BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-283A08
Chromosome18 (Build37)
Map Location 84,299,106 - 84,418,701
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp407
Upstream gene4921531P14Rik, LOC665284, Tshz1, Zadh2, LOC669856
Downstream geneCndp1, EG640234, Cndp2, LOC100039711, LOC100039725, B230399E16Rik, Cyb5, Fbxo15, 1700034H14Rik, LOC100039765
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-283A08.bB6Ng01-283A08.g
ACCGA082086GA082087
length1,1601,109
definitionB6Ng01-283A08.b B6Ng01-283A08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,299,106 - 84,300,254)(84,417,597 - 84,418,701)
sequence
gaattcagaaaatctattttttaatggttgttctttctttgtggagcact
tcctatcccagcgatgctttcttgagcggggaattgttgactttttaggc
tttagatttattagacatgtgtcaacttgtcaacctcctaccgtttgcat
ttgtgtccaccttgcaaacagcagggaaaaagactttttttttcccctac
cagcgttcacttcttggcagttctgaaacaaatttttgaacagttgctgt
tcctattgatagcaatagtttgatgttttaaaaaaaaaacacgcacacaa
aaaaaaccagggttttattttcccctaaatccttgacatgttctgtcata
tcatatcatatcatacccgatgcatcagaaacagccaaggggagggcaga
gcccacactgctcacatagatcaggagccttcactgaacacctacccatc
tgttcgctgttctcttccctttgttctgcctctaatgcgggcatccattc
ctccatcctgccatcctgccataaaacacactcttgctctttgtaagacg
tcacagccatccctccagccaggcttcctcatctatgtggagaaatcctt
ccaaggaattatgaggctcttggaggtttcctgctgccccaatagttgtg
atccaaatacactcatgaaatcagaagcaaacaacaaaaaaccagagact
gcacacgtgaacactgctagcttcaggcaagtgtcacctaccatcactga
aactgaaaacacaatatcaagttttcctgcttacccacctggcagggatg
ccagagtccctctccatggggcaagcatgctgcgactatggagcaaggcc
tctgtggtagggattctaggctttgcctcatagtgtgtccttaaggactt
ccagaaagaagagtggaatcattgtgaccgctgcactcgtccctccaggc
tctaacctctcaggtgcccctggaaggcaaagcagaccttctgctcagct
atggagtttgtcccacgggcccccttcttctccatccccacctgctaact
cccaccgcctccttggggatgtgccagttctatggagcatgtttaaggaa
cattaatcaatgttctatgcagaatcacatgcagctgtgttaacacacgg
tgtgggagat
gaattccacgtgtcacattaaggaaatgtgtttctataataatgtgacag
gtttttatagaattttagatacctcagaataatgggagagagataaataa
aaggtcttgacttagttgtataacttttactggtgtctacccacaagaca
taagacacattataaactgatagtcttaggtgtgtgtttcagaaaacttt
ttttggggggggcaggggagccagcttaaagtgttcaataacccaaaagt
tgacaagacctacatttcggctctcttaatattatacacattttttattt
tggtatagtgcccacataaccacatggctatagtcatatcacccatagcc
tcaggcctgctcggttgtttagtaaacttgcaggagcgaattgctgtttt
gttttgtttttccaagagttaattttgtgtgttatctatgagaagagaag
gtgtaagattatttttctaattctcacgtgttcctgccttgttggattaa
aggttcattgaatttggatggagaattgtgtgcgtgcatgcatgcatgca
tgggtgggtggtggcagcagtggaggtggtggcaatgggagcagcagcag
cagcaacagcagccaaaatctcaggacaggatgaatgttctttctctata
atgcttgagactagaaatgctttggatgtcagatttttccacttttgcaa
atatttgcatttatgtaatgaggtctcaagtttaaatacagaattcattt
gtgtcttttatattccttagacatacaacctgaaggtaatttttacaata
atttaaatttatttttagtcaatatgtaacatattgtttctttattgcat
tttcataagattgtgccactgaactttgttatatttgtgctcttgccacc
cctgagccttctcactggtccttgccttcctcccaaatagtgccctccac
tttcatgtcagatggatgggtggacagacagaacaggcaggcagcagggc
cgagtctaatacgaagagaaagtatgtgataattttgtatattttctccc
ttccataccactgctttgttctggtgctctttgctcactccccttccaat
tttcattac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_84299106_84300254
seq2: B6Ng01-283A08.b_48_1207

seq1  GAATTCAGAAAATCTATTTTTTAATGGTTGTTCTTTCTTTGTGGAGCACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAAAATCTATTTTTTAATGGTTGTTCTTTCTTTGTGGAGCACT  50

seq1  TCCTATCCCAGCGATGCTTTCTTGAGCGGGGAATTGTTGACTTTTTAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATCCCAGCGATGCTTTCTTGAGCGGGGAATTGTTGACTTTTTAGGC  100

seq1  TTTAGATTTATTAGACATGTGTCAACTTGTCAACCTCCTACCGTTTGCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGATTTATTAGACATGTGTCAACTTGTCAACCTCCTACCGTTTGCAT  150

seq1  TTGTGTCCACCTTGCAAACAGCAGGGAAAAAGACTTTTTTTTTCCCCTAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTCCACCTTGCAAACAGCAGGGAAAAAGACTTTTTTTTTCCCCTAC  200

seq1  CAGCGTTCACTTCTTGGCAGTTCTGAAACAAATTTTTGAACAGTTGCTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCGTTCACTTCTTGGCAGTTCTGAAACAAATTTTTGAACAGTTGCTGT  250

seq1  TCCTATTGATAGCAATAGTTTGATGTTTTAAAAAAAAAACACGCACACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATTGATAGCAATAGTTTGATGTTTTAAAAAAAAAACACGCACACAA  300

seq1  AAAAAACCAGGGTTTTATTTTCCCCTAAATCCTTGACATGTTCTGTCATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACCAGGGTTTTATTTTCCCCTAAATCCTTGACATGTTCTGTCATA  350

seq1  TCATATCATATCATACCCGATGCATCAGAAACAGCCAAGGGGAGGGCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATCATATCATACCCGATGCATCAGAAACAGCCAAGGGGAGGGCAGA  400

seq1  GCCCACACTGCTCACATAGATCAGGAGCCTTCACTGAACACCTACCCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCACACTGCTCACATAGATCAGGAGCCTTCACTGAACACCTACCCATC  450

seq1  TGTTCGCTGTTCTCTTCCCTTTGTTCTGCCTCTAATGCGGGCATCCATTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCGCTGTTCTCTTCCCTTTGTTCTGCCTCTAATGCGGGCATCCATTC  500

seq1  CTCCATCCTGCCATCCTGCCATAAAACACACTCTTGCTCTTTGTAAGACG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATCCTGCCATCCTGCCATAAAACACACTCTTGCTCTTTGTAAGACG  550

seq1  TCACAGCCATCCCTCCAGCCAGGCTTCCTCATCTATGTGGAGAAATCCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGCCATCCCTCCAGCCAGGCTTCCTCATCTATGTGGAGAAATCCTT  600

seq1  CCAAGGAATTATGAGGCTCTTGGAGGTTTCCTGCTGCCCCAATAGTTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGAATTATGAGGCTCTTGGAGGTTTCCTGCTGCCCCAATAGTTGTG  650

seq1  ATCCAAATACACTCATGAAATCAGAAGCAAACAACAAAAAACCAGAGACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAATACACTCATGAAATCAGAAGCAAACAACAAAAAACCAGAGACT  700

seq1  GCACACGTGAACACTGCTAGCTTCAGGCAAGTGTCACCTACCATCACTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACACGTGAACACTGCTAGCTTCAGGCAAGTGTCACCTACCATCACTGA  750

seq1  AACTGAAAACACAATATCAAGTTTTCCTGCTTACCCACCTGGCAGGGATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAAAACACAATATCAAGTTTTCCTGCTTACCCACCTGGCAGGGATG  800

seq1  CCAGAGTCCCTCTCCATGGGGCAAGCATGCTGCGACTATGGAGCAAGGCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGTCCCTCTCCATGGGGCAAGCATGCTGCGACTATGGAGCAAGGCC  850

seq1  TCTGTGGTAGGGATTCTAGGCTTTGCCTCATAGTGTGTCCTTAAGGACTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGGTAGGGATTCTAGGCTTTGCCTCATAGTGTGTCCTTAAGGACTT  900

seq1  CCAGAAAGAAGAGTGGAATCATTGTGACCGCTGCACTCGTCCCTCCAGGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAAGAAGAGTGGAATCATTGTGACCGCTGCACTCGTCCCTCCAGGC  950

seq1  TCTAACCTCTCAGGTGCCCCTGG-AGGCAAAGCAGACCTTCTGCTCAGCT  999
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAACCTCTCAGGTGCCCCTGGAAGGCAAAGCAGACCTTCTGCTCAGCT  1000

seq1  ATGGAGTTTGTCCCACGGGCCCC--TC-TCTCCAT-CCCACCTGGCTAAC  1045
      |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||
seq2  ATGGAGTTTGTCCCACGGGCCCCCTTCTTCTCCATCCCCACCT-GCTAAC  1049

seq1  T-CCAC--GCTCCT--GGGATGTGCCAGTTCCTATGGAGCATGTTTAGGG  1090
      | ||||   |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||
seq2  TCCCACCGCCTCCTTGGGGATGTGCCAGTT-CTATGGAGCATGTTTAAGG  1098

seq1  AACATT-ATC-ATGTTCTATGCAG-ATCACATGCCCAGCTGTGTT-ACAC  1136
      |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||
seq2  AACATTAATCAATGTTCTATGCAGAATCACATG--CAGCTGTGTTAACAC  1146

seq1  AC-GTGTGGGAGAT  1149
      || |||||||||||
seq2  ACGGTGTGGGAGAT  1160

seq1: chr18_84417597_84418701
seq2: B6Ng01-283A08.g_63_1171 (reverse)

seq1  GAAATGAAAA-TGGAAGGGGAGTGAAGCAAAGAGGCACAAGAA-AAAGCA  48
      | |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||
seq2  GTAATGAAAATTGGAAGGGGAGTG-AGCAAAGA-GCACCAGAACAAAGCA  48

seq1  GTGGTATGGGAGGGAG-AAATATACAAA--TATCACATACTTTCTC-TCG  94
      ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||
seq2  GTGGTATGGAAGGGAGAAAATATACAAAATTATCACATACTTTCTCTTCG  98

seq1  TATTAGGACTCGGCCTGCCTGCCTGCCTG-TCTGTCTGTCCACCCATCCA  143
      ||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TATTA-GACTCGGCCCTGCTGCCTGCCTGTTCTGTCTGTCCACCCATCCA  147

seq1  TCTGACATGAAAGTGGAGGGCACTATTTGGGAGGAAGGCAAGGACCAGTG  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACATGAAAGTGGAGGGCACTATTTGGGAGGAAGGCAAGGACCAGTG  197

seq1  AGAAGGCTCAGGGGTGGCAAGAGCACAAATATAACAAAGTTCAGTGGCAC  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGCTCAGGGGTGGCAAGAGCACAAATATAACAAAGTTCAGTGGCAC  247

seq1  AATCTTATGAAAATGCAATAAAGAAACAATATGTTACATATTGACTAAAA  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTATGAAAATGCAATAAAGAAACAATATGTTACATATTGACTAAAA  297

seq1  ATAAATTTAAATTATTGTAAAAATTACCTTCAGGTTGTATGTCTAAGGAA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATTTAAATTATTGTAAAAATTACCTTCAGGTTGTATGTCTAAGGAA  347

seq1  TATAAAAGACACAAATGAATTCTGTATTTAAACTTGAGACCTCATTACAT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAAGACACAAATGAATTCTGTATTTAAACTTGAGACCTCATTACAT  397

seq1  AAATGCAAATATTTGCAAAAGTGGAAAAATCTGACATCCAAAGCATTTCT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCAAATATTTGCAAAAGTGGAAAAATCTGACATCCAAAGCATTTCT  447

seq1  AGTCTCAAGCATTATAGAGAAAGAACATTCATCCTGTCCTGAGATTTTGG  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCAAGCATTATAGAGAAAGAACATTCATCCTGTCCTGAGATTTTGG  497

seq1  CTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTCCCATTGCCACCACCTCCACTGCTGCC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTCCCATTGCCACCACCTCCACTGCTGCC  547

seq1  ACCACCCACCCATGCATGCATGCATGCACGCACACAATTCTCCATCCAAA  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCCACCCATGCATGCATGCATGCACGCACACAATTCTCCATCCAAA  597

seq1  TTCAATGAACCTTTAATCCAACAAGGCAGGAACACGTGAGAATTAGAAAA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATGAACCTTTAATCCAACAAGGCAGGAACACGTGAGAATTAGAAAA  647

seq1  ATAATCTTACACCTTCTCTTCTCATAGATAACACACAAAATTAACTCTTG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATCTTACACCTTCTCTTCTCATAGATAACACACAAAATTAACTCTTG  697

seq1  GAAAAACAAAACAAAACAGCAATTCGCTCCTGCAAGTTTACTAAACAACC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAACAAAACAAAACAGCAATTCGCTCCTGCAAGTTTACTAAACAACC  747

seq1  GAGCAGGCCTGAGGCTATGGGTGATATGACTATAGCCATGTGGTTATGTG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGGCCTGAGGCTATGGGTGATATGACTATAGCCATGTGGTTATGTG  797

seq1  GGCACTATACCAAAATAAAAAATGTGTATAATATTAAGAGAGCCGAAATG  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACTATACCAAAATAAAAAATGTGTATAATATTAAGAGAGCCGAAATG  847

seq1  TAGGTCTTGTCAACTTTTGGGTTATTGAACACTTTAAGCTGGCTCCCCTG  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTCTTGTCAACTTTTGGGTTATTGAACACTTTAAGCTGGCTCCCCTG  897

seq1  CCCCCCCCAAAAAAAGTTTTCTGAAACACACACCTAAGACTATCAGTTTA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCCAAAAAAAGTTTTCTGAAACACACACCTAAGACTATCAGTTTA  947

seq1  TAATGTGTCTTATGTCTTGTGGGTAGACACCAGTAAAAGTTATACAACTA  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTGTCTTATGTCTTGTGGGTAGACACCAGTAAAAGTTATACAACTA  997

seq1  AGTCAAGACCTTTTATTTATCTCTCTCCCATTATTCTGAGGTATCTAAAA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAAGACCTTTTATTTATCTCTCTCCCATTATTCTGAGGTATCTAAAA  1047

seq1  TTCTATAAAAACCTGTCACATTATTATAGAAACACATTTCCTTAATGTGA  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATAAAAACCTGTCACATTATTATAGAAACACATTTCCTTAATGTGA  1097

seq1  CACGTGGAATTC  1105
      ||||||||||||
seq2  CACGTGGAATTC  1109