BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-296D19
Chromosome18 (Build37)
Map Location 24,229,051 - 24,230,089
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100040579, LOC665797, Dtna, Mapre2, EG665813, LOC100040623, Zfp397, C230097I24Rik, Zfp35, Zfp191
Downstream geneD030070L09Rik, Galnt1, LOC665586, 2700062C07Rik, BC021395, Slc39a6, Epl2, Mocos, Fhod3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-296D19.b
ACCGA091897
length1,052
definitionB6Ng01-296D19.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcaccaacttgcttctaatatgcaatgtagcctgtactgaagattt
ctatctcagtgggactctatagctctttcatggtaaatccacctattcgc
taggccattgtgtttgggtaagactggctactgtcccaagtaaacactct
gcagaccagccctgagctgctctggctccgtcctttgtaatgcttaatta
gttactgaataggcaactttcttactgaattcctactgaattccaagttt
gtcagcttcaaggtctttctgggatgttggaacactggcaaaggcttagc
tatgtcagaattcaatcttaaaaggcacttataataaaataatactaaaa
gagagcacgtggatccatacaccagactaacgcggggatagggtatgagt
atacgggttgtgaggatgccaaagttccagaaggtgagtttccctgaaac
tctttgcctcgtgagtgctcccaggcctcttggcctgccaagcaaacttc
actggagtgtgcgtagcaaaaggccgtttgaaactcacatggaagccagg
catggttgtgaaggaagataaaatattgtaacttgtgagttgtttaagag
cccactgccccgatctgggactgagaacaaagcagaacagcccccaggca
ggccaaggcagggctgttgataaggcattcctaagaacatcttggccgta
agatgaaaaggtattcaaggacaaatggggctacattatctaagttcaca
ccatctggtcggaacctcctttctgttaccccttggcgctgggtaaaagt
catacatcaactggttgctatgtgaacaaagataagcccccagcccacag
gaaagtcctgatgccctgtgttctttctgttaatgtttgaataggccaat
agtgtgtcgctatgctgaattccacaccctaagccccgtatccataaaag
cccctggctttcgagcctcgtggccggcatctgtatctctgtgtggattc
atgccagccggagctcgtaattaacgtctcatgtaattacagcgagtggg
tc
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_24229051_24230089
seq2: B6Ng01-296D19.b_68_1097

seq1  TATGCAATGTAGCCTGTACTGAAGATTTCTATCTCAGTGGGACTCTATAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAATGTAGCCTGTACTGAAGATTTCTATCTCAGTGGGACTCTATAG  50

seq1  CTCTTTCATGGTAAATCCACCTATTCGCTAGGCCATTGTGTTTGGGTAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTCATGGTAAATCCACCTATTCGCTAGGCCATTGTGTTTGGGTAAG  100

seq1  ACTGGCTACTGTCCCAAGTAAACACTCTGCAGACCAGCCCTGAGCTGCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCTACTGTCCCAAGTAAACACTCTGCAGACCAGCCCTGAGCTGCTC  150

seq1  TGGCTCCGTCCTTTGTAATGCTTAATTAGTTACTGAATAGGCAACTTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCCGTCCTTTGTAATGCTTAATTAGTTACTGAATAGGCAACTTTCT  200

seq1  TACTGAATTCCTACTGAATTCCAAGTTTGTCAGCTTCAAGGTCTTTCTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGAATTCCTACTGAATTCCAAGTTTGTCAGCTTCAAGGTCTTTCTGG  250

seq1  GATGTTGGAACACTGGCAAAGGCTTAGCTATGTCAGAATTCAATCTTAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTGGAACACTGGCAAAGGCTTAGCTATGTCAGAATTCAATCTTAAA  300

seq1  AGGCACTTATAATAAAATAATACTAAAAGAGAGCACGTGGATCCATACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACTTATAATAAAATAATACTAAAAGAGAGCACGTGGATCCATACAC  350

seq1  CAGACTAACGCGGGGATAGGGTATGAGTATACGGGTTGTGAGGATGCCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTAACGCGGGGATAGGGTATGAGTATACGGGTTGTGAGGATGCCAA  400

seq1  AGTTCCAGAAGGTGAGTTTCCCTGAAACTCTTTGCCTCGTGAGTGCTCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCAGAAGGTGAGTTTCCCTGAAACTCTTTGCCTCGTGAGTGCTCCC  450

seq1  AGGCCTCTTGGCCTGCCAAGCAAACTTCACTGGAGTGTGCGTAGCAAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTCTTGGCCTGCCAAGCAAACTTCACTGGAGTGTGCGTAGCAAAAG  500

seq1  GCCGTTTGAAACTCACATGGAAGCCAGGCATGGTTGTGAAGGAAGATAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGTTTGAAACTCACATGGAAGCCAGGCATGGTTGTGAAGGAAGATAAA  550

seq1  ATATTGTAACTTGTGAGTTGTTTAAGAGCCCACTGCCCCGATCTGGGACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGTAACTTGTGAGTTGTTTAAGAGCCCACTGCCCCGATCTGGGACT  600

seq1  GAGAACAAAGCAGAACAGCCCCCAGGCAGGCCAAGGCAGGGCTGTTGATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACAAAGCAGAACAGCCCCCAGGCAGGCCAAGGCAGGGCTGTTGATA  650

seq1  AGGCATTCCTAAGAACATCTTGGCCGTAAGATGAAAAGGTATTCAAGGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATTCCTAAGAACATCTTGGCCGTAAGATGAAAAGGTATTCAAGGAC  700

seq1  AAATGGGGCTACATTATCTAAGTTCACACCATCTGGTCGGAACCTCCTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGGGCTACATTATCTAAGTTCACACCATCTGGTCGGAACCTCCTTT  750

seq1  CTGTTACCCCTTGGCGCTGGGTAAAAGTCATACATCAACTGGTTGCTATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTACCCCTTGGCGCTGGGTAAAAGTCATACATCAACTGGTTGCTATG  800

seq1  TGAACAAAGATAAGCCCCCAGCCCACAGGAAAGTCCTGATGCCCTGTGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACAAAGATAAGCCCCCAGCCCACAGGAAAGTCCTGATGCCCTGTGTT  850

seq1  CTTTCTGTTAATGTTTGAATAGGCCAATAGTGTGTCGCTATGCTGAATTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTGTTAATGTTTGAATAGGCCAATAGTGTGTCGCTATGCTGAATTC  900

seq1  CACACCCCTAAGCCCCGTATCCCATAAAAGCCCCTGGCTTTCGAGCCTCG  950
      |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACA-CCCTAAGCCCCGTAT-CCATAAAAGCCCCTGGCTTTCGAGCCTCG  948

seq1  TGGCCGGCATCTGTTATCTCCTGTGTGGGATTCATGCCAGCCCGGAGCTC  1000
      ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| 
seq2  TGGCCGGCATCTG-TATCT-CTGTGT-GGATTCATGCCAG-CCGGAGCT-  993

seq1  CGTAATTAAACGTCCTCATGTAATTACAGCGAGTGGGTC  1039
      ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAATT-AACGT-CTCATGTAATTACAGCGAGTGGGTC  1030