BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-326G23
Chromosome18 (Build37)
Map Location 73,423,475 - 73,524,716
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDcc, LOC629684, LOC100043411, LOC100042955
Downstream geneRkhd2, Smad4, Elac1, Me2, Mro, Mapk4, 2810433K01Rik, Cxxc1, EG435570, Mbd1, Ccdc11, LOC628298
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-326G23.bB6Ng01-326G23.g
ACCGA114245GA114246
length1,1791,037
definitionB6Ng01-326G23.b B6Ng01-326G23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,523,550 - 73,524,716)(73,423,475 - 73,424,500)
sequence
gaattcatcgcacccccttccttatcgggatgcacctcggggctgggtcc
tcctgccagcatctcagactctaggggacttgcttcccttagtcctttcc
ttcaactttacatcccaccctatcgtctcaccagctcgccagctcatctt
gcttctgatgctctggagctagggttctttgcctccctgcctcgaatctc
cttcttatccttttccctggccagatattttctaccactggagtcctctc
ctggggtgatctttcctgtgcttgcttcctgagcattacctctgcagcta
tggctgtcatggtggccacgcccttgaaaaagatgtgtgtggagcctttg
gtagttaggtttccccagggaaacagaactagcgggaaatgtatctgaac
gcacgtacgagggggattattatgagaattggtttacgtggctaaggagg
ctgagaagtccatagccttccttctgcaagccagagaactggaaatctgt
tggtgtaaggtctctcactctgaaggctgagaaccagaggacccactcac
tgactttgggagacaatgggagatggcctggttcacaaagaggaaatgaa
cttgccctttttctgcttctctaatctacctaggcttttactcacatgcc
accctctgtccaactgctaatcccatggaaacatccacaaacacactcag
agacaacgttttatcactcacctgggcaccccttaacctcatcaggttgg
tatatatatttaagtaccacaagtccttaaaaccagttccactgtgagct
tagactccagaattatggaaataaagcttactggttaaggcagctagcat
gtgtcatttgctatgacagccctggcaaccgatttcatggtggcataatg
attccctttctttcctatcccctttcttgtatttggacgtatgtccttgc
tattgtctcctgacatgtactctggaggtacctggatgttcctgacttct
gaagcgaacattgacccattatcacatcattttattctttcataggagct
taggttttggaatgcccaagggtccgctatcccttaccctgcctcatcgt
tatgcgtcatgaacacaggtaggttactttatgaaaactgtttggctaac
agatactggacctaagtcgtggtggcgat
gaattctccttcgcctaggacgtgtcactccctgattggctgcagcccat
cggccgagttgacgtcacggggaaggcagagcacatggagtgaagaacca
ccctcggcacatgcgcagattatttgtttaccacttagaacacagctgtc
agcgccatcttgtaacggcgaatgtgggcgcggctcccaacaggagaggg
tgtgcttagcctcacagacttgatctgccagagttggggggattcccagg
gccacccacctgctcagaggacaagggaagagaggatggaaggattgtgg
gatggaatgacctggaggggagcagtaagctgagtgtaaagtgaatatat
acaataataaataaaaaaaagaagataggcctaactggagaaaatagatc
actaaaggcatgcctttaaaaaacatgatttttgcccctcaatctttctc
ttgctctctttgtctcctgtggtagtttgaatatgcttggcccaggagtg
gcattatcaggaggtgtggccttgtaagagtaggttaggccttgtttgag
gaagtgtgtcactgtctggatggtcaatgagatcctcctcctatccagat
gggagccagtcttctcctagaggccttcaaatgaagatgtggaactctca
gctattcctgctccattcctgtctggacgctgccatgccttggtgataat
ggactgaacctctaaacctgtacaccagccttaattaagtgttgtccttt
ataagagttgccttggtcatggtgtctgttcacagcagtaaaaccctaac
taaggcacctcccttggggaatgaggagtcaaggtttctctcccctgcat
gtctgccatgattttctatgtcactaagtgacactaagaaacaaaaagct
gaaatctctgcaaccatgtctccaaaaatgtcttttcctcctgtatgctg
ttcagctcaggtaatgccatctaagccacccagctggctattttctccct
ttcacttcactgaaaggaatcaaactcacagttgagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_73523550_73524716
seq2: B6Ng01-326G23.b_50_1227 (reverse)

seq1  TCGCCAC----AGCTAGG-CCAGTATCTG-TAGCC-AACAGTTCTCAATA  43
      |||||||    |  |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||  |
seq2  TCGCCACCACGACTTAGGTCCAGTATCTGTTAGCCAAACAGTTTTCATAA  50

seq1  AGTA--CTTACTGTGTTCATGAACGCAGTGACGATGAGGGCAGGGT-AGG  90
      ||||  ||  ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |||
seq2  AGTAACCTACCTGTGTTCATG-ACGCA-TAACGATGA-GGCAGGGTAAGG  97

seq1  GATAGCGGACCC-TGGGCATTCCAAAACTAAAGCTCCTATGAAAGAAT-A  138
      |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |
seq2  GATAGCGGACCCTTGGGCATTCCAAAACCTAAGCTCCTATGAAAGAATAA  147

seq1  AATGATGTGAT-ATGGGTCATTG-TCGCTTCAGAAGTCAGGAACATCCAG  186
      ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATGTGATAATGGGTCAATGTTCGCTTCAGAAGTCAGGAACATCCAG  197

seq1  GTACCTCCAGAGTACATGTCAGGAGACAATAGCAAGGACATACGTCCAAA  236
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCTCCAGAGTACATGTCAGGAGACAATAGCAAGGACATACGTCCAAA  247

seq1  TACAAGAAAGGGGATAGGAAAGAAAGGGAATCATTATGCCACCATGAAAT  286
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGAAAGGGGATAGGAAAGAAAGGGAATCATTATGCCACCATGAAAT  297

seq1  CGGTTGCCAGGGCTGTCATAGCAAATGACACATGCTAGCTGCCTTAACCA  336
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTTGCCAGGGCTGTCATAGCAAATGACACATGCTAGCTGCCTTAACCA  347

seq1  GTAAGCTTTATTTCCATAATTCTGGAGTCTAAGCTCACAGTGGAACTGGT  386
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGCTTTATTTCCATAATTCTGGAGTCTAAGCTCACAGTGGAACTGGT  397

seq1  TTTAAGGACTTGTGGTACTTAAATATATATACCAACCTGATGAGGTTAAG  436
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGGACTTGTGGTACTTAAATATATATACCAACCTGATGAGGTTAAG  447

seq1  GGGTGCCCAGGTGAGTGATAAAACGTTGTCTCTGAGTGTGTTTGTGGATG  486
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGCCCAGGTGAGTGATAAAACGTTGTCTCTGAGTGTGTTTGTGGATG  497

seq1  TTTCCATGGGATTAGCAGTTGGACAGAGGGTGGCATGTGAGTAAAAGCCT  536
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCATGGGATTAGCAGTTGGACAGAGGGTGGCATGTGAGTAAAAGCCT  547

seq1  AGGTAGATTAGAGAAGCAGAAAAAGGGCAAGTTCATTTCCTCTTTGTGAA  586
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGATTAGAGAAGCAGAAAAAGGGCAAGTTCATTTCCTCTTTGTGAA  597

seq1  CCAGGCCATCTCCCATTGTCTCCCAAAGTCAGTGAGTGGGTCCTCTGGTT  636
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCCATCTCCCATTGTCTCCCAAAGTCAGTGAGTGGGTCCTCTGGTT  647

seq1  CTCAGCCTTCAGAGTGAGAGACCTTACACCAACAGATTTCCAGTTCTCTG  686
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCCTTCAGAGTGAGAGACCTTACACCAACAGATTTCCAGTTCTCTG  697

seq1  GCTTGCAGAAGGAAGGCTATGGACTTCTCAGCCTCCTTAGCCACGTAAAC  736
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCAGAAGGAAGGCTATGGACTTCTCAGCCTCCTTAGCCACGTAAAC  747

seq1  CAATTCTCATAATAATCCCCCTCGTACGTGCGTTCAGATACATTTCCCGC  786
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCTCATAATAATCCCCCTCGTACGTGCGTTCAGATACATTTCCCGC  797

seq1  TAGTTCTGTTTCCCTGGGGAAACCTAACTACCAAAGGCTCCACACACATC  836
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTCTGTTTCCCTGGGGAAACCTAACTACCAAAGGCTCCACACACATC  847

seq1  TTTTTCAAGGGCGTGGCCACCATGACAGCCATAGCTGCAGAGGTAATGCT  886
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCAAGGGCGTGGCCACCATGACAGCCATAGCTGCAGAGGTAATGCT  897

seq1  CAGGAAGCAAGCACAGGAAAGATCACCCCAGGAGAGGACTCCAGTGGTAG  936
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAGCAAGCACAGGAAAGATCACCCCAGGAGAGGACTCCAGTGGTAG  947

seq1  AAAATATCTGGCCAGGGAAAAGGATAAGAAGGAGATTCGAGGCAGGGAGG  986
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATCTGGCCAGGGAAAAGGATAAGAAGGAGATTCGAGGCAGGGAGG  997

seq1  CAAAGAACCCTAGCTCCAGAGCATCAGAAGCAAGATGAGCTGGCGAGCTG  1036
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAACCCTAGCTCCAGAGCATCAGAAGCAAGATGAGCTGGCGAGCTG  1047

seq1  GTGAGACGATAGGGTGGGATGTAAAGTTGAAGGAAAGGACTAAGGGAAGC  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGACGATAGGGTGGGATGTAAAGTTGAAGGAAAGGACTAAGGGAAGC  1097

seq1  AAGTCCCCTAGAGTCTGAGATGCTGGCAGGAGGACCCAGCCCCGAGGTGC  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCCCTAGAGTCTGAGATGCTGGCAGGAGGACCCAGCCCCGAGGTGC  1147

seq1  ATCCCGATAAGGAAGGGGGTGCGATGAATTC  1167
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCGATAAGGAAGGGGGTGCGATGAATTC  1178

seq1: chr18_73423475_73424500
seq2: B6Ng01-326G23.g_66_1102

seq1  GAATTCTCCTTCGCCTAGGACGTGTCACTCCCTGATTGGCTGCAGCCCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTTCGCCTAGGACGTGTCACTCCCTGATTGGCTGCAGCCCAT  50

seq1  CGGCCGAGTTGACGTCACGGGGAAGGCAGAGCACATGGAGTGAAGAACCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCCGAGTTGACGTCACGGGGAAGGCAGAGCACATGGAGTGAAGAACCA  100

seq1  CCCTCGGCACATGCGCAGATTATTTGTTTACCACTTAGAACACAGCTGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCGGCACATGCGCAGATTATTTGTTTACCACTTAGAACACAGCTGTC  150

seq1  AGCGCCATCTTGTAACGGCGAATGTGGGCGCGGCTCCCAACAGGAGAGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGCCATCTTGTAACGGCGAATGTGGGCGCGGCTCCCAACAGGAGAGGG  200

seq1  TGTGCTTAGCCTCACAGACTTGATCTGCCAGAGTTGGGGGGATTCCCAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTTAGCCTCACAGACTTGATCTGCCAGAGTTGGGGGGATTCCCAGG  250

seq1  GCCACCCACCTGCTCAGAGGACAAGGGAAGAGAGGATGGAAGGATTGTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCCACCTGCTCAGAGGACAAGGGAAGAGAGGATGGAAGGATTGTGG  300

seq1  GATGGAATGACCTGGAGGGGAGCAGTAAGCTGAGTGTAAAGTGAATATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAATGACCTGGAGGGGAGCAGTAAGCTGAGTGTAAAGTGAATATAT  350

seq1  ACAATAATAAATAAAAAAAAGAAGATAGGCCTAACTGGAGAAAATAGATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATAATAAATAAAAAAAAGAAGATAGGCCTAACTGGAGAAAATAGATC  400

seq1  ACTAAAGGCATGCCTTTAAAAAACATGATTTTTGCCCCTCAATCTTTCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAGGCATGCCTTTAAAAAACATGATTTTTGCCCCTCAATCTTTCTC  450

seq1  TTGCTCTCTTTGTCTCCTGTGGTAGTTTGAATATGCTTGGCCCAGGAGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCTCTTTGTCTCCTGTGGTAGTTTGAATATGCTTGGCCCAGGAGTG  500

seq1  GCATTATCAGGAGGTGTGGCCTTGTAAGAGTAGGTTAGGCCTTGTTTGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTATCAGGAGGTGTGGCCTTGTAAGAGTAGGTTAGGCCTTGTTTGAG  550

seq1  GAAGTGTGTCACTGTCTGGATGGTCAATGAGATCCTCCTCCTATCCAGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGTGTCACTGTCTGGATGGTCAATGAGATCCTCCTCCTATCCAGAT  600

seq1  GGGAGCCAGTCTTCTCCTAGAGGCCTTCAAATGAAGATGTGGAACTCTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGCCAGTCTTCTCCTAGAGGCCTTCAAATGAAGATGTGGAACTCTCA  650

seq1  GCTATTCCTGCTCCATTCCTGTCTGGACGCTGCCATGCCTTGGTGATAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTCCTGCTCCATTCCTGTCTGGACGCTGCCATGCCTTGGTGATAAT  700

seq1  GGACTGAACCTCTAAACCTGTACACCAGCCTTAATTAAGTGTTGTCCTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGAACCTCTAAACCTGTACACCAGCCTTAATTAAGTGTTGTCCTTT  750

seq1  ATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGTTCACAGCAGTAAAACCCTAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGTTCACAGCAGTAAAACCCTAAC  800

seq1  TAAGGCACCTCCCTTGGGGAATGAGGAGTCAGGGTTTCTCTCCCCTGCAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TAAGGCACCTCCCTTGGGGAATGAGGAGTCAAGGTTTCTCTCCCCTGCAT  850

seq1  GTCCTGCCATGATTTTCTATGTCACTAAGTGACACTAAGAA--CAAAAGC  898
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||
seq2  GT-CTGCCATGATTTTCTATGTCACTAAGTGACACTAAGAAACAAAAAGC  899

seq1  TGAAATCTCTGCAACCATGTCTCCAAAAATGTC-TTTCCTCCTGTATGCT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGAAATCTCTGCAACCATGTCTCCAAAAATGTCTTTTCCTCCTGTATGCT  949

seq1  GTTCAGCTCAGGT-ATGGCATCT-AGGCACCCAGCTGGC--TTTTCT-CC  992
      ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||  |||||| ||
seq2  GTTCAGCTCAGGTAATGCCATCTAAGCCACCCAGCTGGCTATTTTCTCCC  999

seq1  TTTCAC-TCACTGAA--GGATCAAACTCACAG-TGAGT  1026
      |||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||
seq2  TTTCACTTCACTGAAAGGAATCAAACTCACAGTTGAGT  1037