BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-316O06
Chromosome18 (Build37)
Map Location 75,797,515 - 75,798,305
singlet/doubletsinglet
Overlap geneGm672
Upstream geneMyo5b, Acaa2, LOC672799, Lipg, Rpl17, BC031181, Dym, LOC628356, EG667777, Smad7
Downstream geneZbtb7c, 4833419G08Rik, LOC668184, Smad2, LOC668188
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-316O06.bB6Ng01-316O06.g
ACCGA107173GA107174
length791353
definitionB6Ng01-316O06.b B6Ng01-316O06.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattctataaccttgctgtggagacgtgctacattggtctataggaacg
ggggggtgccttttactgatggaatgctaaaacttggtgggttatctacg
tgactgtggctgggccacatgtactgcctcgctttccagaagagtgtgac
catcccagaagccccctggcccactctcaagttcaacctgacagacagaa
ccagctgtacctgggatgagctctagagacttccaacaaaattgtctccc
cagtctataggagcgcaaacccaccactgccctctgccaccccttgtccc
tgatagtcacacttcatccattatctgaaaagccagaacccttctccctt
ccaggctccccaccccgtccttgcacggacagagggactccaggcttgat
ggtaaaggatgtatgttaaaacttgtcttatgtctctttcaccacccagg
gacccgtgacccccaagaaaagtgctatgcaacttgaacaatcagcacaa
ctacatgcactttctccagactccccctttgcacaataacaaagcaggtc
tgaagagcagatgccgcggacacttcacaggccatctgaagatgctcagg
gtaagagaggtgaggccctgagcactcaatgggagaactggtgtcgacat
cgacattctcgagcactcttctggattctggatcaccagtgagtgcttgg
ttgctaataaccaagaatcagtggagtgttcagctgtagtactgaagcac
tgagaccgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt

tggggacttttcagagggtagataggtgccagggccctgagaggtagagt
ggattgttggtgggttgttgttggatgctaacggatgctgttggttgctc
ttggttgtggtttgttaagtagtcgtgaacaaagaagaagaaattagata
tccgatggtaaagatgaaacttacccaaaggaactcgatgcccctaatca
tcaagaagtagtctaacaataacgatgctctgttctgttccagactccag
actttttccagggacctctttcctttcctctctatctgtttttctctcct
agctagtgttaaggggttgaaagggtaggaaaaggatggggaagggagga
aga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_75797515_75798305
seq2: B6Ng01-316O06.b_50_840

seq1  GAATTCTATAACCTTGCTGTGGAGACGTGCTACATTGGTCTATAGGAACG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATAACCTTGCTGTGGAGACGTGCTACATTGGTCTATAGGAACG  50

seq1  GGGGGGTGCCTTTTACTGATGGAATGCTAAAACTTGGTGGGTTATCTACG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGTGCCTTTTACTGATGGAATGCTAAAACTTGGTGGGTTATCTACG  100

seq1  TGACTGTGGCTGGGCCACATGTACTGCCTCGCTTTCCAGAAGAGTGTGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGTGGCTGGGCCACATGTACTGCCTCGCTTTCCAGAAGAGTGTGAC  150

seq1  CATCCCAGAAGCCCCCTGGCCCACTCTCAAGTTCAACCTGACAGACAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCAGAAGCCCCCTGGCCCACTCTCAAGTTCAACCTGACAGACAGAA  200

seq1  CCAGCTGTACCTGGGATGAGCTCTAGAGACTTCCAACAAAATTGTCTCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTGTACCTGGGATGAGCTCTAGAGACTTCCAACAAAATTGTCTCCC  250

seq1  CAGTCTATAGGAGCGCAAACCCACCACTGCCCTCTGCCACCCCTTGTCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTATAGGAGCGCAAACCCACCACTGCCCTCTGCCACCCCTTGTCCC  300

seq1  TGATAGTCACACTTCATCCATTATCTGAAAAGCCAGAACCCTTCTCCCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGTCACACTTCATCCATTATCTGAAAAGCCAGAACCCTTCTCCCTT  350

seq1  CCAGGCTCCCCACCCCGTCCTTGCACGGACAGAGGGACTCCAGGCTTGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTCCCCACCCCGTCCTTGCACGGACAGAGGGACTCCAGGCTTGAT  400

seq1  GGTAAAGGATGTATGTTAAAACTTGTCTTATGTCTCTTTCACCACCCAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAAGGATGTATGTTAAAACTTGTCTTATGTCTCTTTCACCACCCAGG  450

seq1  GACCCGTGACCCCCAAGAAAAGTGCTATGCAACTTGAACAATCAGCACAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCGTGACCCCCAAGAAAAGTGCTATGCAACTTGAACAATCAGCACAA  500

seq1  CTACATGCACTTTCTCCAGACTCCCCCTTTGCACAATAACAAAGCAGGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATGCACTTTCTCCAGACTCCCCCTTTGCACAATAACAAAGCAGGTC  550

seq1  TGAAGAGCAGATGCCGCGGACACTTCACAGGCCATCTGAAGATGCTCAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAGCAGATGCCGCGGACACTTCACAGGCCATCTGAAGATGCTCAGG  600

seq1  GTAAGAGAGGTGAGGCCCTGAGCACTCAATGGGAGAACTGGTGTCGACAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGAGAGGTGAGGCCCTGAGCACTCAATGGGAGAACTGGTGTCGACAT  650

seq1  CGACATTCTCGAGCACTCTTCTGGATTCTGGATCACCAGTGAGTGCTTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACATTCTCGAGCACTCTTCTGGATTCTGGATCACCAGTGAGTGCTTGG  700

seq1  TTGCTAATAACCAAGAATCAGTGGAGTGTTCAGCTGTAGTACTGAAGCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTAATAACCAAGAATCAGTGGAGTGTTCAGCTGTAGTACTGAAGCAC  750

seq1  TGAGACCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  791
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  791


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |