BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-388N07.T7 (MSMg01no388_n07.b1) | MSMg01-388N07.TJ (MSMg01no388_n07.g1) |
ACC | AG491231 | AG491232 |
length | 743 | 748 |
length of high quality (start - end) | 506 (63 - 568) | 239 (83 - 321) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no388_n07.b1 PHD_FILE: MSMg01no388_n07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:32:15 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no388_n07.g1 PHD_FILE: MSMg01no388_n07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:32:15 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCTCATGTCGCTATACGAATCACTACTCCGAGAGGATCCGCGGAATTCTC
ACCCGTGCCAAACCGAAAGGCTGAGAAACACCTGAAAAAATGTTCAACAT
CTTTAATCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCATCTC
ACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTG
GCGAGGATGTGGGGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTTGGATTGCA
AACTGGTACAACCACTCTGGAAATCAGGCTGGTGGTTCCCCGAAAATTGG
ACATAGTACCACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCA
GAAGATGTCCCAACCAGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGC
AGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGTCCCTCAA
CAGAGGAATGGATACAAAAATTGTGGCACATTTACACAATGAAGTACTAC
TCAGCTATTANNAAGAATGAATTCACGAAATTCCTAGCCAAATGGATCTA
CCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACCCAATCACAAAAGAACTCAA
ATGAAATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAACCCCGAAACTTAGTATAG
CGAGATATAAGGACCACATGTAAAACCTGAAACTGGAAAAAACGAAAAAC
CAAGGTGGACAATTTCTCCTCCTAAAATTGTAACAACCCCCCG
| NNNCCACGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTATATACAGAGCTTTGGA
GGACTCTTGAAGCTGGCAGGTAAAAAACTGAGAGAAATTGCTGAGTCTTT
GGCAGCTCTTCAGAGCTATGTGAGTGGGAGCAGATAGCTTCTTGTTTGGT
AAAGTGACAAACAGGCCTTCCAATGTGCAGATGTAGATCCAGCATGAGGA
GAAATTGGCAAGCCACTCCCTTGTCCTATACCTCCTAAAAGGGAAAGGAC
CTGGGCATCAGGGAAGAAAACATTTTTTTAAGAGGCAGGGGATGGAAGTG
CTGGTGGTGGATTTGAGCCAAGGAGCAAGATGCTCAGAATTGAGAATACA
TCCTGAAGATGTCCTGGCCACCCCACTTCTAGGAAAATGATTGTGTTCAG
TGGGGTTTTATGCAGCTGTAAAAAAAAAAAAAAATAATGAAATCCTGTCA
ATTTTTAGCCCCAAGCTTGGGCATTTGTCACATCTCTCTTCTAGAAGTTA
ACCAGGGTTCCATGAGGACAAAATCAATTTCTTTCAAGTGCTATGTCTTT
GATGACTAACAGTAATGCAGACCATATCCCACCTTTTAAAGTCAGACACC
AGAGGTCAATGCTGCCGCCCTGCAGACCTAGCTTCATGAGAACCTTTCTG
AAGCTCCTGAACTATAATAGCCTATCCTCCCAGTTGTGCGATTTATGG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 7 8 8 9 10 8 8 11 8 17 7 7 7 7 7 8 8 8 9 9 9 12 11 11 11 23 25 30 29 28 21 22 18 28 28 37 36 36 33 33 33 33 30 22
17 11 9 9 9 9 9 10 8 8 10 11 18 18 33 32 39 31 59 48 48 48 57 57 59 57 44 44 48 39 39 34 42 48 48 48 53 53 51 42 42 42 42 42 41 41 41 41 41 41
41 54 54 57 57 48 48 32 32 30 30 30 35 42 48 50 50 50 50 50 47 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 42 42 46 50 50 50 54 54 50 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 57 57 57 57 52 54 52 57 57 57 52 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57
59 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 68 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 68 57 68 68 57 57 57 59 68 68 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 48 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 48 48 48 57 57 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 54 57 57 57 47 47 47 59 59 59 54 57 54 59 59 68 68 53 48 50 48 48 47 48 48 48 57 46 48 48 57 47 37 33 28 28
37 37 39 46 46 39 39 39 44 37 37 44 34 34 23 20 20 34 34 44 41 41 40 40 43 43 43 43 37 43 43 57 32 32 18 18 18 18 18 41 32 43 39 59 41 39 39 39 43 32
30 15 14 14 26 28 39 27 23 3 0 0 3 23 21 22 20 23 24 21 28 28 28 17 17 17 30 28 37 39 39 32 29 23 30 24 28 30 24 24 25 39 39 31 36 35 37 37 37 32
29 24 28 22 22 34 31 37 34 38 30 30 22 22 20 22 25 25 23 12 11 11 13 17 17 13 16 16 26 21 21 11 12 11 16 11 11 11 9 9 12 15 13 9 9 12 12 9 17 19
22 34 17 15 13 11 13 11 15 16 16 18 10 10 10 11 10 9 9 9 9 9 10 11 19 11 15 15 12 19 11 10 11 14 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10
9 16 11 13 13 8 8 6 6 7 7 10 10 9 9 8 8 8 10 9 8 8 10 10 11 10 10 8 8 9 8 8 8 8 8 7 8 10 10 10 10 8 10 10 8 11 7 7 6 6
8 8 12 12 10 11 11 13 12 11 11 10 8 8 8 8 8 13 13 10 10 10 10 10 13 11 11 6 7 6 6 6 6 11 11 13 13 19 22 19 10 9 9 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 11 11 21 10 9 9 9 9 14 22 36 32 37 35 37 32 35 36 39 39 39 39 39 25 21 14 26 22 23 11 12 9 12 9 6 6 6 7 7 9 14 13 17
17 30 30 41 50 30 31 30 30 30 30 36 27 18 9 9 6 7 6 6 6 6 18 18 22 17 14 15 21 30 33 36 48 48 59 59 57 47 42 42 42 47 57 57 57 57 57 50 50 50
68 57 54 54 54 54 54 57 59 59 68 68 68 68 57 57 54 54 57 57 54 54 46 46 43 43 40 57 44 57 48 57 48 57 48 50 50 50 51 50 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 59 59 54 59 57 44 43 32 35 44 50 57 57 57 57 68 68 57 57 54 54 52 57 52 52 52 57 52 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59
59 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 59 57 57 54 57 54 57 54 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 44 43 39 43 43 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 54 48 48 47
47 48 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 50 48 59 30 30 20 17 12 12 16 16 13 12 12 12 12 14 26 30 47 47 47 59 48 48 48 48 48 48 48 50 57 57 57 59 57
59 59 59 57 57 59 57 57 54 54 54 44 43 43 43 43 32 32 30 30 32 39 42 43 43 43 48 47 54 59 59 59 59 47 47 43 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 43 43
40 47 47 59 59 59 50 50 50 44 44 41 47 59 59 59 28 28 11 11 10 12 12 13 13 12 21 21 29 30 32 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 43 43 32 32 30
37 41 43 43 43 43 46 59 59 59 59 59 43 39 39 37 59 47 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 54 57 57 57 57 68 57 57 48 48 47 47 47 43 43 43 43 43 39 39 43 57
57 59 59 57 44 44 37 37 37 32 32 28 28 28 28 33 42 40 48 48 48 57 57 59 59 59 40 40 25 28 28 39 39 39 47 40 40 40 43 43 28 28 32 32 40 43 59 59 41 41
39 31 31 37 36 37 39 39 33 33 25 24 28 33 37 37 33 32 27 29 29 37 39 39 39 40 39 59 39 39 41 37 25 25 11 11 11 17 21 23 32 32 34 34 28 28 28 37 37 43
39 40 40 39 37 39 39 25 25 28 34 29 29 19 16 16 15 11 11 12 15 17 11 15 15 27 30 21 22 12 11 11 23 25 21 13 9 8 8 8 15 17 23 20 16 10 9 9 9 9
9 10 12 15 14 14 16 15 18 13 13 11 11 10 9 9 9 12 19 19 17 15 17 10 10 10 10 10 15 11 15 15 27 25 22 22 19 22 23 17 10 10 8 9 10 17 12 12 10 13
8 8 8 10 10 12 11 8 9 9 9 15 15 27 22 20 11 15 11 11 11 12 13 19 15 14 8 8 8 8 8 8 12 6 7 6 6 7 7 8 10 10 13 19 16 12 11 11 |