BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-062H22.T7 (MSMg01no062_h22.b1) | MSMg01-062H22.TJ (MSMg01no062_h22.g1) |
ACC | AG288456 | AG288457 |
length | 1,185 | 1,145 |
length of high quality (start - end) | 604 (91 - 694) | 649 (134 - 782) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_h22.b1 PHD_FILE: MSMg01no062_h22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:06:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_h22.g1 PHD_FILE: MSMg01no062_h22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:06:09 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CGATTTATNNNNNAATCATTCGGCGCTATAGACTACTATAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCTATTTAAAATATATTCCTATTAAATTATGAACCATGACT
AAGTTTGTTTCATCCCCCGTTTAAATGATAATCCCCCCTCTATAACAAAG
AGACAAGAATCACATGATCATCTCAATAAACACAGGATGGTATTTGACAA
AGTCCAATGTGTCTTTCCGGTTAAATAAAAAAAAAAGTCCTGAATAAATT
AGTAATGGAAGGGATATGCCTCAGCATAATAAAAATATACCCAAATTGTA
CTAATGGAGAAAAAGTGAACAAATTGTCTTTAAAATCAGATACTCACTAC
GAGTGCCCACTCTTGTTGCTATTATTCAATAGAGTGCTTGAGTCTTAATT
AGATTTTTAAGAAAAGAGAAATCAATAAAGAAAATGCAAAAAGCGAAGGC
AGAAGTCAAGTCTGCAGATGGCAGGACCTACGCTTAAATGATCCAGATAG
TGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAAGACACTAGCTGCTCTTCCAC
GGGACCTGGATCTGATTCTTAGCACCCACATGGCAGCTCACAGCTGTCTG
TAATTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAACCAT
GAATGCACATAAACTAAAAATAAATAAGTCAGTTTTTTAATTAGCCAGCA
GCAGGAACATCGAGGATCAGAGGAATCATGAAGCTCTTAGACTCGCTATG
TTTAAGGGGGGAAAGGAGATCCTGATAGCACCACCAGAATTCTCTTGATC
TCTGATAAACACTTCCTGAAGAGTACCCAGATATAAAATTAACATACTAA
AATCCACAGCAGCTCTTATATAACCAATAATGAATTTGCACAGTGAAAAA
AATTACCTAAGTAATAAATCTAATCCAGTTCAAAATTGGCTAAAATATGA
CAACAGCTCTAAAGTGTTTGCCTTCAAACCATTTTGTTAAGAAAAATGTT
TTTACGTGGGTGTATAACATTTGGAATTGTTAATTTCTTTCTTATATAAA
AATAAATTTTCCCTCTTTTTGTCAATAAATATTGGCATATCAATATGGAG
GTTCTAATTATTTTCTATTAAATAAATATTCTTTAAACCTCCAATATATT
TTTTCTTAACAATTTTCTACTCTCTTCTTCACTTC
| CAGTCTTTNNNNACTGACGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTATAGCTGGAAGGGGNAAAACCAG
CAAGAGGAAGTTACCTGGTGGAAGGGAACCCAGGATTGCAGCTTAGAGAG
AGAAAACAGCCAAGGGTCTGCTCTGGCTGGTCAACAGATTCTCTCCCTTT
CTCCTTCTTTCTCTCTCTCTCTTTACATTTCATTGATTGAGAGAGGGAGA
GGGGGGCGTATGCTCCACATGCCAAGATCAGACAACAACGAGCCAGTCAG
TTCTCTCCCTCCTCTACATGAGTCTTGAGGAGCAAACTCAGGTAGTCAGA
TTTGGGGGCAATTGTCTCTACCCACTGAGCCATCTCACCGGCCCACTATT
TTTAAACGACTGCTTTGAACTGCATCAGACCCCTGTCTCCTCAGATTCCC
ATTTTCACACACTCTAATCCATAAATTCCATTAAAAGCTGCACTGTAGCA
CGAAGCCAAATAAAAGCAGGCTGTTTCAGGTCAAAGTACACACACCTGGG
AGCCCTGTGCTCTCCGCTGTGCAGGAAGGCGTTTATGGCATCCTTTGGAA
CTTTAGGCGTAGGTGAGCGCAGTCTTTAGCTTACTTATTTGTTAAGGACG
ACTTAACTCCTCCTTAGGCTCCCAGGCAGCACTTGTTTGGTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTACATCTCTTTTTCATTTCTTTCTTTATTGTTTCTGCCTGT
TTGTAGACCTCTTCCTGCCTCGGTTTCCTGAGTCCTGGAATGACAACCAT
TCCTCACCACACCCAATTTTGAAGTTTGAACCGGTTTCTTTTATTCCTAG
AATTCAAAGTGGGACCCTGGCATCATCAGCCTTTTGTTTCACCTTTTAAA
AAACCTTTCTGGAAAAATATTTCCTACAACTCCCTAAAGGAATGCTAGGT
TGTAAATCCTCCTATTAATGGCGTCCCCTTCAAGTTTATGTCCTGGTTTA
TAAATTTTGCTCCGTATTCTCTTGAAATTCTTTTTTTGTTATTCGTAACC
TCTCCCATTAAAATAAACCTTTGTTTTCTTCTGTCTTTTTTCTACAATTT
TTCTATTCTCATCATCATTATTCCTTTTATACAATTTCTTCCCTT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 6 8 8 6 9 3 0 0 0 0 0 3 9 9 7 7 8 7 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 19 10 10 8 10 10 16 16 19 24 35 32 34 34 34 34 34 34 43
43 47 48 47 47 47 47 42 42 38 38 38 36 36 36 53 41 44 39 37 37 37 23 18 9 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 19 17 21 16 16 18 21 30 31 35 35 36 38 38 38
38 38 38 36 36 36 36 31 31 31 33 33 33 27 29 10 8 7 7 7 7 8 8 10 13 24 28 37 23 18 11 9 9 11 10 10 10 10 10 19 22 30 30 33 36 36 37 44 44 59
57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 50 50 53 53 53 50 68 68 68 68 68 57 57 50 54 54 68 68 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 41 41 57 57 59 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 54 48 47 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57
54 54 57 57 57 68 59 59 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 38 38 15 15 16 34 38 44 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 44 39
16 12 10 16 14 29 18 16 15 11 23 39 44 44 62 43 43 43 43 62 62 62 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 52 52 52 62 52 62 52 52
52 52 52 43 43 39 43 43 52 52 52 52 52 43 43 39 43 43 59 43 39 39 43 43 43 52 52 52 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62
62 47 43 35 35 41 43 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 31 43 35 43 43 52 52 52 62 62 62 62 62 52 52 52 43 62 43 43 36 41 24 24 35 44 44 62 62 62 62 44
43 44 31 31 35 35 43 20 20 20 41 41 59 59 59 68 68 68 59 59 43 35 35 35 43 43 52 52 52 43 41 38 17 17 17 38 38 52 57 52 52 52 43 43 32 30 30 42 42 57
52 52 57 57 59 59 52 52 52 57 57 57 50 50 41 41 38 38 43 27 20 20 38 32 35 38 38 35 35 35 41 33 41 28 28 20 20 20 32 18 18 18 32 32 28 23 23 23 37 44
57 54 47 46 41 41 27 26 33 40 40 30 30 30 42 42 36 36 23 28 28 36 36 43 42 48 40 40 28 36 31 29 29 42 42 48 57 26 19 10 10 12 10 16 13 15 18 21 21 20
20 20 19 24 11 18 13 15 15 16 14 14 24 26 14 17 15 19 12 24 24 30 32 31 36 37 41 39 37 37 32 19 23 15 18 24 20 23 11 11 9 15 15 19 19 23 23 31 31 20
20 40 29 31 20 31 32 28 21 19 11 11 21 23 26 18 15 11 11 11 10 10 12 20 16 17 11 13 12 19 12 12 10 10 10 10 10 10 12 15 11 11 14 14 14 13 15 8 8 8
8 8 16 25 20 19 12 11 11 10 10 10 23 15 15 12 12 10 10 9 9 9 9 9 8 10 10 10 10 8 9 9 12 10 8 8 8 8 8 8 10 9 10 13 15 8 8 8 8 8
9 9 12 9 9 10 12 15 12 12 12 11 11 10 12 10 9 9 9 9 9 9 10 10 13 10 11 12 10 8 8 8 16 23 32 28 18 8 8 8 8 8 8 8 9 9 13 10 10 10
12 10 11 11 11 11 10 10 10 10 10 10 10 15 15 19 12 10 10 10 12 7 6 6 6 10 6 9 8 8 8 8 8 8 12 14 9 8 8 8 13 18 12 12 11 11 10 12 13 10
13 11 12 11 9 8 8 6 6 8 6 10 10 10 9 11 11 9 9 10 10 15 19 11 12 10 11 8 8 8 8 8 10 10 9 9 10 10 11 11 13 13 19 19 26 10 10 8 10 8
9 9 9 8 8 8 8 10 6 9 8 8 10 8 8 8 8 8 11 11 15 11 11 10 10 9 10 8 6 6 8 8 8 6 10 6 6 8 8 6 8 8 8 9 9 9 10 12 12 15
13 12 11 11 11 10 10 11 11 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 8 9 10 10 10 15 11 12 10 7 6 6 6 8 13 9 9 8 8 7 6 8 8 10 10 10 11
12 8 10 8 6 8 8 8 7 7 12 10 10 11 11 9 9 8 8 11 13 13 10 10 11 8 8 8 8 8 8 12 21 12 12 12 8 8 6 7 8 8 8 6 6 8 6 6 6 7
13 13 11 11 11 17 10 8 6 6 6 10 10 15 21 12 12 10 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 9 9 9 | Open.Hide. 7 7 7 8 8 8 8 3 0 0 0 0 3 9 9 9 6 6 6 7 7 9 9 9 15 6 6 6 7 8 14 13 9 7 9 9 16 15 22 21 22 9 9 11 22 22 33 30 30 30
30 35 35 35 37 42 35 35 35 36 36 36 36 33 41 37 50 42 41 25 21 11 10 10 10 10 9 9 11 10 13 13 15 11 11 12 18 25 23 23 3 0 3 29 29 59 59 47 50 50
48 48 48 48 57 57 57 57 36 27 10 8 8 8 8 8 10 10 13 13 21 26 34 23 18 11 9 11 8 10 8 8 8 9 25 27 41 47 46 37 37 32 29 35 36 42 42 59 59 59
59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 48 57 57 50 50 50 50 50 48 48 48 53 50 68 68 68 50 50 50 50 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57
57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 68 68 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 59 57 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 48 59 57 57 57 48 43 43 47 47 34 34 21 24 12 15 14 19
34 34 47 41 46 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 54 54 57 59 59 68 68 68 59 59 59 57 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 44 46 46 59 59 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 38 38 43 50 50 50 39 39 43 43 43 43 52 52 52 52 59 59 54 54
44 44 32 32 43 44 50 57 52 43 43 50 50 59 59 57 57 59 59 59 54 57 54 59 57 57 57 57 54 54 54 59 57 57 57 57 57 57 44 44 44 57 57 57 57 57 48 44 44 46
46 54 57 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 54 54 54 54 48 57 46 43 43 39 39 47 59 59 48 48 48 59 59 59 48 48 59 59 59 59 59 59 57 47 39 39 37 37 37 37 37
37 39 39 39 39 25 31 37 47 47 47 59 59 48 48 43 43 37 43 39 47 43 43 37 43 40 25 25 25 36 37 48 47 47 48 48 57 47 50 50 48 48 39 59 46 41 41 30 21 18
18 21 23 23 25 28 28 28 30 33 33 30 28 28 32 32 35 39 37 39 37 37 39 36 33 31 37 28 28 23 23 23 34 34 30 30 18 17 11 17 11 17 17 26 19 28 28 28 28 37
24 26 14 12 12 11 11 12 12 13 13 23 21 28 22 24 29 29 31 30 28 26 33 33 32 29 29 29 25 26 11 10 10 13 15 13 14 19 12 22 19 22 17 17 17 18 18 12 12 12
19 15 12 11 9 9 8 8 10 10 10 11 17 13 12 12 12 10 16 16 17 11 9 9 9 13 12 17 13 11 10 8 8 8 8 8 8 16 19 27 22 28 25 21 19 12 9 9 9 9
9 9 9 14 21 23 19 22 9 8 8 8 8 8 8 10 16 16 14 14 14 13 13 13 11 11 11 11 11 11 16 18 18 26 13 13 11 19 12 11 11 11 13 15 15 8 8 8 8 8
8 10 10 9 10 10 18 15 12 10 8 8 8 10 14 10 9 9 11 9 15 15 10 7 7 8 8 9 8 8 10 13 13 11 11 8 8 10 10 16 9 10 10 12 12 13 19 17 17 8
12 7 9 8 8 8 8 8 8 6 8 8 9 10 10 10 10 10 9 9 9 8 8 7 8 11 10 12 10 12 12 10 10 11 13 12 9 9 9 10 9 10 10 10 10 10 13 8 8 8
8 8 8 8 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 8 10 7 9 10 10 8 8 10 10 11 11 10 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8
8 10 10 8 8 6 6 8 8 10 15 15 15 13 13 11 8 8 6 6 8 8 11 11 13 11 11 10 15 10 9 8 8 6 6 8 8 11 12 21 10 12 10 11 8 8 8 8 8 8
11 11 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 11 6 6 8 8 8 8 8 10 8 10 7 7 10 8 8 8 8 8 8 |