BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-283E19
Chromosome18 (Build37)
Map Location 75,789,960 - 75,924,246
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm672
Upstream geneMyo5b, Acaa2, LOC672799, Lipg, Rpl17, BC031181, Dym, LOC628356, EG667777, Smad7
Downstream geneZbtb7c, 4833419G08Rik, LOC668184, Smad2, LOC668188, EG639576
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-283E19.bB6Ng01-283E19.g
ACCGA082297GA082298
length1,1591,130
definitionB6Ng01-283E19.b B6Ng01-283E19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,923,078 - 75,924,246)(75,789,960 - 75,791,067)
sequence
gaattctagtgtcagggccagatcaagaagactctataacctaagagaaa
gcaaagtgaaggagagacccatcacataatttctgaaagatcgacattag
tctctatggtggggagtcagtgccccccctatagagagcaatgcacacag
catttcataagacaatggtcaggggtcttttccaaggggtcatatgggtt
ctaagaaaagctatcggttacacacttggtccaaggcaatttaatctcta
ggattaattaatttgacacttaaagctctggttcgttctttcagctgagg
aaaaaaggggtgtcaaggagtgcgatagtctgactttagtacttaaactc
cttgtaattccccacaatggccaccatcatgtgaatatatatgtctttta
accaggtcaaattgtaatgaaactcactctacagtcatctcaatcacgct
ttcagcaaggcagtaggggtggggaaggtatactgcctgctaccaccagt
aaacatttccactctttcacctgggcactttagagaggtctcagcccaga
agacctcccatccaagctttgtcttctcaatgtttttgtttctcttagca
ggtcatctatttcctatacatctgctgagcaatggcagagaccccacaca
cacacaacagggacttttacatatgacgtcctatgtccctagtgtcaccc
cttcctacaggatgtacactggttaggtcttaacctctaaagactctgca
gcctctctgaatcaagaggccagtgactaatcagaggaatcccatcgttc
tcctggagggttgtccactctcaaccctctgaccccactgactagggctc
ccatgccttgtgtgttgaacagaaaaaccataacttagataaagcataaa
caaaacaagcagacaaattaatttattaattaattgattgattgattaat
ttaggctgagagatggctcagcagctagacactgattgctcttccagagg
tcctgagttcagttccagcaaccacgtgtgctcacaaccatctgccaatg
ggatctgatgccctctttcagtgtatcttgaagaccaggatatgttactc
ccattatttaaataaataagtctttttaaaatataaaccttgctattatt
gggactcag
gaattcttttttttttttaaagacttcaatctttaacaatttatgtgtag
aatgtgtgtctctgtgtgtggacgccatatttgtgcaagagaaaaggctt
gcaatgttgttggcaatgggtgggattttaaatgtggtattagggaagag
ctgggatgctacacatgtatagggttgctcatttgctttcattacttttc
ccactgtgataaaaattctctgacaagagcatcccccaggagagggtccc
ctcttgttcatagtttgggtgtacagcctgtcatggtggagaggtcaggt
gactggagcgtgaagcagctggtcctatcacgccatggtaaagaacagag
agcagtggacttgtgtttgtgcttgtctcgtcctctctgctttgtccagt
ttaggacttcttgcccagggaatggtcctgcccacaatcacaatgggctt
ctccatatctttcatttcccacatccctcataggcatgcctagatgcctg
tctctcaagtgattctagactcaatttgacatcaactattgcatcatcta
tccatctatttatctgtctatctgtccatccatccatctatccagccagc
cagccatcaaccatccatccatctgtctgtctgtcagctagccagccatc
aaccatccatccatctgtctgtcagtcagtctgtctattaatcaaattat
ctacctattcttcatatgttgtggtttggatatcctccaaagcctcatgg
ttgaaggcttggtctccagtgtaatctcaaaggtgaggctttagagaagt
aatcgtaggtgctgatcaaatcaatggatctatccacacttaaatggaca
agcagaaggaaggacctgattggaaggaattggggctgtgtctttgaaag
gtgtattctgttctctagcctcttcctctgtctctctctttcctcctatc
ctgccatgcagtgtgcagctttctctccaccatgtctctcttgtgatgtg
tttctgcccttaacctaccaccccagaaattgtgagttcagcctgaatca
cgacctggaaaaaagtacaggaaaggtaggtctagggccattcttgttca
cagcaatgaaaaacctgcctaattaatcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_75923078_75924246
seq2: B6Ng01-283E19.b_41_1199 (reverse)

seq1  CTGAGTCACAATAATAGCAAAGGTTTATTATTTTTAAAAAAGATTTATTT  50
      ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||
seq2  CTGAGTCCCAATAATAGC-AAGGTTTA-TATTTT--AAAAAGACTTATTT  46

seq1  ATTTTATATATGTGAGTACATTTTTCTTTGTCTTC-AGATACACTGAAAG  99
      |||| |   ||| ||||| |  | || | |||||| ||||||||||||||
seq2  ATTTAAATAATGGGAGTA-ACATATCCTGGTCTTCAAGATACACTGAAAG  95

seq1  AGGGCATCAGATCCCATT-GCAGATGGTTGTGAGCCACCACGTGGTTGCT  148
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||
seq2  AGGGCATCAGATCCCATTGGCAGATGGTTGTGAGC--ACACGTGGTTGCT  143

seq1  GGGAACTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAATCAGTGTTCTTAGCTGCT  198
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||
seq2  -GGAACTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAATCAGTGT--CTAGCTGCT  190

seq1  GAGCCATCTTCTCAGCCTAAATTAATCAATCAATCAATTAATTAATTAAT  248
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GAGCCATC-TCTCAGCCTAAATTAATCAATCAATCAATTAATTAATAAAT  239

seq1  TAATTTGTCTTGCTTGTTTTGTTTATGCTTTATCTAAGTTATGGTTTTTC  298
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTGTC-TGCTTGTTTTGTTTATGCTTTATCTAAGTTATGGTTTTTC  288

seq1  TGTTCAACACACAAGGCATGGGAGCCCTAGTCAGTGGGGTCAGAGGGTTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCAACACACAAGGCATGGGAGCCCTAGTCAGTGGGGTCAGAGGGTTG  338

seq1  AGAGTGGACAACCCTCCAGGAGAACGATGGGATTCCTCTGATTAGTCACT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGGACAACCCTCCAGGAGAACGATGGGATTCCTCTGATTAGTCACT  388

seq1  GGCCTCTTGATTCAGAGAGGCTGCAGAGTCTTTAGAGGTTAAGACCTAAC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTCTTGATTCAGAGAGGCTGCAGAGTCTTTAGAGGTTAAGACCTAAC  438

seq1  CAGTGTACATCCTGTAGGAAGGGGTGACACTAGGGACATAGGACGTCATA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTACATCCTGTAGGAAGGGGTGACACTAGGGACATAGGACGTCATA  488

seq1  TGTAAAAGTCCCTGTTGTGTGTGTGTGGGGTCTCTGCCATTGCTCAGCAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAAGTCCCTGTTGTGTGTGTGTGGGGTCTCTGCCATTGCTCAGCAG  538

seq1  ATGTATAGGAAATAGATGACCTGCTAAGAGAAACAAAAACATTGAGAAGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATAGGAAATAGATGACCTGCTAAGAGAAACAAAAACATTGAGAAGA  588

seq1  CAAAGCTTGGATGGGAGGTCTTCTGGGCTGAGACCTCTCTAAAGTGCCCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCTTGGATGGGAGGTCTTCTGGGCTGAGACCTCTCTAAAGTGCCCA  638

seq1  GGTGAAAGAGTGGAAATGTTTACTGGTGGTAGCAGGCAGTATACCTTCCC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAAAGAGTGGAAATGTTTACTGGTGGTAGCAGGCAGTATACCTTCCC  688

seq1  CACCCCTACTGCCTTGCTGAAAGCGTGATTGAGATGACTGTAGAGTGAGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCTACTGCCTTGCTGAAAGCGTGATTGAGATGACTGTAGAGTGAGT  738

seq1  TTCATTACAATTTGACCTGGTTAAAAGACATATATATTCACATGATGGTG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTACAATTTGACCTGGTTAAAAGACATATATATTCACATGATGGTG  788

seq1  GCCATTGTGGGGAATTACAAGGAGTTTAAGTACTAAAGTCAGACTATCGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATTGTGGGGAATTACAAGGAGTTTAAGTACTAAAGTCAGACTATCGC  838

seq1  ACTCCTTGACACCCCTTTTTTCCTCAGCTGAAAGAACGAACCAGAGCTTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTTGACACCCCTTTTTTCCTCAGCTGAAAGAACGAACCAGAGCTTT  888

seq1  AAGTGTCAAATTAATTAATCCTAGAGATTAAATTGCCTTGGACCAAGTGT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTCAAATTAATTAATCCTAGAGATTAAATTGCCTTGGACCAAGTGT  938

seq1  GTAACCGATAGCTTTTCTTAGAACCCATATGACCCCTTGGAAAAGACCCC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACCGATAGCTTTTCTTAGAACCCATATGACCCCTTGGAAAAGACCCC  988

seq1  TGACCATTGTCTTATGAAATGCTGTGTGCATTGCTCTCTATAGGGGGGGC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCATTGTCTTATGAAATGCTGTGTGCATTGCTCTCTATAGGGGGGGC  1038

seq1  ACTGACTCCCCACCATAGAGACTAATGTCGATCTTTCAGAAATTATGTGA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGACTCCCCACCATAGAGACTAATGTCGATCTTTCAGAAATTATGTGA  1088

seq1  TGGGTCTCTCCTTCACTTTGCTTTCTCTTAGGTTATAGAGTCTTCTTGAT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCTCTCCTTCACTTTGCTTTCTCTTAGGTTATAGAGTCTTCTTGAT  1138

seq1  CTGGCCCTGACACTAGAATTC  1169
      |||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCCTGACACTAGAATTC  1159

seq1: chr18_75789960_75791067
seq2: B6Ng01-283E19.g_65_1194

seq1  GAATTCTTTTTTTTTTTTAAAGACTTCAATCTTTAACAATTTATGTGTAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTTTTTTTTTAAAGACTTCAATCTTTAACAATTTATGTGTAG  50

seq1  AATGTGTGTCTCTGTGTGTGGACGCCATATTTGTGCAAGAGAAAAGGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGTGTCTCTGTGTGTGGACGCCATATTTGTGCAAGAGAAAAGGCTT  100

seq1  GCAATGTTGTTGGCAATGGGTGGGATTTTAAATGTGGTATTAGGGAAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGTTGTTGGCAATGGGTGGGATTTTAAATGTGGTATTAGGGAAGAG  150

seq1  CTGGGATGCTACACATGTATAGGGTTGCTCATTTGCTTTCATTACTTTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGATGCTACACATGTATAGGGTTGCTCATTTGCTTTCATTACTTTTC  200

seq1  CCACTGTGATAAAAATTCTCTGACAAGAGCATCCCCCAGGAGAGGGTCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGTGATAAAAATTCTCTGACAAGAGCATCCCCCAGGAGAGGGTCCC  250

seq1  CTCTTGTTCATAGTTTGGGTGTACAGCCTGTCATGGTGGAGAGGTCAGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGTTCATAGTTTGGGTGTACAGCCTGTCATGGTGGAGAGGTCAGGT  300

seq1  GACTGGAGCGTGAAGCAGCTGGTCCTATCACGCCATGGTAAAGAACAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGGAGCGTGAAGCAGCTGGTCCTATCACGCCATGGTAAAGAACAGAG  350

seq1  AGCAGTGGACTTGTGTTTGTGCTTGTCTCGTCCTCTCTGCTTTGTCCAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTGGACTTGTGTTTGTGCTTGTCTCGTCCTCTCTGCTTTGTCCAGT  400

seq1  TTAGGACTTCTTGCCCAGGGAATGGTCCTGCCCACAATCACAATGGGCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGACTTCTTGCCCAGGGAATGGTCCTGCCCACAATCACAATGGGCTT  450

seq1  CTCCATATCTTTCATTTCCCACATCCCTCATAGGCATGCCTAGATGCCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATATCTTTCATTTCCCACATCCCTCATAGGCATGCCTAGATGCCTG  500

seq1  TCTCTCAAGTGATTCTAGACTCAATTTGACATCAACTATTGCATCATCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCAAGTGATTCTAGACTCAATTTGACATCAACTATTGCATCATCTA  550

seq1  TCCATCTATTTATCTGTCTATCTGTCCATCCATCCATCTATCCAGCCAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCTATTTATCTGTCTATCTGTCCATCCATCCATCTATCCAGCCAGC  600

seq1  CAGCCATCAACCATCCATCCATCTGTCTGTCTGTCAGCTAGCCAGCCATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCATCAACCATCCATCCATCTGTCTGTCTGTCAGCTAGCCAGCCATC  650

seq1  AACCATCCATCCATCTGTCTGTCAGTCAGTCTGTCTATTAATCAAATTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATCCATCCATCTGTCTGTCAGTCAGTCTGTCTATTAATCAAATTAT  700

seq1  CTACCTATTCTTCATATGTTGTGGTTTGGATATCCTCCAAAGCCTCATGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCTATTCTTCATATGTTGTGGTTTGGATATCCTCCAAAGCCTCATGG  750

seq1  TTGAAGGCTTGGTCTCCAGTGTAATCTCAAAGGTGAGGCTTTAGAGAAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGGCTTGGTCTCCAGTGTAATCTCAAAGGTGAGGCTTTAGAGAAGT  800

seq1  AATCGTAGGTGCTGATCAAATCAATGGATCTATCCACACTTAAATGGACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCGTAGGTGCTGATCAAATCAATGGATCTATCCACACTTAAATGGACA  850

seq1  AGCAGAAGGAAGGACCTGATTGG-AGGAATTGGGGCTGTGTCTTTGAAGG  899
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
seq2  AGCAGAAGGAAGGACCTGATTGGAAGGAATTGGGGCTGTGTCTTTGAAAG  900

seq1  GTGTATTCTG-TCTCTAGCCTCTTCCTCTGTCTCTCTC-TTCCTCCTAT-  946
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| 
seq2  GTGTATTCTGTTCTCTAGCCTCTTCCTCTGTCTCTCTCTTTCCTCCTATC  950

seq1  CTGCCATGCAGTGTGCAGCTTTCTCT-CACCATGT-TCTC-TGTGATGTT  993
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| 
seq2  CTGCCATGCAGTGTGCAGCTTTCTCTCCACCATGTCTCTCTTGTGATGTG  1000

seq1  GTTCTG-CCTTAA-CTA-CACCCCAGAAATGGTGAG-TCAG-CTG-ATCA  1037
       ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||
seq2  TTTCTGCCCTTAACCTACCACCCCAGAAATTGTGAGTTCAGCCTGAATCA  1050

seq1  CGA-CTGGAAAAAAAGACA-GAAAAGTAAGTCTAGG--CA-TCTTG-TCA  1081
      ||| ||||||||||  ||| |||| ||| |||||||  || ||||| |||
seq2  CGACCTGGAAAAAAGTACAGGAAAGGTAGGTCTAGGGCCATTCTTGTTCA  1100

seq1  CAGCGATGAAAA--CTGCCTAATT-ATCCA  1108
      |||| |||||||  |||||||||| |||||
seq2  CAGCAATGAAAAACCTGCCTAATTAATCCA  1130