BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-129M09
Chromosome18 (Build37)
Map Location 83,774,228 - 83,775,296
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneZfp236, LOC100039563, Zfp516, LOC100041001, 4921531P14Rik, LOC665284
Downstream geneTshz1, Zadh2, LOC669856, Zfp407
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-129M09.g
ACCDH931271
length1,066
definitionDH931271|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129M09, 3' end.
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattctgtcctcttgctatgatgttcaagtattccttgaagctagagtg
gggggttccttggattgatggtagagtattccaaggagctggacttccct
gagagcttctgttgacactttctttgtgggatttagtgttgcttcttccc
cctaaccacctgccctcagggatgagacggagctggaactaccctcaacc
aggaaatcacttcagagtcctcacagctgaacacacctggctgttgtctt
ctttcctgtgctcactgtacctaccccacagtctgctatgtgcacactaa
cagtatcagatatctggttgattcatttgggaagagcttacattttaaag
tagttacgcagagcagtaacatgagagcagtaatttaacagacttatacc
cagcaagttgttcccatctgggttattccctcaagtaatatgttcataat
cttctattatggtgtctcacgcttcctatgataaaggagcatgacaaaat
cagagataaatgaacaaatgctagccaagttgtagccatgctcccctgtc
tactcaaagacttactcaaaggcttataaagatagttgaagatttagggg
acaaaaaaagatgaagacatctaccaagagcaaaaactcactcaccagaa
gtgaaaacaggctgatctagaactcacaaaaggtgtgagcacctcaccag
tgagtgttgtaatgtcttcccaaagcccccagtcttattcctgaaacaga
ggtgagtttgataggccatcttctcaagtatatgcatgtgaaatgtatta
gtgggtatttggtaaaaaatcacttagtttgggtataatcctcataaagt
taatgttgtttgaaattctttttgtactttaaggaatactacctaacagc
tgggcagatgcctaaggttaagagtatttcctattctactacaagactct
aaatcacccctagcactcacatcacgtaggtgactatcacaactggtgat
ccagctccaaggaatacaagattacaatgtcctcttcatggctgggcttt
cctgggtatcatacac
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_83774228_83775296
seq2: B6Ng01-129M09.g_69_1134

seq1  GAATTCTGTCCTCTTGCTATGATGTTCACAGTATTCCTTGAAGCTAGAGT  50
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTCCTCTTGCTATGATGTTCA-AGTATTCCTTGAAGCTAGAGT  49

seq1  GGGGGGTTCCTTGGATTGATGGTAGAGTATTCGAAAGAGCTGGACTTCCC  100
      |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
seq2  GGGGGGTTCCTTGGATTGATGGTAGAGTATTCCAAGGAGCTGGACTTCCC  99

seq1  TGAGAGCTTCTGTTGACACATTCTTTGTGGGATTTAGTGTTGCTTCTTCC  150
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGCTTCTGTTGACACTTTCTTTGTGGGATTTAGTGTTGCTTCTTCC  149

seq1  CCCTAACCACCTGCCCTCAGGGATGAGTCTGTGCTGGAACTACACTCAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||
seq2  CCCTAACCACCTGCCCTCAGGGATGAGACGGAGCTGGAACTACCCTCAAC  199

seq1  CAGGAAATCACTTCAGAGTCCTCACAGCTGAACACACCTGGCTGTTGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAATCACTTCAGAGTCCTCACAGCTGAACACACCTGGCTGTTGTCT  249

seq1  TCTTTCCTGTGCTCACTGTACCTACCCCACAGTCTGCTATGTGCACACTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCCTGTGCTCACTGTACCTACCCCACAGTCTGCTATGTGCACACTA  299

seq1  ACAGTATCAGATATCTGGTTGATTCATTTGGGAAGAGCTTACATTTTAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTATCAGATATCTGGTTGATTCATTTGGGAAGAGCTTACATTTTAAA  349

seq1  GTAGTTACGCAGAGCAGTAACATGAGAGCAGTAATTTAACAGACTTATAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTTACGCAGAGCAGTAACATGAGAGCAGTAATTTAACAGACTTATAC  399

seq1  CCAGCAAGTTGTTCCCATCTGGGTTATTCCCTCAAGTAATATGTTCATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCAAGTTGTTCCCATCTGGGTTATTCCCTCAAGTAATATGTTCATAA  449

seq1  TCTTCTATTATGGTGTCTCACGCTTCCTATGATAAAGGAGCATGACAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTATTATGGTGTCTCACGCTTCCTATGATAAAGGAGCATGACAAAA  499

seq1  TCAGAGATAAATGAACAAATGCTAGCCAAGTTGTAGCCATGCTCCCCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGATAAATGAACAAATGCTAGCCAAGTTGTAGCCATGCTCCCCTGT  549

seq1  CTACTCAAAGACTTACTCAAAGGCTTATAAAGATAGTTGAAGATTTAGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTCAAAGACTTACTCAAAGGCTTATAAAGATAGTTGAAGATTTAGGG  599

seq1  GACAAAAAAAGATGAAGACATCTACCAAGAGC-AAAACTCACTCACCAGA  649
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GACAAAAAAAGATGAAGACATCTACCAAGAGCAAAAACTCACTCACCAGA  649

seq1  AGTG-AAACAGGCTGATCTAGAACTCACAAAAGGTGTGAGCACCTCACCA  698
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAAACAGGCTGATCTAGAACTCACAAAAGGTGTGAGCACCTCACCA  699

seq1  GTGAGTGTTGTAATGTCTTCCCAAAGCCCCCAGTCTTATTCCTGAAACAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTGTTGTAATGTCTTCCCAAAGCCCCCAGTCTTATTCCTGAAACAG  749

seq1  AGGTGAGTTTGATAGGCCATCTTCTCAAGTATATGCATGTGAAATGTATT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAGTTTGATAGGCCATCTTCTCAAGTATATGCATGTGAAATGTATT  799

seq1  AGTGGGTATTTGGTAAAAAATCACTTAGTTTGGGTATAATCCTCATAAAG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGTATTTGGTAAAAAATCACTTAGTTTGGGTATAATCCTCATAAAG  849

seq1  TTAATGTTGTTTGAAATTC-TTTTGTACTTTAAGGAATACTACCTAACAG  897
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGTTGTTTGAAATTCTTTTTGTACTTTAAGGAATACTACCTAACAG  899

seq1  CTGGGCAGATGGCTAAGGGTTAAGAGTATTTCCTATTCTACCAC-AGACT  946
      ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||
seq2  CTGGGCAGATGCCTAA-GGTTAAGAGTATTTCCTATTCTACTACAAGACT  948

seq1  CTAAATTCAACCCCCAGCACTCACATCACGTAGGGTGACTTACAACAACC  996
      ||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| 
seq2  CTAAAT--CACCCCTAGCACTCACATCACGTA-GGTGAC-TATCACAACT  994

seq1  TGTGATCCCAGCTCCAAGGAATACAAGAATACAATGGCCTCTTCATGGCT  1046
       ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
seq2  GGTGAT-CCAGCTCCAAGGAATACAAGATTACAATGTCCTCTTCATGGCT  1043

seq1  -GGCTTCCATGGGTATCCATACAC  1069
       ||||| | ||||||| |||||||
seq2  GGGCTTTCCTGGGTAT-CATACAC  1066