BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-100P03
Chromosome18 (Build37)
Map Location 22,089,578 - 22,293,115
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4921528I01Rik
Upstream geneRnf125, Rnf138, Mep1b, EG622978, Gm944, LOC665722, LOC225264, Klhl14
Downstream geneLOC546708, LOC100040547, Asxl3, Nol4, LOC100040579
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-100P03.bB6Ng01-100P03.g
ACCDH910291DH910292
length1,1491,096
definitionDH910291|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-100P03, 5' end.DH910292|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-100P03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,291,965 - 22,293,115)(22,089,578 - 22,090,671)
sequence
gaattccatactaaactctcagcaacttgcgatcatttcatttagtaatg
acttattgaaaattgaccaacttctcttagttgttactaagatgacattc
tgaaaaactaacatacttctttaggcagaggaatggacttgctacacata
tgacttttctggtttttttattttggtccctggatctgacctagagaatg
ttccgctctaggaagtcatcttttttgagaggcattggttcgatggtcaa
gatcacaggctttgaagagacatgctgtatgacctttggagggtgtgagg
agaccctgacagtgtgctagagtgtcagaataggaagaatcccagagcac
acacatgagctattacaacaaataattatatgcattatttttgaatatta
ttgttcaatattgcatggcagcatctcttttacctatacacctccaaatc
agaatatacattagtacaattgcagatcacatggcaaacagatttctagg
tctggaatcatataaagaaatagaaccgaaagatatttattaatagatac
ttccccttccatagacactaattctcaattatccataaaacttaaaatgg
taaaatcatatctgtagatgccttaacaaaccattatgatagttactatt
tattgtaatcttaatggaaagcataccaaatattttgctatatcatgtct
cttaaacacataggatttctactgagtattcttgtgaagtgacacaaggt
aaaatatagtttaaaataatttggattcttgttcaactggaagattattt
gttgccattatgtgacatgatactaaccaaaaatgccaccaagaggatat
actttggctcacagtttaaaggatgtacttcatgatggcaggttagggaa
gacatccattaggaagtaccacagtgataggagaaagcagctaggtgcac
atataacctcttcacatctcggcaggcagactaggaaccacaaggcccta
tagaacagacaccaggtctacttacttcaggaattcttcagttccaatgg
tacattagctttatacatattgagcccatcgaagcattttaagttcaagg
catatgaacttgcaagaaatgacttcagatggcatattggtttatgttt
gaattccaggaatgggccatgctttcctggagggtaagtaaggaactcac
tggcagaggaggccgagccactgaaccttcctgtgcagtttccagggctt
cactattaccgttgatagcttgttagctttaatgccaagtttgacaaact
caagaggagacaaggtcagcatttggactccatgaactttctatgatcac
tgctacagtccttttggtgactttcctatactatgccatgtgtccttatg
atgagaacatagaagtgatgggaaatccctgcattttatgcaaagagaac
ccatgcgaatgagaggaaatatatactgattaaaacacacacctgtgaat
ggaatgattcttcagacctaagctgactatgggaggtgcttgaatttctt
tgcaataacaccacggacatttttgcacattctgttgtcacataaaaata
aactgacggtatttgaagaaagtcttcttaaacaaaaactccataaaacc
caatcctcccacagttttgcagttccttatggaatgtccagtgatgaaac
aaggtggtctcaacatggatccaacatcttctgattgaggcccagggcag
catatctacaatcctaacactccagacataagagcagtaagattgcaact
tcaaagctcgcctgactaagagtcaagaaagaaaacaacaacccccaccc
ccaccccaagaaaggctgttgagaggaaagcaaaacaaattacattctaa
ttctattttcttgaaccatattccattttatgaattaaattatttcatga
aaatggtgtcaattcagtaacagttgatatacttgatatttttcttcaga
aaggaaattatatatttaatttgttgtactttgatattttctggcaaaaa
gaatgacttttgcattagaataatccttacataattttagagtagattat
aatcacaaataaataaaatctgtgataccagtaatttctaaggattctag
gtatcataccaagttgaaattcattctcttaacgtttaacatctggtcgg
agtttttaccacttattaaaatcatacaatggagtgagcatctgca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_22291965_22293115
seq2: B6Ng01-100P03.b_47_1195 (reverse)

seq1  AAACATAACCAAATATCCATTCTGAAGCTATTTCTTTCCAAGGTCATATG  50
      |||||||| | ||||| |  |||||||  ||||| || |||| |||||||
seq2  AAACATAAACCAATATGCCATCTGAAGTCATTTC-TTGCAAGTTCATATG  49

seq1  GCTTGAACTTAAAATGCCTCTGATGGGCTCAATATGTAT--AGCTAATGG  98
       |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| |
seq2  CCTTGAACTTAAAATGCTTC-GATGGGCTCAATATGTATAAAGCTAAT-G  97

seq1  TACCATTGGAACCTGAGAATTCCCTGAAGTAAGTAGACCCTGGTGTCTGT  148
      ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TACCATTGGAACTGAAGAATT-CCTGAAGTAAGTAGA-CCTGGTGTCTGT  145

seq1  TCTATTGGGCC-TGTGTTTCCTAGTCTGCCTGCCGAGATGTGAAGAGGTT  197
      ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAGGGCCTTGTGGTTCCTAGTCTGCCTGCCGAGATGTGAAGAGGTT  195

seq1  ATATGTGCACCTAGCTGCTTTCTCCTATCACTGTGGTACTTCCTAATGGA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTGCACCTAGCTGCTTTCTCCTATCACTGTGGTACTTCCTAATGGA  245

seq1  TGTCTTCCCTACCCTGCCATCATGAAGTACATCCTTTAAACTGTGAGCCA  297
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTCCCTAACCTGCCATCATGAAGTACATCCTTTAAACTGTGAGCCA  295

seq1  AAGTATATCCTCTTGGTGGCATTTTTGGTTAGTATCATGTCACATAATGG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATATCCTCTTGGTGGCATTTTTGGTTAGTATCATGTCACATAATGG  345

seq1  CAACAAATAATCTTCCAGTTGAACAAGAATCCAAATTATTTTAAACTATA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAATAATCTTCCAGTTGAACAAGAATCCAAATTATTTTAAACTATA  395

seq1  TTTTACCTTGTGTCACTTCACAAGAATACTCAGTAGAAATCCTATGTGTT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACCTTGTGTCACTTCACAAGAATACTCAGTAGAAATCCTATGTGTT  445

seq1  TAAGAGACATGATATAGCAAAATATTTGGTATGCTTTCCATTAAGATTAC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGACATGATATAGCAAAATATTTGGTATGCTTTCCATTAAGATTAC  495

seq1  AATAAATAGTAACTATCATAATGGTTTGTTAAGGCATCTACAGATATGAT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATAGTAACTATCATAATGGTTTGTTAAGGCATCTACAGATATGAT  545

seq1  TTTACCATTTTAAGTTTTATGGATAATTGAGAATTAGTGTCTATGGAAGG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCATTTTAAGTTTTATGGATAATTGAGAATTAGTGTCTATGGAAGG  595

seq1  GGAAGTATCTATTAATAAATATCTTTCGGTTCTATTTCTTTATATGATTC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTATCTATTAATAAATATCTTTCGGTTCTATTTCTTTATATGATTC  645

seq1  CAGACCTAGAAATCTGTTTGCCATGTGATCTGCAATTGTACTAATGTATA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCTAGAAATCTGTTTGCCATGTGATCTGCAATTGTACTAATGTATA  695

seq1  TTCTGATTTGGAGGTGTATAGGTAAAAGAGATGCTGCCATGCAATATTGA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATTTGGAGGTGTATAGGTAAAAGAGATGCTGCCATGCAATATTGA  745

seq1  ACAATAATATTCAAAAATAATGCATATAATTATTTGTTGTAATAGCTCAT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATAATATTCAAAAATAATGCATATAATTATTTGTTGTAATAGCTCAT  795

seq1  GTGTGTGCTCTGGGATTCTTCCTATTCTGACACTCTAGCACACTGTCAGG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGCTCTGGGATTCTTCCTATTCTGACACTCTAGCACACTGTCAGG  845

seq1  GTCTCCTCACACCCTCCAAAGGTCATACAGCATGTCTCTTCAAAGCCTGT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCTCACACCCTCCAAAGGTCATACAGCATGTCTCTTCAAAGCCTGT  895

seq1  GATCTTGACCATCGAACCAATGCCTCTCAAAAAAGATGACTTCCTAGAGC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTGACCATCGAACCAATGCCTCTCAAAAAAGATGACTTCCTAGAGC  945

seq1  GGAACATTCTCTAGGTCAGATCCAGGGACCAAAATAAAAAAACCAGAAAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACATTCTCTAGGTCAGATCCAGGGACCAAAATAAAAAAACCAGAAAA  995

seq1  GTCATATGTGTAGCAAGTCCATTCCTCTGCCTAAAGAAGTATGTTAGTTT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATATGTGTAGCAAGTCCATTCCTCTGCCTAAAGAAGTATGTTAGTTT  1045

seq1  TTCAGAATGTCATCTTAGTAACAACTAAGAGAAGTTGGTCAATTTTCAAT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAATGTCATCTTAGTAACAACTAAGAGAAGTTGGTCAATTTTCAAT  1095

seq1  AAGTCATTACTAAATGAAATGATCGCAAGTTGCTGAGAGTTTAGTATGGA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCATTACTAAATGAAATGATCGCAAGTTGCTGAGAGTTTAGTATGGA  1145

seq1  ATTC  1151
      ||||
seq2  ATTC  1149

seq1: chr18_22089578_22090671
seq2: B6Ng01-100P03.g_71_1166

seq1  GAATTCCAGGAATGGGCCATGCTTTCCTGGAGGGTAAGTAAGGAACTCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGAATGGGCCATGCTTTCCTGGAGGGTAAGTAAGGAACTCAC  50

seq1  TGGCAGAGGAGGCCGAGCCACTGAACCTTCCTGTGCAGTTTCCAGGGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGAGGAGGCCGAGCCACTGAACCTTCCTGTGCAGTTTCCAGGGCTT  100

seq1  CACTATTACCGTTGATAGCTTGTTAGCTTTAATGCCAAGTTTGACAAACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATTACCGTTGATAGCTTGTTAGCTTTAATGCCAAGTTTGACAAACT  150

seq1  CAAGAGGAGACAAGGTCAGCATTTGGACTCCATGAACTTTCTATGATCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGGAGACAAGGTCAGCATTTGGACTCCATGAACTTTCTATGATCAC  200

seq1  TGCTACAGTCCTTTTGGTGACTTTCCTATACTATGCCATGTGTCCTTATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACAGTCCTTTTGGTGACTTTCCTATACTATGCCATGTGTCCTTATG  250

seq1  ATGAGAACATAGAAGTGATGGGAAATCCCTGCATTTTATGCAAAGAGAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAACATAGAAGTGATGGGAAATCCCTGCATTTTATGCAAAGAGAAC  300

seq1  CCATGCGAATGAGAGGAAATATATACTGATTAAAACACACACCTGTGAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCGAATGAGAGGAAATATATACTGATTAAAACACACACCTGTGAAT  350

seq1  GGAATGATTCTTCAGACCTAAGCTGACTATGGGAGGTGCTTGAATTTCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATGATTCTTCAGACCTAAGCTGACTATGGGAGGTGCTTGAATTTCTT  400

seq1  TGCAATAACACCACGGACATTTTTGCACATTCTGTTGTCACATAAAAATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATAACACCACGGACATTTTTGCACATTCTGTTGTCACATAAAAATA  450

seq1  AACTGACGGTATTTGAAGAAAGTCTTCTTAAACAAAAACTCCATAAAACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGACGGTATTTGAAGAAAGTCTTCTTAAACAAAAACTCCATAAAACC  500

seq1  CAATCCTCCCACAGTTTTGCAGTTCCTTATGGAATGTCCAGTGATGAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCCTCCCACAGTTTTGCAGTTCCTTATGGAATGTCCAGTGATGAAAC  550

seq1  AAGGTGGTCTCAACATGGATCCAACATCTTCTGATTGAGGCCCAGGGCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGGTCTCAACATGGATCCAACATCTTCTGATTGAGGCCCAGGGCAG  600

seq1  CATATCTACAATCCTAACACTCCAGACATAAGAGCAGTAAGATTGCAACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATCTACAATCCTAACACTCCAGACATAAGAGCAGTAAGATTGCAACT  650

seq1  TCAAAGCTCGCCTGACTAAGAGTCAAGAAAGAAAACAACAACCCCCACCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGCTCGCCTGACTAAGAGTCAAGAAAGAAAACAACAACCCCCACCC  700

seq1  CCACCCCAAGAAAGGCTGTTGAGAGGAAAGCAAAACAAATTACATTCTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCCAAGAAAGGCTGTTGAGAGGAAAGCAAAACAAATTACATTCTAA  750

seq1  TTCTATTTTCTTGAACCATATTCCATTTTATGAATTAAATTATTTCATGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATTTTCTTGAACCATATTCCATTTTATGAATTAAATTATTTCATGA  800

seq1  AAATGGTGTCAATTCAGTAACAGTTGATATACTTGATATTTTTCTTCAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGTGTCAATTCAGTAACAGTTGATATACTTGATATTTTTCTTCAGA  850

seq1  AAGGAAATTATATATTTATTTTGTTGTACTTTGATA-TTTCTGGCAAAAA  899
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AAGGAAATTATATATTTAATTTGTTGTACTTTGATATTTTCTGGCAAAAA  900

seq1  GAATGAC-TTTGCATTAGAATAATCCTTACATAATTTTAGAGTAAGATTA  948
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GAATGACTTTTGCATTAGAATAATCCTTACATAATTTTAGAGT-AGATTA  949

seq1  TAATCACAAATAAATAAAATCTGTGATACCAGTAATTTCTAAGGATTCTA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCACAAATAAATAAAATCTGTGATACCAGTAATTTCTAAGGATTCTA  999

seq1  GGTATCATACCCAGTTGAAATTCATTCTCTTAACGTTTAACATCCTGGTC  1048
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GGTATCATACCAAGTTGAAATTCATTCTCTTAACGTTTAACAT-CTGGTC  1048

seq1  -GAGTTTTTACCACTAATTAAAATCATACAATGGAGT-AGCATCTGCA  1094
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GGAGTTTTTACCACTTATTAAAATCATACAATGGAGTGAGCATCTGCA  1096