BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010P02
Chromosome19 (Build37)
Map Location 37,850,437 - 37,970,878
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668251, LOC209281
Upstream geneTnks2, Fgfbp3, Btaf1, Cpeb3, March5, LOC668230, Ide, LOC100043010, Kif11, EG667490, LOC631069, Hhex, Exoc6, Cyp26c1, Cyp26a1, LOC668248
Downstream geneFer1l3, Cep55, Gpr120, Rbp4, Pde6c, 5730455O13Rik, Lgi1, Tmem20, LOC100042483, Plce1, EG667587, Noc3l, Tbc1d12
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010P02.bB6Ng01-010P02.g
ACCDH846466DH846467
length898442
definitionDH846466|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010P02, 5' end.DH846467|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010P02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,850,437 - 37,851,336)(37,970,431 - 37,970,878)
sequence
gaattcacttcctggaaagatctggaaccctcgacggaaggggagaactt
ctgtacattctcctctaacctcaccccatgccacacagtcctctctctca
caataataataattaataatgatgattttaaaaagcaaactcagaaatga
gtgttgatgtgacacttcctcaaaggagatgtgcagatggctcacacttc
taagatgatcatcagcactgccagtcatgaaggcctagtggcctatccct
tcagtcacagcacttgggaaactgaggcatgaggcttgttaaaaatttga
gttcaagaccagcttgaactacaagtgagagtgaccctgtgtgaatggag
gaaggaaggaaaagaaagagagtggggggtggaaaaacccaagcctacat
gatactattccgtgctcctcaggacagatacaacaagaacccagagtttg
ccagtacatgaagaaacagaaccgctcgtacattgtcagtgtgaatgtgc
aatgatgcagatggaatgtaaaatagtttgacagttcctaataaatcaag
tgtagaactgctattggatccaatgaatacattcctggcgtaagctaatg
taagtgaaaaggatgttcaagcaagatcttggcactgacctgtgctgcag
tcctgtttcacggtgtctaaaagacagaaaacaaccccgtgtccaccagg
agacaaataaacacacgtggtgtgtttagatcacaggataccaaaaggag
tagggtaatgataataccagctaccacctggctgaatcctcagcacattg
cgctaagggaagatggcaggtgccaaaggccacagtggtatggttctcct
tccttcatatgaaacctacagagagctaagcgattatgatcccaggga
cattcggagggatgctttgtaatgtctgcttatgtggaatgagttcataa
tgagtcaacgttgtaaagagattaagggcccaccatcttcgaagctgagt
gctgtgtttgttcagcgttgaatgagaactccctaatcttccttcagtta
aacatgatgaggtcccaaggaagatgaaagggaggggccccttccccctg
gatatacatccgtgaagtgaaatgccagagttcatgtagttcaagaaaaa
cacaagagaggcatgtagctgggactaactttgaggcctagagagtgtgg
ggacataatgggaaacacaggcctgtgtgtgaggggtgctctgctgactg
gggtacacatttccaagagagtctcagccccaagttttaaagatctgaat
aaactgaataaggggtctgtgtgtgtatgtgtgtgtatgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_37850437_37851336
seq2: B6Ng01-010P02.b_45_942

seq1  GAATTCACTTCCTGGAAAGATCTGGAACCCTCGACGGAAGGGGAGAACTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTCCTGGAAAGATCTGGAACCCTCGACGGAAGGGGAGAACTT  50

seq1  CTGTACATTCTCCTCTAACCTCACCCCATGCCACACAGTCCTCTCTCTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACATTCTCCTCTAACCTCACCCCATGCCACACAGTCCTCTCTCTCA  100

seq1  CAATAATAATAATTAATAATGATGATTTTAAAAAGCAAACTCAGAAATGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAATAATAATTAATAATGATGATTTTAAAAAGCAAACTCAGAAATGA  150

seq1  GTGTTGATGTGACACTTCCTCAAAGGAGATGTGCAGATGGCTCACACTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGATGTGACACTTCCTCAAAGGAGATGTGCAGATGGCTCACACTTC  200

seq1  TAAGATGATCATCAGCACTGCCAGTCATGAAGGCCTAGTGGCCTATCCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATGATCATCAGCACTGCCAGTCATGAAGGCCTAGTGGCCTATCCCT  250

seq1  TCAGTCACAGCACTTGGGAAACTGAGGCATGAGGCTTGTTAAAAATTTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCACAGCACTTGGGAAACTGAGGCATGAGGCTTGTTAAAAATTTGA  300

seq1  GTTCAAGACCAGCTTGAACTACAAGTGAGAGTGACCCTGTGTGAATGGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAGACCAGCTTGAACTACAAGTGAGAGTGACCCTGTGTGAATGGAG  350

seq1  GAAGGAAGGAAAAGAAAGAGAGTGGGGGGTGGAAAAACCCAAGCCTACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAAGGAAAAGAAAGAGAGTGGGGGGTGGAAAAACCCAAGCCTACAT  400

seq1  GATACTATTCCGTGCTCCTCAGGACAGATACAACAAGAACCCAGAGTTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTATTCCGTGCTCCTCAGGACAGATACAACAAGAACCCAGAGTTTG  450

seq1  CCAGTACATGAAGAAACAGAACCGCTCGTACATTGTCAGTGTGAATGTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTACATGAAGAAACAGAACCGCTCGTACATTGTCAGTGTGAATGTGC  500

seq1  AATGATGCAGATGGAATGTAAAATAGTTTGACAGTTCCTAATAAATCAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATGCAGATGGAATGTAAAATAGTTTGACAGTTCCTAATAAATCAAG  550

seq1  TGTAGAACTGCTATTGGATCCAATGAATACATTCCTGGCGTAAGCTAATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAACTGCTATTGGATCCAATGAATACATTCCTGGCGTAAGCTAATG  600

seq1  TAAGTGAAAAGGATGTTCAAGCAAGATCTTGGCACTGACCTGTGCTGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGAAAAGGATGTTCAAGCAAGATCTTGGCACTGACCTGTGCTGCAG  650

seq1  TCCTG-TTCACGGTGTCTAAAAGACAG-AAACAACCCCGTGTCCACCAGG  698
      ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTTTCACGGTGTCTAAAAGACAGAAAACAACCCCGTGTCCACCAGG  700

seq1  AGACAAATAAACACACGTGGTGTGTTTAGATCACAGGATACC-AAAGGAG  747
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AGACAAATAAACACACGTGGTGTGTTTAGATCACAGGATACCAAAAGGAG  750

seq1  TAGGGTAATGATAATACCAGCTACCACCTGGCTGAATCCTCAGCACATTG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGTAATGATAATACCAGCTACCACCTGGCTGAATCCTCAGCACATTG  800

seq1  CGCTAAGGGAAGATGGCAGGTGCCAAAGGCCACAGGTGGTATGGTTCTAC  847
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
seq2  CGCTAAGGGAAGATGGCAGGTGCCAAAGGCCACA-GTGGTATGGTTCTCC  849

seq1  TTCCATCATATGAAAACCTACAGAGAGCTAAGCAGATTAATGATTCACAG  897
      |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || |||
seq2  TTCCTTCATATG-AAACCTACAGAGAGCTAAGC-GATT-ATGA-TCCCAG  895

seq1  GGA  900
      |||
seq2  GGA  898

seq1: chr19_37970431_37970878
seq2: B6Ng01-010P02.g_66_513 (reverse)

seq1  ACACATACACACACATACACACACAGACCCCTTATTCAGTTTATTCAGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATACACACACATACACACACAGACCCCTTATTCAGTTTATTCAGAT  50

seq1  CTTTAAAACTTGGGGCTGAGACTCTCTTGGAAATGTGTACCCCAGTCAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAAAACTTGGGGCTGAGACTCTCTTGGAAATGTGTACCCCAGTCAGC  100

seq1  AGAGCACCCCTCACACACAGGCCTGTGTTTCCCATTATGTCCCCACACTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCACCCCTCACACACAGGCCTGTGTTTCCCATTATGTCCCCACACTC  150

seq1  TCTAGGCCTCAAAGTTAGTCCCAGCTACATGCCTCTCTTGTGTTTTTCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGCCTCAAAGTTAGTCCCAGCTACATGCCTCTCTTGTGTTTTTCTT  200

seq1  GAACTACATGAACTCTGGCATTTCACTTCACGGATGTATATCCAGGGGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTACATGAACTCTGGCATTTCACTTCACGGATGTATATCCAGGGGGA  250

seq1  AGGGGCCCCTCCCTTTCATCTTCCTTGGGACCTCATCATGTTTAACTGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGCCCCTCCCTTTCATCTTCCTTGGGACCTCATCATGTTTAACTGAA  300

seq1  GGAAGATTAGGGAGTTCTCATTCAACGCTGAACAAACACAGCACTCAGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGATTAGGGAGTTCTCATTCAACGCTGAACAAACACAGCACTCAGCT  350

seq1  TCGAAGATGGTGGGCCCTTAATCTCTTTACAACGTTGACTCATTATGAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAAGATGGTGGGCCCTTAATCTCTTTACAACGTTGACTCATTATGAAC  400

seq1  TCATTCCACATAAGCAGACATTACAAAGCATCCCTCCGAATGGAATTC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCCACATAAGCAGACATTACAAAGCATCCCTCCGAATGGAATTC  448