BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-219F22
Chromosome18 (Build37)
Map Location 27,354,915 - 27,471,257
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG665977
Downstream geneEG665646, EG271505
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-219F22.bB6Ng01-219F22.g
ACCGA035226GA035227
length571852
definitionB6Ng01-219F22.b B6Ng01-219F22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(27,354,915 - 27,355,491)(27,470,406 - 27,471,257)
sequence
attggctgaaagtaaaatgcaatggctcaggtatatgaaatgccagagag
aaatcgcttcaattgaattctaagctgtgagaatggattaatatagttac
aatactgatatcatatacttacaataaattgtctatatgaagttcaatag
catgtataaagtatacatgcaaagtaaggtataaaatttacatttgaaat
aaacataataatataggtatgcatcttatgtcccccttttcattgtcatt
acaaaattttgggagtgtgtctataacagatttggcttattaacagtagc
aaatcaaagaaacagatatgtaaaaagtggctaagaacttattctagaac
atcttctttattaaatgcattacctgtttgcctgcttggtgtaaattaat
tccaaaactggtcttggaaaatcttgcacctcaatttacatgtctatgga
aaatgtgattccatactaaaatacccattgcattagttaaatttcagaat
gatttctgaggtgtaagactgcaatagtgtgtgtgtatgtgtgtgcatgt
atgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

gaattcagaggaatgcaatacccttaaagggaaccgattagcagcatatt
aaaatttcagaaataaagtgtactgtggtttgaaaaggatcttgggattt
ccactgttataaagagacaccatgaccaaggcaacatttatttatttatt
tatctatttatctatttatttatttatttatttattcatctatctatcta
tctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatttgag
acagggtttctaggtgtagccctggctgtccagaaactcactctgtagac
caggctggcctcgaactcagaaattcacctgcctctgcctcccaagtgct
aggattaaaggcatgcaccaccatgccgggataaggcaacttttataatg
gacaacatttgattgaggcggttttactggttctgtggttcggttattat
catcatggcagtacgtgtagcagcatgcaggcaggcatggtgctgtgctg
ggggaactgagagttgtacatcttgttttggctcccacatggctaggagg
aagatgtcaatgtccttagtgacagtgacatgtttcctccaacaaaggca
cacttactccaagaccacacctcctaattgtttattccctgagccaagca
tattcaaaccaccacaaaaagggaggtaaaggagaaatgttagagaattt
gtaatgtaaattggagatcagaagattatatacaaagacccttatataca
aagatccacaaaactgttataaatgaacggcttctattaaacgtatgtgt
tcctgctgtgtgtgtgcgtgcatgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_27354915_27355491
seq2: B6Ng01-219F22.b_41_617

seq1  GAATTCATTGGCTGAAAGTAAAATGCAATGGCTCAGGTATATGAAATGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGGCTGAAAGTAAAATGCAATGGCTCAGGTATATGAAATGCC  50

seq1  AGAGAGAAATCGCTTCAATTGAATTCTAAGCTGTGAGAATGGATTAATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAAATCGCTTCAATTGAATTCTAAGCTGTGAGAATGGATTAATAT  100

seq1  AGTTACAATACTGATATCATATACTTACAATAAATTGTCTATATGAAGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACAATACTGATATCATATACTTACAATAAATTGTCTATATGAAGTT  150

seq1  CAATAGCATGTATAAAGTATACATGCAAAGTAAGGTATAAAATTTACATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGCATGTATAAAGTATACATGCAAAGTAAGGTATAAAATTTACATT  200

seq1  TGAAATAAACATAATAATATAGGTATGCATCTTATGTCCCCCTTTTCATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATAAACATAATAATATAGGTATGCATCTTATGTCCCCCTTTTCATT  250

seq1  GTCATTACAAAATTTTGGGAGTGTGTCTATAACAGATTTGGCTTATTAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTACAAAATTTTGGGAGTGTGTCTATAACAGATTTGGCTTATTAAC  300

seq1  AGTAGCAAATCAAAGAAACAGATATGTAAAAAGTGGCTAAGAACTTATTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGCAAATCAAAGAAACAGATATGTAAAAAGTGGCTAAGAACTTATTC  350

seq1  TAGAACATCTTCTTTATTAAATGCATTACCTGTTTGCCTGCTTGGTGTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACATCTTCTTTATTAAATGCATTACCTGTTTGCCTGCTTGGTGTAA  400

seq1  ATTAATTCCAAAACTGGTCTTGGAAAATCTTGCACCTCAATTTACATGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATTCCAAAACTGGTCTTGGAAAATCTTGCACCTCAATTTACATGTC  450

seq1  TATGGAAAATGTGATTCCATACTAAAATACCCATTGCATTAGTTAAATTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAAAATGTGATTCCATACTAAAATACCCATTGCATTAGTTAAATTT  500

seq1  CAGAATGATTTCTGAGGTGTAAGACTGCAATAGTGTGTGTGTATGTGTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATGATTTCTGAGGTGTAAGACTGCAATAGTGTGTGTGTATGTGTGT  550

seq1  GCATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  577
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  577


seq1: chr18_27470406_27471257
seq2: B6Ng01-219F22.g_68_919 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACACACACATACATGCACGCACACACACAGCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACATACATGCACGCACACACACAGCAG  50

seq1  GAACACATACGTTTAATAGAAGCCGTTCATTTATAACAGTTTTGTGGATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACACATACGTTTAATAGAAGCCGTTCATTTATAACAGTTTTGTGGATC  100

seq1  TTTGTATATAAGGGTCTTTGTATATAATCTTCTGATCTCCAATTTACATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTATATAAGGGTCTTTGTATATAATCTTCTGATCTCCAATTTACATT  150

seq1  ACAAATTCTCTAACATTTCTCCTTTACCTCCCTTTTTGTGGTGGTTTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATTCTCTAACATTTCTCCTTTACCTCCCTTTTTGTGGTGGTTTGAA  200

seq1  TATGCTTGGCTCAGGGAATAAACAATTAGGAGGTGTGGTCTTGGAGTAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTTGGCTCAGGGAATAAACAATTAGGAGGTGTGGTCTTGGAGTAAG  250

seq1  TGTGCCTTTGTTGGAGGAAACATGTCACTGTCACTAAGGACATTGACATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCTTTGTTGGAGGAAACATGTCACTGTCACTAAGGACATTGACATC  300

seq1  TTCCTCCTAGCCATGTGGGAGCCAAAACAAGATGTACAACTCTCAGTTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCCTAGCCATGTGGGAGCCAAAACAAGATGTACAACTCTCAGTTCC  350

seq1  CCCAGCACAGCACCATGCCTGCCTGCATGCTGCTACACGTACTGCCATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCACAGCACCATGCCTGCCTGCATGCTGCTACACGTACTGCCATGA  400

seq1  TGATAATAACCGAACCACAGAACCAGTAAAACCGCCTCAATCAAATGTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAATAACCGAACCACAGAACCAGTAAAACCGCCTCAATCAAATGTTG  450

seq1  TCCATTATAAAAGTTGCCTTATCCCGGCATGGTGGTGCATGCCTTTAATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTATAAAAGTTGCCTTATCCCGGCATGGTGGTGCATGCCTTTAATC  500

seq1  CTAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGAATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGAATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCC  550

seq1  TGGTCTACAGAGTGAGTTTCTGGACAGCCAGGGCTACACCTAGAAACCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTACAGAGTGAGTTTCTGGACAGCCAGGGCTACACCTAGAAACCCT  600

seq1  GTCTCAAATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAAATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA  650

seq1  GATAGATAGATAGATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAGATAAATAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATAGATAGATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAGATAAATAGA  700

seq1  TAAATAAATAAATAAATGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTCTTTATAACAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATAAATAAATAAATGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTCTTTATAACAGT  750

seq1  GGAAATCCCAAGATCCTTTTCAAACCACAGTACACTTTATTTCTGAAATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATCCCAAGATCCTTTTCAAACCACAGTACACTTTATTTCTGAAATT  800

seq1  TTAATATGCTGCTAATCGGTTCCCTTTAAGGGTATTGCATTCCTCTGAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATGCTGCTAATCGGTTCCCTTTAAGGGTATTGCATTCCTCTGAAT  850

seq1  TC  852
      ||
seq2  TC  852


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |