BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-045P24
Chromosome18 (Build37)
Map Location 23,022,882 - 23,055,444
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNol4
Upstream gene4921528I01Rik, LOC546708, LOC100040547, Asxl3
Downstream geneLOC100040579, LOC665797, Dtna, Mapre2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-045P24.bB6Ng01-045P24.g
ACCDH871291DH871292
length1,1171,029
definitionDH871291|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-045P24, 5' end.DH871292|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-045P24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,054,299 - 23,055,444)(23,022,882 - 23,023,926)
sequence
gaattcttaattgcttatttctgagttaaagcatatatacatgtgcttta
attatgagcaacagtctaaacatctcatagtaaatattatataaaaaaag
aagcttgcataattttattagaatattttcatctttattgaaaaaaaaat
cagtaaatgaatgacagcaagagaaagctgcttggagacaggtgaaatgc
aaaattctctgagaagaactaagtagccatagccagaggaggagagcagc
tggagatgacaaggtctgcttgtgataatatctagttagtgacatcttta
gttaatatctaattggtgagccagtgcatggccaggttgactggaaacat
cccatggctttttattgccttgtccattcatcatttcatcctaaggaatc
aagcccaagagtgtgagaataagatacttggtaatttatgctttatgcta
gaaagagtcttacatatggacaagctagtgtgaggctgtctaacagggca
agtggagtggtctacaaagctgaaagattatttaattgggttgagtgcat
ctcagaaactcgaggaaggccatcacgagcacttttgacaagggcaggct
tcttatgggctaggtctcgtgtaggagtaaaaagagaataagctgagccc
atcatctcaaacatctgagccattcacttcctgtgaaggaggcttaaaga
aaagatgaacgttgttctaatgctgatggaatatgcattctgagctagaa
attactgaatgacttttgtttagtaatttttttccagaagtatggacata
aataaaattcaatataaaagaaaaaatatccatttctgtatgatagggaa
gctttgtagatattgtactctttgtactttaaatgcaaatgtaagcaatg
gcatctctaagttgtagcaggagactgaaataatcattacccaagttcca
gagctttttttttttagatatatcagtcatgtctctttttgatacttgta
gcatatgaacatatgtacatctgtgctcttcatagtatcctataatttca
gaagttctttagcagaatgatgctccaactctctgtctatcttgtatcat
ctaagcatatttatctt
gaattcatattattttgatattttcatttaaaagttaaaggatataaaat
gaaacaaagagaactcaataaagaattatacacaagtagcttactcgtta
gtttgtattagaaagttgaaatatgtttgctcaactaaatgattgggtca
gtttttctaatggtgttcttagacacatggtaggtgagaaaattattctg
gcatccaagccctgtaaatccactcatattggtagagaagagcattctga
gccccatgttcattgctgcatctgtaagctgagatagcttacaagctcct
tgcaaatacaggcatttgtctaagacctcctttggggatggtgactactg
ccatatgcttccaagaggtctctccttcaaggcacactgccaacacactg
gagtgaaattgagtttattataaactggcttaaggatgaggggcttgttc
taatcagtttcacattcatgaaataatgattcattaaagccatggacata
taaaatatggctgtttgttacaatgggaaatctttattgtgtttagagtg
agaataacattttactagtattataaagatatcaatgtagagatcatata
caaagtactgttgtttttaaaacaaactgaaacaatgtttagaaaatctg
agaagccattataagtagcattacaatgctttcaacacttaacttcggta
tgaggacaaatggttatagatcattgtcacagataataagctgaacagtg
atgacaccaatagacattccaaactacaaagagaaagtccatgaagcctc
aaccctacacaaggaacaacagcaactaagggaagctaggaacgtgacaa
gtagtccttgccagggagagcacaccagttggttgttcattgtcaaatgg
tcagtgctaaaacatacatgcaaatgacatatagagactgagcagaaaat
ttgtgagtacgatataacaaagacgtacatgtgtacattacattaataaa
gaacacaaatttgatgagtacaggagggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_23054299_23055444
seq2: B6Ng01-045P24.b_44_1160 (reverse)

seq1  AAGATAAAATAATTGCTTAGATGATAACAAAGATTAGACAGAAGAGTTTG  50
      ||||| |||||  |||||||||||||   |||| ||||||| |||| |||
seq2  AAGAT-AAATA--TGCTTAGATGATA--CAAGA-TAGACAG-AGAG-TTG  42

seq1  AAGCATCTATCTGGCCTAAAGGAGACTTTCTGAAATGTATAGGGATTACT  100
       ||||||  ||||  ||||   |||  ||||||||| ||||||   ||| 
seq2  GAGCATCATTCTG--CTAA---AGAACTTCTGAAAT-TATAGG--ATAC-  83

seq1  TATGAAAGAGCACAGATGTACAATAATGTTCATATGCCTACAAGGTATCA  150
      |||| |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||
seq2  TATG-AAGAGCACAGATGTACA--TATGTTCATATG-CTACAA-GTATCA  128

seq1  AAAAAGGAAGAACAATGACTGATAATATCTAAAAAAAAAAAAGCTCTGGA  200
      ||     ||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
seq2  AA-----AAGAGACATGACTGAT-ATATCT-AAAAAAAAAAAGCTCTGGA  171

seq1  ACTTGGGTAATGATTATTTCAGTCTCCTGCTACAACTTAGAGATGCCATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGGTAATGATTATTTCAGTCTCCTGCTACAACTTAGAGATGCCATT  221

seq1  GCTAACATTTGCATTTAAAGTACAAAGGGTACAATATCTACAAAGCTTCC  300
      ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTACATTTGCATTTAAAGTACAAAGAGTACAATATCTACAAAGCTTCC  271

seq1  CTATCATACAGAAATGGATATTTTTTCTTTTATATTGAATTTTATTTATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCATACAGAAATGGATATTTTTTCTTTTATATTGAATTTTATTTATG  321

seq1  TCCATACTTCTGGAAAAAAATTACTAAACAAAAGTCATTCAGTAATTTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATACTTCTGGAAAAAAATTACTAAACAAAAGTCATTCAGTAATTTCT  371

seq1  AGCTCAGAATGCATATTCCATCAGCATTAGAACAACGTTCATCTTTTCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAGAATGCATATTCCATCAGCATTAGAACAACGTTCATCTTTTCTT  421

seq1  TAAGCCTCCTTCACAGGAAGTGAATGGCTCAGATGTTTGAGATGATGGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCCTCCTTCACAGGAAGTGAATGGCTCAGATGTTTGAGATGATGGGC  471

seq1  TCAGCTTATTCTCTTTTTACTCCTACACGAGACCTAGCCCATAAGAAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTTATTCTCTTTTTACTCCTACACGAGACCTAGCCCATAAGAAGCC  521

seq1  TGCCCTTGTCAAAAGTGCTCGTGATGGCCTTCCTCGAGTTTCTGAGATGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTTGTCAAAAGTGCTCGTGATGGCCTTCCTCGAGTTTCTGAGATGC  571

seq1  ACTCAACCCAATTAAATAATCTTTCAGCTTTGTAGACCACTCCACTTGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAACCCAATTAAATAATCTTTCAGCTTTGTAGACCACTCCACTTGCC  621

seq1  CTGTTAGACAGCCTCACACTAGCTTGTCCATATGTAAGACTCTTTCTAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTAGACAGCCTCACACTAGCTTGTCCATATGTAAGACTCTTTCTAGC  671

seq1  ATAAAGCATAAATTACCAAGTATCTTATTCTCACACTCTTGGGCTTGATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGCATAAATTACCAAGTATCTTATTCTCACACTCTTGGGCTTGATT  721

seq1  CCTTAGGATGAAATGATGAATGGACAAGGCAATAAAAAGCCATGGGATGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAGGATGAAATGATGAATGGACAAGGCAATAAAAAGCCATGGGATGT  771

seq1  TTCCAGTCAACCTGGCCATGCACTGGCTCACCAATTAGATATTAACTAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGTCAACCTGGCCATGCACTGGCTCACCAATTAGATATTAACTAAA  821

seq1  GATGTCACTAACTAGATATTATCACAAGCAGACCTTGTCATCTCCAGCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCACTAACTAGATATTATCACAAGCAGACCTTGTCATCTCCAGCTG  871

seq1  CTCTCCTCCTCTGGCTATGGCTACTTAGTTCTTCTCAGAGAATTTTGCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCTCCTCTGGCTATGGCTACTTAGTTCTTCTCAGAGAATTTTGCAT  921

seq1  TTCACCTGTCTCCAAGCAGCTTTCTCTTGCTGTCATTCATTTACTGATTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACCTGTCTCCAAGCAGCTTTCTCTTGCTGTCATTCATTTACTGATTT  971

seq1  TTTTTTCAATAAAGATGAAAATATTCTAATAAAATTATGCAAGCTTCTTT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTCAATAAAGATGAAAATATTCTAATAAAATTATGCAAGCTTCTTT  1021

seq1  TTTTATATAATATTTACTATGAGATGTTTAGACTGTTGCTCATAATTAAA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATATAATATTTACTATGAGATGTTTAGACTGTTGCTCATAATTAAA  1071

seq1  GCACATGTATATATGCTTTAACTCAGAAATAAGCAATTAAGAATTC  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATGTATATATGCTTTAACTCAGAAATAAGCAATTAAGAATTC  1117

seq1: chr18_23022882_23023926
seq2: B6Ng01-045P24.g_65_1093

seq1  GAATTCATATTATTTTGATATTTTCATTTAAAAGTTAAAGGATATAAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATATTATTTTGATATTTTCATTTAAAAGTTAAAGGATATAAAAT  50

seq1  GAAACAAAGAGAACTCAATAAAGAATTATACACAAGTAGCTTACTCGTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAAAGAGAACTCAATAAAGAATTATACACAAGTAGCTTACTCGTTA  100

seq1  GTTTGTATTAGAAAGTTGAAATATGTTTGCTCAACTAAATGATTGGGTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTATTAGAAAGTTGAAATATGTTTGCTCAACTAAATGATTGGGTCA  150

seq1  GTTTTTCTAATGGTGTTCTTAGACACATGGTAGGTGAGAAAATTATTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTCTAATGGTGTTCTTAGACACATGGTAGGTGAGAAAATTATTCTG  200

seq1  GCATCCAAGCCCTGTAAATCCACTCATATTGGTAGAGAAGAGCATTCTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCAAGCCCTGTAAATCCACTCATATTGGTAGAGAAGAGCATTCTGA  250

seq1  GCCCCATGTTCATTGCTGCATCTGTAAGCTGAGATAGCTTACAAGCTCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCATGTTCATTGCTGCATCTGTAAGCTGAGATAGCTTACAAGCTCCT  300

seq1  TGCAAATACAGGCATTTGTCTAAGACCTCCTTTGGGGATGGTGACTACTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAATACAGGCATTTGTCTAAGACCTCCTTTGGGGATGGTGACTACTG  350

seq1  CCATATGCTTCCAAGAGGTCTCTCCTTCAAGGCACACTGCCAACACACTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATGCTTCCAAGAGGTCTCTCCTTCAAGGCACACTGCCAACACACTG  400

seq1  GAGTGAAATTGAGTTTATTATAAACTGGCTTAAGGATGAGGGGCTTGTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGAAATTGAGTTTATTATAAACTGGCTTAAGGATGAGGGGCTTGTTC  450

seq1  TAATCAGTTTCACATTCATGAAATAATGATTCATTAAAGCCATGGACATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCAGTTTCACATTCATGAAATAATGATTCATTAAAGCCATGGACATA  500

seq1  TAAAATATGGCTGTTTGTTACAATGGGAAATCTTTATTGTGTTTAGAGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATATGGCTGTTTGTTACAATGGGAAATCTTTATTGTGTTTAGAGTG  550

seq1  AGAATAACATTTTACTAGTATTATAAAGATATCAATGTAGAGATCATATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAACATTTTACTAGTATTATAAAGATATCAATGTAGAGATCATATA  600

seq1  CAAAGTACTGTTGTTTTTAAAACAAACTGAAACAATGTTTAGAAAATCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTACTGTTGTTTTTAAAACAAACTGAAACAATGTTTAGAAAATCTG  650

seq1  AGAAGCCATTATAAGTAGCATTACAATGCTTTCAACACTTAACTTCGGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCCATTATAAGTAGCATTACAATGCTTTCAACACTTAACTTCGGTA  700

seq1  TGAGGACAAATGGTTATAGATCATTGTCACAGATAATAAGCTGAACAGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGACAAATGGTTATAGATCATTGTCACAGATAATAAGCTGAACAGTG  750

seq1  ATGACACCAATAGACATTCCAAACTACAAAGAGAAAGTCCATGAAGCCTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACACCAATAGACATTCCAAACTACAAAGAGAAAGTCCATGAAGCCTC  800

seq1  AACCCTACACAAGGAACAACAGGCAACTAAGGGAAGCTAGGAACGTGACA  850
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTACACAAGGAACAACA-GCAACTAAGGGAAGCTAGGAACGTGACA  849

seq1  AGTAGTCCTTGCCAGGGAAGAGCACACCAGTTGGTTGTTCATTGTCAAAT  900
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGTCCTTGCCAGGG-AGAGCACACCAGTTGGTTGTTCATTGTCAAAT  898

seq1  GGTCAGTGCTAAAAACATACATGCAAATGACAATATAGAGACTGAGCAGG  950
      |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| 
seq2  GGTCAGTGCT-AAAACATACATGCAAATGAC-ATATAGAGACTGAGCAG-  945

seq1  AAAAATTTGTGAGTAAACGAATATAAACAAAGACGTACATGTGTACAATT  1000
       |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||
seq2  -AAAATTTGTGAGT--ACG-ATAT-AACAAAGACGTACATGTGTAC-ATT  989

seq1  ACAATTAAATAAAAGAACACAAATTTGATGAAGTACAGGGAGGGG  1045
      || |||||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||
seq2  AC-ATTAA--TAAAGAACACAAATTTGATG-AGTACA-GGAGGGG  1029