BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-153P22
Chromosome18 (Build37)
Map Location 84,288,605 - 84,383,753
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp407
Upstream gene4921531P14Rik, LOC665284, Tshz1, Zadh2, LOC669856
Downstream geneCndp1, EG640234, Cndp2, LOC100039711, LOC100039725, B230399E16Rik, Cyb5, Fbxo15, 1700034H14Rik, LOC100039765
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-153P22.bB6Ng01-153P22.g
ACCDH949155DH949156
length1,1851,092
definitionDH949155|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-153P22, 5' end.DH949156|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-153P22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,382,571 - 84,383,753)(84,288,605 - 84,289,697)
sequence
gaattcaaagttacagtagagattcacattcgtttaagtgacacttgaac
ttctgcatcgctccacattaattcattatggttgaaatggaagaatcttc
aatgggtgaatctttttcaatctgattgaggctgttacattttataggtg
ctatttttcaaagcagtactgacagcactcgaagttattaaattgctgaa
tcaaaagacggacctgcactcacatttatgaactatgatggactggctgg
ggccgcgctgccggaggttaagatgttggtggcattaaacttcatcacag
aaccaactgacagcagtatttacccacacggtttactttaatggtttgga
agtagcttagcccatctctggattcaaatgaactgagcaagtagttcgga
atcataattatcagtggtgcaaggaattcagaggctcattctgtacccaa
gacggtttccttccgttttctagtgagtagtggattgctggggcccaagc
aagtggtctttcttgccttctaagaataatatttttctcatttcccccaa
cttgtatggtttctcctgatttttactgtaaacgcaataatctcttctta
tgtaattactgggggcagagccagttgaatgaagcagtctgtgaattaca
ccatatataaccttgaaatcaggatgagcagacacaaatccaaatcagaa
gtaagaaaggcaagcaaaatactgcattccaggctggaaagttagagctg
ggttatgacattgcatgcatagcagaagagagcccgacagacccaggtga
tgagctagaggacccagtgaatgacacacagacggactgaccaggagcaa
ggcccactcaaaccctgtcacagatgcagtcagtctgtggtgcttctagt
gttggatctcttcagagactgacgcagctaacctctcagagaagaaaatt
gaggacaggtgaaaggtgaatgacaacatgagcgtaggtgaacccgtgga
gaacctgctcatggaggcctgcctcatgcgacctgcttcatcaaaccggc
ttcatggaaggctgctcatgggaacctgctcattgaagctgctcatgaga
cctgctccatgaaggccgtctctgtcaacccgctctatggaaaactgctc
atagcaacctgctcattgagaggcttgctcatgca
gaattctcattgaaagtcaacaaggaagcattcctgtttcctgttgctga
ctgtggacttggtgtgaccgactccctcccaggcctgttgctcaatctgt
gagccaaaataaacactctgtccttcaaaacgtgtcaccagggaactgag
atgtcacttgcaatgtagagtcactcaccactcaccaggctgcttcctta
tgttaatgttaataatttctttggtgatatcatcatagcttaacttgtca
cttttaagttttgcctttatctagaaaaggcaatgcacatgaagaggtct
cctgcctcagcacccagccactttgttttagacaagatctcttgttggct
cagaacttgtagtttaggttaggctagctggctagtggattgcctcaaca
ctcagcctcactccaacaaacatgtctgccctgcctcagcattcctgcct
ctgcttgtcagaaggctgtgcatggccccacattgtggagaatcgctaca
caccatgtccggtcccattcctacttcccggtaaaagtatgagattatga
tccttcctgtatctggcaacatggattcatgggattgtactcaggtcccc
atgcatatatagacagtcatttcccagaggcatgatggtcaactctacaa
ggtgtatttcagaagctgtgtatgatatgctcatctgtactgaaggggct
gtggctggctcaccagacacaagggaggcatcctgacctcctgttagcca
gtgacagagtgggacgcatggttgctcaggatacatctgccccatgagat
gaacgtcacccaccacatagcaaaaacctgagctctgccttgttctcaca
gtgaatgtttggggtgcacaccaacttcctaggctgatgtaacaaatgat
caaaacgtggcttaacactgggaagagggtcataaaaacaccaaatccat
caggagctatggacagctgataatttcagaaggagggaaatgagtttaat
taaggtggggcctcctggtaaggtgaccatgtttccagtgaatggccccc
cacctattccgaagtggatgaacacattcgagttgatgggta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_84382571_84383753
seq2: B6Ng01-153P22.b_47_1231 (reverse)

seq1  TGCATGAGCAGGC--CTCCATGAGCAGGTCTGC-ATGAGCAGGTCTCCAT  47
      |||||||||| ||  ||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||
seq2  TGCATGAGCAAGCCTCTCAATGAGCAGGT-TGCTATGAGCAGTTTTCCAT  49

seq1  -GAGCAGGTCTGCATGAGCAGGCCTCCAT-GAGCAGGTCTACATGAGCAG  95
       |||| ||| ||   |||  ||||| ||| |||||||||| |||||||||
seq2  AGAGCGGGT-TGACAGAGACGGCCTTCATGGAGCAGGTCT-CATGAGCAG  97

seq1  CCTCCATGAGCAGGTCTCCATGAGCAGCC-TCCATG-AGCCGGTCTGCAT  143
      | || ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| || ||
seq2  CTTCAATGAGCAGGTTCCCATGAGCAGCCTTCCATGAAGCCGGTTTG-AT  146

seq1  G-AGCAGGTCTGCATGA-GCAGGCCTCCATGAGCAGG-TCTCCACGGGTT  190
      | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GAAGCAGGTC-GCATGAGGCAGGCCTCCATGAGCAGGTTCTCCACGGGTT  195

seq1  CACCTACGCTCATGTTGTCATTTCACCTTTCACCTGTCCTCAATTTTCTT  240
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTACGCTCATGTTGTCA-TTCACCTTTCACCTGTCCTCAATTTTCTT  244

seq1  CTCTGAGAGGTTAGCCTGCGTCAGTCTCTGAAGAGATCCAACACTAGAAG  290
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAGAGGTTAG-CTGCGTCAGTCTCTGAAGAGATCCAACACTAGAAG  293

seq1  CACCACAGACCTGACTGCATCTGTGACAGGGTTTGAGTGGGCCTTGCTCC  340
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACAGA-CTGACTGCATCTGTGACAGGGTTTGAGTGGGCCTTGCTCC  342

seq1  TGGTCAGTCCGTCTGTGTGTCATTCACTGGGTCCTCTAGCTCATCACCTG  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCAGTCCGTCTGTGTGTCATTCACTGGGTCCTCTAGCTCATCACCTG  392

seq1  GGTCTGTCGGGCTCTCTTCTGCTATGCATGCAATGTCATAACCCAGCTCT  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTGTCGGGCTCTCTTCTGCTATGCATGCAATGTCATAACCCAGCTCT  442

seq1  AACTTTCCAGCCTGGAATGCAGTATTTTGCTTGCCTTTCTTACTTCTGAT  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTTCCAGCCTGGAATGCAGTATTTTGCTTGCCTTTCTTACTTCTGAT  492

seq1  TTGGATTTGTGTCTGCTCATCCTGATTTCAAGGTTATATATGGTGTAATT  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATTTGTGTCTGCTCATCCTGATTTCAAGGTTATATATGGTGTAATT  542

seq1  CACAGACTGCTTCATTCAACTGGCTCTGCCCCCAGTAATTACATAAGAAG  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGACTGCTTCATTCAACTGGCTCTGCCCCCAGTAATTACATAAGAAG  592

seq1  AGATTATTGCGTTTACAGTAAAAATCAGGAGAAACCATACAAGTTGGGGG  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTATTGCGTTTACAGTAAAAATCAGGAGAAACCATACAAGTTGGGGG  642

seq1  AAATGAGAAAAATATTATTCTTAGAAGGCAAGAAAGACCACTTGCTTGGG  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAGAAAAATATTATTCTTAGAAGGCAAGAAAGACCACTTGCTTGGG  692

seq1  CCCCAGCAATCCACTACTCACTAGAAAACGGAAGGAAACCGTCTTGGGTA  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGCAATCCACTACTCACTAGAAAACGGAAGGAAACCGTCTTGGGTA  742

seq1  CAGAATGAGCCTCTGAATTCCTTGCACCACTGATAATTATGATTCCGAAC  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATGAGCCTCTGAATTCCTTGCACCACTGATAATTATGATTCCGAAC  792

seq1  TACTTGCTCAGTTCATTTGAATCCAGAGATGGGCTAAGCTACTTCCAAAC  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGCTCAGTTCATTTGAATCCAGAGATGGGCTAAGCTACTTCCAAAC  842

seq1  CATTAAAGTAAACCGTGTGGGTAAATACTGCTGTCAGTTGGTTCTGTGAT  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAAAGTAAACCGTGTGGGTAAATACTGCTGTCAGTTGGTTCTGTGAT  892

seq1  GAAGTTTAATGCCACCAACATCTTAACCTCCGGCAGCGCGGCCCCAGCCA  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTTAATGCCACCAACATCTTAACCTCCGGCAGCGCGGCCCCAGCCA  942

seq1  GTCCATCATAGTTCATAAATGTGAGTGCAGGTCCGTCTTTTGATTCAGCA  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCATCATAGTTCATAAATGTGAGTGCAGGTCCGTCTTTTGATTCAGCA  992

seq1  ATTTAATAACTTCGAGTGCTGTCAGTACTGCTTTGAAAAATAGCACCTAT  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAATAACTTCGAGTGCTGTCAGTACTGCTTTGAAAAATAGCACCTAT  1042

seq1  AAAATGTAACAGCCTCAATCAGATTGAAAAAGATTCACCCATTGAAGATT  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGTAACAGCCTCAATCAGATTGAAAAAGATTCACCCATTGAAGATT  1092

seq1  CTTCCATTTCAACCATAATGAATTAATGTGGAGCGATGCAGAAGTTCAAG  1140
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCATTTCAACCATAATGAATTAATGTGGAGCGATGCAGAAGTTCAAG  1142

seq1  TGTCACTTAAACGAATGTGAATCTCTACTGTAACTTTGAATTC  1183
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACTTAAACGAATGTGAATCTCTACTGTAACTTTGAATTC  1185

seq1: chr18_84288605_84289697
seq2: B6Ng01-153P22.g_68_1159

seq1  GAATTCTCATTGAAAGTCAACAAGGAAGCATTCCTGTTTCCTGTTGCTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATTGAAAGTCAACAAGGAAGCATTCCTGTTTCCTGTTGCTGA  50

seq1  CTGTGGACTTGGTGTGACCGACTCCCTCCCAGGCCTGTTGCTCAATCTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGACTTGGTGTGACCGACTCCCTCCCAGGCCTGTTGCTCAATCTGT  100

seq1  GAGCCAAAATAAACACTCTGTCCTTCAAAACGTGTCACCAGGGAACTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAAAATAAACACTCTGTCCTTCAAAACGTGTCACCAGGGAACTGAG  150

seq1  ATGTCACTTGCAATGTAGAGTCACTCACCACTCACCAGGCTGCTTCCTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCACTTGCAATGTAGAGTCACTCACCACTCACCAGGCTGCTTCCTTA  200

seq1  TGTTAATGTTAATAATTTCTTTGGTGATATCATCATAGCTTAACTTGTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAATGTTAATAATTTCTTTGGTGATATCATCATAGCTTAACTTGTCA  250

seq1  CTTTTAAGTTTTGCCTTTATCTAGAAAAGGCAATGCACATGAAGAGGTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAAGTTTTGCCTTTATCTAGAAAAGGCAATGCACATGAAGAGGTCT  300

seq1  CCTGCCTCAGCACCCAGCCACTTTGTTTTAGACAAGATCTCTTGTTGGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCTCAGCACCCAGCCACTTTGTTTTAGACAAGATCTCTTGTTGGCT  350

seq1  CAGAACTTGTAGTTTAGGTTAGGCTAGCTGGCTAGTGGATTGCCTCAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACTTGTAGTTTAGGTTAGGCTAGCTGGCTAGTGGATTGCCTCAACA  400

seq1  CTCAGCCTCACTCCAACAAACATGTCTGCCCTGCCTCAGCATTCCTGCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCCTCACTCCAACAAACATGTCTGCCCTGCCTCAGCATTCCTGCCT  450

seq1  CTGCTTGTCAGAAGGCTGTGCATGGCCCCACATTGTGGAGAATCGCTACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTGTCAGAAGGCTGTGCATGGCCCCACATTGTGGAGAATCGCTACA  500

seq1  CACCATGTCCGGTCCCATTCCTACTTCCCGGTAAAAGTATGAGATTATGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATGTCCGGTCCCATTCCTACTTCCCGGTAAAAGTATGAGATTATGA  550

seq1  TCCTTCCTGTATCTGGCAACATGGATTCATGGGATTGTACTCAGGTCCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCCTGTATCTGGCAACATGGATTCATGGGATTGTACTCAGGTCCCC  600

seq1  ATGCATATATAGACAGTCATTTCCCAGAGGCATGATGGTCAACTCTACAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATATATAGACAGTCATTTCCCAGAGGCATGATGGTCAACTCTACAA  650

seq1  GGTGTATTTCAGAAGCTGTGTATGATATGCTCATCTGTACTGAAGGGGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTATTTCAGAAGCTGTGTATGATATGCTCATCTGTACTGAAGGGGCT  700

seq1  GTGGCTGGCTCACCAGACACAAGGGAGGCATCCTGACCTCCTGTTAGCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTGGCTCACCAGACACAAGGGAGGCATCCTGACCTCCTGTTAGCCA  750

seq1  GTGACAGAGTGGGACGCATGGTTGCTCAGGATACATCTGCCCCATGAGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACAGAGTGGGACGCATGGTTGCTCAGGATACATCTGCCCCATGAGAT  800

seq1  GAACGTCACCCACCACATAGCAAAAACCTGAGCTCTGCCTTGTTCTCACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACGTCACCCACCACATAGCAAAAACCTGAGCTCTGCCTTGTTCTCACA  850

seq1  GTGAATGTTTGGGGTGCACACCAACTTCCTAGGCTGATGTAACAAATGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATGTTTGGGGTGCACACCAACTTCCTAGGCTGATGTAACAAATGAT  900

seq1  CAAAAACGTGGCTTAACACTGGGAAGAGGGTCAT-AAAACACCAAATCCA  949
      | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| 
seq2  C-AAAACGTGGCTTAACACTGGGAAGAGGGTCATAAAAACACCAAATCC-  948

seq1  ATCAGGGAGCTATGGACAGCTGATAATTCCAG-AGGAGGGAAATGAGTTT  998
      |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||
seq2  ATCA-GGAGCTATGGACAGCTGATAATTTCAGAAGGAGGGAAATGAG-TT  996

seq1  TAATTAAGGTTGTGACTCCTGGTAGGTTGACCATG-TTCCAGTGAATGGC  1047
      |||||||||| | | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||
seq2  TAATTAAGGTGGGGCCTCCTGGTAAGGTGACCATGTTTCCAGTGAATGGC  1046

seq1  CCCACACCTATCCAGAAGTGGATG-ACACAATCGGAGTTGATGGGTA  1093
      ||| ||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||
seq2  CCCCCACCTATTCCGAAGTGGATGAACACATTC-GAGTTGATGGGTA  1092