BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-423A06.T7 (MSMg01no423_a06.b1) | MSMg01-423A06.TJ (MSMg01no423_a06.g1) |
ACC | AG517270 | AG517271 |
length | 744 | 740 |
length of high quality (start - end) | 514 (56 - 569) | 579 (64 - 642) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no423_a06.b1 PHD_FILE: MSMg01no423_a06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:43:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no423_a06.g1 PHD_FILE: MSMg01no423_a06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:43:36 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCAGTAATA
TTCCTGCCTATTCAGTGATATTCAGAATTGCCTCTGGTATTACAATATCA
CTTAGAATAAAAGCCAAGTTGCTCCCATATACAGGAATTCACAATGGTTT
AGGAAGTAGATTGGGCTGTGGTTTTAGAGTATTGCATTATTCATGAGATG
GTTAGCTAGAACGGAACTCCCTAATTAGAACCATGACTTGGGTGTGAAAG
CCCTTGCCCTAGGAGTGTAAAGACCTCACACCTGGCTTCTAAGACTATAG
CTGACCTTATATAGGGCTGACTTTGTCTCAGTTATTTTATTGCCCAGTTC
CTGCCAGTCTTTGTGTTTACATTCCTCTGTTTTGTGTAAGAGTCATTGAG
CATCCGGTAACCTCATTTGTACCTTGCCGATGTGTCACCTAACTTCCCTA
TTTTCTTCCGTATAAAAAGTTTGATGCTCAATTTGACAAATTACATTCAG
ATTCTACACAACCTCTCCTGTGTGCATCTGTCTGTCATTTCATCCAACAC
TTTGCCCATTTGCGACTAGAGACCCATTCCACGCAGACAATGGGGCCCAC
AGGGTCTGCGGCCAAGCTCGTACACCACAATCCCAAGGCCACTGGCTGCT
ATGGAATACAAACCTTGATTTTTATGCGCCCAGGGAAAAACCAGGTTATG
TTCTGCGTAATTTCAAAACCAAAAACTTTTTCCTATTATGGCTT
| GXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXAGCCACACTGCCCTTCTTCTCAACCTTGGCGGTCTGA
TGTTGTAACATAGAAACAGCAGACACAGTGCAGAGGAAAGCTTGCCAAGG
CATGAAGCCCTTCATCTCAGACTAGCAACAGCTACATTAGCTACGTGTCA
TCCACTCTTTCTTAGTCCACTGAGGACTAAGGCCCGTTTAGAAGCTGAAA
ATGCCAGGACCCTGCACTGTGGGTGAACCTCATAGGCAAGTTTCATGATT
TTGAAAAACAGTTTTACTCAAAATGACAAAAGGCAAGTTTCATAGAGGAT
GTAACACCCAAGTAACGACAGAAAGTTTTGCCTTTGTGGTATCACAAGCG
TTGCGATCTTTCTGACACCTATATGGAAATGTGTTACTGCCAATATTTTT
ACTTTCCTATAACTGAGCTTTGAATAGGTCTAGAGTTTCTGGAAGTCAAT
AGATCAAACTGATTTATTAACCAAGGTGAGATTTAAATGATGGGAGTTGG
AGGAGCTCTTTGCTCATTTGTAGTCATATCCTGGTTTAGTTGGTTGGGCA
CATGGTGTAAACATGTTTGCAGATGAACAAAAGCAGAGAANATTCCAGAT
AAGGAGAGAATGTCCAGAAGGAGCCAATAAAAAATAAATCTATGGGGCCT
TTTTTTTTTTAACTGTCAAGACNATTTCTTTTGGAAAAGA
|
quality values | Open.Hide.11 11 15 15 21 13 9 9 19 19 31 31 39 27 20 16 12 11 8 10 9 10 9 12 14 17 28 28 30 25 29 28 28 28 25 30 30 35 35 26 26 20 14 15 22 22 9 8 6 8
8 8 8 10 12 23 22 30 37 43 29 24 16 16 29 29 53 53 53 36 42 23 16 14 27 27 47 32 42 34 35 35 39 41 41 41 35 68 68 43 42 31 25 25 36 42 42 30 24 22
22 24 34 34 57 57 57 57 57 57 57 44 36 28 22 23 38 38 44 57 41 41 35 37 37 28 31 44 44 44 42 29 28 43 42 50 42 33 32 19 22 28 32 43 43 57 57 57 68 68
68 68 68 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 52 52 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 59 59 44 44 39 27 27 38 38 68 68 68 68 68
68 68 57 57 43 52 52 59 57 57 43 43 45 57 57 42 42 43 43 52 43 43 44 44 57 57 62 44 34 33 26 35 35 44 44 52 52 43 44 43 52 52 62 62 68 68 68 62 44 43
33 31 43 43 44 43 35 35 29 29 38 38 62 62 62 68 68 68 68 68 44 44 43 43 43 43 21 21 35 39 39 43 43 44 43 43 43 43 39 39 38 38 44 31 43 43 62 62 62 43
43 43 41 43 35 35 34 34 19 20 20 35 35 35 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 43 26 44 44 62 62 62 68 68 68 68 59 59 57 45 43 43 43 43 43 20 38
38 43 43 39 35 35 44 26 27 43 44 44 59 68 68 68 44 44 43 35 33 44 43 41 43 43 30 30 38 38 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 38 41 28 33 33 44 44 59 57 43
38 38 32 43 30 38 38 44 44 44 32 43 43 33 33 43 44 59 57 50 43 43 43 43 59 59 43 43 43 44 44 59 44 44 35 35 35 42 44 57 57 48 36 40 36 37 37 42 42 57
57 44 44 32 30 30 37 26 32 23 28 30 44 47 57 57 57 57 43 43 43 57 57 47 46 39 37 28 28 28 37 40 48 59 43 42 35 35 35 40 40 40 37 28 28 34 30 28 21 28
15 20 15 24 21 28 24 30 32 28 28 14 17 11 11 11 15 22 25 24 24 28 37 37 47 47 39 39 39 39 39 43 37 37 30 30 30 24 30 23 14 14 19 19 18 22 22 30 34 40
34 31 24 14 14 17 23 24 30 34 34 41 41 39 37 28 28 13 13 12 21 15 16 16 12 12 12 15 13 10 12 11 17 15 11 11 11 10 7 6 6 6 15 15 24 15 13 12 11 11
12 15 13 11 8 8 10 10 8 10 10 10 10 10 9 9 11 17 20 15 15 8 8 8 8 8 6 9 9 10 13 11 11 10 10 9 9 9 8 8 8 13 16 16 18 16 16 10 10 10
17 17 22 25 25 11 11 10 10 9 9 8 9 8 11 8 9 10 10 11 12 15 9 11 11 16 9 9 9 12 12 12 10 10 8 11 8 8 8 8 8 10 10 14 11 15 10 9 9 9
9 16 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 13 14 12 12 10 10 10 10 10 10 12 12 11 12 14 23 15 17 15 17 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 | Open.Hide.11 11 12 19 16 28 37 37 37 44 44 39 39 39 41 30 28 23 18 14 11 9 9 9 17 15 18 20 24 31 26 34 37 37 53 57 31 35 24 24 24 28 41 41 41 25 23 12 9 10
11 13 19 22 28 30 34 28 28 28 28 24 24 28 37 28 25 25 33 33 34 34 40 37 35 39 39 43 43 43 43 36 36 32 30 42 30 32 39 44 44 68 68 44 44 28 28 40 44 48
68 68 68 68 68 59 48 41 41 36 42 42 57 44 43 36 43 44 42 42 39 48 37 39 42 42 37 44 44 39 46 37 57 57 68 68 68 57 57 43 43 43 50 43 42 35 35 44 44 52
52 52 57 57 57 44 43 27 33 43 43 43 32 32 35 43 32 32 17 38 32 50 50 59 43 52 57 52 52 57 57 57 57 43 39 39 59 59 59 57 57 57 57 52 43 59 59 35 35 43
39 43 43 43 43 35 43 43 59 43 45 38 41 43 44 35 35 43 43 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 59 43 39 35 43 35 44 44 62 62 62 62 62 43 52 62 62 62 68 68
62 62 52 43 43 35 62 44 43 43 43 52 43 43 43 52 43 62 62 62 68 68 68 68 62 44 43 43 43 39 39 39 44 44 62 62 62 62 62 62 44 44 43 43 52 62 62 68 68 68
68 68 68 62 62 43 43 29 29 31 39 39 62 62 62 52 43 39 29 17 39 39 68 44 62 43 39 41 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 41 41 39 44 44 68 68 68 68 68 68
68 62 62 43 43 43 43 43 39 39 44 59 62 62 52 52 52 62 52 52 62 62 68 68 68 68 68 62 44 43 35 35 43 43 43 68 68 68 68 44 44 43 43 43 43 43 62 62 62 52
62 62 62 62 62 62 52 52 43 62 52 45 45 44 43 39 39 35 43 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 52 52 52 59 59 68 68 68 68 59 59
57 57 57 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 59 59 68 68 68 68 68 44 44 31 31 43 44 44 68 68 41 41 32 32 35 59 44 68 59 47 35 35 35 44 44
57 44 44 42 42 32 44 42 57 57 57 57 68 57 57 59 59 59 59 42 30 28 28 37 44 57 57 57 57 57 54 57 57 57 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 48
48 48 48 57 40 40 30 32 32 40 43 59 43 39 39 37 43 34 41 40 39 32 28 23 23 34 30 43 39 41 41 32 28 32 31 36 39 39 35 29 24 26 20 20 20 30 36 36 41 41
41 41 32 28 22 31 30 23 18 26 25 27 37 43 36 39 39 37 37 39 32 34 30 32 32 26 24 30 20 20 29 37 37 39 28 32 20 15 15 3 0 3 17 12 16 12 12 16 12 12
12 11 18 20 34 34 30 28 24 16 21 12 12 12 14 19 19 26 15 15 11 14 14 10 10 10 18 28 20 26 23 19 19 10 12 12 21 27 40 36 37 36 32 27 16 11 8 8 8 9
18 36 59 59 44 37 28 17 8 8 8 8 13 13 15 15 15 18 18 20 14 3 0 3 14 14 15 15 16 14 14 10 10 10 13 18 15 8 8 8 |