| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-305N17.T7 (MSMg01no305_n17.b1) | MSMg01-305N17.TJ (MSMg01no305_n17.g1) |
|---|
| ACC | AG430689 | AG430690 |
|---|
| length | 1,314 | 1,313 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 418 (44 - 461) | 378 (73 - 450) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_n17.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_n17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:19 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_n17.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_n17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:19 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NNNCCCAGCAATGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCAAGCATACTCACATACACACACACACACACACACACACACACACACA
CACACACACACAGACACACACACACAGACACACACACTCACACACACACT
CACACACGCACACTCACACACACAGACACACACACAGACACACAGACACA
GACACAGACACACAGACACAGACACAGACACACACACAGACACAGACACA
GACACACACACACACACACACACACACACACACTTTGGCTGGGCCGGACC
ACCTGTCTCAACAATTCCACAAGTGTTCATGCATACGTATGTACATACAC
ATATACCTACACACATATGTATGCACATACATATAGACAAACAGACATAC
GCATATATATTTTGGTAGATGGGGCTGAGCCTCAAATGTCACTCTTTATT
TTTTCTCTCATTTTTTTTTACCCCCCCCTCAGACAAAAGTTCTCCATGAA
AAAAAAAGAGGGATGAAATGTTACACAAAGGGGGATTTATAGAAGGATGT
TGATATTACCTTCGAAGCAGAGTTTCTATTCTACAAGCTCATTATAAGTT
CACAGCAACAGTTTGATATGGCCTTGCTTTATCCTAGTGCACACCAATGG
CTTGCTTTATCCTAGTGCACACCAATGGCTTCATCTTTGGAGTGACCTAT
AATGAATCTTTTTTCTTGATTACAAATTTGTTTCAAGTCTTCAAGTTTCT
TATCCCAGGGCAGTTAGCCTGTGATGTGTCAAGGTTTACGGAGCTCTATT
TGCAGCTTTATTCTATAGGGAGCTTGGGATTACGTATATCAATTTAAGTG
TTCTATAAAATCATTATCAGGAATTGTGAAATCATCAATTCACCTATACA
GCATTATTACATGAGAGTACAACTTTATGGTACTCTACAAAACATCTGCT
CAAAAGGGTGGGCGAATGTCCAGGAGGTTAGGTAAAGTGACAGGAAAGGA
AAATCAGCAACACAATCCTAAGAAGAAGTCTCCGGTGACCCTGGATCTCC
GAAACTACCCATCAAGGGCCAAGCAAAATGGGGGGGCCTATTGCAGGCAA
CCCATTGGAGGGCCTAACCTTTCCAAAGGGCTTTTGAAAACGGAAANCCC
CCCCAATTCCTAACCCTAGGGGGGCTTTGGGGAAAGGGTCCAAAAAAAAT
TCCTACCCAAAAAGGGTTTCTGGGGAGAGGGGAGAAAAAAACCCCCCCCC
CACGGGGCCAAGGATAAATTTGTACATAAAAACCAAAAGAGGGTTCAAAT
TAGAACTCATGGGG
| NNTTCCCTTGAGGCGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTCTAAGTTGTTGATTTGGTTATAAA
TAAGAGAAACTTCTATCAGAAAGATCTATTGAAATGTTTCAGTCAATAAG
TGATCATCTAAATTGGATGTTCCTGTCTCAGTTCCCAATTACTTGGACCT
ACGACTTTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTAGTTTTTCAAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGG
AACTCACTTTGTAAACCAGGCTGGACTCAAACTCAAAAATCCTCCTGCCT
CTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCAAGCGCCACCACTGCCCGGTTA
TTTTTCGACTTTAAACACATCTTGGTTCTCTTCAAATTCCCTTTTCTTAT
TGTTATATTCCCCCCCCCCCANNNNAAGGNNACCTTTAACAAAAAAAAGG
GGGCNNNNNGGCNNANAAGNGGGGAAGGCAACCCAAGCCCACGGGGGAAA
CACANNCCAAACAGCCAAGCNAACACAGGCNAACAGGGGGNNCCACCCGG
GNGGAAGCCCCCCCAAGNCGNGAACCGGGCCGGGCNNNNNNNCAGNCNCN
NNNCAGNNAGAACAGAAGAACAANNNACNNGGAAAAGAACAAANNAAGAA
CCNCAACAAGCCGGCCGGGGNCNAAGGACAACCAGCCCCCNNCCGNNANN
NCGGGGGNNGGGGAAACAAACAGGGCNNNCCCCCGCCCGAAACAAANNCN
NAAACCCCNCCCCCCNNCCCCCCCCCCCCACGGCCCCCGCAGGAAAAAGG
AAAGACAGGGNAAGGGGGGAAGGGGGGGCCAAGCAACAAAGGAACACAGC
CACCAAGGGGCCCAGGAAACGAAAACCAAAGCCAAGCCCAAGGGCCCGGG
AAAACCACCCAAAAAAAAACAAAAAANNAAAAACCACCGGAAAAAACCAG
AGGCAAAAACCGGNGNNNAACCAACCGGAAACCCCCGGAGGGGCCAACCC
AAAAAAGAAAAAAAGAAGAGAAACCCCCCCAAAAAAAACAAAAGGAAAGA
AGGGGGGGGCCCCCAACCCCCCAAAAAAAAAAAAGGGGAACGGGGCGCAG
CACCCCAACNAAGCCCGCGGCCAAAAGAAGGGGACCAAGNCCAAAAAAAA
CAACAACCCNNGNNCCCCCCCAGGAAAGAANNANAACNCGCNCCCAAGAA
ACAAACACAAACCCAAAGGCGACCCGAGAGGAAAACCCCCGCGAAAGCCG
CCGCACCCCACAA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 8 6 8 8 8 10 8 13 15 14 10 9 9 10 10 12 9 9 9 8 8 10 10 14 23 29 30 28 28 28 28 30 30 33 37 37 37 37 33 32 32 32 32
23 37 37 30 33 33 37 41 33 36 36 38 38 42 42 42 43 43 43 53 57 57 57 53 53 50 50 50 54 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 59 59 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 54 57 57 59 59 59
57 57 57 57 57 57 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 50 57 57 57 59 59 59 57 57 48 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 59 59 54 48 48 59 48 48 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 59 59 59 34 30 21 13 13 13 18 23 24 20 32 32 40 48 48 48 48 59 57 48 48 48 48 48 50 57 59 59 59 48 46 47 46 46 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 31 24 18 13 17 15 24 29 29 25 17 10 8 8 10 10 14 17 15 15 9 9 9 12 12 26 33 59 59 59 59 48 37 37 37 34 37 28 28 28 33 27 22
17 13 13 13 11 12 10 12 12 12 14 17 11 11 12 27 30 46 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 53 50 50 57 59 68 68 59 57 54 54 54 48 48 57 50
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 57 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 54 54 59 59 59 68 68 59 59 48 48 47 48 48
37 37 43 59 59 59 59 59 68 59 68 59 59 59 59 54 54 59 59 59 68 59 59 54 54 48 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 68 54 54 54 42 42 42 42 47 48 48 48
48 48 48 48 59 59 48 48 57 59 59 59 59 48 48 48 39 41 36 36 32 37 30 28 31 43 59 59 59 35 31 31 40 40 37 36 40 37 36 39 39 41 39 44 44 34 36 37 37 41
41 46 46 43 39 39 35 29 29 32 37 33 30 25 34 37 37 36 32 43 31 28 28 31 31 25 31 32 37 32 27 27 29 29 30 36 32 35 35 19 27 13 13 14 28 28 41 46 46 43
43 43 43 39 47 47 59 43 43 48 41 41 41 41 41 41 41 31 29 32 37 36 32 17 15 15 18 19 11 14 15 25 24 37 37 36 32 32 35 32 32 39 39 39 39 30 30 21 17 11
11 11 11 9 11 15 9 9 9 19 15 23 23 30 32 19 20 20 23 22 24 29 27 24 17 11 11 8 8 8 10 12 16 20 16 19 13 13 11 13 22 16 12 12 13 13 24 25 37 26
26 13 13 17 21 27 41 34 32 25 15 10 15 10 15 10 10 11 16 22 19 26 29 32 34 19 14 9 9 9 9 12 15 17 28 33 21 21 22 28 31 28 28 28 32 31 30 37 17 17
11 9 9 9 9 8 15 7 9 9 17 17 35 30 28 13 11 10 10 10 10 12 10 13 10 12 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 21 15 19 14 19 21 19 19 10 9 9
9 13 15 18 19 12 11 11 11 8 8 10 10 8 8 8 9 9 10 10 11 9 8 9 11 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 9 10 9 9 9 9 9 9 10 9 9 10 8 8
8 8 10 8 8 8 8 10 21 12 14 14 14 15 13 11 11 9 9 9 8 8 8 10 10 16 16 9 11 11 19 16 31 16 13 12 7 6 6 6 6 8 10 11 9 9 8 8 8 8
8 10 10 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 15 8 9 8 9 9 9 10 12 13 13 13 10 12 11 11 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 6 3 0 3 8 8
19 15 22 16 14 10 10 10 10 12 10 14 15 15 19 12 17 17 22 19 15 13 12 9 9 6 6 6 6 7 8 9 8 8 8 10 9 9 10 10 10 9 10 11 11 19 26 15 10 10
10 9 6 6 6 6 8 8 8 10 9 9 8 8 8 6 8 8 6 10 10 11 11 7 13 7 9 10 9 14 9 9 9 9 13 19 21 21 14 9 10 9 10 8 8 8 8 8 8 10
6 6 6 6 7 7 7 7 10 8 6 6 6 8 10 7 6 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 7 10 6 6 8 10 10 7 8 8 10 15 23 9 6
6 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 6 | Open.Hide. 0 0 3 3 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 11 8 6 9 8 15 11 19 19 19 8 9 10 21 21 29 30 28 28 38 34 36 36 42 42
37 37 37 42 43 43 44 43 48 50 54 54 68 68 68 43 34 19 24 19 36 36 34 34 36 36 41 30 30 32 42 50 50 50 50 46 50 57 57 44 36 24 15 14 15 24 36 37 47 47
36 36 24 36 44 57 57 32 32 32 32 32 37 35 42 21 42 42 57 57 59 59 59 57 50 51 51 51 50 57 57 57 59 57 57 57 48 48 42 42 42 42 50 57 68 68 68 54 54 54
57 57 57 57 57 54 42 47 47 47 47 50 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 47 36 36 33 33 33 33 31 31 17 16 10 11 11 13 23 32 41 42 42 39 39 35 35 35 39 39 43
48 48 48 59 59 53 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 57 42 36 32 32 32 44 44 47 57 42 44 29 29 29 33 32 43 44 57 44 43 43 43 43 43 43 33 35 24 38 32 43 43 44 44 50 43 43 29 31 35 43 43 43 43 33 35
35 44 43 43 43 44 44 48 57 57 43 43 23 23 23 44 44 43 42 42 42 42 42 43 31 32 19 17 17 20 24 41 32 44 27 27 23 44 44 57 57 48 48 48 47 47 47 47 47 48
48 48 48 57 48 48 46 59 59 47 42 35 35 35 39 37 39 35 35 35 42 42 48 57 47 57 48 48 43 43 43 43 43 43 43 48 48 43 43 40 40 40 46 43 47 30 18 8 6 8
8 9 8 12 11 9 12 15 32 32 41 47 47 59 48 48 48 43 47 39 43 43 43 37 59 34 34 32 32 43 40 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 26 17 13
8 8 8 8 8 6 6 7 12 12 15 21 25 23 19 23 32 17 15 9 3 0 0 0 0 3 23 18 3 0 0 3 9 12 12 15 15 12 9 9 9 17 18 31 29 22 17 12 12 12
12 12 11 3 0 0 0 0 0 3 29 3 0 0 3 0 3 27 3 0 3 9 8 7 7 6 6 6 18 23 47 47 59 59 27 27 9 9 9 22 22 9 9 9 9 9 9 24 27 41
41 23 23 3 0 0 3 9 23 27 47 47 46 59 59 59 59 27 23 3 0 3 23 23 23 25 9 9 9 3 0 3 8 15 6 9 9 12 12 3 0 0 3 9 9 9 9 27 27 23
3 0 3 9 9 9 9 9 9 27 6 6 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 23 25 25 23 11 11 9 27 6 6 6 7 3 0 0 0 0 0 0 0 3 23 3 0 3 0 3 0
0 0 0 3 23 3 0 0 3 15 15 25 26 16 15 15 8 6 6 9 7 10 3 0 0 0 3 3 0 0 3 9 17 23 43 36 36 36 47 47 27 23 3 0 0 3 12 12 7 7
7 3 0 3 22 25 39 41 39 25 23 9 9 9 23 9 9 9 23 3 0 3 0 3 9 11 11 12 15 9 9 9 20 18 13 9 8 7 7 3 0 0 3 20 3 0 0 3 0 0
0 3 9 9 18 29 3 0 0 3 23 16 12 7 9 7 9 9 11 11 11 10 9 9 9 3 0 0 0 3 6 7 7 9 8 8 9 9 12 9 18 16 20 12 19 3 0 0 3 0
0 3 8 8 8 8 8 3 0 3 9 17 18 13 3 0 0 3 17 12 12 13 33 30 39 39 37 25 11 10 8 8 8 10 12 11 9 9 10 10 9 9 9 12 9 9 9 9 9 9
19 19 10 11 11 12 12 12 13 3 0 3 9 9 8 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 17 22 10 9 9 8 8 8 8 17 10 10 9 9 9 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8
10 8 9 8 8 7 7 8 8 9 12 10 9 9 11 15 9 7 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 11 9 9 9 10 10 10 10 14 10 10 9 9 9 7 8 8 8 8
8 22 12 17 10 16 10 9 8 8 8 8 6 6 6 8 11 9 9 11 9 17 17 9 9 3 0 0 3 14 18 17 12 8 8 8 8 8 8 10 15 6 8 8 8 9 9 10 9 9
7 8 10 9 9 8 13 9 9 9 9 10 3 0 3 0 0 0 3 7 7 6 10 7 7 7 8 8 7 10 10 15 11 10 10 9 9 9 9 9 7 9 9 13 13 10 8 8 9 12
12 10 10 10 8 8 9 9 9 11 11 8 8 7 7 6 8 10 8 8 8 9 7 7 6 6 6 6 8 8 11 11 11 25 23 18 12 10 6 9 8 8 6 8 8 8 9 13 9 9
9 9 11 10 14 19 24 25 8 8 8 8 8 8 12 10 9 10 8 9 9 9 10 10 11 11 8 8 8 8 8 6 12 14 15 9 8 6 6 7 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8
8 8 8 8 11 11 9 11 3 0 3 9 10 10 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 15 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 9 10 3 0 3 10 11 12 17 9 9 11 11 8
6 6 8 8 6 6 6 7 3 0 0 3 0 0 3 6 6 6 7 7 10 9 9 9 11 13 10 8 8 3 0 0 3 0 3 9 3 0 3 9 3 0 3 17 19 8 9 8 8 7
6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 7 9 9 9 9
9 9 9 11 8 8 6 6 8 8 9 9 9 |
|---|
