BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-330M03
Chromosome18 (Build37)
Map Location 83,897,050 - 83,898,260
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039563, Zfp516, LOC100041001, 4921531P14Rik, LOC665284
Downstream geneTshz1, Zadh2, LOC669856, Zfp407, Cndp1, EG640234, Cndp2, LOC100039711, LOC100039725, B230399E16Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-330M03.bB6Ng01-330M03.g
ACCGA117324GA117325
length1,21277
definitionB6Ng01-330M03.b B6Ng01-330M03.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcttgagggtatacaaatggtgactccaggaaatctgaggagagaa
ataaccattagaaatccagtggataccatgtgtctctccaacccacctat
gctaagttcatgtactaccatcatggcatctccaagatggctgtcagcct
actctttctggcatgatcaacatttgttactgtgactgcccatctatgat
ttggtgaatgtggcaacagccagctcatgataagtaagtctgatagccag
ctaataactcaactagtcaatgtccatggacctgggatactttttgatga
ctctttgaagtagatggtatggatctgatccatggctgtgaagatgaata
ataagaccctcctcttcataccagtaagaaactccatatggtatttgtat
cttatgaatataattcttcagcatcttcatggccttatgaagagttacat
atatgcaggctacagttactggcatgtttctggatcctctagagtggctc
tatttttttctgaagtcactcaaaactgtgagtcttgttagttacttgta
agttgactaatagaatacttttatatgtggctcatgctttcttcaaaacc
ttaataaccctagggtgtttttaacttaaagaaaagggtctggtgaaatg
actcgtgggctaaaggtgcttgtaacaaagttatgaccttagttcaatcc
ccaggacataactgactcctacaagttgtcctctggtctccacacacata
tacatataccatcacacatacattcatacaaattaataaatttagtaaaa
ataaaatttttacacaaagcattaacaaccccaaaccctagcttatttct
taatggtagaaggtgcaatgtatcaaaaatttaaatggtttagtctgcca
atcatccctatatcccttaagacttattaacatagcaagatttaaaatgg
tgcagcttacctccccccacatcctaaaatgcagtagaatatttgtactt
tgtgttcttcatattctggagacataccagccattattaataggccacac
aggataccctgaattgaccatggttgaaccttccggactctatttgtgac
acaagaataagaattcacctaatccagatgaatacttgggcaatgcacat
tggtgtgccatttcaaggtgagccactctatctgatctctcctttcctta
taggtcgtaaaa

accttcccacagtcagaatggctaaggaaacaaagaaagacaatatatag
tggtatggatatcggggtgggggtggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_83897050_83898260
seq2: B6Ng01-330M03.b_52_1263

seq1  GAATTCTTGAGGGTATACAAATGGTGACTCCAGGAAATCTGAGGAGAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGAGGGTATACAAATGGTGACTCCAGGAAATCTGAGGAGAGAA  50

seq1  ATAACCATTAGAAATCCAGTGGATACCATGTGTCTCTCCAACCCACCTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACCATTAGAAATCCAGTGGATACCATGTGTCTCTCCAACCCACCTAT  100

seq1  GCTAAGTTCATGTACTACCATCATGGCATCTCCAAGATGGCTGTCAGCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAGTTCATGTACTACCATCATGGCATCTCCAAGATGGCTGTCAGCCT  150

seq1  ACTCTTTCTGGCATGATCAACATTTGTTACTGTGACTGCCCATCTATGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTTCTGGCATGATCAACATTTGTTACTGTGACTGCCCATCTATGAT  200

seq1  TTGGTGAATGTGGCAACAGCCAGCTCATGATAAGTAAGTCTGATAGCCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGAATGTGGCAACAGCCAGCTCATGATAAGTAAGTCTGATAGCCAG  250

seq1  CTAATAACTCAACTAGTCAATGTCCATGGACCTGGGATACTTTTTGATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAACTCAACTAGTCAATGTCCATGGACCTGGGATACTTTTTGATGA  300

seq1  CTCTTTGAAGTAGATGGTATGGATCTGATCCATGGCTGTGAAGATGAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTGAAGTAGATGGTATGGATCTGATCCATGGCTGTGAAGATGAATA  350

seq1  ATAAGACCCTCCTCTTCATACCAGTAAGAAACTCCATATGGTATTTGTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGACCCTCCTCTTCATACCAGTAAGAAACTCCATATGGTATTTGTAT  400

seq1  CTTATGAATATAATTCTTCAGCATCTTCATGGCCTTATGAAGAGTTACAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGAATATAATTCTTCAGCATCTTCATGGCCTTATGAAGAGTTACAT  450

seq1  ATATGCAGGCTACAGTTACTGGCATGTTTCTGGATCCTCTAGAGTGGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCAGGCTACAGTTACTGGCATGTTTCTGGATCCTCTAGAGTGGCTC  500

seq1  TATTTTTTTCTGAAGTCACTCAAAACTGTGAGTCTTGTTAGTTACTTGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTTTCTGAAGTCACTCAAAACTGTGAGTCTTGTTAGTTACTTGTA  550

seq1  AGTTGACTAATAGAATACTTTTATATGTGGCTCATGCTTTCTTCAAAACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGACTAATAGAATACTTTTATATGTGGCTCATGCTTTCTTCAAAACC  600

seq1  TTAATAACCCTAGGGTGTTTTTAACTTAAAGAAAAGGGTCTGGTGAAATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATAACCCTAGGGTGTTTTTAACTTAAAGAAAAGGGTCTGGTGAAATG  650

seq1  ACTCGTGGGCTAAAGGTGCTTGTAACAAAGTTATGACCTTAGTTCAATCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCGTGGGCTAAAGGTGCTTGTAACAAAGTTATGACCTTAGTTCAATCC  700

seq1  CCAGGACATAACTGACTCCTACAAGTTGTCCTCTGGTCTCCACACACATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACATAACTGACTCCTACAAGTTGTCCTCTGGTCTCCACACACATA  750

seq1  TACATATACCATCACACATACATTCATACAAATTAATAAATTTAGTAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATATACCATCACACATACATTCATACAAATTAATAAATTTAGTAAAA  800

seq1  ATAAAATTTTTACACAAAGCATTAACAACCCCAAACCCTAGCTTATTTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATTTTTACACAAAGCATTAACAACCCCAAACCCTAGCTTATTTCT  850

seq1  TAATGGTAGAAGGTGCAATGTATCAAAAATTTAAATGGTTTAGTCTGCCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGGTAGAAGGTGCAATGTATCAAAAATTTAAATGGTTTAGTCTGCCA  900

seq1  ATCATCCCTATATCCCTTAAGACTTATTAACATAGCAAGATTTAAAATGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCCCTATATCCCTTAAGACTTATTAACATAGCAAGATTTAAAATGG  950

seq1  TGCAGCTTACCTCCCCCCACATCCTAAAATGCAGGTAGAATATTTGTTAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
seq2  TGCAGCTTACCTCCCCCCACATCCTAAAATGCA-GTAGAATATTTG-TAC  998

seq1  TTTGTGTTCTTCATATTCTGGAGACATACCAGCCAT--ATAATA-GCCAC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||
seq2  TTTGTGTTCTTCATATTCTGGAGACATACCAGCCATTATTAATAGGCCAC  1048

seq1  ACAGGATACCCTGAAATGACCAATGGTTGTACCTT-CAGACTCTA-TTGT  1095
      ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||
seq2  ACAGGATACCCTGAATTGACC-ATGGTTGAACCTTCCGGACTCTATTTGT  1097

seq1  GACACAAG-ATAAGAATTCACCTAATCCAGAATGAATACTTTGGGCAAAT  1144
      |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||
seq2  GACACAAGAATAAGAATTCACCTAATCCAG-ATGAATAC-TTGGGC-AAT  1144

seq1  GCACATTGGTG-GCCA-TTCCAGGTGAAGGCAAACTAATTCTGATCT-TC  1191
      ||||||||||| |||| ||| ||||| || ||  |||  |||||||| ||
seq2  GCACATTGGTGTGCCATTTCAAGGTG-AGCCACTCTA--TCTGATCTCTC  1191

seq1  CTTT-CTTATGGGTCGTAAAA  1211
      |||| ||||| ||||||||||
seq2  CTTTCCTTATAGGTCGTAAAA  1212


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |