BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-308I01.T7 (MSMg01no308_i01.b1) | MSMg01-308I01.TJ (MSMg01no308_i01.g1) |
ACC | AG432566 | AG432567 |
length | 711 | 711 |
length of high quality (start - end) | 377 (46 - 422) | 343 (77 - 419) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no308_i01.b1 PHD_FILE: MSMg01no308_i01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:49:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no308_i01.g1 PHD_FILE: MSMg01no308_i01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:49:50 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (22,173,390 - 22,173,762) | (22,016,935 - 22,017,277) |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTTTGGAATACCCCATTATTAATGCTCAGCAAGAACTTGAATATAA
AAAATTGATTCCTAACTGCCTTAGATATATCTATCCTGATAGTTTGCCAC
ATGTGACCCAAAGCATAGTGTTCATATGTGTGATGAGAAAATTCAGGGTT
CACTGATGACCAAATCTTCTCATTAGGGACATTTTTTATGTGGGGTCCAC
TTTAAGGTTTTAGTGGTAAACAGTGTGGTAGCACACTCTGCTTCCTCCCA
GCAAGCATGATGTCATTCCTTTTTAGAAACTGAGTAAGTTCACAAATACC
TATGTAAGGCAATCCAAGAAGAGATATGTTATATGAAAGGTATACTTGGT
GTTACTGATCCAGACATTCTCCCCGCCCAGAAGAATTGATCACAATTATA
GATCATCTTTAGATCTATAATTGTTTAGGGAGAAAACCATATAATATCTA
CTGTAGTGTTGACCAAGCAAGTAAAAGAATTAAATGTACTAGCAACTAGT
AAGAGAGTCAGACACTCTACTCCACTCTGCATTCTTGACAGCCCAGTCTT
TCCCCATGCCAAAGCTTCTCTCCTGTGTTTTTAACATTTATTTATTTATT
GTTGTCGCCTGCTTGATCGTCTTTTCCCCCACCCCCACCTCTTTTTCTTC
CTTACACTCTC
| CCGATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGGAAGCCAGGATTTCAACTCCCT
CCCACCCCCTGTCCTTGCAGCTATGCCCATTGCTGTGAGGTCAGCTGGGA
TGAAAAACTATCCTATATAGAAATATGGGAGGGGTATGGCCCCTAAAACA
AGCACAGATGGGCAGCCCAGCAGAGCTATGGGCTGTGTTGGACCCGGCAA
CTAGTTCTGTTAATATTATTATTTAAGTATCTTTTTTAAAAAAATTGAAT
CCTTCATTCTTTCTTTTACTGTGATGTCTACCATTATTTGAAAGGTTCCA
CGTGGACTTACTTAAGAATGAAGTTTAGAACATAAAAGTACTTATTACTT
TTATTTAATGAATACTTAGGATCCAAATACTAACCTCTAGAATAGCAATA
GGAAGTGAGAGATGTGTTAGCCCTCTGACCCATTAGCTTAGTCCAGAAAA
GTGAAGATTCAGTGATGTAATAGGAAAGGCCTGGGTATGCTTTCAAAATA
TAAGTGACTAAGAGCTTGACTTTTTGAAGTGAAGTGAAGAGGGCAATCCT
TTGTCATGACTTAAGCATGGAGAAGGTGCTCTGGGTGATTTTGATTGGTG
TGTGGGACTCAGTTCAACACTGGAAGGTAGTTTCAATTTTATCATTGCCT
TCAGCAATATT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 13 24 43 34 39 39 30 25 27 37 37 37 30 29 32 37 37 39 41 30 28 21 20 20 19 19 10 8 8 7 7 8 9 15 10 11 19 22 28 28 39 37 37 35
36 35 35 36 42 59 47 47 36 28 21 21 16 20 20 28 37 39 43 48 48 57 57 54 50 50 50 48 43 41 50 41 41 47 57 57 48 48 48 54 47 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 46 43 43 44 44 44 68 68 68 68 51 51 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 52 43 43 52
52 57 57 68 57 57 57 43 43 33 44 44 57 57 57 57 57 57 52 43 44 43 52 52 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 42 39 35 41 38 44 44 43
43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 44 44 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 44 38 22 17 18 16 28 28 43 43 57
57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 52 50 50 43
52 52 52 59 52 52 43 43 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 44 44 32 32 32 43 43 47 50 50 50 57 57 59 43 43 43 57 46 44 48 48 48 57 59 57 46 48
54 47 57 48 46 48 42 36 30 27 27 28 28 31 23 23 25 26 36 32 32 37 40 40 37 37 39 37 37 43 43 43 57 47 48 43 43 43 43 43 46 46 48 59 57 59 47 39 35 35
35 39 32 37 32 35 33 39 37 37 43 34 34 25 25 25 25 27 12 14 14 21 10 8 6 6 8 8 10 15 20 23 23 28 37 37 48 43 43 43 33 33 28 28 28 40 40 40 27 24
13 13 21 26 33 37 32 28 22 22 21 18 25 36 43 47 43 30 30 30 37 37 48 46 32 32 20 18 15 15 13 18 18 34 30 32 26 26 32 37 39 41 39 39 33 37 37 37 40 43
34 36 23 18 14 14 18 26 33 39 43 42 37 32 30 28 28 23 23 23 28 31 33 28 28 28 23 28 37 31 31 23 19 19 12 18 13 21 18 23 18 26 13 13 13 26 26 18 18 18
30 28 59 47 47 34 37 28 28 12 19 9 9 10 12 26 34 39 47 41 37 37 28 37 37 43 41 34 23 23 19 30 30 33 43 40 40 43 43 37 37 32 32 33 32 28 28 23 32 24
41 30 24 26 32 26 37 37 37 18 18 11 14 9 9 10 16 22 30 35 43 43 34 27 19 12 11 12 16 24 24 28 19 26 22 28 28 34 34 40 40 43 43 43 43 37 29 18 18 18
19 16 24 21 16 12 9 8 10 8 13 12 15 18 10 6 6 7 6 8 8 14 13 10 7 6 8 8 10 8 8 8 14 21 21 13 12 12 12 12 10 12 15 19 8 8 8 8 8 8
11 13 8 8 8 8 8 8 10 10 10 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 9 9 15 19 37 37 41 37 39 48 48 53 53 50 50 41 41 37 27 25 11 11 9 9 10 13 9 8 8 10 10 16 13 28 26 28 39 37 33
33 36 36 36 33 41 37 37 47 33 27 12 10 10 10 12 10 12 15 16 13 19 25 29 33 33 33 36 36 57 59 47 42 47 42 43 43 47 43 43 57 47 47 43 43 57 57 57 68 68
50 50 50 50 50 50 59 59 57 57 57 57 54 57 59 57 57 44 37 30 30 32 28 28 13 12 12 32 32 57 57 68 57 57 57 57 57 68 57 57 54 54 57 57 57 57 57 50 50 50
50 50 50 68 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 59 68 68 68 57 62 62 62 62 62 62 59 59 59 57
57 59 59 59 59 52 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 59 59
59 59 59 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 44 57 37 37 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 54 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 42 44 36 37 37 44 43 48 48 57 59 68 68 59 59 48 57 57 59 59 59 59 59 59 57 53
53 53 53 53 57 57 57 48 48 48 48 59 59 47 47 28 27 12 11 11 11 11 11 11 11 11 12 21 28 34 41 46 46 48 48 48 43 43 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 48
48 48 57 57 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 59 59 59 59 59 43 47 47 54 54 48 57 57 57 57 57 59 59 59 59 54 54 59 59 44 44 26 30 36 43 43 57 59 57 54
54 54 42 48 39 39 39 48 48 42 48 48 48 48 59 57 57 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 41 41 41 43 37 37 39 37 37 37 37 46 41 34 37 47 47 47 47 57 48 43
39 39 35 35 35 39 40 43 37 43 37 37 37 47 47 48 43 48 48 40 40 41 47 59 59 44 41 37 41 41 41 47 43 39 39 39 47 43 39 39 39 39 40 43 43 48 48 48 48 48
43 43 43 43 40 40 40 41 39 37 37 37 29 29 32 37 43 43 36 36 35 30 30 28 20 25 30 32 34 34 37 32 19 18 18 28 34 37 31 32 39 39 39 35 31 29 29 24 28 28
25 25 23 20 16 18 18 24 24 26 14 14 16 14 16 10 18 27 28 27 25 29 29 32 29 34 31 27 18 18 14 14 16 16 19 19 28 39 39 37 37 37 37 37 37 41 39 32 31 34
34 31 31 37 34 29 32 32 32 32 27 |