BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-461M19.T7 (MSMg01no461_m19.b1) | MSMg01-461M19.TJ (MSMg01no461_m19.g1) |
ACC | AG546838 | AG546839 |
length | 802 | 752 |
length of high quality (start - end) | 414 (71 - 484) | 515 (69 - 583) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no461_m19.b1 PHD_FILE: MSMg01no461_m19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:35:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no461_m19.g1 PHD_FILE: MSMg01no461_m19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:35:32 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCGAGAATCCGCGGAATT
CTTTGTATATTTCGCATATTAGCCCTCTATCAGAAGTAGGATTGGTAAAG
ATCTTTTCCCAATCTGTTGGTTTCCATTTTGTTCCATTGACAGTGTCCTT
TGCCTTACAGAGGCTTTGCAATTTCATGAGGTCTCATTTGTCAATTCCTG
ATCTTAGAGCACAAGCTATTGGTATACTGTTCAGGAAATTTTCCCTATGC
CCTTGTGCTCGAGGATCTTCCCCAATTTCTATTGTATTAGTTTCAGTGTA
TCCAGTTTTATGTGGAGTTTCTTGATCCACTTGGATTTGAGTTTTGTACA
AGGAGATAATAATGGAACAATTTGCATGCTTCTACATACTTACTGGCAGA
TGAACCAACACCATTTATTGAAAAGGCTGTCTTTTCCCACTGGATGGTTT
TAGCCCCTTTGTCAAAGATCAAGTGACCATTGATGTGCGCGTTCATTTCT
GGGTTTTCACTCTTATTCCCTTGATGTACTTGCCTGTTATTATACTATTA
CCATGTAATTTCTTTCCCCCATCGACCTTTATTTCCCTTTTTTCCGCTTA
CAATACAATTTCTCCCTTAATATCCTTTTAATTTGCTTGTAAACATTCCT
TCTCCTATTTCCTTTTTTTTTTTGCCCACCTCTTCTTAATTTCCCGCTTC
TACCTTTCTTTTTTATTTTCANCACCCCCCCTTTTCAGTTTACCTCTTAA
CTTTTTTTTCCCCCCTCTCTTTTTTGTTTTTTCTTTAATAAACTTGTCCC
CG
| GCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTGTTTCCTCCTTGAAAAAAAAATCTCAGAA
TTCTCTGCTCCAGGTTTCTTTTGATCAGTTTAAAATGTAGAGAGAAAAGG
CATCATTTGAGAAGTAATTTGAATTCAACAGTTTTCATGACATTTTCCTG
AATATTTCATAGTTGCCTATCTGCAATAATATTTTGGCGTGATTTTCTTA
TATTCAGTATTGTCAAAGCATTCAACTCACCTTGACTAGAAAGAACAAAT
ACACCTGTCACTGANTTTTATCTATTAATTGTATAATGATGGTGACAAGT
CCAACCAAAATGAACAAGATGCAAAGCTATGTACCTGTGAAGGGGTTACC
AGGGACTGAACCCAGGGCCTCTTGCATGGTAAGCCAGTGCTCTTCCACTG
AGCTACACCTGGGGTTCTCACTCGCATCTCCTTTCTGGGCCATGGAGAGC
AATGAGCAAACCAGAGAGCAGCTGTGAGAACCCTTAGCTCACTTCAAGCA
TCCACTGCTGTGCTCTCTGCAAGTGTTGGAGCAGATGGGTGAGCAACCAT
TCATGGGGTTCTGTTGTTGTTATTATCACCTTCCTGAGATCTTTATGATC
TAGCACTTTACCAGGAGGTTTCCTCCCATAAATTCCGCCAAAACTGGTAA
ACACTACCAAACCATTGTTCCCAACCCACCTTTTATCCCTAGTTTTTGGT
TN
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 15 27 13 14 6 6 6 15 21 29 34 28 28 28 37 37 37 32 29 33 33 30 28 27 16 9 9 9 12 9 9 9 7 7 8 8 8 10 16 20 12 23 23 31 33 33
33 50 50 42 41 25 25 11 10 8 8 8 6 6 6 13 13 13 15 16 11 25 28 43 43 43 57 57 53 53 53 47 47 47 57 57 57 50 42 42 42 42 42 42 57 68 57 59 54 68
68 68 68 50 57 57 57 47 50 50 50 50 50 53 50 57 57 32 29 18 18 20 26 36 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 59 52 57 57 52 43 43 52 52 52 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 57 50 50 68 68 68 68 57 44 44 28 28
31 42 42 44 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 59 59 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 59 48 59 59 59 59 59 41 24 17 10 10 9 9 9 9 9 15 20 23 19 30 32 47 48 43 47 40 43 43 43 43 57 57 48 48 48 48 43 43 40 39 47 43 43
43 48 48 39 29 29 22 22 17 15 16 21 24 22 19 23 36 44 43 48 48 50 48 48 48 57 48 54 54 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 57 57 42 37 30 44 44 44 23
36 36 39 42 43 43 43 43 43 43 43 43 59 43 42 30 30 30 32 37 35 39 35 35 35 39 37 43 43 48 43 43 25 34 28 22 22 30 30 39 39 36 36 32 23 14 12 15 13 19
18 17 17 21 24 30 37 41 33 33 30 30 27 24 20 20 23 30 30 30 24 24 24 30 32 32 32 35 35 35 34 24 19 19 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 18
12 12 12 21 24 22 22 10 8 8 8 8 10 8 10 10 11 13 14 16 15 13 11 16 16 13 9 10 10 8 8 8 10 10 17 10 8 8 6 6 8 8 11 9 11 11 9 8 8 8
8 8 8 10 10 11 13 13 23 18 11 11 10 11 11 14 16 17 13 10 8 10 10 10 10 17 19 13 13 9 10 8 9 10 8 10 10 10 10 18 19 28 10 10 8 6 6 10 10 9
9 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 13 10 10 8 13 7 6 6 8 8 8 12 15 11 14 14 13 13 12 15 15 15 15 11 8 8 11 10 10 12 10 10 11 11 10 10
10 12 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 10 11 12 10 10 10 14 22 12 11 9 8 8 10 6 7 6 8 8 10 13 8 9 10 9 10 10 10 13 13 17 8 8 8 8 8 8 9
9 9 9 10 8 10 8 8 8 11 10 8 13 8 8 8 8 8 6 6 3 0 3 8 8 14 12 15 13 19 16 20 14 13 10 6 6 6 6 7 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8
8 10 11 12 12 12 12 12 12 10 8 8 13 8 10 10 10 8 10 10 12 22 18 18 10 10 10 10 13 10 10 8 8 12 17 10 8 8 8 8 8 10 10 13 8 8 8 7 10 12
8 6 | Open.Hide. 8 8 6 8 8 8 8 8 8 10 15 21 36 35 35 28 28 28 34 24 24 34 35 39 25 25 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 11 14 18 24 22 22 12 12 12 26 33 59 59
44 37 37 25 14 13 10 10 11 10 9 10 8 8 8 8 10 13 30 30 39 39 41 48 50 59 59 59 59 59 44 44 39 37 37 19 23 23 25 27 27 28 31 31 35 39 47 36 36 36
42 37 37 57 57 57 57 57 42 42 33 33 32 32 41 42 47 43 48 48 48 42 42 50 50 50 50 54 57 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 47 54 59 59 68 68 68 68 68 68 51
50 50 50 50 50 68 68 57 59 59 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57
57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 54 54 54 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 51 50 50 50 38 39 35 43 42 47 42
48 59 44 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 50 59 50 50 47 27 27 11 8 3 0 3 7 7 12 11 11 12 22 34 37 59 59 50 50 50 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
59 39 35 32 32 30 30 30 39 39 48 57 57 57 54 54 54 54 54 57 57 54 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48 59 59 68 68 68 68 68 57
57 47 47 41 41 47 48 57 54 54 46 47 42 33 33 35 35 47 59 59 59 59 57 54 54 59 59 59 54 59 57 59 59 68 59 59 59 54 54 54 54 59 59 54 54 54 50 50 43 48
41 48 48 48 57 54 54 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 39 39 39 39 39 41 43 41 41 46 46 39 47 37
39 37 37 37 37 39 39 37 37 41 32 31 31 31 31 37 37 32 32 20 20 20 28 31 34 37 31 30 31 31 31 34 39 34 34 28 18 18 12 18 21 34 25 31 28 28 28 34 43 48
43 43 43 43 37 37 30 30 30 37 39 43 43 47 41 41 39 37 35 30 24 27 34 35 32 37 27 26 24 18 12 12 12 16 11 15 12 12 12 13 28 15 19 19 26 25 29 15 23 10
11 10 17 17 16 11 8 8 8 10 10 10 9 9 9 9 8 9 9 9 9 10 13 24 19 18 13 10 8 8 8 8 8 7 7 13 10 10 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 9 10
10 8 8 10 10 11 13 14 25 19 15 12 12 11 10 10 10 12 10 10 10 9 10 12 16 10 9 9 9 11 11 12 12 12 16 13 9 9 7 8 8 9 13 11 11 8 8 8 8 9
8 13 13 18 15 17 19 19 22 24 24 13 11 10 10 10 10 15 21 20 20 18 10 10 9 8 8 8 15 9 10 10 11 13 16 20 16 14 11 8 8 8 8 11 12 25 10 10 10 10
3 0 |