BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-061D08
Chromosome18 (Build37)
Map Location 59,439,606 - 59,581,424
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4833446K15Rik
Upstream geneSlc27a6, Isoc1, Adamts19, A730017C20Rik
Downstream geneLOC667549, EG240327, LOC546714, EG225594, F830016B08Rik, LOC667578, EG667584, LOC435565, Iigp1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-061D08.bB6Ng01-061D08.g
ACCDH881951DH881952
length1,1951,166
definitionDH881951|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-061D08, 5' end.DH881952|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-061D08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,439,606 - 59,440,808)(59,580,256 - 59,581,424)
sequence
gaattcagtttattaggaaatgtaaaaaccaattttgaaggtcatatcta
gtttataatgtgaaggcagcttactgtatacttcttcctatgaaattaga
tacgctgatacatatgcagataatgacagaaacatatatttagattgtgt
taggagtctggggtgaccaaggagttggaaatatggaacattaaggcagt
gactgtaataatggcacataggatctaagcaagaagcaatcaaagctaag
agattgagaagcgcttcataaagacatggtctgtgaatgtctttagagag
tagttggcattgtaacctgtgcttgagtgaatggaaaggagaaggaggca
caaagagagcacagcattgaagaatgtgaagaagcacatataatgagagg
gcagggctgaagattacaacaaagtacatatttctgggcaaaatttagaa
ctaagcttttattaaaggagtgacaggctgtcaggaaaaattaatggggt
tatttgaggtgacaaagtcagagaattaagacatcagcatatgaccattt
gaaggatatgcgttgtggtatttcaatgtggttgatatcaccatgagaat
tacagagaaaataacatttttctcggcaaatgacaaaagttaaataaatg
ataccaaaaataagtttcagacaatgatatttgggtggcttaaagggcat
ttgtttctggtggaaccaaataaattgcaagtaaaagtagcaagacacgg
tgagacatttaaagtataaagtaaaacctcaaatatgttcactagtgtta
ggaaaaagctcattcagaatacatccaaatttaggtcatagccaattaga
ggagtaagtaggaaaaggttgagtttagttcaatgttttagtcatgccag
gcatggagattgaggaaacatcaagtgtttggggtaagtcaagggcagtc
ttagggtcagaatgggtacagaaaaattctggagatgacagtctgagatc
ttagagacctggttcatgctggtgaccatgggtatggctaatgatacaag
tcccgagaaggatcagagctgaatacattaacatcttatctgtgtacccg
agtatcactgggatgaatgtcgaagtgtcccaggaattcagagagcccag
gtcaggaatgatgtcgaaataagagctctgaagcatcctttaact
gaattctacttaggggaagacaagacaccacacacactaattacatataa
gatttcaccaggctcatgtccattgggctctataaagagaaagaggattg
ctaacctcagcaggaaaagaaatcaaacatagaaaagaaattttagccca
attggaagctattttgctacctaagagggtggcaattattcattgcaaag
ggcatcaaagggcaaatatttccttaaaccccagagcagtagagtagctg
acctggctgcctgggaagtggccctagattcagtagaacctctttaagtc
ttggtaaccctgcccgggcccagcttagcagactacccagaatacactcc
aggtaagagtggaagaaagaactggttaaaaagaataataaaggatgaag
gatgctatttgacagcagacccatcttatgaaattatattaaaattatat
ttgggagactacctcccatcctccccaaacatcaagcttttccccaggcg
gaatgtttaattccacctttctcaagtccttgcgtgttttgaaggaagct
cactgatttgactgtgaaagaaatcctctcatctttctgaaccctcccac
tagttccagctaggagacttggtatgggtaaagaagatccccaacctagt
ctcaggaatctgtctagaatggactctacctacttatcctcaccatcccc
atcactgtcaaagtaagtggtgtcatcctttgggaaaagggacactgagg
aagaccgcagatggacttggacctagggctcttaaagataagactgagga
gtttactaactgggatacacaatcctcaccaggtcccaaactaaacatgg
gaatttataacaaaacagagatgagaattatcttttgggtggccctctgc
tctctgacatctcttcatgggtagagcaatattggtctagaaagagataa
cggtcagtaaatcaagttgtgaagaatactggttagaaaactaccttcaa
ggattacaattttatacatgtattgtaatgatgagtgtctgtcagaacag
ggtacaagcatcaatatctttcaattacctgactagataactagggtggg
cctcctctcgtggctatttctcaataatgcccataatgggaagaggagcc
agaggctcatactgac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_59439606_59440808
seq2: B6Ng01-061D08.b_46_1240

seq1  GAATTCAGTTTATTAGGAAATGTAAAAACCAATTTTGAAGGTCATATCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTTATTAGGAAATGTAAAAACCAATTTTGAAGGTCATATCTA  50

seq1  GTTTATAATGTGAAGGCAGCTTACTGTATACTTCTTCCTATGAAATTAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATAATGTGAAGGCAGCTTACTGTATACTTCTTCCTATGAAATTAGA  100

seq1  TACGCTGATACATATGCAGATAATGACAGAAACATATATTTAGATTGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGCTGATACATATGCAGATAATGACAGAAACATATATTTAGATTGTGT  150

seq1  TAGGAGTCTGGGGTGACCAAGGAGTTGGAAATATGGAACATTAAGGCAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAGTCTGGGGTGACCAAGGAGTTGGAAATATGGAACATTAAGGCAGT  200

seq1  GACTGTAATAATGGCACATAGGATCTAAGCAAGAAGCAATCAAAGCTAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTAATAATGGCACATAGGATCTAAGCAAGAAGCAATCAAAGCTAAG  250

seq1  AGATTGAGAAGCGCTTCATAAAGACATGGTCTGTGAATGTCTTTAGAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTGAGAAGCGCTTCATAAAGACATGGTCTGTGAATGTCTTTAGAGAG  300

seq1  TAGTTGGCATTGTAACCTGTGCTTGAGTGAATGGAAAGGAGAAGGAGGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTGGCATTGTAACCTGTGCTTGAGTGAATGGAAAGGAGAAGGAGGCA  350

seq1  CAAAGAGAGCACAGCATTGAAGAATGTGAAGAAGCACATATAATGAGAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAGAGCACAGCATTGAAGAATGTGAAGAAGCACATATAATGAGAGG  400

seq1  GCAGGGCTGAAGATTACAACAAAGTACATATTTCTGGGCAAAATTTAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGGCTGAAGATTACAACAAAGTACATATTTCTGGGCAAAATTTAGAA  450

seq1  CTAAGCTTTTATTAAAGGAGTGACAGGCTGTCAGGAAAAATTAATGGGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGCTTTTATTAAAGGAGTGACAGGCTGTCAGGAAAAATTAATGGGGT  500

seq1  TATTTGAGGTGACAAAGTCAGAGAATTAAGACATCAGCATATGACCATTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGAGGTGACAAAGTCAGAGAATTAAGACATCAGCATATGACCATTT  550

seq1  GAAGGATATGCGTTGTGGTATTTCAATGTGGTTGATATCACCATGAGAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGATATGCGTTGTGGTATTTCAATGTGGTTGATATCACCATGAGAAT  600

seq1  TACAGAGAAAATAACATTTTTCTCGGCAAATGACAAAAGTTAAATAAATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAGAAAATAACATTTTTCTCGGCAAATGACAAAAGTTAAATAAATG  650

seq1  ATACCAAAAATAAGTTTCAGACAATGATATTTGGGTGGCTTAAAGGGCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCAAAAATAAGTTTCAGACAATGATATTTGGGTGGCTTAAAGGGCAT  700

seq1  TTGTTTCTGGTGGAACCAAATAAATTGCAAGTAAAAGTAGCAAGACACGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTCTGGTGGAACCAAATAAATTGCAAGTAAAAGTAGCAAGACACGG  750

seq1  TGAGACATTTAAAGTATAAAGTAAAACCTCAAATATGTTCACTAGTGTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACATTTAAAGTATAAAGTAAAACCTCAAATATGTTCACTAGTGTTA  800

seq1  GGAAAAAGCTCATTCAGAATACATCCAAATTTAGGTCATAGCCAATTAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAAGCTCATTCAGAATACATCCAAATTTAGGTCATAGCCAATTAGA  850

seq1  GGAGTAAGTAGGAAAAGGTTGAGTTTAGTTCAATGTTTTAGTCATGCCAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTAAGTAGGAAAAGGTTGAGTTTAGTTCAATGTTTTAGTCATGCCAG  900

seq1  GCATGGAGATTGGAGGAAACATCAAGTGTTTGGGGTAAGTCAAGGGCAGT  950
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGAGATT-GAGGAAACATCAAGTGTTTGGGGTAAGTCAAGGGCAGT  949

seq1  CTTAGGGTCAGAATGGGTACAGAAACATTCTGGAGATGACAGTCTGAGAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGGTCAGAATGGGTACAGAAAAATTCTGGAGATGACAGTCTGAGAT  999

seq1  CTTAGAGACCTGGTCCATGCTGGTGACCATGGGTATGGCTAATGATACAA  1050
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAGACCTGGTTCATGCTGGTGACCATGGGTATGGCTAATGATACAA  1049

seq1  GTCCCGAGAA-GATCAGAGCTGAATAACATTAACATCCTATCTGTGTACC  1099
      |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
seq2  GTCCCGAGAAGGATCAGAGCTGAAT-ACATTAACATCTTATCTGTGTACC  1098

seq1  CGAGTATCACTGGGATGGAATGTCAGAGTTGTCCACAGGAATGCAGGAGA  1149
      |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||| || ||||
seq2  CGAGTATCACTGGGAT-GAATGTC-GAAGTGTCC-CAGGAATTCA-GAGA  1144

seq1  AGCCAGGGTGCAGGATTGATGTTCAGATTAAGAGCTCTGAAGCATCCTTT  1199
        |||||   ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGG--TCAGGAATGATG-TCGAAATAAGAGCTCTGAAGCATCCTTT  1191

seq1  AACT  1203
      ||||
seq2  AACT  1195

seq1: chr18_59580256_59581424
seq2: B6Ng01-061D08.g_70_1235 (reverse)

seq1  GTCAGTATGAGCTCTCT-GCTCCTCT--CCATTATGTGCATATATTGAGA  47
      |||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||||
seq2  GTCAGTATGAGC-CTCTGGCTCCTCTTCCCATTATGGGCAT-TATTGAGA  48

seq1  AATAG-CACAGAAGGAGGCACA-CCTAGTTAATCTAGTCAGGTAATTTGA  95
      ||||| |||   ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |
seq2  AATAGCCACGAGAGGAGGCCCACCCTAGTT-ATCTAGTCAGGTAATTGAA  97

seq1  AGATA-TGATGCTTGTACCCTGTCCTTGACAGAACAACTCATCATTAACA  144
      ||||| ||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||| |||
seq2  AGATATTGATGCTTGTACCCTGTTC-TGACAGA--CACTCATCATT-ACA  143

seq1  ATACATGTATAAAATTGTAATCCCTGAAGGTAGTTGTCTAACCAGTATTC  194
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATACATGTATAAAATTGTAATCCTTGAAGGTAGTTTTCTAACCAGTATTC  193

seq1  TTCACAACTTGATTTACTGACCCTTATCTCTTTCTAGACCAATATTGCTC  244
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAACTTGATTTACTGACCGTTATCTCTTTCTAGACCAATATTGCTC  243

seq1  TACCCATGGAAGAGATGTCAGAGAGCAGAGGGCCACCCAAAAGATAATTT  294
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TACCCAT-GAAGAGATGTCAGAGAGCAGAGGGCCACCCAAAAGATAA-TT  291

seq1  CTCATCTCTGTTTTGTTATAAATTCCCATGTTTAGTTTGGGACCTGGTGA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCTCTGTTTTGTTATAAATTCCCATGTTTAGTTTGGGACCTGGTGA  341

seq1  GGATTGTGTATCCCAGTTAGTAAACTCCTCAGTCTTATCTTTAAGAGCCC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTGTGTATCCCAGTTAGTAAACTCCTCAGTCTTATCTTTAAGAGCCC  391

seq1  TAGGTCCAAGTCCATCTGCGGTCTTCCTCAGTGTCCCTTTTCCCAAAGGA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTCCAAGTCCATCTGCGGTCTTCCTCAGTGTCCCTTTTCCCAAAGGA  441

seq1  TGACACCACTTACTTTGACAGTGATGGGGATGGTGAGGATAAGTAGGTAG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACCACTTACTTTGACAGTGATGGGGATGGTGAGGATAAGTAGGTAG  491

seq1  AGTCCATTCTAGACAGATTCCTGAGACTAGGTTGGGGATCTTCTTTACCC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCATTCTAGACAGATTCCTGAGACTAGGTTGGGGATCTTCTTTACCC  541

seq1  ATACCAAGTCTCCTAGCTGGAACTAGTGGGAGGGTTCAGAAAGATGAGAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCAAGTCTCCTAGCTGGAACTAGTGGGAGGGTTCAGAAAGATGAGAG  591

seq1  GATTTCTTTCACAGTCAAATCAGTGAGCTTCCTTCAAAACACGCAAGGAC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTTTCACAGTCAAATCAGTGAGCTTCCTTCAAAACACGCAAGGAC  641

seq1  TTGAGAAAGGTGGAATTAAACATTCCGCCTGGGGAAAAGCTTGATGTTTG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAAAGGTGGAATTAAACATTCCGCCTGGGGAAAAGCTTGATGTTTG  691

seq1  GGGAGGATGGGAGGTAGTCTCCCAAATATAATTTTAATATAATTTCATAA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGATGGGAGGTAGTCTCCCAAATATAATTTTAATATAATTTCATAA  741

seq1  GATGGGTCTGCTGTCAAATAGCATCCTTCATCCTTTATTATTCTTTTTAA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGTCTGCTGTCAAATAGCATCCTTCATCCTTTATTATTCTTTTTAA  791

seq1  CCAGTTCTTTCTTCCACTCTTACCTGGAGTGTATTCTGGGTAGTCTGCTA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTCTTTCTTCCACTCTTACCTGGAGTGTATTCTGGGTAGTCTGCTA  841

seq1  AGCTGGGCCCGGGCAGGGTTACCAAGACTTAAAGAGGTTCTACTGAATCT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGCCCGGGCAGGGTTACCAAGACTTAAAGAGGTTCTACTGAATCT  891

seq1  AGGGCCACTTCCCAGGCAGCCAGGTCAGCTACTCTACTGCTCTGGGGTTT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCCACTTCCCAGGCAGCCAGGTCAGCTACTCTACTGCTCTGGGGTTT  941

seq1  AAGGAAATATTTGCCCTTTGATGCCCTTTGCAATGAATAATTGCCACCCT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAATATTTGCCCTTTGATGCCCTTTGCAATGAATAATTGCCACCCT  991

seq1  CTTAGGTAGCAAAATAGCTTCCAATTGGGCTAAAATTTCTTTTCTATGTT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGTAGCAAAATAGCTTCCAATTGGGCTAAAATTTCTTTTCTATGTT  1041

seq1  TGATTTCTTTTCCTGCTGAGGTTAGCAATCCTCTTTCTCTTTATAGAGCC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTCTTTTCCTGCTGAGGTTAGCAATCCTCTTTCTCTTTATAGAGCC  1091

seq1  CAATGGACATGAGCCTGGTGAAATCTTATATGTAATTAGTGTGTGTGGTG  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGGACATGAGCCTGGTGAAATCTTATATGTAATTAGTGTGTGTGGTG  1141

seq1  TCTTGTCTTCCCCTAAGTAGAATTC  1169
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTCTTCCCCTAAGTAGAATTC  1166