BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-301L13
Chromosome18 (Build37)
Map Location 82,530,698 - 82,661,897
singlet/doubletdoublet
Overlap geneB020010K11Rik, Galr1, Mbp
Upstream geneLOC100039458, LOC100040871
Downstream geneEG637748, Zfp236, LOC100039563, Zfp516, LOC100041001, 4921531P14Rik, LOC665284
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-301L13.bB6Ng01-301L13.g
ACCGA095959GA095960
length1,1101,117
definitionB6Ng01-301L13.b B6Ng01-301L13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,530,698 - 82,531,800)(82,660,786 - 82,661,897)
sequence
gaattcttctcaggacagacttcagaaatgtgagaatttggatcctagaa
tccagcttgctcagcccttcccctctcacagatcccaaccgctgccctgc
tgagagcactgcctgtgattctctaacaaacagacctccagatgccaagg
tttctcaccagggaagtgggtactggtatctccctgtctggggcatgtga
tacagtgacgggaagccagctaacacacttacctgccactaaagagcctc
ctctccaaatgctaggggtcgtagacagaacctaaacaggcaagaggcag
aaacgcagggagggagggcttataaacatgtgcattagctaagcatggct
agccgcctctgtgggttctgatctctaatcaagtctcgtgaggaacctga
gaggaagcggtgagcttcagcatgaggaagaccatgcttacctctgcaca
gaaggcgtagggacgcatgtgggcttcccagaggacagtggcgcccagct
aaagggacatgctatgaggaaggatggttcctggtgcattttttaaaaga
ccctgagtgatttgctagttgaggtgtcaaaggacatctagttagaagaa
agtgagataggaaaaaatggagagtaggatgccctgggtgggcatcccat
ggtccagcagatggaagcttaattcactgctatttataaacttcatgaaa
gtagggtgtctttctgcaaaagaacctgggagcatctggttacctgccca
gtattatgtagcagtttcctccccagattagagcattccttttgtacaag
gaagtttaatcagggaaaaaaaaagccactcaaatcgtttcaggaagtcc
cttgaaactgacaagtaacattaggcccctcccttcctaaaagtacataa
acagtaaggattcctgagagtcactcccagacaaaccacatagcctttaa
agaacacatgagcaactgagctacctggaagaagactcagataactggga
gagattaaggtgagagtgccacctaggaaaggcactctcctaaccttctt
gagcatctacactcatgcacttgagcttcaggtttcaaacctccttgaac
tgtcactcat
gaattccaaagaaggaaaggatagtatagactgcatgagtcagaggcttc
ttaaagaaaacctggctgggcagtggtggcacacgcctttaatcccagca
cttgggaggcagaggcaggcagatttctgagttcaaagtcagcctggtct
acagagggagttccaggacagccagggctacacagaaaaaccctgtctca
aaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaaccaaaccccaatcaaacaaaaa
caaaacaaaacaaaaacaacaacaacaaaacgacccaaaaaaaccaaacc
aaaccaaaccaaaccaaaccaaaccaaaccaaaccaaaccaaaccaaacc
aaaccaaaccaaacaagaacctgggtagagtttacttgaaaatgaagact
gaagtcccaggaatgactaagggaatgtgagctgaagagggaacatttca
caagtctagcatcttccctttgcaggacaggaggtttcctgctagactct
gcagcaggaactcttcctgtgtatcaggttcagcaggcccacagcctctt
acagagactcctattcatgcccccaagagcccccaggaccacagactgac
attatgacctggactaagtggggtagtttctcaggtgccgcatttaacat
gctgggttctcctgcagatgaaataaaccccaccctgaatgtggacacag
atggcctcacatgggagcagtgggtgactctgcttccttgacttttaaag
aaagacagggaagaaacccaatagatcaggggacatgcatgatataaaag
atctcaaggggacagactctgagtggccaggcttagccctttgtgtcttc
tctgagcctgtctcgctccatctttgcctctctctgtgtctcctcctctc
ctctgcctcactctcttttgtcagcacgcatgaaatcattgctccgttgc
caacattcttgtaacagcctgtgcttagaagctcagaacacagctagcca
gcgcatcaccaagaatggccagctaaacagcacgtgtatgcagcatgcac
acaccagcattacagtcaccacatatggatgcacatagaacatacactcc
attacatgcatgcacgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_82530698_82531800
seq2: B6Ng01-301L13.b_48_1157

seq1  GAATTCTTCTCAGGACAGACTTCAGAAATGTGAGAA-TGGGATCCTAGAA  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
seq2  GAATTCTTCTCAGGACAGACTTCAGAAATGTGAGAATTTGGATCCTAGAA  50

seq1  TCCAGCTTGCTCAGCCCTTCCCCTCTCACAGATCCCAACCGCTGCCCTGC  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTTGCTCAGCCCTTCCCCTCTCACAGATCCCAACCGCTGCCCTGC  100

seq1  TGAGAGCACTGCCTGTGATTCTCTAACAAACAGACCTCCAGATGCCAAGG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGCACTGCCTGTGATTCTCTAACAAACAGACCTCCAGATGCCAAGG  150

seq1  TTTCTCACCAGGGAAGTGGGTACTGGTATCTCCCTGTCTGGGGCATGTGA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCACCAGGGAAGTGGGTACTGGTATCTCCCTGTCTGGGGCATGTGA  200

seq1  TACAGTGACGGGAAGCCAGCTAACACACTTACCTGCCACTAAAGAGCCTC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGTGACGGGAAGCCAGCTAACACACTTACCTGCCACTAAAGAGCCTC  250

seq1  CTCTCCAAATGCTAGGGGTCGTAGACAGAACCTAAACAGGCAAGAGGCAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCAAATGCTAGGGGTCGTAGACAGAACCTAAACAGGCAAGAGGCAG  300

seq1  AAACGCAGGGAGGGAGGGCTTATAAACATGTGCATTAGCTAAGCATGGCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACGCAGGGAGGGAGGGCTTATAAACATGTGCATTAGCTAAGCATGGCT  350

seq1  AGCCGCCTCTGTGGGTTCTGATCTCTAATCAAGTCTCGTGAGGAACCTGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCGCCTCTGTGGGTTCTGATCTCTAATCAAGTCTCGTGAGGAACCTGA  400

seq1  GAGGAAGCGGTGAGCTTCAGCATGAGGAAGACCATGCTTACCTCTGCACA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAGCGGTGAGCTTCAGCATGAGGAAGACCATGCTTACCTCTGCACA  450

seq1  GAAGGCGTAGGGACGCATGTGGGCTTCCCAGAGGACAGTGGCGCCCAGCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGCGTAGGGACGCATGTGGGCTTCCCAGAGGACAGTGGCGCCCAGCT  500

seq1  AAAGGGACATGCTATGAGGAAGGATGGTTCCTGGTGCATTTTTTAAAAGA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGACATGCTATGAGGAAGGATGGTTCCTGGTGCATTTTTTAAAAGA  550

seq1  CCCTGAGTGATTTGCTAGTTGAGGTGTCAAAGGACATCTAGTTAGAAGAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGTGATTTGCTAGTTGAGGTGTCAAAGGACATCTAGTTAGAAGAA  600

seq1  AGTGAGATAGGAAAAAATGGAGAGTAGGATGCCCTGGGTGGGCATCCCAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGATAGGAAAAAATGGAGAGTAGGATGCCCTGGGTGGGCATCCCAT  650

seq1  GGTCCAGCAGATGGAAGCTTAATTCACTGCTATTTATAAACTTCATGAAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCAGCAGATGGAAGCTTAATTCACTGCTATTTATAAACTTCATGAAA  700

seq1  GTAGGGTGTCTTTCTGCAAAAGAACCTGGGAGCATCTGGTTACCTGCCCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGTGTCTTTCTGCAAAAGAACCTGGGAGCATCTGGTTACCTGCCCA  750

seq1  GTATTATGTAGCAGTTTCCTCCCCAGATTAGAGCATTCC-TTTGTACAAG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GTATTATGTAGCAGTTTCCTCCCCAGATTAGAGCATTCCTTTTGTACAAG  800

seq1  GAAG-TTAATCAGGG-AAAAAAAAGCCACTCAAATCGTTTCAGGAAGTCC  846
      |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTTAATCAGGGAAAAAAAAAGCCACTCAAATCGTTTCAGGAAGTCC  850

seq1  C-TGAAACTGACAAGTAACATTAGGCCCCTCCCTTCCTAAAAGTACATAA  895
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAAACTGACAAGTAACATTAGGCCCCTCCCTTCCTAAAAGTACATAA  900

seq1  ACAGTAAGGATTCCTGAGAGTCACTCCCAGACAAACCACATAGCC-TTAA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ACAGTAAGGATTCCTGAGAGTCACTCCCAGACAAACCACATAGCCTTTAA  950

seq1  AGAACACATGAGCAACTGAGCTACCTGGAAG-AGACTCAGATTAACTGGG  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  AGAACACATGAGCAACTGAGCTACCTGGAAGAAGACTCAGA-TAACTGGG  999

seq1  AGAGATTAAGGTGAGAGTGCCACCTAGGAAGGGCACTCTCC-AACC-TCC  1041
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || 
seq2  AGAGATTAAGGTGAGAGTGCCACCTAGGAAAGGCACTCTCCTAACCTTCT  1049

seq1  TGAGCCATCTACACTCCATGCAC-TGAGCTCCAGGTTTCCAACCTCTCTG  1090
      |||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||
seq2  TGAG-CATCTACACT-CATGCACTTGAGCTTCAGGTTTCAAACCTCCTTG  1097

seq1  AACTGTCACTCAT  1103
      |||||||||||||
seq2  AACTGTCACTCAT  1110

seq1: chr18_82660786_82661897
seq2: B6Ng01-301L13.g_67_1183 (reverse)

seq1  ACGTGCATGCATGTA--TGAATGTATG-TCTATGTGCATCCATATGT-GT  46
      |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||| ||
seq2  ACGTGCATGCATGTAATGGAGTGTATGTTCTATGTGCATCCATATGTGGT  50

seq1  GACTGTATGCCTTGTGTGTGCATGCCTGCATACACGTGCTGTTTAGCT-G  95
      |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
seq2  GACTGTAATGCTGGTGTGTGCATG-CTGCATACACGTGCTGTTTAGCTGG  99

seq1  CCA-TCTTGGTGATGCCGCTTGCTAGCTGTG-TCTGAGC-TCTAAGCACA  142
      ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||
seq2  CCATTCTTGGTGATG-CGCTGGCTAGCTGTGTTCTGAGCTTCTAAGCACA  148

seq1  GGCTGTTACAAGAATGTTGGCAACGGAGCAATGATTTCATGCGTGCTGAC  192
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTTACAAGAATGTTGGCAACGGAGCAATGATTTCATGCGTGCTGAC  198

seq1  AAAAGAGAGTGAGGCAGAGGAGAGGGAGGAGACACAGAGAGAGGCAAAGA  242
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAGAGTGAGGCAGAGGAGA-GGAGGAGACACAGAGAGAGGCAAAGA  247

seq1  TGGAGCGAGACAGGCTCAGAGAAGACACCAAGGGCTAAGCCTGGCCACTC  292
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCGAGACAGGCTCAGAGAAGACACAAAGGGCTAAGCCTGGCCACTC  297

seq1  AGAGTCTGTCCCCTTGAGATCTTTTATATCATGCATGTCCCCTGATCTAT  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCTGTCCCCTTGAGATCTTTTATATCATGCATGTCCCCTGATCTAT  347

seq1  TGGGTTTCTTCCCTGTCTTTCTTTAAAAGTCAAGGAAGCAGAGTCACCCA  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTTCTTCCCTGTCTTTCTTTAAAAGTCAAGGAAGCAGAGTCACCCA  397

seq1  CTGCTCCCATGTGAGGCCATCTGTGTCCACATTCAGGGTGGGGTTTATTT  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCCCATGTGAGGCCATCTGTGTCCACATTCAGGGTGGGGTTTATTT  447

seq1  CATCTGCAGGAGAACCCAGCATGTTAAATGCGGCACCTGAGAAACTACCC  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGCAGGAGAACCCAGCATGTTAAATGCGGCACCTGAGAAACTACCC  497

seq1  CACTTAGTCCAGGTCATAATGTCAGTCTGTGGTCCTGGGGGCTCTTGGGG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAGTCCAGGTCATAATGTCAGTCTGTGGTCCTGGGGGCTCTTGGGG  547

seq1  GCATGAATAGGAGTCTCTGTAAGAGGCTGTGGGCCTGCTGAACCTGATAC  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGAATAGGAGTCTCTGTAAGAGGCTGTGGGCCTGCTGAACCTGATAC  597

seq1  ACAGGAAGAGTTCCTGCTGCAGAGTCTAGCAGGAAACCTCCTGTCCTGCA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAAGAGTTCCTGCTGCAGAGTCTAGCAGGAAACCTCCTGTCCTGCA  647

seq1  AAGGGAAGATGCTAGACTTGTGAAATGTTCCCTCTTCAGCTCACATTCCC  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGAAGATGCTAGACTTGTGAAATGTTCCCTCTTCAGCTCACATTCCC  697

seq1  TTAGTCATTCCTGGGACTTCAGTCTTCATTTTCAAGTAAACTCTACCCAG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCATTCCTGGGACTTCAGTCTTCATTTTCAAGTAAACTCTACCCAG  747

seq1  GTTCTTGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTT  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTT  797

seq1  GGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTTTTGGGTCGTTTTGTTGTT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTTTTGGGTCGTTTTGTTGTT  847

seq1  GTTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTTTGATTGGGGTTTGGTTTGTTTG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGTTTGATTGGGGTTTGGTTTGTTTG  897

seq1  TTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTTTCTGTGTAGCCCTGGC  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTTTTTCTGTGTAGCCCTGGC  947

seq1  TGTCCTGGAACTCCCTCTGTAGACCAGGCTGACTTTGAACTCAGAAATCT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTGGAACTCCCTCTGTAGACCAGGCTGACTTTGAACTCAGAAATCT  997

seq1  GCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACTG  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACTG  1047

seq1  CCCAGCCAGGTTTTCTTTAAGAAGCCTCTGACTCATGCAGTCTATACTAT  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCCAGGTTTTCTTTAAGAAGCCTCTGACTCATGCAGTCTATACTAT  1097

seq1  CCTTTCCTTCTTTGGAATTC  1112
      ||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCCTTCTTTGGAATTC  1117