seq1: chr18_3848351_3849400
seq2: B6Ng01-289B18.b_46_1105
seq1 GAATTCTGAGCAGTTGTGAGCTGCCCAGTATGAGCGCTGGGAATCTAATT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCTGAGCAGTTGTGAGCTGCCCAGTATGAGCGCTGGGAATCTAATT 50
seq1 CAGGTCCATCTCTCCAGCCCAAGAAGTATTCAAAACCTATTCTTATAGGT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGGTCCATCTCTCCAGCCCAAGAAGTATTCAAAACCTATTCTTATAGGT 100
seq1 TTGTCCTTCTAACTGTAACTTTCAGGTTTCTGTGACAAAAGATGATGCTA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGTCCTTCTAACTGTAACTTTCAGGTTTCTGTGACAAAAGATGATGCTA 150
seq1 CACACTCATCATATGTCATTTAATACTCCTCTTAGGATTGTCAAATGTCC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACACTCATCATATGTCATTTAATACTCCTCTTAGGATTGTCAAATGTCC 200
seq1 CCATAAGCTTGTGTGTTTGAACACTTGGTCCCTGGATGGTGGTGTCATTT 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCATAAGCTTGTGTGTTTGAACACTTGGTCCCTGGATGGTGGTGTCATTT 250
seq1 AGAAAGGCATTGGGATCTTTCGAAGGTGGAGCTTGCTGGAGGAAGTACAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGAAAGGCATTGGGATCTTTCGAAGGTGGAGCTTGCTGGAGGAAGTACAT 300
seq1 TTGTGGGTGTGAGCTTTGAGGGTTTATAGTCCAACCTTCCTCCAATATTC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGTGGGTGTGAGCTTTGAGGGTTTATAGTCCAACCTTCCTCCAATATTC 350
seq1 CTTTCAGCTTTGTGACTGTGACCATTCTATTCATACACACACACACACAC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTTCAGCTTTGTGACTGTGACCATTCTATTCATACACACACACACACAC 400
seq1 ACACACACACACATACACACAGTCTGGACCAGCAATGCAACCCTGTCTCC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACACACACACACATACACACAGTCTGGACCAGCAATGCAACCCTGTCTCC 450
seq1 ACACCTCTCCTGAAGTGATGGAGTATAAGCCCAAACACGCTTTTTTTCTT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACACCTCTCCTGAAGTGATGGAGTATAAGCCCAAACACGCTTTTTTTCTT 500
seq1 CTTTTTCTTCTATTTCTTCTCTTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTTTTCTTCTATTTCTTCTCTTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 550
seq1 TTTTTTTGGTCAGGTTATTCCATCCCAGCAACACAGACAAACTAATACAC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTTTTTGGTCAGGTTATTCCATCCCAGCAACACAGACAAACTAATACAC 600
seq1 TGAGCATGTAGGATACCTGTATTTCCTGACATACTTCCTTCAGACCAAAG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAGCATGTAGGATACCTGTATTTCCTGACATACTTCCTTCAGACCAAAG 650
seq1 CACATGACTGCTTCTCACCAGTGGGATAGGTGAGTTCCAAATGCAGTCTT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACATGACTGCTTCTCACCAGTGGGATAGGTGAGTTCCAAATGCAGTCTT 700
seq1 TAGCCTTACTGCATCAGAGCACATATCCCACTC-TTTCCCTGATTCAGCA 749
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2 TAGCCTTACTGCATCAGAGCACATATCCCACTCTTTTCCCTGATTCAGCA 750
seq1 GCCATGAAGCTCAGTGCTGAGCTCACCTCATCAAAGATGGCGATAGCCTG 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCCATGAAGCTCAGTGCTGAGCTCACCTCATCAAAGATGGCGATAGCCTG 800
seq1 GA-TCCTGGAATCCCCAGGTAGAGGAGAGAAAACCTGAG-CGGTGATC-T 846
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
seq2 GATTCTTGGAATCCCCAGGTAGAGGAGAGAAAACCTGAGCCGGTGATCTT 850
seq1 TACATAAGCC-TTTTTGTCCTAGGTGACTGGAA-TTTCTGT-ATGCTTTG 893
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
seq2 TACATAAGCCTTTTTTGTCCTAGGTGACTGGAATTTTCTGTAATGCTTTG 900
seq1 ATCAGTA-TAGGATAGCT-GGAGTTGTCTGCCCTCTCCTTTCACATCCTC 941
||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
seq2 ATCAGTATTAGGATAGCTGGGAGTTGTCTGCCCTCCTCTTTCACATCCTC 950
seq1 ATTCT-CTGTTCCCCAACTCACG-TACAGAA--TCTCAGCTTTTTATTGA 987
||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
seq2 ATTCTCCTGTT-CCCAACTCACGTTACAGAAATTCTCAGCTTTTTATTGA 999
seq1 AGGATTAAGTGTCCTCACTCTGAAGCCCATCTCACCTCTA-CTGTCAAGG 1036
|||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||
seq2 --GATTAAGTGT-CTCACTCTTGAGGCCATCTCACCTCTATCTGTCAGGG 1046
seq1 GGGGGGGGTTGATT 1050
|||||||| |||||
seq2 GGGGGGGGCTGATT 1060
| seq1: chr18_3983713_3983990
seq2: B6Ng01-289B18.g_73_350 (reverse)
seq1 TCCCTCCCTTCCTCTTTTCCCCCCTCTCCCATTCCTGCCCTCAACTTCCC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCCTCCCTTCCTCTTTTCCCCCCTCTCCCATTCCTGCCCTCAACTTCCC 50
seq1 TTCCTGAGTGTTCCATACAAAGCCTGTGCCCCAAGGAATACTCACACCCC 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCTGAGTGTTCCATACAAAGCCTGTGCCCCAAGGAATACTCACACCCC 100
seq1 AATGTCCCTGGCATGATGACCCTGGCATTGGCTAAGTCTCAGCCAGTGAG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATGTCCCTGGCATGATGACCCTGGCATTGGCTAAGTCTCAGCCAGTGAG 150
seq1 GGGAGTGGGTAACCTGGAGGGCAGGATTGATCACAAGGAGAACTGGCCAA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGGAGTGGGTAACCTGGAGGGCAGGATTGATCACAAGGAGAACTGGCCAA 200
seq1 GGCTGTACTGAGGAGAGATGCCCCTCCCAGATAGATCCCTGGGTCACACA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCTGTACTGAGGAGAGATGCCCCTCCCAGATAGATCCCTGGGTCACACA 250
seq1 AGTATCACATAGCAAAGCTGCCTTGGAT 278
||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTATCACATAGCAAAGCTGCCTTGGAT 278
|
