BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-301B11
Chromosome18 (Build37)
Map Location 84,715,364 - 84,866,480
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp407, Cndp1, EG640234, Cndp2, LOC100039711
Upstream geneTshz1, Zadh2, LOC669856
Downstream geneLOC100039725, B230399E16Rik, Cyb5, Fbxo15, 1700034H14Rik, LOC100039765
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-301B11.bB6Ng01-301B11.g
ACCGA095494GA095495
length1,096202
definitionB6Ng01-301B11.b B6Ng01-301B11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,715,364 - 84,716,461)(84,866,279 - 84,866,480)
sequence
gaattcctaacaagccatgttactccacccagctacctttgctgtttagt
taactaggttggaaacacgaacatctgtcttaggaacagtcctcaactaa
ctttgccagagtctgtggggagacttttttatattcctcaacagttggag
gtttccattcaacctggctccacatatagtgactcttggaccttaatctg
ttttctcctcaggtctctgccctccatggggcttgagagcacaaggccaa
tacacaattctgtcaccatgcttgcacaaagaaactcagaggaatctacc
aaaagagaggagaatgaagaatcagttgacagcaaagtgtcccttctgct
tacacttccaacacctgtgctcaagcacttcctgggcaaatcaggaacac
tggcagagaaaagacttaggaaactgattagcaaggggaagtgcatctaa
ggaaaagcagacacagaacaggtgacaaacaaaggccaaaacccagccgc
tcctaagctgctgtgacaacggggcacttaaacaccttgaccccagtatg
acttttaataaccaggagccaaaaatagatattcaagacactaccacacg
actatttcactggagggaaaaaaacagaagctgacattttcaactataac
caacatgtaaaaatgcttattttatctctagtgtgttctatcagttaacc
acacttggtggccttggaataagtccatgaaccatgggaagacaagcgcc
atgtgaccatgcagaaggaaaggcgcactggtggcaatgacactctccac
cactgtgagacccactgcaaggagctctcctctccacatcgctgtcttac
cccaattctctcccgaagtaccaaacacttcagtggaaaataagagagag
ttctagaataatgtttgtatctgaatattctaatcaaaatattgcttagt
tttcaacccatagagtgagttgcattataaaatatgtagaaaatactgat
aatttgaaaggtatttaagattttacccccagaagggtaatgcttcacct
tgggttaagtgacagaagaagacaggtattggttgcatggtgtttt
caagccaggcagggttacaaaagagatcctgtctcaaatatagatggatg
gatggatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagataga
tgatagatagatagatggatgatagatagatagatagatagatagataga
tagatagatagatagacatgaagttgagagggagagttgggttagggggc
ac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_84715364_84716461
seq2: B6Ng01-301B11.b_48_1143

seq1  GAATTCCTAACAAGCCATGTTACTCCACCCAGCTACCTTTGCTGTTTAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAACAAGCCATGTTACTCCACCCAGCTACCTTTGCTGTTTAGT  50

seq1  TAACTAGGTTGGAAACACGAACATCTGTCTTAGGAACAGTCCTCAACTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTAGGTTGGAAACACGAACATCTGTCTTAGGAACAGTCCTCAACTAA  100

seq1  CTTTGCCAGAGTCTGTGGGGAGACTTTTTTATATTCCTCAACAGTTGGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCCAGAGTCTGTGGGGAGACTTTTTTATATTCCTCAACAGTTGGAG  150

seq1  GTTTCCATTCAACCTGGCTCCACATATAGTGACTCTTGGACCTTAATCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCATTCAACCTGGCTCCACATATAGTGACTCTTGGACCTTAATCTG  200

seq1  TTTTCTCCTCAGGTCTCTGCCCTCCATGGGGCTTGAGAGCACAAGGCCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCCTCAGGTCTCTGCCCTCCATGGGGCTTGAGAGCACAAGGCCAA  250

seq1  TACACAATTCTGTCACCATGCTTGCACAAAGAAACTCAGAGGAATCTACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAATTCTGTCACCATGCTTGCACAAAGAAACTCAGAGGAATCTACC  300

seq1  AAAAGAGAGGAGAATGAAGAATCAGTTGACAGCAAAGTGTCCCTTCTGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAGAGGAGAATGAAGAATCAGTTGACAGCAAAGTGTCCCTTCTGCT  350

seq1  TACACTTCCAACACCTGTGCTCAAGCACTTCCTGGGCAAATCAGGAACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTTCCAACACCTGTGCTCAAGCACTTCCTGGGCAAATCAGGAACAC  400

seq1  TGGCAGAGAAAAGACTTAGGAAACTGATTAGCAAGGGGAAGTGCATCTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGAGAAAAGACTTAGGAAACTGATTAGCAAGGGGAAGTGCATCTAA  450

seq1  GGAAAAGCAGACACAGAACAGGTGACAAACAAAGGCCAAAACCCAGCCGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAGCAGACACAGAACAGGTGACAAACAAAGGCCAAAACCCAGCCGC  500

seq1  TCCTAAGCTGCTGTGACAACGGGGCACTTAAACACCTTGACCCCAGTATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAAGCTGCTGTGACAACGGGGCACTTAAACACCTTGACCCCAGTATG  550

seq1  ACTTTTAATAACCAGGAGCCAAAAATAGATATTCAAGACACTACCACACG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTAATAACCAGGAGCCAAAAATAGATATTCAAGACACTACCACACG  600

seq1  ACTATTTCACTGGAGGGAAAAAAACAGAAGCTGACATTTTCAACTATAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTTCACTGGAGGGAAAAAAACAGAAGCTGACATTTTCAACTATAAC  650

seq1  CAACATGTAAAAATGCTTATTTTATCTCTAGTGTGTTCTATCAGTTAACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATGTAAAAATGCTTATTTTATCTCTAGTGTGTTCTATCAGTTAACC  700

seq1  ACACTTGGTGGCCTTGGAATAAGTCCATGAACCATGGGAAGACAAGCGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTGGTGGCCTTGGAATAAGTCCATGAACCATGGGAAGACAAGCGCC  750

seq1  ATGTGACCATGCAGAAGGAAAGGCGCACTGGTGGCAATGACACTCTCCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGACCATGCAGAAGGAAAGGCGCACTGGTGGCAATGACACTCTCCAC  800

seq1  CACTGTGAGACCCACTGCAAGGAGCTCTCCTCTCCACATCGCTGTCTTAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTGAGACCCACTGCAAGGAGCTCTCCTCTCCACATCGCTGTCTTAC  850

seq1  CCCAATTCTCTCCCGAAGTACCAAACACTTCAGTGGAAAATAAGAGAGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAATTCTCTCCCGAAGTACCAAACACTTCAGTGGAAAATAAGAGAGAG  900

seq1  TTCTAGAATAATGTTTGTATCTGAATATTCTAATCAAAATATTGCTTAGG  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TTCTAGAATAATGTTTGTATCTGAATATTCTAATCAAAATATTGCTTA-G  949

seq1  TTTTCAAACCATAGAGTGAGTTGCATTATAAAATAATGTAGAAAATACTG  1000
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TTTTCAACCCATAGAGTGAGTTGCATTATAAAAT-ATGTAGAAAATACTG  998

seq1  ATAATTTGAAAGGTATTTAAAGAATTTTACCCCCAGAAGGGTAAAGGCTT  1050
      ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||
seq2  ATAATTTGAAAGGTATTTAA--GATTTTACCCCCAGAAGGGT-AATGCTT  1045

seq1  CACC-TGGGTTAAGTGACAGAAG-AGACA-GTATTTGTTGCATGGTGTTT  1097
      |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||
seq2  CACCTTGGGTTAAGTGACAGAAGAAGACAGGTATTGGTTGCATGGTGTTT  1095

seq1  T  1098
      |
seq2  T  1096

seq1: chr18_84866279_84866480
seq2: B6Ng01-301B11.g_72_273 (reverse)

seq1  GTGCCCCCTAACCCAACTCTCCCTCTCAACTTCATGTCTATCTATCTATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCCCTAACCCAACTCTCCCTCTCAACTTCATGTCTATCTATCTATC  50

seq1  TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATCCATCTATCTATCTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATCCATCTATCTATCTAT  100

seq1  CATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCCA  150

seq1  TCCATCCATCTATATTTGAGACAGGATCTCTTTTGTAACCCTGCCTGGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCCATCTATATTTGAGACAGGATCTCTTTTGTAACCCTGCCTGGCT  200

seq1  TG  202
      ||
seq2  TG  202