BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-256K07
Chromosome18 (Build37)
Map Location 84,107,849 - 84,265,215
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTshz1, Zadh2
Upstream geneZfp516, LOC100041001, 4921531P14Rik, LOC665284
Downstream geneLOC669856, Zfp407, Cndp1, EG640234, Cndp2, LOC100039711, LOC100039725, B230399E16Rik, Cyb5, Fbxo15, 1700034H14Rik, LOC100039765
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-256K07.bB6Ng01-256K07.g
ACCGA062548GA062549
length1,0141,136
definitionB6Ng01-256K07.b B6Ng01-256K07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,264,201 - 84,265,215)(84,107,849 - 84,108,975)
sequence
gaattctctcccaaatgtctatttagatgggaggttagtgattttagggg
gaaaaggctcctcaggcacactgcctgtgagaatccaaggtggaccgaca
ctgctttctcaactgttcagtgcttgacacgagaacgactgctttcaatg
caaaggagactcggtgagctctctgaagactgatttaaaaaaaaaaaatc
tcatcaagctggggacatactgactcgatcaggtctcacacatcaggaat
taatttacttccctggaacaataaaatctggaatgagaccgtccatgact
aaagactcaaatgtaaacgttttacctcttagctagagagagaactctga
ttgaggcacattatttttacccccaaggaaagggaggcaattcattaaca
ctatacttttgtttttaagaaatattaagttcgttttaaggcatggagaa
ttcatttctctcctttggtttctgtcactgtcctgttggtcacagcttac
tgctgacagggtgtggtaactcaacaacaagcttcccagtatttttcccc
gtgtacatatagtcgacagcctgaaacacggactccaggccaatgaacct
tccatccggagccaggtgtcccaggtccacctcacacaccaggtccccac
gagcgtacagctccagcaaacgttccatggcagcctggtacttggagaag
tagtggttcagaaagaaacccctgaggctggccgacttcttcaggagctt
ggttggcaaaactcccgcttttattggtgagagtcctgtagggctttggt
agccagagataaacccaatcactatcaagcgccctttggtggccaaggca
tccacagccaggtcaaacatggctcccccaacagactcatagactacgtc
aacgccttcagggtactccttgcttcagaaccgtctccacaggctctgtt
ctgtagttgatgggccgatcacacccaattgatttcagaaagctgctttt
cgtctgaggagcag
gaattcccagttgccagacctatcaaagcaaaaaggtgaatagatcgtgt
ccaaagaacaactacctcagcactacttgatactgggcctctctcagcac
aggaaactcatctcctccttgaccttcaaaattgtcaccaagttagttta
ccaggcctgccatcgacctcgctgactgggaaaacagcagaaatgggttg
gccctcagtttgaagactagacattcaagaccacttgtccagctgtggca
tcgagcagcaacatctgtacctcctgactcctccccaggagtcttgtctc
gagttccttctttagaacacagttagttcttctgtattagaggttctcca
cagtgcctcagttttacacatatcgtcccttaaacacattgttgccaaag
agcttcatgttctgagatacaagggggttaagacttcaaccagaaacaga
aacctttttgataaggatttagtcacaatttactgttgagctgttgtgaa
tgtccggggcgagaacctcagaaagcccaaatacagtcagctgcaaagca
gctgcagacaagggtcaaggtctttaccagacagggcatttcactcaaat
aagagatggcttcacttttaagcacatcacacaggttgctagaatgagga
attgtaacttactgcatgcaacatgggtgggaacatacaagcccagcccg
ctagcaccacgaacccttcttgaacacaccacaggtgctgccagcaaatt
ctgcgaggtcgagtctttagggtcactcctttatggaatttaccacatat
gtgtgtttcatccctcatcccacactgtatttcaatagatcctcagcgca
tggcgacctcagtgacttcttcatgtcctcatgtggcagctaacaagcca
agatacttgggttatgcttgagcttattcttctttcaataaagtcaacaa
agcccagcctattggggagttttgttttgaatcttggttactagagtcga
tactgcttcccaaaatgctaccttccatctgcttggctcagcccacttac
ttagtaataggggcttgctgattgttagtacattaaggacgagttcacat
tggattggacgttgtctataatcaatctggactggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_84264201_84265215
seq2: B6Ng01-256K07.b_43_1056 (reverse)

seq1  CTGCTCCTCAGACGAAAAGGCAGCTTTTCTGAAATCAATTGGGTGTGATC  50
      |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCCTCAGACGAAAA-GCAGC-TTTCTGAAATCAATTGGGTGTGATC  48

seq1  GGCCCATCAACTACAGAACAGAGCCTGTGGAGACGGTTCTGAAGC-AGGA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGCCCATCAACTACAGAACAGAGCCTGTGGAGACGGTTCTGAAGCAAGGA  98

seq1  GTACCCTGAAGGCGTTGACGTAGTCTATGAGTCTGTTGGGGGAGCCATGT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCCTGAAGGCGTTGACGTAGTCTATGAGTCTGTTGGGGGAGCCATGT  148

seq1  TTGACCTGGCTGTGGATGCCTTGGCCACCAAAGGGCGCTTGATAGTGATT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACCTGGCTGTGGATGCCTTGGCCACCAAAGGGCGCTTGATAGTGATT  198

seq1  GGGTTTATCTCTGGCTACCAAAGCCCTACAGGACTCTCACCAATAAAAGC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTATCTCTGGCTACCAAAGCCCTACAGGACTCTCACCAATAAAAGC  248

seq1  GGGAGTTTTGCCAACCAAGCTCCTGAAGAAGTCGGCCAGCCTCAGGGGTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGTTTTGCCAACCAAGCTCCTGAAGAAGTCGGCCAGCCTCAGGGGTT  298

seq1  TCTTTCTGAACCACTACTTCTCCAAGTACCAGGCTGCCATGGAACGTTTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCTGAACCACTACTTCTCCAAGTACCAGGCTGCCATGGAACGTTTG  348

seq1  CTGGAGCTGTACGCTCGTGGGGACCTGGTGTGTGAGGTGGACCTGGGACA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGCTGTACGCTCGTGGGGACCTGGTGTGTGAGGTGGACCTGGGACA  398

seq1  CCTGGCTCCGGATGGAAGGTTCATTGGCCTGGAGTCCGTGTTTCAGGCTG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTCCGGATGGAAGGTTCATTGGCCTGGAGTCCGTGTTTCAGGCTG  448

seq1  TCGACTATATGTACACGGGGAAAAATACTGGGAAGCTTGTTGTTGAGTTA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGACTATATGTACACGGGGAAAAATACTGGGAAGCTTGTTGTTGAGTTA  498

seq1  CCACACCCTGTCAGCAGTAAGCTGTGACCAACAGGACAGTGACAGAAACC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACCCTGTCAGCAGTAAGCTGTGACCAACAGGACAGTGACAGAAACC  548

seq1  AAAGGAGAGAAATGAATTCTCCATGCCTTAAAACGAACTTAATATTTCTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAGAGAAATGAATTCTCCATGCCTTAAAACGAACTTAATATTTCTT  598

seq1  AAAAACAAAAGTATAGTGTTAATGAATTGCCTCCCTTTCCTTGGGGGTAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACAAAAGTATAGTGTTAATGAATTGCCTCCCTTTCCTTGGGGGTAA  648

seq1  AAATAATGTGCCTCAATCAGAGTTCTCTCTCTAGCTAAGAGGTAAAACGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAATGTGCCTCAATCAGAGTTCTCTCTCTAGCTAAGAGGTAAAACGT  698

seq1  TTACATTTGAGTCTTTAGTCATGGACGGTCTCATTCCAGATTTTATTGTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATTTGAGTCTTTAGTCATGGACGGTCTCATTCCAGATTTTATTGTT  748

seq1  CCAGGGAAGTAAATTAATTCCTGATGTGTGAGACCTGATCGAGTCAGTAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGAAGTAAATTAATTCCTGATGTGTGAGACCTGATCGAGTCAGTAT  798

seq1  GTCCCCAGCTTGATGAGATTTTTTTTTTTTAAATCAGTCTTCAGAGAGCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCCAGCTTGATGAGATTTTTTTTTTTTAAATCAGTCTTCAGAGAGCT  848

seq1  CACCGAGTCTCCTTTGCATTGAAAGCAGTCGTTCTCGTGTCAAGCACTGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCGAGTCTCCTTTGCATTGAAAGCAGTCGTTCTCGTGTCAAGCACTGA  898

seq1  ACAGTTGAGAAAGCAGTGTCGGTCCACCTTGGATTCTCACAGGCAGTGTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTGAGAAAGCAGTGTCGGTCCACCTTGGATTCTCACAGGCAGTGTG  948

seq1  CCTGAGGAGCCTTTTCCCCCTAAAATCACTAACCTCCCATCTAAATAGAC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGGAGCCTTTTCCCCCTAAAATCACTAACCTCCCATCTAAATAGAC  998

seq1  ATTTGGGAGAGAATTC  1015
      ||||||||||||||||
seq2  ATTTGGGAGAGAATTC  1014

seq1: chr18_84107849_84108975
seq2: B6Ng01-256K07.g_63_1198

seq1  GAATTCCCAGTTGCCAGACCTATCAAAGCAAAAAGGTGAATAGATCGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAGTTGCCAGACCTATCAAAGCAAAAAGGTGAATAGATCGTGT  50

seq1  CCAAAGAACAACTACCTCAGCACTACTTGATACTGGGCCTCTCTCAGCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGAACAACTACCTCAGCACTACTTGATACTGGGCCTCTCTCAGCAC  100

seq1  AGGAAACTCATCTCCTCCTTGACCTTCAAAATTGTCACCAAGTTAGTTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAACTCATCTCCTCCTTGACCTTCAAAATTGTCACCAAGTTAGTTTA  150

seq1  CCAGGCCTGCCATCGACCTCGCTGACTGGGAAAACAGCAGAAATGGGTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCCTGCCATCGACCTCGCTGACTGGGAAAACAGCAGAAATGGGTTG  200

seq1  GCCCTCAGTTTGAAGACTAGACATTCAAGACCACTTGTCCAGCTGTGGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCAGTTTGAAGACTAGACATTCAAGACCACTTGTCCAGCTGTGGCA  250

seq1  TCGAGCAGCAACATCTGTACCTCCTGACTCCTCCCCAGGAGTCTTGTCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAGCAGCAACATCTGTACCTCCTGACTCCTCCCCAGGAGTCTTGTCTC  300

seq1  GAGTTCCTTCTTTAGAACACAGTTAGTTCTTCTGTATTAGAGGTTCTCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCCTTCTTTAGAACACAGTTAGTTCTTCTGTATTAGAGGTTCTCCA  350

seq1  CAGTGCCTCAGTTTTACACATATCGTCCCTTAAACACATTGTTGCCAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCCTCAGTTTTACACATATCGTCCCTTAAACACATTGTTGCCAAAG  400

seq1  AGCTTCATGTTCTGAGATACAAGGGGGTTAAGACTTCAACCAGAAACAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCATGTTCTGAGATACAAGGGGGTTAAGACTTCAACCAGAAACAGA  450

seq1  AACCTTTTTGATAAGGATTTAGTCACAATTTACTGTTGAGCTGTTGTGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTTTTGATAAGGATTTAGTCACAATTTACTGTTGAGCTGTTGTGAA  500

seq1  TGTCCGGGGCGAGAACCTCAGAAAGCCCAAATACAGTCAGCTGCAAAGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCGGGGCGAGAACCTCAGAAAGCCCAAATACAGTCAGCTGCAAAGCA  550

seq1  GCTGCAGACAAGGGTCAAGGTCTTTACCAGACAGGGCATTTCACTCAAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCAGACAAGGGTCAAGGTCTTTACCAGACAGGGCATTTCACTCAAAT  600

seq1  AAGAGATGGCTTCACTTTTAAGCACATCACACAGGTTGCTAGAATGAGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGATGGCTTCACTTTTAAGCACATCACACAGGTTGCTAGAATGAGGA  650

seq1  ATTGTAACTTACTGCATGCAACATGGGTGGGAACATACAAGCCCAGCCCG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTAACTTACTGCATGCAACATGGGTGGGAACATACAAGCCCAGCCCG  700

seq1  CTAGCACCACGAACCCTTCTTGAACACACCACAGGTGCTGCCAGCAAATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCACCACGAACCCTTCTTGAACACACCACAGGTGCTGCCAGCAAATT  750

seq1  CTGCGAGGTCGAGTCTTTAGGGTCACTCCTTTATGGAATTTACCACATAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCGAGGTCGAGTCTTTAGGGTCACTCCTTTATGGAATTTACCACATAT  800

seq1  GTGTGTTTCATCCCTCATCCCACACTGTATTTCAATAGATCCTCAGCGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTTTCATCCCTCATCCCACACTGTATTTCAATAGATCCTCAGCGCA  850

seq1  TGGCGACCTCAGTGACTTCTTCATGTCCTCATGTGGCAGCTAACAAGCCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCGACCTCAGTGACTTCTTCATGTCCTCATGTGGCAGCTAACAAGCCA  900

seq1  AGATACTTGGG-TATGCTTGAGC-TATTCTTCTTTCAATAAAAGTCAACA  948
      ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AGATACTTGGGTTATGCTTGAGCTTATTCTTCTTTCAAT-AAAGTCAACA  949

seq1  AAG-CCAGCCTATT-GGGAGTTTTGTTTTGAATCTTGG-TACTAGAGTCG  995
      ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AAGCCCAGCCTATTGGGGAGTTTTGTTTTGAATCTTGGTTACTAGAGTCG  999

seq1  ATACTGCTTCCCAAAATGCTACC-TCCATCTGCTT-GCTCAGCCCACTTA  1043
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATACTGCTTCCCAAAATGCTACCTTCCATCTGCTTGGCTCAGCCCACTTA  1049

seq1  CTTAGTAATAGGGGCTTTGCTGAT--GTAGTACATTAA-GACGAGGTCAC  1090
      ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||| ||||
seq2  CTTAGTAATAGGGGC-TTGCTGATTGTTAGTACATTAAGGACGAGTTCAC  1098

seq1  ATTGGA-TGAACGTGGGCTATAATCCAATCT-GACTGGT  1127
      |||||| || |||| | ||||||| |||||| |||||||
seq2  ATTGGATTGGACGTTGTCTATAAT-CAATCTGGACTGGT  1136