BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-032M19
Chromosome18 (Build37)
Map Location 10,744,889 - 10,899,712
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMib1
Upstream geneColec12, LOC665111, LOC100039787, EG433161, Thoc1, Usp14, Rock1, LOC100039978, LOC635344, LOC435554, AK220484, LOC621832, Esco1, Snrpd1, LOC100039880, Abhd3
Downstream geneLOC665296, 1010001N08Rik, Gata6, LOC665310, LOC100040148, Rbbp8
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-032M19.bB6Ng01-032M19.g
ACCDH862030DH862031
length1,130221
definitionDH862030|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032M19, 5' end.DH862031|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032M19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(10,744,889 - 10,746,035)(10,899,492 - 10,899,712)
sequence
gaattcttccagtcttggcccttgccctgagcagaacttgggcacaaact
ccacagccagccccataacacccagaggaagccctactcacaggtgcttt
aacacacccaggatcacaggaacacaggatcctaggagcttggtcacacc
agaatctcagggtcccagaggcaacttgactcctaggagcttggacatac
ccaggatcaggatcccaggatcccagaatcacagagaaagcttgacaatg
atgacaatcactcaagtcaaatagctttgatcatagcaggaaatctgtat
ccaaataattgtgcctgtaattcattccttgacgcagcagaactgtcaac
acttaacttagctactatacaatcctttggtgatgtgagggacattgaag
tacagccttattacaatgaaatccagtgtctaaaaattgttcttgctttt
ataccacagtaagaaccaagattttcagctttactaaaaacaaaacaaac
aaacaaaaagacattatctttttatgctcatttaataacatctctatcat
ttgttatgattggtagaaaattatatattatgttgaatatagtaataaaa
agaataaaaaaaggagtgggaaaaaaagaatcttaaggcaagtcattgct
acagatggattactgcacattcacttcagctccttataaacttgctagtt
gagattgtacagtggtcatttgggcagaatcctaatgcacagtggagtat
tgttggactaaatttagaaagatggttgcctcttttgagagacggttgga
gggcggctgtgatgaggtgcagtggggacctgagaagtctgggcttcact
ttttaagacagtggaataattataagggtgttcatttcttttttattttt
aaagtatatttctaaagtgtttacaatacataaaaaactttcaaagatgt
atggacttatagtaatttaaagtatttctcatatggttcactaatctaaa
aatgagtccttttatttctaaacagttctttagtcagagcagaaaagaag
ttattatgttatttaaagcagactatagtaatataagctgctttatatgt
atgagtctaatgatcaagtagaacggaaca
aggtcatggtggcaaagacctttacctgctaagccatctcaccagcctaa
gtttgcttttttatgaagtagttattcattcaactctccagatgtgtcta
gttcttgctcttgtgaaaagcctgggctacataggaagaaacctatctca
agaaaagcatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagat
atggtttatatgtgtatatac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_10744889_10746035
seq2: B6Ng01-032M19.b_51_1180

seq1  GAATTCTTCCAGTCTTGGCCCTTGCCCTGAGCAGAACTTGGGCACAAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCAGTCTTGGCCCTTGCCCTGAGCAGAACTTGGGCACAAACT  50

seq1  CCACAGCCAGCCCCATAACACCCAGAGGAAGCCCTACTCACAGGTGCTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGCCAGCCCCATAACACCCAGAGGAAGCCCTACTCACAGGTGCTTT  100

seq1  AACACACCCAGGATCACAGGAACACAGGATCCTAGGAGCTTGGTCACACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACCCAGGATCACAGGAACACAGGATCCTAGGAGCTTGGTCACACC  150

seq1  AGAATCTCAGGGTCCCAGAGGCAACTTGACTCCTAGGAGCTTGGACATAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCTCAGGGTCCCAGAGGCAACTTGACTCCTAGGAGCTTGGACATAC  200

seq1  CCAGGATCAGGATCCCAGGATCCCAGAATCACAGAGAAAGCTTGACAATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGATCAGGATCCCAGGATCCCAGAATCACAGAGAAAGCTTGACAATG  250

seq1  ATGACAATCACTCAAGTCAAATAGCTTTGATCATAGCAGGAAATCTGTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACAATCACTCAAGTCAAATAGCTTTGATCATAGCAGGAAATCTGTAT  300

seq1  CCAAATAATTGTGCCTGTAATTCATTCCTTGACGCAGCAGAACTGTCAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATAATTGTGCCTGTAATTCATTCCTTGACGCAGCAGAACTGTCAAC  350

seq1  ACTTAACTTAGCTACTATACAATCCTTTGGTGATGTGAGGGACATTGAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAACTTAGCTACTATACAATCCTTTGGTGATGTGAGGGACATTGAAG  400

seq1  TACAGCCTTATTACAATGAAATCCAGTGTCTAAAAATTGTTCTTGCTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGCCTTATTACAATGAAATCCAGTGTCTAAAAATTGTTCTTGCTTTT  450

seq1  ATACCACAGTAAGAACCAAGATTTTCAGCTTTACTAAAAACAAAACAAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCACAGTAAGAACCAAGATTTTCAGCTTTACTAAAAACAAAACAAAC  500

seq1  AAACAAAAAGACATTATCTTTTTATGCTCATTTAATAACATCTCTATCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAAAAGACATTATCTTTTTATGCTCATTTAATAACATCTCTATCAT  550

seq1  TTGTTATGATTGGTAGAAAATTATATATTATGTTGAATATAGTAATAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTATGATTGGTAGAAAATTATATATTATGTTGAATATAGTAATAAAA  600

seq1  AGAATAAAAAAAGGAGTGGGAAAAAAAGAATCTTAAGGCAAGTCATTGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAAAAAAAGGAGTGGGAAAAAAAGAATCTTAAGGCAAGTCATTGCT  650

seq1  ACAGATGGATTACTGCACATTCACTTCAGCTCCTTATAAACTTGCTAGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATGGATTACTGCACATTCACTTCAGCTCCTTATAAACTTGCTAGTT  700

seq1  GAGATTGTACAGTGGTCATTTGGGCAGAATCCTAATGCACAGTGGAGTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTGTACAGTGGTCATTTGGGCAGAATCCTAATGCACAGTGGAGTAT  750

seq1  TGTTGGACTAAATTTAGAAAGATGGTTGCCTCTTTTGAGAGACGGTTGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGACTAAATTTAGAAAGATGGTTGCCTCTTTTGAGAGACGGTTGGA  800

seq1  GGGCGGCTGTGATGAGGTGCAGTGGGGACCTGAGAAGTCTGGGCTTCACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCGGCTGTGATGAGGTGCAGTGGGGACCTGAGAAGTCTGGGCTTCACT  850

seq1  TTTTAAGACAGTGGAATAATTATAAGGGTGTTCATTTCTTTTTTTATTTT  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTTTAAGACAGTGGAATAATTATAAGGGTGTTCATTTC-TTTTTTATTTT  899

seq1  TAAAAGTATATTTCTAAAGTGTTTACAATACATAAAAAACTTTCAAAGAA  950
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  T-AAAGTATATTTCTAAAGTGTTTACAATACATAAAAAACTTTCAAAG-A  947

seq1  TGTATGGACTTAATAGTAATTTAAAGTATTTCTCATATGGTTCACTAAAT  1000
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGTATGGACTT-ATAGTAATTTAAAGTATTTCTCATATGGTTCACT-AAT  995

seq1  CTTAAAAAATGAAGTCCTTTTATTTCTAAACAGTTCTTTAGTTCAGAGCA  1050
      ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CT--AAAAATG-AGTCCTTTTATTTCTAAACAGTTCTTTAG-TCAGAGCA  1041

seq1  GAAAAGAAAGTTTAATATGTATTTTAAAAGCAGACTAAAGTAATATTAGT  1100
      ||||||||   ||| ||||| | || ||||||||||| |||||||| || 
seq2  GAAAAGAA--GTTATTATGT-TATTTAAAGCAGACTATAGTAATATAAG-  1087

seq1  CTGCTTT-TATGTTATGAAGTACTAATGATACAAGTTAGAACGGAACA  1147
      ||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||
seq2  CTGCTTTATATG-TATG-AGT-CTAATGAT-CAAG-TAGAACGGAACA  1130

seq1: chr18_10899492_10899712
seq2: B6Ng01-032M19.g_76_296 (reverse)

seq1  GTATATACACATATAAACCATATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATACACATATAAACCATATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA  50

seq1  TCTATCTATCTATGCTTTTCTTGAGATAGGTTTCTTCCTATGTAGCCCAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTATCTATGCTTTTCTTGAGATAGGTTTCTTCCTATGTAGCCCAG  100

seq1  GCTTTTCACAAGAGCAAGAACTAGACACATCTGGAGAGTTGAATGAATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTCACAAGAGCAAGAACTAGACACATCTGGAGAGTTGAATGAATAA  150

seq1  CTACTTCATAAAAAAGCAAACTTAGGCTGGTGAGATGGCTTAGCAGGTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTTCATAAAAAAGCAAACTTAGGCTGGTGAGATGGCTTAGCAGGTAA  200

seq1  AGGTCTTTGCCACCATGACCT  221
      |||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTTTGCCACCATGACCT  221