seq1: chr18_3511973_3513188
seq2: B6Ng01-313G04.b_46_1242 (reverse)
seq1 CCTTTAGGACAAGGAAACCGGTATCAGCATGACAGCA-GCAGAAACCTCA 49
|||||||||||||| || | |||||||||||| ||| |||| |||||||
seq2 CCTTTAGGACAAGGGAAACCGTATCAGCATGAACGCACGCAG-AACCTCA 49
seq1 TCACTAAGA-TGCAGGAGCTGACTTCCTCCAAAGAACTGTGGTTCCGCGC 98
| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| | || ||
seq2 T--CTTAGATTGCA-GAGCTGACT--CTCC-AAGAACTGTG--TTCGGGC 91
seq1 AGCTGTGATAGCGGTTCCCATTGCTGGCGGACTGATCTTGGTGCTGCTCA 148
||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2 AGCTG-GATAGCG--TCCCATTGCTG--CGACTGATCT--GTGCTGCTCA 134
seq1 TTATGTTGGCCTTGCGAATGCTTCGAAGTGAGAACAAGAGGCTGCAGGAT 198
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2 -TATGTTGGC--TGCGAATGCTTCGAAGTGAGAACAAGA-GCTGCAGGAT 180
seq1 GAGCGGCAGCAGATGCTGTCCCGTCTGCACTACAGCTTTCACGGACACCA 248
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGCGGCAGCAGATGCTGT-CCGTCTGCACTACAGCTTTCACGGACACCA 229
seq1 TTCCAAGAAGGGGCAAGTTGCAAAGTTGGACTTGGAGTGCATGGTGCCTG 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCAAGAAGGGGCAAGTTGCAAAGTTGGACTTGGAGTGCATGGTGCCTG 279
seq1 TCAGTGGGCAGGAGAACTGCTGTCTGACCTGTGACAAAATGCGGCAAGCA 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCAGTGGGCAGGAGAACTGCTGTCTGACCTGTGACAAAATGCGGCAAGCA 329
seq1 GAGCTCAGTAATGAGAAGATCCTCTCCCTTGTGCACTGGGGCATGTACAG 398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGCTCAGTAATGAGAAGATCCTCTCCCTTGTGCACTGGGGCATGTACAG 379
seq1 TGGTCATGGAAAGCTGGAATTCATATGACAGTCATGTCTGAACTATAAAT 448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGTCATGGAAAGCTGGAATTCATATGACAGTCATGTCTGAACTATAAAT 429
seq1 GGAACCCTTGAAGGCCTTCTGAGTTCTGCTGACAGGAGCACTTTTATCTG 498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGAACCCTTGAAGGCCTTCTGAGTTCTGCTGACAGGAGCACTTTTATCTG 479
seq1 GAGACAACTAACTCGCTTAGTCATCTTGGAGAAACAAAATGACCTCTGAA 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGACAACTAACTCGCTTAGTCATCTTGGAGAAACAAAATGACCTCTGAA 529
seq1 AAGAGAATCTTGGGTATTTCTTCTGAAGGATTATTTGCACAGATTCTACA 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGAGAATCTTGGGTATTTCTTCTGAAGGATTATTTGCACAGATTCTACA 579
seq1 GTCAAATGGATTAATTTGCTTTAAAGTTATAAAAAGCAAAGAGAGGACTC 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTCAAATGGATTAATTTGCTTTAAAGTTATAAAAAGCAAAGAGAGGACTC 629
seq1 TGCACACTTTCCCAGGGTTCTTTGTGTCCTAGGGAGCTGCAGCTGACTGA 698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCACACTTTCCCAGGGTTCTTTGTGTCCTAGGGAGCTGCAGCTGACTGA 679
seq1 AGTAAAAACACTGTGCTCTCTGTAAGCTCCTACATCCTCATTTATTGTAA 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTAAAAACACTGTGCTCTCTGTAAGCTCCTACATCCTCATTTATTGTAA 729
seq1 AGATTTTTTAAAATATATATATTTTTGTCCGAAAATTTAGTGGTGTCTTT 798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGATTTTTTAAAATATATATATTTTTGTCCGAAAATTTAGTGGTGTCTTT 779
seq1 CATGAATTAAAACTTCAGACGGGTGTGGGGAGGCTGGTGGTGGTGCAGTG 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CATGAATTAAAACTTCAGACGGGTGTGGGGAGGCTGGTGGTGGTGCAGTG 829
seq1 CAGTGGTAAGATGCTTGCTTGTCTGGTGTGCGTGAGGCCCTGGCTGTGAT 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGTGGTAAGATGCTTGCTTGTCTGGTGTGCGTGAGGCCCTGGCTGTGAT 879
seq1 TTCTCCAGCACCACAGAAAGCCAATCAGTCAAAAAACATTTGATTTGGAA 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCTCCAGCACCACAGAAAGCCAATCAGTCAAAAAACATTTGATTTGGAA 929
seq1 GTGTATGAGAGTACATGTTAATTATATGAATGAAAATCCGTTTACTCATA 998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGTATGAGAGTACATGTTAATTATATGAATGAAAATCCGTTTACTCATA 979
seq1 CTTCTCAAATGTAGGTTTTGATCTTGTTCATTCTTACACAAACGTATAAT 1048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTCTCAAATGTAGGTTTTGATCTTGTTCATTCTTACACAAACGTATAAT 1029
seq1 TAATTATCTTTGTGTAATGACCATTGTCGAGTGTCTCACTTACAGTTGTT 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAATTATCTTTGTGTAATGACCATTGTCGAGTGTCTCACTTACAGTTGTT 1079
seq1 TTCCAGAATGGTTCTGGTTTTAGTTTTCATGTAAGAACTTTGCTTGTTTG 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCAGAATGGTTCTGGTTTTAGTTTTCATGTAAGAACTTTGCTTGTTTG 1129
seq1 TGCTAAAAGTTGTGCATGCTAAGTGCACAGTCTCTACCACTAAGCTACTC 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCTAAAAGTTGTGCATGCTAAGTGCACAGTCTCTACCACTAAGCTACTC 1179
seq1 CCCAAGCTCTAGGAATTC 1216
||||||||||||||||||
seq2 CCCAAGCTCTAGGAATTC 1197
| seq1: chr6_11751380_11751664
seq2: B6Ng01-313G04.g_133_284 (reverse)
seq1 CCATTTTAAAAAAAAACTATTCATTCAAGCATTAAAATAGGCTCAAGGGC 50
|||||||||||||||||||| | |
seq2 CCATTTTAAAAAAAAACTATCC---------------------------C 23
seq1 ATGCAAGAGAGCTCAGCATGTAAGAGCACTGACTGCTCTTCTGAAGGTCC 100
| ||| | || |||||
seq2 GTACAA------------------ATCA---------------AAGGTGG 40
seq1 TGTGTTCAAATCCCAGCAACCACAAGATGGCTCACAACCACCCATAATGA 150
|| |||||| ||
seq2 TG--------------------GAAGATGCCT------------------ 52
seq1 GGTCTGAACCCCTCTTCTGGTGCGTCAGAAGACACCAACAGTGTACCTAT 200
|||| || |||| | | |
seq2 ----TGAATCC---------------------------CAGTAT---TTT 68
seq1 TTTTTTTTTCCATTTTTTATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCAATG 250
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |
seq2 TTTATTTTTCCATTTTTT-TTAGGTATTTAGCTCATTTATATTTCACAAG 117
seq1 CTATACCAAAAGTCCCCCATACCCACC--CACCCCCA 285
|||| || |||||||||||||||||| ||||||||
seq2 CTATCCC--AAGTCCCCCATACCCACCTACACCCCCA 152
|
