BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-324D07
Chromosome18 (Build37)
Map Location 73,579,835 - 73,581,019
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC629684, LOC100043411, LOC100042955
Downstream geneRkhd2, Smad4, Elac1, Me2, Mro, Mapk4, 2810433K01Rik, Cxxc1, EG435570, Mbd1, Ccdc11, LOC628298, LOC668124, LOC668126
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-324D07.bB6Ng01-324D07.g
ACCGA112582GA112583
length1,182305
definitionB6Ng01-324D07.b B6Ng01-324D07.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattctacaggaattccacagaggctctacaggaactcttccagcttag
aaaaaaatctcttgctcagctggactaaatctgtaattgcaaggtgtgct
tagaaggtcacaaaagagttgttagacaagacgctgttaacatgtaaagt
accagacctggcaattcatcctcaaacaacactttcctctaaatagtagg
tgttgccccaaattacccagaaaaatacatgaagctttctaccagattag
agctcacagctcacttgctatcgtaaaagagaaagaaaaatcaacccaga
cttgggatctggatcctgctcggcacactactggttggtgcttcctgcaa
gtcacattatttaggactgaggacatggctcttgcagcaatgctgcccta
gcatgtcttggctgccagggtaagaaaaagaatgaacaaataggatcatc
ccatcatcagttcaacggtgactccctggtatcccaattatgtaagagat
gaacaaagatcacattaaaagaagtttggagaacagaatttaaattagct
ggttgtaaaaggaacactaaaagcaacaaagctcacgcaagtctttaaaa
catgcagaactgcactcaatccttactcccacccccacccccccaccccc
cggggtgtgctgagttggtgactgtggtggtttgaatacgcttggcccag
ggagtggcactattcagaggtgtgaccttgttgggggaagtgtgtcattg
tcagtgtgggctttgacacccttctcctagctgctcgtgagacagtctac
tcttggcttcttagaactcttggctcctccaacaccatgtctgcctgcct
gctggcattcttcatgccatgctgataatggactgaagctctgaacctgt
atgccaaccccaattaaacattgtccttttataagagttgccttgggcat
ggtgtcctcttcactgcactaaaaccccaactaagaccgtgaatactttc
ccttagccaccagacctatgacttctaccctgattttcagttctggctaa
cattctttctctcccatccctactcccacgaaagacatttgggctcttta
gaactcgacaggcaatgcaagattatgtgatgcttccccaaattctgtca
tgagatgactttttcttcttgagaccctcttt

cataggaaaaccaacagaatcaactaacctggaactcttggggctctcgg
aggctgaaacaccaaccaaagagcataaatgggctggacttaggcctccc
tgcacataggtagcagatgtgcagctttgacttcttatggatcccaaaca
actggagtggaagctatcccaaatgctgttgcctgtctgtatggatatgt
gcttcactcagccctggagagacttgatattccagggtggggagataccc
ggggaggaccccacctactcagaggagaagaagaggggggtggggaagga
ttgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_73579835_73581019
seq2: B6Ng01-324D07.b_48_1229

seq1  GAATTCTACAGGAATTCCACAGAGGCTCTACAGGAACTCTTCCAGCTTAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACAGGAATTCCACAGAGGCTCTACAGGAACTCTTCCAGCTTAG  50

seq1  AAAAAAATCTCTTGCTCAGCTGGACTAAATCTGTAATTGCAAGGTGTGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAATCTCTTGCTCAGCTGGACTAAATCTGTAATTGCAAGGTGTGCT  100

seq1  TAGAAGGTCACAAAAGAGTTGTTAGACAAGACGCTGTTAACATGTAAAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGGTCACAAAAGAGTTGTTAGACAAGACGCTGTTAACATGTAAAGT  150

seq1  ACCAGACCTGGCAATTCATCCTCAAACAACACTTTCCTCTAAATAGTAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGACCTGGCAATTCATCCTCAAACAACACTTTCCTCTAAATAGTAGG  200

seq1  TGTTGCCCCAAATTACCCAGAAAAATACATGAAGCTTTCTACCAGATTAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCCCCAAATTACCCAGAAAAATACATGAAGCTTTCTACCAGATTAG  250

seq1  AGCTCACAGCTCACTTGCTATCGTAAAAGAGAAAGAAAAATCAACCCAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCACAGCTCACTTGCTATCGTAAAAGAGAAAGAAAAATCAACCCAGA  300

seq1  CTTGGGATCTGGATCCTGCTCGGCACACTACTGGTTGGTGCTTCCTGCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGATCTGGATCCTGCTCGGCACACTACTGGTTGGTGCTTCCTGCAA  350

seq1  GTCACATTATTTAGGACTGAGGACATGGCTCTTGCAGCAATGCTGCCCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACATTATTTAGGACTGAGGACATGGCTCTTGCAGCAATGCTGCCCTA  400

seq1  GCATGTCTTGGCTGCCAGGGTAAGAAAAAGAATGAACAAATAGGATCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTCTTGGCTGCCAGGGTAAGAAAAAGAATGAACAAATAGGATCATC  450

seq1  CCATCATCAGTTCAACGGTGACTCCCTGGTATCCCAATTATGTAAGAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCATCAGTTCAACGGTGACTCCCTGGTATCCCAATTATGTAAGAGAT  500

seq1  GAACAAAGATCACATTAAAAGAAGTTTGGAGAACAGAATTTAAATTAGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAAAGATCACATTAAAAGAAGTTTGGAGAACAGAATTTAAATTAGCT  550

seq1  GGTTGTAAAAGGAACACTAAAAGCAACAAAGCTCACGCAAGTCTTTAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTAAAAGGAACACTAAAAGCAACAAAGCTCACGCAAGTCTTTAAAA  600

seq1  CATGCAGAACTGCACTCAATCCTTACTCCCACCCCCACCCCCCCACCCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAGAACTGCACTCAATCCTTACTCCCACCCCCACCCCCCCACCCCC  650

seq1  CGGGGTGTGCTGAGTTGGTGACTGTGGTGGTTTGAATACGCTTGGCCCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGGTGTGCTGAGTTGGTGACTGTGGTGGTTTGAATACGCTTGGCCCAG  700

seq1  GGAGTGGCACTATTCAGAGGTGTGACCTTGTTGGGGGAAGTGTGTCATTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGGCACTATTCAGAGGTGTGACCTTGTTGGGGGAAGTGTGTCATTG  750

seq1  TCAGTGTGGGCTTTGACACCCTTCTCCTAGCTGCTCGTGAGACAGTCTAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGTGGGCTTTGACACCCTTCTCCTAGCTGCTCGTGAGACAGTCTAC  800

seq1  TCTTGGCTTCTTAGAACTCTTGGCTCCTCCAACACCATGTCTGCCTGCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGCTTCTTAGAACTCTTGGCTCCTCCAACACCATGTCTGCCTGCCT  850

seq1  GCTGGCATTCTTCATGCCATGCTGATAATGGACTGAAGCTCTGAACCTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCATTCTTCATGCCATGCTGATAATGGACTGAAGCTCTGAACCTGT  900

seq1  ATGCCAACCCCAATTAAACATTGTCC-TTTATAAGAGTTGCCTTGGGCAT  949
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCAACCCCAATTAAACATTGTCCTTTTATAAGAGTTGCCTTGGGCAT  950

seq1  GGTGT-CTCTTCACTGCACTAAAACCCCAACTAAGACCGTG-ATACTTTC  997
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GGTGTCCTCTTCACTGCACTAAAACCCCAACTAAGACCGTGAATACTTTC  1000

seq1  CCCTAGCCACCAGACCTATGACTTCTACCTTGAATTTCAGTTCTGGCTTA  1047
      || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||
seq2  CCTTAGCCACCAGACCTATGACTTCTACCCTGATTTTCAGTTCTGGC-TA  1049

seq1  ACAATCTTTCTCTTCCCCATCACTACTCCCACGAAAGACATTT-GGCTCT  1096
      ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ACATTCTTTCTCT--CCCATCCCTACTCCCACGAAAGACATTTGGGCTCT  1097

seq1  TTAGAACTCGACAGGCATTGGCAGGAATTAATGTGATGCTTCCCCCACTC  1146
      ||||||||||||||||| | ||| ||  | ||||||||||||||| | | 
seq2  TTAGAACTCGACAGGCAAT-GCAAGA--TTATGTGATGCTTCCCCAAATT  1144

seq1  TGGCCATGAGGAATTGGCTTTTTCTTCTT--GAACCTCTTT  1185
        | ||||||    || ||||||||||||  || |||||||
seq2  CTGTCATGAG---ATGACTTTTTCTTCTTGAGACCCTCTTT  1182


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |