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BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-245P15
Chromosome	18 (Build37)
Map Location	82,596,352 - 82,597,163
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	LOC100039458, LOC100040871, B020010K11Rik, Galr1
Downstream gene	Mbp, EG637748, Zfp236, LOC100039563, Zfp516, LOC100041001, 4921531P14Rik
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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name		B6Ng01-245P15.g
ACC		GA054721
length		814
definition		B6Ng01-245P15.g
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence		gaattcatcaccgaggtctggataggagcttttcttgtggatgctcccac ctgaaaagtgtccacacgctacgtgttgttgttctagattaagttcttct ggctgcagtgatgaaggaggagacctgatatggcagacactgagtaagct tcctcctcagctgtctccataacagcagggctggtgggacattgcaagca tggcacagagagtgaccagccatgtatcactctgatggaagctggtgatc ggcaatggcccaggaagagctgcgtgtggtgactgataagctagcaggtt ggatggttacaaatatgagtagatggaatggtggttaagtggtggaggct gcagggtcttctgtttgtgctggtggtgggtgtctgatcttttgaacaat taaaacgatgttatctataaatatagggctatgctcagctattctaggat atatgtggcctatgatctgtagggttgcgatctctgcaagtgagcctaga aagaacaaacaggagaaatagaaatctatgcacgcacagttgaaagtgtg cagcctggctctagaatctgtttctgtgtgttcagtgttcagagaagcag agctagctggggaggccaaagtggggataacttttcctgagtcctacaga atgctcccttggaatcacccccaaactcagctgagtcccagctcattgga ggtccaaggcttgagaatcaggggacatgtgcagctgatactggatagag ccactctttgggagccagagctacagaaggcacagtctggatatgggggt tgtggatgtggggt
quality values		Open. Hide. 62 47 42 44 62 47 44 62 59 62 51 39 19 21 19 32 28 28 36 34 49 46 40 59 59 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 59 59 59 56 48 49 54 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 59 59 59 62 62 62 62 54 62 62 62 62 59 59 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 59 62 62 62 62 62 62 59 59 62 59 59 59 59 62 62 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 62 59 59 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 54 59 62 62 62 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 62 62 59 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 62 62 62 62 54 49 59 62 62 62 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 62 62 59 56 59 62 62 56 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 56 62 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 50 56 50 56 56 62 62 59 62 62 62 62 51 59 59 56 59 59 56 51 62 62 38 51 51 50 39 42 62 62 62 62 56 62 62 62 62 62 62 62 56 56 56 56 62 62 47 62 62 62 62 62 47 39 62 62 56 62 62 62 51 62 62 47 47 62 62 62 47 41 56 56 62 50 42 31 38 38 47 47 32 62 62 56 39 56 47 32 38 43 62 62 56 47 62 62 56 62 62 43 52 43 23 52 47 52 62 62 62 42 43 35 28 23 27 21 28 42 47 45 52 52 54 54 62 62 62 52 62 58 54 58 58 52 39 41 54 45 54 34 52 54 50 49 52 50 48 52 54 54 49 42 30 58 10 21 44 58 52 54 58 54 54 36 50 52 47 30 58 40 48 58 52 16 58 50 52 54 37 48 52 34 54 19 52 52 46 33 32 52 50 52 52 52 42 33 49 48 50 27 51 50 50 49 46 38 39 47 46 40 50 54 52 44 58 48 53 53 50 50 50 51 50 48 30 29 17 38 42 13 21 58 16 26 50 32 40 29 31 37 27 42 58 48 48 22 33 39 37 39 40 35 32 35 27 49 35 41 54 36 40 26 31 39 41 32 6 40 32 30 29 30 13 37 41 50 43 39 28 40 29 16 6 49 30 29 46 33 37 24 58 32 53 53 51 32 24 46 50 50 26 34 15 44 31 34 37 39 34 53 37 37 29 27 13 13 25 32 28 29 11 19 29 39 39 29 44 41 37 35 41 27 33 41 35 33 33 33 45 54 25 52 33 21 25 19 20 20 29 26 38 10 31 31 14 31 16 29 44 19 15 27 33 14 17 35 25 41 28 35 41 21 40 29 33 30 19 40 32 32 23 18 14 29 31 11 7 6 5 13 21 15 14 9 5 7

Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
	seq1: chr18_82596352_82597163 seq2: B6Ng01-245P15.g_65_878 (reverse) seq1 ACCCCACATCCACAA-CCCCATATCCAGACTGTGCCTTCTGTAGCTCTGG 49 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACCCCACATCCACAACCCCCATATCCAGACTGTGCCTTCTGTAGCTCTGG 50 seq1 CTCCCAAAGAGTGGCTCTATCCAGTATCAGCTGCACATGTCCCCTGATTC 99 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTCCCAAAGAGTGGCTCTATCCAGTATCAGCTGCACATGTCCCCTGATTC 100 seq1 TCAAGCCTTGGACCTCCAATGAGCTGGGACTCAGCTGAGTTTGGGGGTGA 149 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCAAGCCTTGGACCTCCAATGAGCTGGGACTCAGCTGAGTTTGGGGGTGA 150 seq1 TTCCAAGGGAGCATTCTGTAGGACTCAGGAAAAGTTATCCCCACTTTGGC 199 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTCCAAGGGAGCATTCTGTAGGACTCAGGAAAAGTTATCCCCACTTTGGC 200 seq1 CTCCCCAGCTAGCTCTGCTTCTCTGAACACTGAACACACAG-AACAGATT 248 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTCCCCAGCTAGCTCTGCTTCTCTGAACACTGAACACACAGAAACAGATT 250 seq1 CTAGAGCCAGGCTGCACACTTTCAACTGTGCGTGCATAGATTTCTATTTC 298 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTAGAGCCAGGCTGCACACTTTCAACTGTGCGTGCATAGATTTCTATTTC 300 seq1 TCCTGTTTGTTCTTTCTAGGCTCACTTGCAGAGATCGCAACCCTACAGAT 348 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCCTGTTTGTTCTTTCTAGGCTCACTTGCAGAGATCGCAACCCTACAGAT 350 seq1 CATAGGCCACATATATCCTAGAATAGCTGAGCATAGCCCTATATTTATAG 398 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CATAGGCCACATATATCCTAGAATAGCTGAGCATAGCCCTATATTTATAG 400 seq1 ATAACATCGTTTTAATTGTTCAAAAGATCAGACACCCACCACCAGCACAA 448 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATAACATCGTTTTAATTGTTCAAAAGATCAGACACCCACCACCAGCACAA 450 seq1 ACAGAAGACCCTGCAGCCTCCACCACTTAACCACCATTCCATCTACTCAT 498 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACAGAAGACCCTGCAGCCTCCACCACTTAACCACCATTCCATCTACTCAT 500 seq1 ATTTGTAACCATCCAACCTGCTAGCTTATCAGTCACCACACGCAGCTCTT 548 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTTGTAACCATCCAACCTGCTAGCTTATCAGTCACCACACGCAGCTCTT 550 seq1 CCTGGGCCATTGCCGATCACCAGCTTCCATCAGAGTGATACATGGCTGGT 598 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTGGGCCATTGCCGATCACCAGCTTCCATCAGAGTGATACATGGCTGGT 600 seq1 CACTCTCTGTGCCATGCTTGCAATGTCCCACCAGCCCTGCTGTTATGGAG 648 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CACTCTCTGTGCCATGCTTGCAATGTCCCACCAGCCCTGCTGTTATGGAG 650 seq1 ACAGCTGAGGAGGAAGCTTACTCAGTGTCTGCCATATCAGGTCTCCTCCT 698 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACAGCTGAGGAGGAAGCTTACTCAGTGTCTGCCATATCAGGTCTCCTCCT 700 seq1 TCATCACTGCAGCCAGAAGAACTTAATCTAGAACAACAACACGTAGCGTG 748 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCATCACTGCAGCCAGAAGAACTTAATCTAGAACAACAACACGTAGCGTG 750 seq1 TGGACACTTTTCAGGTGGGAGCATCCACAAGAAAAGCTCCTATCCAGACC 798 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGGACACTTTTCAGGTGGGAGCATCCACAAGAAAAGCTCCTATCCAGACC 800 seq1 TCGGTGATGAATTC 812 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCGGTGATGAATTC 814

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr18_82596352_82597163
seq2: B6Ng01-245P15.g_65_878 (reverse)

seq1  ACCCCACATCCACAA-CCCCATATCCAGACTGTGCCTTCTGTAGCTCTGG  49
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCACATCCACAACCCCCATATCCAGACTGTGCCTTCTGTAGCTCTGG  50

seq1  CTCCCAAAGAGTGGCTCTATCCAGTATCAGCTGCACATGTCCCCTGATTC  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAAAGAGTGGCTCTATCCAGTATCAGCTGCACATGTCCCCTGATTC  100

seq1  TCAAGCCTTGGACCTCCAATGAGCTGGGACTCAGCTGAGTTTGGGGGTGA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGCCTTGGACCTCCAATGAGCTGGGACTCAGCTGAGTTTGGGGGTGA  150

seq1  TTCCAAGGGAGCATTCTGTAGGACTCAGGAAAAGTTATCCCCACTTTGGC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAGGGAGCATTCTGTAGGACTCAGGAAAAGTTATCCCCACTTTGGC  200

seq1  CTCCCCAGCTAGCTCTGCTTCTCTGAACACTGAACACACAG-AACAGATT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTCCCCAGCTAGCTCTGCTTCTCTGAACACTGAACACACAGAAACAGATT  250

seq1  CTAGAGCCAGGCTGCACACTTTCAACTGTGCGTGCATAGATTTCTATTTC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAGCCAGGCTGCACACTTTCAACTGTGCGTGCATAGATTTCTATTTC  300

seq1  TCCTGTTTGTTCTTTCTAGGCTCACTTGCAGAGATCGCAACCCTACAGAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTTTGTTCTTTCTAGGCTCACTTGCAGAGATCGCAACCCTACAGAT  350

seq1  CATAGGCCACATATATCCTAGAATAGCTGAGCATAGCCCTATATTTATAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGGCCACATATATCCTAGAATAGCTGAGCATAGCCCTATATTTATAG  400

seq1  ATAACATCGTTTTAATTGTTCAAAAGATCAGACACCCACCACCAGCACAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACATCGTTTTAATTGTTCAAAAGATCAGACACCCACCACCAGCACAA  450

seq1  ACAGAAGACCCTGCAGCCTCCACCACTTAACCACCATTCCATCTACTCAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAGACCCTGCAGCCTCCACCACTTAACCACCATTCCATCTACTCAT  500

seq1  ATTTGTAACCATCCAACCTGCTAGCTTATCAGTCACCACACGCAGCTCTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTAACCATCCAACCTGCTAGCTTATCAGTCACCACACGCAGCTCTT  550

seq1  CCTGGGCCATTGCCGATCACCAGCTTCCATCAGAGTGATACATGGCTGGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGCCATTGCCGATCACCAGCTTCCATCAGAGTGATACATGGCTGGT  600

seq1  CACTCTCTGTGCCATGCTTGCAATGTCCCACCAGCCCTGCTGTTATGGAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTCTGTGCCATGCTTGCAATGTCCCACCAGCCCTGCTGTTATGGAG  650

seq1  ACAGCTGAGGAGGAAGCTTACTCAGTGTCTGCCATATCAGGTCTCCTCCT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTGAGGAGGAAGCTTACTCAGTGTCTGCCATATCAGGTCTCCTCCT  700

seq1  TCATCACTGCAGCCAGAAGAACTTAATCTAGAACAACAACACGTAGCGTG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCACTGCAGCCAGAAGAACTTAATCTAGAACAACAACACGTAGCGTG  750

seq1  TGGACACTTTTCAGGTGGGAGCATCCACAAGAAAAGCTCCTATCCAGACC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACACTTTTCAGGTGGGAGCATCCACAAGAAAAGCTCCTATCCAGACC  800

seq1  TCGGTGATGAATTC  812
      ||||||||||||||
seq2  TCGGTGATGAATTC  814

BAC Information

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