BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-337B10
Chromosome18 (Build37)
Map Location 43,001,969 - 43,118,161
singlet/doubletdoublet
Overlap genePpp2r2b
Upstream geneLOC100041997, Prelid2, Gm851, Sh3rf2, EG435561, Plac8l1, LOC433177, Lars, EG625929, LOC100042757, Rbm27, Pou4f3, LOC100042767, LOC100042027, Tcerg1, Gpr151, LOC100042037
Downstream geneLOC100042046, LOC100042051, EG666594, Stk32a, Dpysl3, LOC100042074, LOC100042807, Jakmip2, Spink3, Scgb3a2, Gm94
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-337B10.bB6Ng01-337B10.g
ACCGA121818GA121819
length8751,132
definitionB6Ng01-337B10.b B6Ng01-337B10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(43,117,287 - 43,118,161)(43,001,969 - 43,003,110)
sequence
gaattctctgtcattgtggcgaccaaccttctagcactgttacaaactgc
ccaaaagaacagaaggaggaaggttatctgcactcattttcaggggtctc
agtccatggttggcttcactgctgtgaggcccaaggcaaggcagaatcat
tgcagaggaatcatgaggctgaggaaatgtgttcacatgatgtcatccac
aaagcagaggaaggggaaagatgtactcttcacggcatgcccatgatgat
gtacttcctcccttgaggccctgttgtcacctttaatttggacctatagc
ttccagaacctagagggcttctctaaggtcccaatttgtggtaatttact
acactatcctgagaaaaccaacataaaatgtgttttaatttttaaaggaa
agattaatttacaaatcacatagagcaagattcactattctgccatgtgg
agccatgaaccatgctttaggttgttttggatgcaagataaatttctgga
attgaattttggtacaggtaaaaggaaaggaatggggcctacttcttagt
tgctcttcagatcacgatgtacagagggagcagaacatacttgaaggcta
cataagcatcatatcccaaaactccaaaagatttcatgacacatctggag
atctatcttactgacagactgttttaaagatccccaggcctacttgtcat
cattttcattttttccctcaaccatattaaataagattgtaagaatgagc
tgaagggaaaattaggccccaagtgttctggcgtcttttcttcatcgaag
gtcaaccacatagcagtgagccagaatgcattgtgaacagacatatggca
tttgtttgggaggaggaagggtggg
gaattctctgggagggttgaagtggtatttccttcatcttaacaagacac
atgttaaattaggagggtaatacacataaatattatatatttaaactatc
caaaagtagggaagaaatgcttgtttcagatatatgtgtgcacatgtgtg
tacattcatatgttctcatccaatgtgatagggtacagaattgttttcag
tttcagtatctctcatcaaattattttaataaaccatgtatttcaggatg
acaaaggaagcctattttcccataggcatttggtgtttttttatatggaa
ttgctattaatttttaggttctcaggaataacatgtatgcttccatgaca
tgcgtgtgttaagcacctattgctacttaagtcatttactacatcttttg
ctgcattctattctaattcagactgacctctaagtcccaacagtgatggc
agctgctagccactaccaccttcaggctggaggtttttcaaaaatgtaca
atggatcaacagagtcagaacagaaaggactctggaacaagaaatcagtg
cattttagcactagcttaaatgggtcctcactggaatcgaatgggcaagg
agagtcatctctagccttcctcatcctcagaagacacttggagaaaacac
tgggatgaatgggtcctttgcagactgcagagggtcatgttatccaaaag
aatgtggccatctgggcggtgcagaagtgagtgtgcagaaggagaggtct
gtttatcctctgccacctccatgtcccttacaatcactcttctagatgct
tgggctttattaactcaagggtggaccctgggtcagcagcatctggaaca
cctgggagcctgaagaacttcagaatctcactcttcacccagactcctga
atcaggatttacattataacaggaaccccaggtgacccccacacattaaa
gcttaagagttgcttctctcagtcgccctaacttctttgtcagccatcta
ctctagtagtcagagatcctccacattcatagacactacttttgacactt
ccaggcttgctgctatggtttgtgactcaagagccaatgtcatggctctg
cataagttcaagcagctatcatcttcagagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_43117287_43118161
seq2: B6Ng01-337B10.b_47_921 (reverse)

seq1  CCCACCCTTCCTCCTCCCAAACAAATGCCATATGTCTGTTCACAATGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCCTTCCTCCTCCCAAACAAATGCCATATGTCTGTTCACAATGCAT  50

seq1  TCTGGCTCACTGCTATGTGGTTGACCTTCGATGAAGAAAAGACGCCAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCTCACTGCTATGTGGTTGACCTTCGATGAAGAAAAGACGCCAGAA  100

seq1  CACTTGGGGCCTAATTTTCCCTTCAGCTCATTCTTACAATCTTATTTAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGGGCCTAATTTTCCCTTCAGCTCATTCTTACAATCTTATTTAAT  150

seq1  ATGGTTGAGGGAAAAAATGAAAATGATGACAAGTAGGCCTGGGGATCTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTGAGGGAAAAAATGAAAATGATGACAAGTAGGCCTGGGGATCTTT  200

seq1  AAAACAGTCTGTCAGTAAGATAGATCTCCAGATGTGTCATGAAATCTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGTCTGTCAGTAAGATAGATCTCCAGATGTGTCATGAAATCTTTT  250

seq1  GGAGTTTTGGGATATGATGCTTATGTAGCCTTCAAGTATGTTCTGCTCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTTTTGGGATATGATGCTTATGTAGCCTTCAAGTATGTTCTGCTCCC  300

seq1  TCTGTACATCGTGATCTGAAGAGCAACTAAGAAGTAGGCCCCATTCCTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTACATCGTGATCTGAAGAGCAACTAAGAAGTAGGCCCCATTCCTTT  350

seq1  CCTTTTACCTGTACCAAAATTCAATTCCAGAAATTTATCTTGCATCCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTACCTGTACCAAAATTCAATTCCAGAAATTTATCTTGCATCCAAA  400

seq1  ACAACCTAAAGCATGGTTCATGGCTCCACATGGCAGAATAGTGAATCTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACCTAAAGCATGGTTCATGGCTCCACATGGCAGAATAGTGAATCTTG  450

seq1  CTCTATGTGATTTGTAAATTAATCTTTCCTTTAAAAATTAAAACACATTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATGTGATTTGTAAATTAATCTTTCCTTTAAAAATTAAAACACATTT  500

seq1  TATGTTGGTTTTCTCAGGATAGTGTAGTAAATTACCACAAATTGGGACCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTGGTTTTCTCAGGATAGTGTAGTAAATTACCACAAATTGGGACCT  550

seq1  TAGAGAAGCCCTCTAGGTTCTGGAAGCTATAGGTCCAAATTAAAGGTGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAAGCCCTCTAGGTTCTGGAAGCTATAGGTCCAAATTAAAGGTGAC  600

seq1  AACAGGGCCTCAAGGGAGGAAGTACATCATCATGGGCATGCCGTGAAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGGCCTCAAGGGAGGAAGTACATCATCATGGGCATGCCGTGAAGAG  650

seq1  TACATCTTTCCCCTTCCTCTGCTTTGTGGATGACATCATGTGAACACATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATCTTTCCCCTTCCTCTGCTTTGTGGATGACATCATGTGAACACATT  700

seq1  TCCTCAGCCTCATGATTCCTCTGCAATGATTCTGCCTTGCCTTGGGCCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCAGCCTCATGATTCCTCTGCAATGATTCTGCCTTGCCTTGGGCCTC  750

seq1  ACAGCAGTGAAGCCAACCATGGACTGAGACCCCTGAAAATGAGTGCAGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAGTGAAGCCAACCATGGACTGAGACCCCTGAAAATGAGTGCAGAT  800

seq1  AACCTTCCTCCTTCTGTTCTTTTGGGCAGTTTGTAACAGTGCTAGAAGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTCCTCCTTCTGTTCTTTTGGGCAGTTTGTAACAGTGCTAGAAGGT  850

seq1  TGGTCGCCACAATGACAGAGAATTC  875
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCGCCACAATGACAGAGAATTC  875

seq1: chr18_43001969_43003110
seq2: B6Ng01-337B10.g_68_1199

seq1  GAATTCTCTGGGAGGGTTGAAGTGGTATTTCCTTCATCTTAACAAGACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGGGAGGGTTGAAGTGGTATTTCCTTCATCTTAACAAGACAC  50

seq1  ATGTTAAATTAGGAGGGTAATACACATAAATATTATATATTTAAACTATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAAATTAGGAGGGTAATACACATAAATATTATATATTTAAACTATC  100

seq1  CAAAAGTAGGGAAGAAATGCTTGTTTCAGATATATGTGTGCACATGTGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGTAGGGAAGAAATGCTTGTTTCAGATATATGTGTGCACATGTGTG  150

seq1  TACATTCATATGTTCTCATCCAATGTGATAGGGTACAGAATTGTTTTCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTCATATGTTCTCATCCAATGTGATAGGGTACAGAATTGTTTTCAG  200

seq1  TTTCAGTATCTCTCATCAAATTATTTTAATAAACCATGTATTTCAGGATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGTATCTCTCATCAAATTATTTTAATAAACCATGTATTTCAGGATG  250

seq1  ACAAAGGAAGCCTATTTTCCCATAGGCATTTGGTGTTTTTTTATATGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGGAAGCCTATTTTCCCATAGGCATTTGGTGTTTTTTTATATGGAA  300

seq1  TTGCTATTAATTTTTAGGTTCTCAGGAATAACATGTATGCTTCCATGACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTATTAATTTTTAGGTTCTCAGGAATAACATGTATGCTTCCATGACA  350

seq1  TGCGTGTGTTAAGCACCTATTGCTACTTAAGTCATTTACTACATCTTTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGTGTGTTAAGCACCTATTGCTACTTAAGTCATTTACTACATCTTTTG  400

seq1  CTGCATTCTATTCTAATTCAGACTGACCTCTAAGTCCCAACAGTGATGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATTCTATTCTAATTCAGACTGACCTCTAAGTCCCAACAGTGATGGC  450

seq1  AGCTGCTAGCCACTACCACCTTCAGGCTGGAGGTTTTTCAAAAATGTACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCTAGCCACTACCACCTTCAGGCTGGAGGTTTTTCAAAAATGTACA  500

seq1  ATGGATCAACAGAGTCAGAACAGAAAGGACTCTGGAACAAGAAATCAGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATCAACAGAGTCAGAACAGAAAGGACTCTGGAACAAGAAATCAGTG  550

seq1  CATTTTAGCACTAGCTTAAATGGGTCCTCACTGGAATCGAATGGGCAAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTAGCACTAGCTTAAATGGGTCCTCACTGGAATCGAATGGGCAAGG  600

seq1  AGAGTCATCTCTAGCCTTCCTCATCCTCAGAAGACACTTGGAGAAAACAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCATCTCTAGCCTTCCTCATCCTCAGAAGACACTTGGAGAAAACAC  650

seq1  TGGGATGAATGGGTCCTTTGCAGACTGCAGAGGGTCATGTTATCCAAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATGAATGGGTCCTTTGCAGACTGCAGAGGGTCATGTTATCCAAAAG  700

seq1  AATGTGGCCATCTGGGCGGTGCAGAAGTGAGTGTGCAGAAGGAGAGGTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGGCCATCTGGGCGGTGCAGAAGTGAGTGTGCAGAAGGAGAGGTCT  750

seq1  GTTTATCCTCTGCCACCTCCATGTCCCTTACAATCACTCTTCTAGATGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATCCTCTGCCACCTCCATGTCCCTTACAATCACTCTTCTAGATGCT  800

seq1  TGGGCTTTATTAACTCAAGGGTGGACCCTGGGTCAGCAGCATCTGGAACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTTTATTAACTCAAGGGTGGACCCTGGGTCAGCAGCATCTGGAACA  850

seq1  CCTGGGAGCCTGAAGAACTTCAGAATCTCACTCTTCACCCAGACTCCTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGAGCCTGAAGAACTTCAGAATCTCACTCTTCACCCAGACTCCTGA  900

seq1  ATCAGGATTTACATTATAACAGGAACCCCAGGTGACCCCCACACATTAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGATTTACATTATAACAGGAACCCCAGGTGACCCCCACACATTAAA  950

seq1  GCTTAAGAGTTGCTTCTCTTCAAGTCGCCCTAACTTCTTTGTTCAGCCAT  1000
      |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| 
seq2  GCTTAAGAGTTGCTTCTCT--CAGTCGCCCTAACTTCTTTG-TCAGCCA-  996

seq1  TCTACTCTAGTAGTTCAGAGAATCT-CACATTCATAGAACACCTACTTTT  1049
      ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||
seq2  TCTACTCTAGTAG-TCAGAGATCCTCCACATTCATAG-ACA-CTACTTTT  1043

seq1  GGACACTTCCCAGGCTTGCTTGCTATGGGTTTGTGACTCAGGAGCCATTG  1099
       ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||
seq2  -GACACTT-CCAGGCTTGC-TGCTAT-GGTTTGTGACTCAAGAGCCAATG  1089

seq1  TCAT-GCTCTGCATA--GTCAAGCGAGGCTAATCATCTTTAGAGAA  1142
      |||| ||||||||||   ||||||   ||| |||||||| ||||||
seq2  TCATGGCTCTGCATAAGTTCAAGC--AGCT-ATCATCTTCAGAGAA  1132