BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-068A07
Chromosome18 (Build37)
Map Location 84,532,189 - 84,648,445
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp407
Upstream geneLOC665284, Tshz1, Zadh2, LOC669856
Downstream geneCndp1, EG640234, Cndp2, LOC100039711, LOC100039725, B230399E16Rik, Cyb5, Fbxo15, 1700034H14Rik, LOC100039765
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-068A07.bB6Ng01-068A07.g
ACCDH886732DH886733
length1,1291,142
definitionDH886732|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-068A07, 5' end.DH886733|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-068A07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,647,298 - 84,648,445)(84,532,189 - 84,533,355)
sequence
gaattcttgaagtagttggagtttgtatgttgacaggaagaaatcctaag
tacgcctcaacatagaagcttgcttctgtcactgctgaggtgatgtctac
attttatatactatagagagacttatggaaaaagttgttttctcatatca
aatgaagctttaaaaaataaatcttagtagtttgttgtaaagattttgca
tctgttaatgaaacagaatcatctagactggtagcttcattgaaaatgcg
taattgcaaaattaacttgtcacgcaccccactcagcaaagtcactttct
cataagtctgtggtcacagtatggttttacagttcagcatctggctctgt
ggggtactgatggcttctaggaagaaatgtaccagggtgagcaattaaag
gcaaagtgacagcataaaatatgatcattgtggttatccgaaagacacag
atatgaaatttgcagatcattgtcatttctgtacccgtattttctcttgc
tttgttagcttaataattgtagaacaatttattttttctttgaaaaagtg
agcaaggctgttttaattattcttgttcttgtttgtgtctttcttcttca
attgtggcactgtaattgtcatatatagtattatgtatcaacactatcaa
aggacatgatacttttatatttaaaacataaatattaaaatagaaattta
gttgttactaaaatttcctatggttattagcatttgtatcacatggagat
tgtatgatacttgccacctggaaatgagggttgctcatagtttccttcat
aatgtcaggtgtgttttgaagtgtgcttacagtatcctgttaggtataga
attcatagcctggcatgagggcttaggtatgtggtgaagacagtggtgtt
tctgctttgctttcactcgcaaaacctgcttataacagaatagttaggat
tctgtcaaacaggcagagcttgccagatgccatgcttgctcatgagcctc
tgtgctccttttagcagtggtactctctactcctggacattgcatgccac
ctcatctgtctactctgagtcattcttcagtgccatgggaaagctagtga
cttacaattcaggcccaggtcctctcttg
gaattcaatgtagctttatccttctcaggtgctaatcatcaaacagatta
catacacatgaagtgcacacaggtaattcctgggagcaaacctaaagggc
tgacctctccaggaaaaggctgggccagtttatccatctggttaggtaat
gagcaagcttctatacaccgcaaactttgagcaaagaccaccgtccctta
gctccatcacactgtatattatgaagtgtgctcagagctgtttgctggat
ctcctgtatttcaatgaaaaaaacgtttcatgacgacacgttgttgttgt
tgttgttgttgttgttgttgttaagatagagcctcagtgtgttacacaga
taactttaaatttaggattctttggtcccagcctgtagactacttggatt
aaggcattaacaaccaagcctagcgtgacagcactattttaacatagcaa
gcaatcccattagagaagacagattctaccaatatgacgaaaaacagaca
tacataggagaaaagcatacaatttcaaaacaatcaactacaaaatcaaa
tccaggaatatcattttctttaaaaatgtagtatttaaatcagataccta
ttagtaaactgtcaacaaaactgtccctacaaaataccatattcaagttc
atttcaccctgtaaagtttatattaaagacctctcccaattgcagtaatt
atatatcaagaaaatgtttaatacttcatacactttatgtctatgaatga
ttactaatgataaacccagtcatgtcctttaaataattcagctccttgca
aaaggaaaagcaaaaggttcagagatacccgggagtgaagtaagtgaggt
ggcagatgtagctcactaaggctccacggcagcctcggtgcctcaggagg
accatgtggtctgttctagtatgagtcactcataaatgagtactactggc
atagacagtagctcgtcctttattcaagtctagatccctgtgtccattac
ctagtactcacacaactgactttactgttagtgtgtactctaagagtaag
aaaccatagctgtgtcagaatctttcggtgtccatctcaagagcacctcc
agggcactcgctggaacggatggatttctgacagacagagca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_84647298_84648445
seq2: B6Ng01-068A07.b_45_1173 (reverse)

seq1  CAAGAGAGTGACCTTGGCCTGAAATGGTAAAGTCACTAGCTTTCCCATGG  50
      |||||||| ||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGAG-GACCTGGGCCTGAATTG--TAAGTCACTAGCTTTCCCATGG  47

seq1  CACATGAAGAAATGACTCAGAGTAGACAGGAGAGGTGGGCAGCAATGTCC  100
      ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||
seq2  CAC-TGAAG-AATGACTCAGAGTAGACAGATGAGGTGGCATGCAATGTCC  95

seq1  AGGAGTAGAGAGTAGCCACCTGCTTAAAAGGGAGCACAGAGGCTCATGAG  150
      |||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTAGAGAGTA-CCA-CTGCT--AAAAGGAGCACAGAGGCTCATGAG  141

seq1  CAAACATGGCATCCTGGGCAAGGCTCTTGCCTGTTTGAACAGAATCCTAA  200
      ||| |||||||||   ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||
seq2  CAAGCATGGCATC--TGGCAA-GCTC-TGCCTGTTTG-ACAGAATCCTAA  186

seq1  CAATTCTGTTTATAAAGCAGGTTTCTGCGAGTGAAAGCAAAGCAGAAACA  250
      | |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCTG-TTAT-AAGCAGGTTT-TGCGAGTGAAAGCAAAGCAGAAACA  233

seq1  CCTGCTGTCTTCACCACATACCTAAGCCCTCATGCCAGGCTATGAATTCT  300
      ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CC-ACTGTCTTCACCACATACCTAAGCCCTCATGCCAGGCTATGAATTCT  282

seq1  ATACCTAACAGGATACTGTAAAGCACACTTCAAAACACACCTGACATTAT  350
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTAACAGGATACTGT-AAGCACACTTCAAAACACACCTGACATTAT  331

seq1  GAAGGAAACTATGAGCAACCCTCATTTCCAGGTGGCAAGTATCATACAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAAACTATGAGCAACCCTCATTTCCAGGTGGCAAGTATCATACAAT  381

seq1  CTCCATGTGATACAAATGCTAATAACCATAGGAAATTTTAGTAACAACTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATGTGATACAAATGCTAATAACCATAGGAAATTTTAGTAACAACTA  431

seq1  AATTTCTATTTTAATATTTATGTTTTAAATATAAAAGTATCATGTCCTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCTATTTTAATATTTATGTTTTAAATATAAAAGTATCATGTCCTTT  481

seq1  GATAGTGTTGATACATAATACTATATATGACAATTACAGTGCCACAATTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGTGTTGATACATAATACTATATATGACAATTACAGTGCCACAATTG  531

seq1  AAGAAGAAAGACACAAACAAGAACAAGAATAATTAAAACAGCCTTGCTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGAAAGACACAAACAAGAACAAGAATAATTAAAACAGCCTTGCTCA  581

seq1  CTTTTTCAAAGAAAAAATAAATTGTTCTACAATTATTAAGCTAACAAAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCAAAGAAAAAATAAATTGTTCTACAATTATTAAGCTAACAAAGC  631

seq1  AAGAGAAAATACGGGTACAGAAATGACAATGATCTGCAAATTTCATATCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAAAATACGGGTACAGAAATGACAATGATCTGCAAATTTCATATCT  681

seq1  GTGTCTTTCGGATAACCACAATGATCATATTTTATGCTGTCACTTTGCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTTTCGGATAACCACAATGATCATATTTTATGCTGTCACTTTGCCT  731

seq1  TTAATTGCTCACCCTGGTACATTTCTTCCTAGAAGCCATCAGTACCCCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTGCTCACCCTGGTACATTTCTTCCTAGAAGCCATCAGTACCCCAC  781

seq1  AGAGCCAGATGCTGAACTGTAAAACCATACTGTGACCACAGACTTATGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCAGATGCTGAACTGTAAAACCATACTGTGACCACAGACTTATGAG  831

seq1  AAAGTGACTTTGCTGAGTGGGGTGCGTGACAAGTTAATTTTGCAATTACG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGACTTTGCTGAGTGGGGTGCGTGACAAGTTAATTTTGCAATTACG  881

seq1  CATTTTCAATGAAGCTACCAGTCTAGATGATTCTGTTTCATTAACAGATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTCAATGAAGCTACCAGTCTAGATGATTCTGTTTCATTAACAGATG  931

seq1  CAAAATCTTTACAACAAACTACTAAGATTTATTTTTTAAAGCTTCATTTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATCTTTACAACAAACTACTAAGATTTATTTTTTAAAGCTTCATTTG  981

seq1  ATATGAGAAAACAACTTTTTCCATAAGTCTCTCTATAGTATATAAAATGT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAGAAAACAACTTTTTCCATAAGTCTCTCTATAGTATATAAAATGT  1031

seq1  AGACATCACCTCAGCAGTGACAGAAGCAAGCTTCTATGTTGAGGCGTACT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATCACCTCAGCAGTGACAGAAGCAAGCTTCTATGTTGAGGCGTACT  1081

seq1  TAGGATTTCTTCCTGTCAACATACAAACTCCAACTACTTCAAGAATTC  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATTTCTTCCTGTCAACATACAAACTCCAACTACTTCAAGAATTC  1129

seq1: chr18_84532189_84533355
seq2: B6Ng01-068A07.g_68_1208

seq1  GAATTCAATGTAGCTTTATCCTTCTCAGGTGCTAATCATCAAACAGATTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATGTAGCTTTATCCTTCTCAGGTGCTAATCATCAAACAGATTA  50

seq1  CATACACATGAAGTGCACACAGGTAATTCCTGGGAGCAAACCTAAAGGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACACATGAAGTGCACACAGGTAATTCCTGGGAGCAAACCTAAAGGGC  100

seq1  TGACCTCTCCAGGAAAAGGCTGGGCCAGTTTATCCATCTGGTTAGGTAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTCTCCAGGAAAAGGCTGGGCCAGTTTATCCATCTGGTTAGGTAAT  150

seq1  GAGCAAGCTTCTATACACCGCAGACTTTGAGCAAAGACCACCGTCCCTTA  200
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAGCTTCTATACACCGCAAACTTTGAGCAAAGACCACCGTCCCTTA  200

seq1  GCTCCATCACACTGTATATTATGAAGTGTGCTCAGAGCTGTTTGCTGGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCATCACACTGTATATTATGAAGTGTGCTCAGAGCTGTTTGCTGGAT  250

seq1  CTCCTGTATTTCAATGAAAAAAACGTTTCATGACGACACGTTGTTGTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGTATTTCAATGAAAAAAACGTTTCATGACGACACGTTGTTGTTGT  300

seq1  TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAAGATAGAGCCTCAGTGTGTTACACAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAAGATAGAGCCTCAGTGTGTTACACAGA  350

seq1  TAACTTTAAATTTAGGATTCTTTGGTCCCAGCCTGTAGACTACTTGGATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTTAAATTTAGGATTCTTTGGTCCCAGCCTGTAGACTACTTGGATT  400

seq1  AAGGCATTAACAACCAAGCCTAGCGTGACAGCACTATTTTAACATAGCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCATTAACAACCAAGCCTAGCGTGACAGCACTATTTTAACATAGCAA  450

seq1  GCAATCCCATTAGAGAAGACAGATTCTACCAATATGACGAAAAACAGACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATCCCATTAGAGAAGACAGATTCTACCAATATGACGAAAAACAGACA  500

seq1  TACATAGGAGAAAAGCATACAATTTCAAAACAATCAACTACAAAATCAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATAGGAGAAAAGCATACAATTTCAAAACAATCAACTACAAAATCAAA  550

seq1  TCCAGGAATATCATTTTCTTTAAAAATGTAGTATTTAAATCAGATACCTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGAATATCATTTTCTTTAAAAATGTAGTATTTAAATCAGATACCTA  600

seq1  TTAGTAAACTGTCAACAAAACTGTCCCTACAAAATACCATATTCAAGTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTAAACTGTCAACAAAACTGTCCCTACAAAATACCATATTCAAGTTC  650

seq1  ATTTCACCCTGTAAAGTTTATATTAAAGACCTCTCCCAATTGCAGTAATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCACCCTGTAAAGTTTATATTAAAGACCTCTCCCAATTGCAGTAATT  700

seq1  ATATATCAAGAAAATGTTTAATACTTCATACACTTTATGTCTATGAATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATCAAGAAAATGTTTAATACTTCATACACTTTATGTCTATGAATGA  750

seq1  TTACTAATGATAAACCCAGTCATGTCCTTTAAATAATTCAGTTCCTTGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TTACTAATGATAAACCCAGTCATGTCCTTTAAATAATTCAGCTCCTTGCA  800

seq1  AAAGGAAAAGCAAAAGGTTCAGAGATACCCGGGAGTGAAGTAAGTGAGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAAAAGCAAAAGGTTCAGAGATACCCGGGAGTGAAGTAAGTGAGGT  850

seq1  GGCAGAAAGTAGCTCAGCTAAGGCTCCACGGCAGCCTCGGTGCCTCAGGA  900
      ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAG-ATGTAGCTCA-CTAAGGCTCCACGGCAGCCTCGGTGCCTCAGGA  898

seq1  GGACCATGTGGTCCTGTTTCTTGGTATGAGTTCAAGTCATAATTATGTAA  950
      |||||||||||| |||||   | ||||||||   | |||||| |  || |
seq2  GGACCATGTGGT-CTGTT--CTAGTATGAGT--CACTCATAAATGAGT-A  942

seq1  CTACTGGCATAGGACAGGTAGCTCTTCATTTAGTTCACAGTCTAGATCCC  1000
      ||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||||
seq2  CTACTGGCATA-GACA-GTAGCTCGTCCTTTA-TTCA-AGTCTAGATCCC  988

seq1  TTGTGTCCTATACATAGTAAATCACAACAACTGACTATAACTGTTTGTTG  1050
       |||||||  ||| |||| | |||| |||||||||| | |||||| | ||
seq2  -TGTGTCCATTACCTAGT-ACTCAC-ACAACTGACT-TTACTGTTAG-TG  1033

seq1  TATACTCTAACAGTAAGAAAACCATAGCTCTGTCAGTAATCATTTCCAGG  1100
      | |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||   |
seq2  TGTACTCTAAGAGTAAG-AAACCATAGCTGTGTCAG-AATC-TTTCGGTG  1080

seq1  TCCAATTGCCAAAGAGGAACTACTAGGCACTTTGTAGGAAGTGATGGATT  1150
      ||||    |  ||||| | || |  ||||| | |  ||||  ||||||||
seq2  TCCA---TCTCAAGAGCACCTCCAGGGCAC-TCGCTGGAACGGATGGATT  1126

seq1  TCTGAACAAGACAGAGC  1167
      |||||   |||||||||
seq2  TCTGA--CAGACAGAGC  1141