| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-143L04.T7 (MSMg01no143_l04.b1) | MSMg01-143L04.TJ (MSMg01no143_l04.g1) |
|---|
| ACC | AG347976 | AG347977 |
|---|
| length | 717 | 711 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 522 (43 - 564) | 545 (73 - 617) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no143_l04.b1 PHD_FILE: MSMg01no143_l04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:04:19 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no143_l04.g1 PHD_FILE: MSMg01no143_l04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:04:19 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCTAGTTTCTTCTGATTCCTAGACTTGGGAGTATGAGGTTCTAGCCTGCA
TATCTTTAAATGTTCTTAGATTCTATCTGGAGAAGGTTCTTTGAAGATTG
TTTTTTTATTTTGTTATTTTCTATTTTTTTATTTGTTTTTTTCAAGACAG
GGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTTCTGGAACTAACTCTATAACCAGGC
TGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCAGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGAT
TAAAGGTGTGCACCACCATTGCCCAGCTGAAGATTTATTTTTATTATTTT
TAAATTATGTATATGTAGGTGTGTCTGAATGTGGGTTTGTGCACCAAGGT
TTATGCAGAGGGCACAGGTACTGGACTCCTTGCAGTTGGAGTTTATGCAG
AGGGTAGAGGTACTGGACTTGCAGTTGGAGCTGTGTGATGTTGGGTTTGA
CCCACTTGATGTGGGTGCTAGGAAGTAAACTTGGGTCCTTGATTCATCTT
TCCAGCTCTGGAGGCGTCCTCATTGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTC
TTACTTTTTTTCCTCCTCCTCTTCCTTGTATAGTATTTCGATATGTGCTG
TTCTGAGACGCTAGCGGTAGCTTCTTTCTCCCTTCGCATTATTGAACTGC
GGGCGTCCTCCACTCCG
| ATGATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTGAAAGGAGACTCTCTGGTTGTGAACT
TCCTTGCAGGAAGAGGGAGATCTACACAGGCATTACTCCCTTAGGAGAAT
CTCTCACTCTCCTTGCAGTCTGACCCTGTGCCCTGAGCAGACCTTGGCTG
CTGGCTCCTCACCCAATCCCATAACAGCCAGAGGAAGCTCAACTCCCAGG
GGCTCTGAAAGGCCCAGGGTCACAGGAGAGGCCACAACATCTGCCCAGCA
CCCTGCATAACTGGGTTCTCAGGATCCAGGAACGCAGAAAGCCCCACTCA
GACAGTGGCATGAGTTCCTTCTGGTCTGAACTCATGCCCAGAGAGGACCT
AGGGTGCTGACTCTGCACCCACTCTTACAACTCCCAGACACTCTGAAACA
AAAAGAACTATACAAAAAAGGAAAAACAAAATTCAACAAAACAAGGAGTT
GGTTCTTTGAGAAAAATCAACAAAATAGATAAACCCTTAGCCAGACTAAC
CAGACAGCACATACACAGTATCCAAATTAACAAAGTCAGAAAGGAAAAGG
GAGACATAAAAACAGAATCTGAGAAAATTTAAAAAAAAAAAAATCAAATC
CTACTACAAAAGCATATATTCCACAAAACTGGAAAATTGGGATATAATAG
ACATTTTTCTA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 6 9 19 28 30 23 23 24 22 15 19 10 10 10 19 19 39 39 27 21 10 10 10 15 15 11 12 10 10 10 11 16 16 21 21 29 24 26 28 32 36 38 36 36 50 50
50 37 37 47 47 28 27 20 23 15 15 13 26 26 48 48 57 57 48 48 43 42 36 42 42 42 31 39 37 47 48 48 48 48 50 46 46 47 50 48 46 57 57 57 47 47 57 47 57 57
57 57 57 57 59 59 57 47 48 35 35 37 42 42 57 57 57 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 43 50 57 57 54 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 50 50 50 42 42 37
50 50 57 59 59 57 68 57 57 57 57 57 47 47 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 45 45 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 57 57
52 57 57 57 47 57 62 62 62 52 62 62 62 62 62 52 52 62 62 41 62 35 35 43 62 52 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 52
62 43 62 41 41 43 43 43 62 62 62 43 43 31 44 43 43 43 47 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 52 52 52 62 62 52 62 62 68 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 35 35 39 43 44 52 52 52 52 52 57 52 52 57 59 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 57 57 54 54 59 57 57 43 43 42 44 43 52 50 50 43 50 52 52 52 57 57 57 57 52 52 48 48 59
59 59 59 44 43 28 23 43 43 43 24 19 11 11 13 24 30 39 42 44 42 42 35 47 47 59 57 59 59 47 57 42 44 42 54 54 59 54 54 54 59 59 57 48 48 46 40 37 28 37
37 39 42 44 46 43 39 39 39 37 43 43 43 43 43 43 43 48 48 57 57 48 48 48 43 46 46 46 48 48 57 48 48 48 59 59 59 41 37 37 37 32 31 34 39 39 59 37 37 37
37 28 28 28 37 37 46 46 41 41 37 37 28 28 30 30 33 31 32 23 23 19 30 16 19 19 24 32 37 43 37 32 19 18 15 15 15 19 30 32 33 33 22 16 11 11 11 16 24 39
28 27 12 12 12 21 21 32 32 22 15 8 8 8 8 8 10 18 22 26 24 33 19 19 15 12 14 19 27 27 37 33 33 33 33 28 28 24 23 20 20 20 31 22 17 13 13 13 25 15
13 9 9 10 11 8 8 8 8 9 10 10 10 11 11 13 14 14 12 13 10 11 11 12 12 12 12 12 11 11 11 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 13 13 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 6 8 8 11 12 12 12 12 12 6 8 8 8 8
8 8 8 6 6 8 7 9 10 10 8 6 6 10 8 8 6 | Open.Hide. 7 10 6 6 8 15 19 17 10 11 10 23 23 19 11 17 18 27 25 37 33 33 28 26 26 19 22 12 6 6 6 6 6 8 10 8 15 15 21 15 25 23 36 21 21 9 9 11 21 21
39 37 37 34 23 15 9 9 9 10 19 9 12 12 16 14 20 24 26 30 17 14 14 23 27 44 44 48 48 57 57 47 48 37 37 34 34 36 31 31 42 42 41 41 41 42 42 43 43 43
43 47 48 48 46 39 42 39 47 57 57 47 48 48 57 48 48 47 41 36 48 41 38 42 37 37 35 37 37 42 37 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 51 50 50 50
50 50 50 50 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 50 50 50 50 52 57 57 52 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 52 52 57
57 59 59 59 59 52 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 52 57 52 52 50 43 43 52 44 46 43 57
57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 47 44 35 33 42 42 47 59 57 43 43 43 57 57 57 57 57 68 68 44 44 30 30 42 42 57 54 54 46 57 46 47 43 43 43 47 47 47 42 42
39 39 43 42 39 43 48 57 57 59 54 48 57 57 34 34 32 32 39 39 32 39 43 57 57 48 48 48 48 57 59 48 48 47 39 35 36 36 34 30 32 26 26 32 37 41 37 37 37 36
36 37 37 47 47 47 43 43 37 37 43 43 59 59 59 46 47 48 57 59 57 57 46 59 47 43 48 48 59 59 48 47 43 43 43 46 48 48 48 48 48 57 59 59 57 57 57 39 39 42
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 44 36 32 24 32 32 42 42 48 48 48 57 57 57 57 47 47 44 57 44 57 50 50 50 57 57 57 43 43 50 50 50 57 57 57 57 54 50
50 57 59 68 59 57 48 48 48 57 42 42 35 35 35 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 42 35 35 35 59 42 42 37 28 28 37 37 41 41 31 29 24 24 20 26 37 46 46 42 48
48 39 42 30 39 42 59 41 59 48 48 48 59 43 39 31 27 19 15 15 21 25 32 39 41 48 46 46 46 43 39 39 27 22 21 29 34 27 21 16 14 12 18 21 39 39 39 39 27 25
25 27 37 37 37 30 27 13 13 21 22 31 32 24 24 24 25 25 36 43 29 29 22 22 37 37 57 57 48 48 37 37 37 37 26 26 14 14 14 25 19 32 37 39 39 41 41 39 34 26
24 28 24 31 20 23 23 28 32 30 22 25 25 25 24 20 19 21 15 16 16 22 20 24 18 23 24 22 22 22 25 25 24 24 25 37 41 47 47 47 34 34 20 20 20 20 15 23 18 15
17 18 28 27 21 22 14 19 19 29 17 18 10 10 10 25 25 30 28 19 14 14 14 14 15 15 11 10 10 10 11 13 37 27 28 29 20 17 17 18 20 32 32 28 36 39 32 32 32 28
15 18 18 20 32 23 30 15 13 12 12 |
|---|
