BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-186A05.T7 (MSMg01no186_a05.b1) | MSMg01-186A05.TJ (MSMg01no186_a05.g1) |
ACC | AG377830 | AG377831 |
length | 797 | 766 |
length of high quality (start - end) | 200 (46 - 245) | 253 (76 - 328) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no186_a05.b1 PHD_FILE: MSMg01no186_a05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:00:52 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no186_a05.g1 PHD_FILE: MSMg01no186_a05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:00:52 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCATCTCCCCTTAGGGGCTGCAATCTTTATTCCAACTCTTCTATAAG
AGTTCTCCAGCTCCATCCACTGTTTGGCTGTGGATGTCTTTGTCCATCTG
AGTCAGCTGCTAGTTGGAGCCTGTCAGAGGACAGCGATGCTATACACCTG
TCTTCAAGCATAACAAAGTATCATTAATAGTGTCAGGGATTGGTNNGAAT
ACNNCCATGGGNTANNTGGGGTCCTCAAGGTTGGTTGGCCATTACCTTAG
TTTCTGCACAATTCCCTGTCTTTGAATTTTTTGTAGACATGATAAATTTT
GGGTTAAAAGTTTTGTGGNTACGGTGGTTGTTTTTTATTGGCCCCCCCCC
ACCACGTTCCTGGCCTTGGGATTTCCAGGGAAGGTGGGTTCCTTGGGTCC
CCAGGCCCCTTAATCCCAAAAAGATGTGGAACTTATCAGTTTAAAGGATT
CCCCCCCATATTTTCACTTCTCATTGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNTTGCGTTCGAGAGGGNTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTCTA
GAGTTTCTAGTGCCTCTCCTTCCCTNNNCAGGAGGGGGTGCTAAATATAT
GCTTTTTCNTCGGTAGTGGGGTGGAAGCATGCTCCTATTGGCTATTTTTT
CACCAACATCNCGCTCTACTCAAATAACCCCCTACCTCCCACTCCCGNNC
CGTTGATAACATTTTATNCTCTAATATCTCAATAGTTTATCGCTTTC
| TCGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTGTTTATCTTTATAACCAAGGAT
ATAGAATCTTATGTGGAGACCCAGAATCCTCAGTAAGAGAGAGATAAAGA
GCATACTCCTGCAAACTGTGAAAACCTTGTATCCTGCCGTTCCTTCATTA
CTCAATTCATGCTCTCTTCTTAATTATTGCCACACCCATACATGCAAACA
CATACATACACACACCCTGCTGACTCCATTTAGTATTGTGCGTATCTGTG
TAAAGTTAACCACTTGGAACTGCATGAACTATCAGGAAATGTCCGTGGAG
AAGATTGACTACCTTTCATAATGGGCATTTATTAACTTCAGATATTCGTC
TAAGGGTGGGGCCTTGTGATATGTCTCCCATATAATTTGGGCTTCCAACC
GATGTCATCATTGCCCAGGTCTTGTTTCAGCAACCATAGTGTCATTTCAT
GGGTACAAGTTCTTGTCACATATATAAGACCCTTTGTAGACGTGCTTAGC
CTCTGGCTTTTTGAATGTTTCTCTGCATCCAGAGATGAACCCTAGGTGTA
GAAGTTGTGTTGTAGATGTATTTACTAGGATTGTTTCACCTCTCTCAATA
GTTCGCTACTTGTAATCCAGGGGTATTTTTCTTTTTTTACCTTAGTATTG
TTGTCCTATGTACACTTTTTTTAACTGTTCCCCACCATCTTTTAGTTATT
CACCCGTATACTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 12 12 11 16 19 37 37 30 30 28 24 24 30 30 30 30 33 33 37 37 37 59 35 32 36 36 36 36 43 53 53 53 50 57 57 57 59 42 42 28 36 36 42 41 57 57 47
47 47 47 68 50 50 50 51 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 50 50 50 50 51 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 50 51 50 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 53 53 53 53 50 57 57 57 57 57 50 50 50 50 53 53 50 50 33 33 33 33 33 23 27 3 0 0 3 14 15 23
21 3 0 0 3 14 14 9 7 7 3 0 3 3 0 0 3 10 14 15 14 19 9 10 11 19 18 11 15 13 13 19 44 44 44 37 32 31 31 31 37 59 59 59 47 50 59 59 48 48
48 59 59 59 59 47 41 37 37 31 31 31 31 44 59 47 41 39 39 39 39 41 44 22 18 17 15 15 19 37 37 37 39 39 26 30 17 24 24 34 34 28 31 31 39 35 32 32 12 12
12 12 11 11 17 18 16 21 16 16 14 16 17 14 9 8 8 3 0 3 8 15 9 11 10 10 10 6 6 6 6 8 15 15 17 10 9 9 9 9 10 12 12 13 14 12 13 8 6 6
6 6 8 6 8 10 8 10 8 8 8 8 9 11 9 11 12 12 12 11 11 12 13 10 8 8 8 8 9 9 10 10 10 10 11 8 8 8 11 11 10 10 10 12 11 9 8 9 12 9
6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 14 15 12 8 10 9 8 11 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 15 15 10 10 10 9 9 9
9 9 9 11 10 10 8 8 8 10 10 14 12 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 3 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 6 6 3 0 3 8 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 8 6 6 6 8
6 6 7 7 8 12 10 8 8 10 8 8 8 8 9 9 8 8 9 9 9 8 8 8 3 0 0 0 3 8 7 7 8 8 8 10 9 9 9 9 9 10 9 10 12 8 8 8 8 7
9 11 8 8 8 21 21 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 7 8 8 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 11 11 9 10
10 8 8 6 6 8 8 9 10 3 0 3 6 6 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 9 9 9 12 13 10 10 9 9 11 15 21 10 8 3 0 0 3
8 8 6 6 6 8 8 8 6 7 10 8 10 8 11 10 3 0 3 9 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 9 12 12 12 11 11 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 6 6 8 19 23 37 30 30 35 39 43 48 36 38 57 57 53 53 50 50 50 50 47 41 28 21 11 9 9 6 6 7 6 11 6 8 8 9 9 9 15 23 25 12
12 11 26 26 34 32 23 41 41 47 29 19 19 9 9 9 9 9 9 9 9 12 14 20 21 22 23 29 43 43 48 53 53 53 53 53 53 57 57 57 57 50 50 50 50 47 47 47 47 47
47 51 68 68 53 53 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 54 48 48 42 39 35 24 24 17 17 11 11 12 12 27 34 57 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 59 68 68
68 68 68 68 50 50 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 48 48 48 48 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 53 53 53 50 50 50 59 59 31 25 15 11 11 11 12 11 11 9 11 15 23 30 41 47 50 50 59 59 59 59 57 57 57 57
57 53 53 47 50 50 53 57 57 57 57 57 68 59 43 39 25 24 14 14 14 12 12 15 21 22 30 30 30 30 32 31 31 30 32 37 47 47 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 57 57
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 44 44 48 48 48 59 59 59 59 59 59 42 42 28 27 27 23 23 18 20 15 15 18 24 36 44 57 57 57 46 43 43
47 43 43 39 43 43 43 43 48 59 59 59 59 57 57 57 68 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 50 50 47 50 47 47 47 43 40 59 59 59 59 59 59 47 47 44 44 39
37 41 39 37 37 37 37 37 37 41 39 43 39 41 39 48 48 48 57 57 57 57 57 48 43 43 37 43 28 28 25 31 37 43 57 57 57 48 48 43 43 43 41 41 47 39 41 41 41 31
31 39 37 37 32 32 35 35 37 37 46 47 37 43 37 37 30 30 30 37 37 48 57 43 43 36 36 39 37 39 35 35 35 39 39 41 37 37 30 25 25 30 32 23 11 10 13 12 17 15
14 12 16 19 19 26 17 21 13 8 8 12 10 8 8 10 14 11 13 8 6 8 6 6 8 10 12 12 10 10 8 8 7 7 10 6 8 8 8 12 11 11 8 8 7 8 8 8 6 6
8 10 10 8 9 8 8 6 6 8 8 15 10 8 8 8 8 8 10 10 10 11 11 11 11 11 21 19 20 12 12 9 15 11 12 13 10 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 9 8 10 8 8 8 8 10 17 13 15 8 8 6 6 8 6 9 9 12 12 8 10 10 8 8 8 10 10 10 17 15 8 6 6 6 8 8 9 8
8 10 10 8 6 8 8 10 10 8 8 8 8 10 10 8 |