagcactgct
gtactgtgagaactcctgttagaggagcctacccaattggccattccctt
ctgag
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_31581055_31582191
seq2: B6Ng01-007N18.b_47_1151

seq1  GAATTCTATGTATCCTGTCAATACTAAAAGGTCTTGAAAACCAGATAAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATGTATCCTGTCAATACTAAAAGGTCTTGAAAACCAGATAAGC  50

seq1  ATGCCTATTGATGTGGTCCTTGTTCCAGTCTTTTTAAGGCAGCCATGTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTATTGATGTGGTCCTTGTTCCAGTCTTTTTAAGGCAGCCATGTTG  100

seq1  ATGAAACTTTATGGGCATAGCTTCTCTGACATTTCTAGGAAATACCATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAACTTTATGGGCATAGCTTCTCTGACATTTCTAGGAAATACCATCT  150

seq1  CCAAGAAAATGTCCTGTTCCTCTCACTCATGCAATCTTTCCTCCCTCTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAAAATGTCCTGTTCCTCTCACTCATGCAATCTTTCCTCCCTCTCA  200

seq1  TTCACAATGATCCATGAGCCTTAGGTGTAGGCATAGTGCTGTAGATGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAATGATCCATGAGCCTTAGGTGTAGGCATAGTGCTGTAGATGTGT  250

seq1  CGGTTGGGACAAGGTATCACATAATCTCTTGTTCTCTGCATTTAACCTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTTGGGACAAGGTATCACATAATCTCTTGTTCTCTGCATTTAACCTGT  300

seq1  GTTGGGTTTTTGTAATGTCCTCTACCAGTTACAGAGAACTATACTTATCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGGTTTTTGTAATGTCCTCTACCAGTTACAGAGAACTATACTTATCT  350

seq1  GTGGGTTTAAGATAAATGCTTAGAATATTGCTAGAGATTATGCTTGTTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTTTAAGATAAATGCTTAGAATATTGCTAGAGATTATGCTTGTTTA  400

seq1  GTAAAGTGGCTGTTGTAGATTCTCCTTTAAAATCTAGGACTTTATTAGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGTGGCTGTTGTAGATTCTCCTTTAAAATCTAGGACTTTATTAGCA  450

seq1  CTGAGTAGTCAGCTAGGTTTTTAGTACTAGGAATGGTTTTTGTCTTGTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTAGTCAGCTAGGTTTTTAGTACTAGGAATGGTTTTTGTCTTGTTG  500

seq1  AATGGCCCTTAAGTTCAACTAAACATCTGTTGATTGCTGCCAAAGATGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGCCCTTAAGTTCAACTAAACATCTGTTGATTGCTGCCAAAGATGCA  550

seq1  TGCCACTATTGTACCCTTCAGGTTCTCATGCTGTTCTAGTCATTGTTGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACTATTGTACCCTTCAGGTTCTCATGCTGTTCTAGTCATTGTTGTG  600

seq1  TTTCATAGGCAGCATAGCTGGATAGAACTGGTGGTAGCTTCCCTCCACCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATAGGCAGCATAGCTGGATAGAACTGGTGGTAGCTTCCCTCCACCA  650

seq1  GAAGGTTGCATGGCATCTTCTGGTACTACAAAAGCTAATCCTCATGGAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTTGCATGGCATCTTCTGGTACTACAAAAGCTAATCCTCATGGAAG  700

seq1  AAGCATTCTTGTCTATTCCAGGTAAGGTACTCTGGGTCCTAGGTCACCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATTCTTGTCTATTCCAGGTAAGGTACTCTGGGTCCTAGGTCACCTT  750

seq1  CAGCAATAGGGACTTACCTTCCACCTCTAGGAGGCAAGTGAGAGCAATAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAATAGGGACTTACCTTCCACCTCTAGGAGGCAAGTGAGAGCAATAA  800

seq1  TCTAATCCTAATTTGGTCAGACAACTTCGTACAACTAATTCATTCAACAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATCCTAATTTGGTCAGACAACTTCGTACAACTAATTCATTCAACAA  850

seq1  CTTTACCTACTGGGTCTCAAAGCCCATATCGAGCACTCTTTTAGTTCTTT  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
seq2  CTTTACCTACTGGGTCTCAAAGCCCATATCGAGCACTCTTTTAGT--CTT  898

seq1  TAGTATTATCCCATACATATATTGGTGAAGATAATTGATTATGTGACTGG  950
      ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTA-TATCCCATACATATATT-GTGAAGATAATTGATTATGTGACTGG  946

seq1  GAGCAGCCATGAGAACCTCAACCTCTTTCTCAGGCTCAAACTTGGTGACC  1000
      ||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||| 
seq2  GAGCAGCCATGAGA--CTCA--CTCTTTCTCA-GCTCAAACTTGGTGAC-  990

seq1  TTTGGAGCTCCTCCATAAATGTACATATTTTTTAATCCAAAACATTTGCT  1050
       || |||||||| ||| |||||||||||||||  || |||||||||||||
seq2  -TTTGAGCTCCT-CAT-AATGTACATATTTTT--AT-CAAAACATTTGCT  1034

seq1  ATAACCATCAGCCACCTGCTGTACTGGTGGAGGAAACTCTCTGGTAAGAG  1100
       ||| |||||||   |||||||||||   |||  ||||| || || ||||
seq2  -TAA-CATCAGC--ACTGCTGTACTG--TGAG--AACTC-CT-GTTAGAG  1074

seq1  GCAGCACTACACAAATTGGGCCATTCCTCTTTCTGAG  1137
      | ||| |||| |||  | ||||||||  | |||||||
seq2  G-AGC-CTACCCAA--TTGGCCATTC--CCTTCTGAG  1105