| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-234F06.T7 (MSMg01no234_f06.b1) | MSMg01-234F06.TJ (MSMg01no234_f06.g1) |
|---|
| ACC | AG400256 | AG400257 |
|---|
| length | 1,623 | 753 |
|---|
length of high quality
(start - end) | --- | 296 (77 - 372) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no234_f06.b1 PHD_FILE: MSMg01no234_f06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:51:17 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no234_f06.g1 PHD_FILE: MSMg01no234_f06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:51:17 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | TTTTTTTTTTTTTNNAATTTNNTTTTTTTNNNNTAGCGTACAANAATTTA
ATCGGACTAAGGATCCATCGTGAGATCAGAAGAAAAGTATGCGGGGGCGG
CGTAGAATGCTGATCTGCACACTATAAGTTTTTCTGTAGTTATTCCTGTC
GCTGTAATCTGCCGCGGTCGTCATCAGAGGTATTTCTTTCCATTATCTTC
TAATTATGTCCTCACATCTAATTAACATCAAGACACACGGCGGAAGGTAT
GATATTGTGATGTAGGGCGCCGACTCTTGGAGGATAGAGCAATCGCACAC
TCAGCACTCGATGACAACGAAAACGAAAGAGAACCAACGTAGGACATACG
GACAGGGGCACGATGGACGCTACAGATGTCTGTTTACTTGTGTATAACTC
GAACAAGGACAGAACCACGTGATAATAGTTTAGTGAATGTATACCAGGTA
GAAGAGATATATATTGACATGAAAAGAAACCAACCTACGTGCTACGCAAA
TCAGCCAATCCAGCCGCGCCTGAGCTTCGATAGAGACGCAGCCGCACGAC
GCAGCGAGCGGCTTTTGCCGGACAAACATAGGAAGCATCAGTCTGTANAT
AACGAGGATGCAGAGGCTAGGAGTAGTCTCCGTATCAGTCTAATACGCAA
CTACATATCATCGACGCCCGTATAGCTCTACCTGTTGTTTCACTTCCTCA
ACAAGCCTGGCAAGTGCTGACGAAGTATCTAAGTGAAGTAGGATCTCATC
AAACTACAGTTGTACAGGCGACATCCCATCGATCAAAGCAACGATTTTAG
TACTACGATAGTAAACTCAGAAATGAAGAAATAAGAGCGTGGTAGTCATC
AGACCGGAAGTGGGTATGTGCAGATTGTCCTGTTCAACCGTTGTCTGACT
AACATCGTCATAAAATATACGGTAGCACATATCGCAGATGTAAACTATGC
TGTACGTTATGGACGATTGCACGCGTGGATGTGAAAATATATCTAATGAT
GTGTACGTATGATGATGAGTCAATAGTGACACTTTAATGGTCTACCCTGC
GCCGGAGGCCAATATACGATTCGTCTCATCCTCGTCGTATCACGTCAGCA
CTGCATACACATCAGAGAGCGAAGCACACCGCGCTAACTACACTGTGTAT
ACGTCTCACGACCTCACTACGCGAGCGATACGCGCTACCGAAATGAGACG
AGTATGATAGGCGTGTATGATAAGTGCGTTATATATATGAGCGAGTGTAT
TAGTCAGAGCATCATACTCGATTCAAGACATCAAGAAGATATGATGTCAC
TCGCCCGACTCATCTCGGTTAGATACTANACCACTGAGAGTCAGATATCA
CNTAGCGACACCGTATACCGTGTATGATGTGGCGATGATGGATATATNTG
ACGGATNAAATAGGANCTATGCTGATGGTGACAGGTGATGACAAGTATGG
TATCGTGCAGCGGTTCACGATGTGTAGATGGGGATCCGAGGCTGTGGCGA
CTAACTATCTGACTGNTNCNGCTTCAATACTCGGNACATGTCGATAGAGT
GATTACTGCTAGAAGGTGTGAGAGAGACAGAGACAGTACATTAGCGTGTC
AGACGCCGCGAGGTACCGCGTGC
| CCATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCAGTGTACAAACTTCATGCCATG
TCCAAAATTCATTCCATGAATTTGGGCTTCCAATCCTCACCCACTGGGAG
CTCAGCATCAGATAGAGGGAAATCTTTCAGCATAATGGTTTCCCCCAAAG
ATAAAGGAGAACAGAAGAGGAATGCATGTGAAACAACCCACCCAGGGAAA
CTGCTATTTTTTCCATCACACTGAAGAACAAAGGGTTGGTCACATGCAAT
GATGTTAAGTAGCTGTGTAGCATGCTGAGGAAACTTTCCTAGGGACTGTC
TCAGACCATGAAGGCAGATTATAGGAGTTCACCCCACGTATCATATTCTG
ATAAGGAAACCTTCCATGCTTGCTGGAAGCAGCAAAATCAGGGTGAGCTC
ACCTGGTTGCTGTTAGAAGCATGTTTGTAGAAGGGAGCAACAAAGAATGA
CACCACAGCTCTTATTTCTCTGAATCAGATATTTTAGCCACACGAGGTAG
CATCCTCAGGTATAACAGCACACTTTTTAAAACGGAGGTTTTTTGTTTTT
TGGTTTGTTTTTGTTTTTAACAACTAACAGTGATCTCTGTAAGATGGGAA
ATTATGAAGTAAGCCTCACGTATTAGTGGAATTACTGCTTACATGTCAGG
NTATGGCTTAAGGAGGAGGGCCTTAGTGGATGGACTCCATTTATTGTAGA
GCA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 9 24 24 9 9 9 7 7 3 0 0 3 7 7 17 3 0 0 3 17 8 8 10 17 3 0 0 0 0 3 8 8 8 8 10 9 9 9 3 0 3 7 7 12 9 9
8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 12 8 6 6 6 6 11 10 9 7 9 6 6 6 8 8
8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 8 10 9 8 8 8 9 9 9 6 7 7 7 6 7 8 8 8 8 11 10 8 7 7 10 7 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 13 17 22 8 7 6 10 8 10 10 11 11 11 11 10 9 9 9 9
9 9 9 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 10 15 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 6 6 8 8 8 8
8 8 10 10 9 10 10 10 13 15 14 15 15 10 8 8 8 8 8 10 9 11 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 10 13 10 8 12 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 7 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 8 8 8 6 6 6 6 8 6 9 10 16 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6
8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 12 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 10 10 11 11 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6
7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 10 10 8 7 6 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 10 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 10 11 12 11 9
8 8 6 6 6 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 10 6 8 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 10 6
6 6 6 8 8 8 9 9 9 9 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 10 6 8 6 6 8 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 12 15 10 10 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 12 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 13 12 12 8 6 6 6 8 6 6 6 6 7 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 8 8 6 6 6 6 11 12
12 11 11 11 9 7 7 8 8 8 8 11 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 9 8 8 6 6 6 12 10 10 10 8 8 8 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 6 7 8 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 9 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 13 9 9 8 8 9 9 7 10 8 8 8 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10 10 8 8 6 6 8 8 6 7 7 6 6 8 6 6 8 8 8 6 8
6 6 6 8 11 8 11 10 13 6 6 8 8 9 9 12 9 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 6 6 6 6 8 8 10 11 10 8 9 8 8 8 8
8 8 8 8 7 7 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 17 16 15 12 11 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 10 15 11 11 6 8 8 6 6 8 8 10 10 6 10 6 6 8 6 7 10 10
7 6 8 6 6 8 8 12 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 8 8 10 6 6 8 8 12 12 10 10 7 6 6 6 8 8 12 8 8 8 10
10 8 10 10 11 12 9 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 10 9 9 8 8 7 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 6 6 6 6 8 8 9 10 10 13 11 10 8 8 11 11 8 8 6 6 8 6 10 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 9 8 8 8
8 8 8 9 9 10 9 16 19 12 9 9 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 8 8 7 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 7 9 9 11 10 8 8 8 8 8 8 10 13 11 11 9 9 8 8 8 6 7 7 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 8 8 6 6 6 6 6
8 6 8 8 10 8 10 11 8 8 7 6 9 6 10 8 8 8 12 10 9 12 13 13 17 10 10 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 11 10
8 8 8 8 8 12 7 7 6 8 7 6 10 8 8 8 9 10 9 10 10 9 9 9 8 6 6 6 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 9 13 10 11 8 8 10 7 6 6
6 8 6 8 8 8 6 6 8 8 8 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 7 8 10 9 3 0 3 6 6 6 7 6 8 6 6 6 8 10 11 11 16 15 15 13 18 11 11
3 0 3 6 8 8 7 9 11 7 8 8 8 8 8 6 6 8 9 6 6 8 10 10 10 8 8 8 11 13 12 8 7 6 6 6 6 8 7 8 8 7 7 7 7 9 3 0 3 6
6 6 11 11 8 3 0 3 8 7 7 8 15 10 3 0 3 9 10 12 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 11 10 8 8 8 8 6 8 8 9 9 10 8 10 6 6 12 8 10 10
10 10 10 10 11 10 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 6 7 7 6 8 8 7 7 7 8 10 6 6 8 6 8 8 8 8 8 10 10 10 13 11 11 11 11 11 12 6 6 6
6 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 9 10 8 3 0 3 0 3 0 3 6 6 13 8 9 9 10 10 8 9 9 9 3 0 3 11 11 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 9 9 9 11 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 6 6 6 7 6 8 9 9 17 22 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 13 8 8
6 6 6 6 8 7 9 8 7 8 8 18 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 15 13 8 8 8 8 19 25 41 37 39 41 37 37 44 39 39 47 47 50 50 50 50 50 50 57 53 57 57 57 57 48 57 48 43 37 33 36 36 37 42 48 48 48 48 48 48
54 54 54 53 53 68 68 68 68 68 68 48 48 41 41 43 43 59 57 57 46 46 46 46 50 50 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50
50 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 57 44 44 27 38 43 43 43 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 62 62 62 68 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 57 57 57
57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 48 54 54 54 54 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59
59 59 57 57 57 57 57 50 50 50 57 57 44 47 30 24 12 12 12 9 9 9 10 10 12 24 12 11 8 8 6 6 8 10 8 9 9 10 11 12 28 30 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 43 39 39 39 43 46 48 59 59 59 59 57 57 57
57 57 48 57 46 57 57 57 59 59 59 59 59 59 35 35 35 47 47 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 54 59 59 59 59 50 50 50 50 50 50
59 59 48 48 48 59 59 59 47 40 47 47 59 59 59 59 59 47 47 59 59 44 41 41 41 43 47 41 41 41 41 48 48 59 59 57 57 57 57 57 57 48 57 57 59 57 57 50 48 48
48 48 48 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 59 48 48 47 47 47 59 59 59 41 37 37 43 39 39 41 41 39 39 41 37 37 44 59 59 59 46 46 46 59 59 59
35 26 21 21 21 29 37 41 41 43 34 34 25 20 20 34 34 41 37 37 41 37 37 43 41 29 29 32 37 36 33 35 39 37 48 48 47 43 40 40 40 34 34 24 28 22 30 30 30 32
29 31 31 32 41 39 31 35 39 39 36 36 39 31 31 35 31 30 37 37 37 37 34 34 28 34 33 32 22 19 17 19 22 23 39 40 40 37 37 37 37 37 33 37 31 31 32 21 15 3
0 3 16 17 27 30 34 28 34 26 31 31 31 32 24 18 23 18 25 18 10 10 13 19 13 8 8 8 11 12 22 16 20 23 22 22 20 27 30 30 20 28 25 18 14 11 11 11 10 10
10 10 10 |
|---|
