BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-062A05
Chromosome19 (Build37)
Map Location 50,551,146 - 50,701,835
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSorcs1
Upstream geneLOC629448, Siah1-ps1, EG433251
Downstream geneLOC100042924
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-062A05.bB6Ng01-062A05.g
ACCDH882534DH882535
length1,052906
definitionDH882534|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-062A05, 5' end.DH882535|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-062A05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(50,551,146 - 50,552,201)(50,700,930 - 50,701,835)
sequence
gaattctgaggcagtggttgcccaagtgtgctaaatccttccaaattcca
ggttactagcacagtgcctcatttaggaggcatgaacatcaatgatcctg
aactcttcccagctaagtcaactaggactcctttctaggaaatggagctc
tgtgcttactggaagaccaggtgagatccctacagacctgtcctccaaag
cagcgttctcccaacccacagtatgagctgccaccaacaatctgttcaaa
ctcccttcttcagcaagacgtgagcacgggtgaggtgtgaggcaccctat
gggtgcatcagatggcgtgcctgtggtggggcatatgcttagcagatccc
catgccaattaagtcactcgaagtgctaaatttcaatcagggatgctgat
caacgacagcagggtggctgtttgtatgaggacagagaatgatgttgtga
ctccacctcagtgggattttgccaaatagtcctgtaaatcccccaacaag
aaaattgggatgtgggcagaaagcatttctaggtagttgccctcatgata
caatatagcagtgaactaaataaggaagctcatctggtcacaggctatgg
ctcccactcatgtgacaagggactttagaggtgcccaggggtgggaaccc
tttagcccagtgtcaaatggtgtaagccagcccacccacatacacagcca
ttgtttaagcaattttccagggcacgtgtgtatatgaaagggaaaatttg
ttccctgcttcctcttgctgggctagtaaaagcaaaaaaaaatgctagtg
atatagtccgacagtttatcaatactgcacaggggagcatcctctgtaca
tttcacgacatagctgttcagccaatataatcttttttttttttttttag
atctgagcaaaaaggaaagatgaaatcttatctttggttacgtattccaa
tagataatctgaggtcttgtcttctcttgaatttttcccattcaattggg
tgtgccacattactcatgcctcatgcctggcagtcaagtgaaacatgcta
tg
gaattcatgaaaagtacctatagatatttctgtgtcttctgaaaggttct
actgaggagtggggagtattcttcttaaaagtacactagttgtcctatag
tagagtatgaatgtagggagaaattattgttgagatgtcatggagaagtt
aaaaggggaaatgagatggattatctaaatgggaagtggggaaaagattg
gaaaaagagccttggattgaaacaagtttatagcacatgatattaggagt
ttcactttaaaataaggaacatttactatacttatatggagtgaatatga
tttggcaagctactttgttaaagcaaaattcttttgggaaaagttacagg
ccacatcaatagcatgtattaaaagtcagattttgaacttagacacatga
tttatggcaggacttgtctacacttctttgagcaaagcctagtaccttca
aggcatcgattccccattccttgaatgacaatgcataactttgtctgtgt
attctttctgaagtataacattaacttagatcattaccgttctcatttag
agttgctgaagtaccaggctagaggaaattcatttgtaaaccatgaggaa
atatccaatttagtagagcttatgtatgatgatatgggagcttccagttg
gacaggaatgggaactacccagtgagggcttcatagacagaagaggaaaa
ttcctgggcatgttgtcaagtaactttgtcctttgggcttttatgtagat
tgaatcccacacacaatttggaaataactgtgttggagttatatggttca
ttgtaagcaggacaaacacattttcatatttgcctttataatattttagt
tgaatcacttttaagtgtgcttctcttgatagaaagcctggacattttat
gtaact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_50551146_50552201
seq2: B6Ng01-062A05.b_45_1096

seq1  GAATTCTGAGGCAGTGGTTGCCCAAGTGTGCTAAATCCTTCCAAATTCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGAGGCAGTGGTTGCCCAAGTGTGCTAAATCCTTCCAAATTCCA  50

seq1  GGTTACTAGCACAGTGCCTCATTTAGGAGGCATGAACATCAATGATCCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTACTAGCACAGTGCCTCATTTAGGAGGCATGAACATCAATGATCCTG  100

seq1  AACTCTTCCCAGCTAAGTCAACTAGGACTCCTTTCTAGGAAATGGAGCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTTCCCAGCTAAGTCAACTAGGACTCCTTTCTAGGAAATGGAGCTC  150

seq1  TGTGCTTACTGGAAGACCAGGTGAGATCCCTACAGACCTGTCCTCCAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTTACTGGAAGACCAGGTGAGATCCCTACAGACCTGTCCTCCAAAG  200

seq1  CAGCGTTCTCCCAACCCACAGTATGAGCTGCCACCAACAATCTGTTCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCGTTCTCCCAACCCACAGTATGAGCTGCCACCAACAATCTGTTCAAA  250

seq1  CTCCCTTCTTCAGCAAGACGTGAGCACGGGTGAGGTGTGAGGCACCCTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTTCTTCAGCAAGACGTGAGCACGGGTGAGGTGTGAGGCACCCTAT  300

seq1  GGGTGCATCAGATGGCGTGCCTGTGGTGGGGCATATGCTTAGCAGATCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGCATCAGATGGCGTGCCTGTGGTGGGGCATATGCTTAGCAGATCCC  350

seq1  CATGCCAATTAAGTCACTCGAAGTGCTAAATTTCAATCAGGGATGCTGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCAATTAAGTCACTCGAAGTGCTAAATTTCAATCAGGGATGCTGAT  400

seq1  CAACGACAGCAGGGTGGCTGTTTGTATGAGGACAGAGAATGATGTTGTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACGACAGCAGGGTGGCTGTTTGTATGAGGACAGAGAATGATGTTGTGA  450

seq1  CTCCACCTCAGTGGGATTTTGCCAAATAGTCCTGTAAATCCCCCAACAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCACCTCAGTGGGATTTTGCCAAATAGTCCTGTAAATCCCCCAACAAG  500

seq1  AAAATTGGGATGTGGGCAGAAAGCATTTCTAGGTAGTTGCCCTCATGATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTGGGATGTGGGCAGAAAGCATTTCTAGGTAGTTGCCCTCATGATA  550

seq1  CAATATAGCAGTGAACTAAATAAGGAAGCTCATCTGGTCACAGGCTATGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATAGCAGTGAACTAAATAAGGAAGCTCATCTGGTCACAGGCTATGG  600

seq1  CTCCCACTCATGTGACAAGGGACTTTAGAGGTGCCCAGGGGTGGGAACCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCACTCATGTGACAAGGGACTTTAGAGGTGCCCAGGGGTGGGAACCC  650

seq1  TTTAGCCCAGTGTCAAATGGTGTAAGCCAGCCCACCCACATACACAGCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCCCAGTGTCAAATGGTGTAAGCCAGCCCACCCACATACACAGCCA  700

seq1  TTGTTTAAGCAA-TTTCCAGGGCACGTGTGTATATGAAAGGGAAAATTTG  749
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTAAGCAATTTTCCAGGGCACGTGTGTATATGAAAGGGAAAATTTG  750

seq1  TTCCCTGCTTCCTCTTGCTGGGCTAGTAAAAGCAAAAAAAAAATGCTAGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TTCCCTGCTTCCTCTTGCTGGGCTAGTAAAAGC-AAAAAAAAATGCTAGT  799

seq1  GATATAGTCCGACAGTTTATCAATACTGCACAGGGGAGCATCCTCTGTAA  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GATATAGTCCGACAGTTTATCAATACTGCACAGGGGAGCATCCTCTGT-A  848

seq1  CATTTCACGACATAGCTGTTCAAGCCAATATAATCTTTTTTTTTTTTTTT  899
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCACGACATAGCTGTTC-AGCCAATATAATCTTTTTTTTTTTTTTT  897

seq1  TAGAATCTGAGCAGAAAAGGAAAGATGAAATCTTATCTTTGGGTTACGTA  949
      ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TAG-ATCTGAGCA-AAAAGGAAAGATGAAATCTTATCTTT-GGTTACGTA  944

seq1  TTCCAATAGATAATCTGAGGTC-TGCCTTC-CCTGCATTTTTCCCATCCA  997
      |||||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||| ||
seq2  TTCCAATAGATAATCTGAGGTCTTGTCTTCTCTTGAATTTTTCCCATTCA  994

seq1  TTTGGGTGTG-CACATTACTCATGCCTCAATGCTGGGCAGTCAAGTGATA  1046
       ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |
seq2  ATTGGGTGTGCCACATTACTCATGCCTC-ATGCCTGGCAGTCAAGTGAAA  1043

seq1  CAATGCTATG  1056
      | ||||||||
seq2  C-ATGCTATG  1052

seq1: chr19_50700930_50701835
seq2: B6Ng01-062A05.g_69_974 (reverse)

seq1  AGTTACATAAAATGT-CAGGCTCTCTATCAAAGAGAAGCACACTT-AAAG  48
      ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||
seq2  AGTTACATAAAATGTCCAGGCTTTCTATC-AAGAGAAGCACACTTAAAAG  49

seq1  TGATTCAACTAAAATATTATAAAGGCAAATATGAAAATGTGCTTTGTCCT  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGATTCAACTAAAATATTATAAAGGCAAATATGAAAATGTG-TTTGTCCT  98

seq1  GCTTACAATGAACCATATAACTCCAACACAGTTATTTCCAAATTGTGTGT  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTACAATGAACCATATAACTCCAACACAGTTATTTCCAAATTGTGTGT  148

seq1  GGGATTCAATCTACATAAAAGCCCAAAGGACAAAGTTACTTGACAACATG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATTCAATCTACATAAAAGCCCAAAGGACAAAGTTACTTGACAACATG  198

seq1  CCCAGGAATTTTCCTCTTCTGTCTATGAAGCCCTCACTGGGTAGTTCCCA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGAATTTTCCTCTTCTGTCTATGAAGCCCTCACTGGGTAGTTCCCA  248

seq1  TTCCTGTCCAACTGGAAGCTCCCATATCATCATACATAAGCTCTACTAAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGTCCAACTGGAAGCTCCCATATCATCATACATAAGCTCTACTAAA  298

seq1  TTGGATATTTCCTCATGGTTTACAAATGAATTTCCTCTAGCCTGGTACTT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATATTTCCTCATGGTTTACAAATGAATTTCCTCTAGCCTGGTACTT  348

seq1  CAGCAACTCTAAATGAGAACGGTAATGATCTAAGTTAATGTTATACTTCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAACTCTAAATGAGAACGGTAATGATCTAAGTTAATGTTATACTTCA  398

seq1  GAAAGAATACACAGACAAAGTTATGCATTGTCATTCAAGGAATGGGGAAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAATACACAGACAAAGTTATGCATTGTCATTCAAGGAATGGGGAAT  448

seq1  CGATGCCTTGAAGGTACTAGGCTTTGCTCAAAGAAGTGTAGACAAGTCCT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATGCCTTGAAGGTACTAGGCTTTGCTCAAAGAAGTGTAGACAAGTCCT  498

seq1  GCCATAAATCATGTGTCTAAGTTCAAAATCTGACTTTTAATACATGCTAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATAAATCATGTGTCTAAGTTCAAAATCTGACTTTTAATACATGCTAT  548

seq1  TGATGTGGCCTGTAACTTTTCCCAAAAGAATTTTGCTTTAACAAAGTAGC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTGGCCTGTAACTTTTCCCAAAAGAATTTTGCTTTAACAAAGTAGC  598

seq1  TTGCCAAATCATATTCACTCCATATAAGTATAGTAAATGTTCCTTATTTT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCAAATCATATTCACTCCATATAAGTATAGTAAATGTTCCTTATTTT  648

seq1  AAAGTGAAACTCCTAATATCATGTGCTATAAACTTGTTTCAATCCAAGGC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGAAACTCCTAATATCATGTGCTATAAACTTGTTTCAATCCAAGGC  698

seq1  TCTTTTTCCAATCTTTTCCCCACTTCCCATTTAGATAATCCATCTCATTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTTCCAATCTTTTCCCCACTTCCCATTTAGATAATCCATCTCATTT  748

seq1  CCCCTTTTAACTTCTCCATGACATCTCAACAATAATTTCTCCCTACATTC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTTTAACTTCTCCATGACATCTCAACAATAATTTCTCCCTACATTC  798

seq1  ATACTCTACTATAGGACAACTAGTGTACTTTTAAGAAGAATACTCCCCAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTCTACTATAGGACAACTAGTGTACTTTTAAGAAGAATACTCCCCAC  848

seq1  TCCTCAGTAGAACCTTTCAGAAGACACAGAAATATCTATAGGTACTTTTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCAGTAGAACCTTTCAGAAGACACAGAAATATCTATAGGTACTTTTC  898

seq1  ATGAATTC  906
      ||||||||
seq2  ATGAATTC  906