BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-092A14
Chromosome19 (Build37)
Map Location 49,350,854 - 49,497,875
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneSorcs3, LOC100042896
Downstream geneLOC629448, Siah1-ps1, EG433251, Sorcs1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-092A14.bB6Ng01-092A14.g
ACCDH903907DH903908
length1,1981,092
definitionDH903907|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-092A14, 5' end.DH903908|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-092A14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(49,350,854 - 49,352,076)(49,496,781 - 49,497,875)
sequence
gaattctttcttaatgcaggatgtagtatttggcttcagtcaccttctct
gaactatacatagtcttgtgtgaaatgcctgccctcctcctatcctttca
gatataatggtgacagagacaatctctgtagtcagagtgacttggttcaa
atgctgtctttaccaattaatagctatgtgactttgaggaaatagatctc
tgtgtttaggtgttcacatctggaagcaagataatagaaaaacaatgaca
tctatggaatcagaggtttactgagaagattatacaaaatacttatgtag
actcttcaacaagatcttctttatagatttcaaaagagtttaatgtagtc
aagtcctttacagtggataggctttgtatgggaaataggctatatgtttt
tggaaaacctttggtcccttcttggaactttatggatcaagttagaagta
aaccatacataagacatggcatttctttctttaccatatactgaagagga
actgacccacatatcaatatgaaaaatagagaacagaagacctaaagtgc
tttaaattttggaacagaggcagcaatttggatgagcatcaaggaaagat
tcaagaaaagtcaatataggatcttggaactctcaactagggcagagctc
tgaattcgcatgaggtagtaatgcaaatagcaaagaacaagttgcctagt
agagtggaatagaagggaaaagagataaaggacatatatcctaaacccaa
gaaatgcatgcataaggaaaaagtgttagctttcattatggtacaccaac
cagagttttagcaattgaaatgaactgcttaacaacaagaagactataaa
gaccttctttctgctattaactttgtacaacttcatggtcaaactgaata
agtttctgatctcttgtttttcttatcattgtttccaatggacaatatct
ccctacttgctctagaatggagtctgatgagataaatactactctgagtg
tattgaatgaaaatgaatagacactagaggatggatctgatctttgatga
tgagaaagaagaacagatggtaccacagagagagggagtagtgcttcttg
gttaaaccagctcttgcaaacaatcacattgacaatgtgtcttaaattgg
tggctattgaaccttcactcctgttagaatagagaccaataggaacag
gaattctctcaggagaggaaacaaggcaggaaggtaataaaggcttccta
gtaagctgcagaatggaacagctgcaagatctattcacctccatgtaaac
agctcaccaaggaggaggttttcagtgaagccattggggtgaaagccctg
aaaaatgccccagtcttttcctgctgggtttatgaaccgccttggcagcc
taacagcagcacattatatgaaattgctggtttactctaccttgtctgct
tttattttcacaaggaatccttgttattcagtggaattagcaaaggaatt
cattaagtgccggctacaaagactgcacagtatttattccagtaataaaa
aagtctaattttgcaataacatggcaatctttgggaagagctggctgatg
gaataagttagtttggtaaaatttgactcttttggtccttatgattatgg
tgcttgtgagaagcagacagagaggggacttgcttgccagctaagcactt
ttacacaacaaaacaaattctcttccacagaatcctcctgtaataaaaac
aaaataggggaaaatgttgtctagctcagacagcagaaacagcaagcaaa
ctcactcttaattaatgtggactgaggctaatggtgttcagaatcaggga
tgtgtccttggcaaaaatatatatctgggtagtttgccacctggtcctgt
tcttctcttccagatccatccacaggtatctggtaccatccgcacagcac
caggggcctcacagcatccttacgatccagtgaaaagcaaccttctgtta
gcaatgcatggaacatcaggccttcaaataattggagaactcagattctt
tctagatagcaggaggtatgagagtttttaaagacaaagcactcgtgcct
gtgccttacctcatgtctcttggctgcctcctgctcttcctttgcacagt
ttcatcaaattaacatcttcacatcactgtttgttcatagcatagtgttc
cagcaagctctttagcacattaaggtgagctgttatattcagaatcgttt
cggaggtgttaatttctactggtgtttattgattaggacagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_49350854_49352076
seq2: B6Ng01-092A14.b_47_1244

seq1  GAATTCTTTCTTAATGCAGGATGTAGTATTTGGCTTCAGTCACCTTCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCTTAATGCAGGATGTAGTATTTGGCTTCAGTCACCTTCTCT  50

seq1  GAACTATACATAGTCTTGTGTGAAATGCCTGCCCTCCTCCTATCCTTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTATACATAGTCTTGTGTGAAATGCCTGCCCTCCTCCTATCCTTTCA  100

seq1  GATATAATGGTGACAGAGACAATCTCTGTAGTCAGAGTGACTTGGTTCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATAATGGTGACAGAGACAATCTCTGTAGTCAGAGTGACTTGGTTCAA  150

seq1  ATGCTGTCTTTACCAATTAATAGCTATGTGACTTTGAGGAAATAGATCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGTCTTTACCAATTAATAGCTATGTGACTTTGAGGAAATAGATCTC  200

seq1  TGTGTTTAGGTGTTCACATCTGGAAGCAAGATAATAGAAAAACAATGACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTTAGGTGTTCACATCTGGAAGCAAGATAATAGAAAAACAATGACA  250

seq1  TCTATGGAATCAGAGGTTTACTGAGAAGATTATACAAAATACTTATGTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGGAATCAGAGGTTTACTGAGAAGATTATACAAAATACTTATGTAG  300

seq1  ACTCTTCAACAAGATCTTCTTTATAGATTTCAAAAGAGTTTAATGTAGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTCAACAAGATCTTCTTTATAGATTTCAAAAGAGTTTAATGTAGTC  350

seq1  AAGTCCTTTACAGTGGATAGGCTTTGTATGGGAAATAGGCTATATGTTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCTTTACAGTGGATAGGCTTTGTATGGGAAATAGGCTATATGTTTT  400

seq1  TGGAAAACCTTTGGTCCCTTCTTGGAACTTTATGGATCAAGTTAGAAGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAACCTTTGGTCCCTTCTTGGAACTTTATGGATCAAGTTAGAAGTA  450

seq1  AACCATACATAAGACATGGCATTTCTTTCTTTACCATATACTGAAGAGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATACATAAGACATGGCATTTCTTTCTTTACCATATACTGAAGAGGA  500

seq1  ACTGACCCACATATCAATATGAAAAATAGAGAACAGAAGACCTAAAGTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGACCCACATATCAATATGAAAAATAGAGAACAGAAGACCTAAAGTGC  550

seq1  TTTAAATTTTGGAACAGAGGCAGCAATTTGGATGAGCATCAAGGAAAGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATTTTGGAACAGAGGCAGCAATTTGGATGAGCATCAAGGAAAGAT  600

seq1  TCAAGAAAAGTCAATATAGGATCTTGGAACTCTCAACTAGGGCAGAGCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGAAAAGTCAATATAGGATCTTGGAACTCTCAACTAGGGCAGAGCTC  650

seq1  TGAATTCGCATGAGGTAGTAATGCAAATAGCAAAGAACAAGTTGCCTAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTCGCATGAGGTAGTAATGCAAATAGCAAAGAACAAGTTGCCTAGT  700

seq1  AGAGTGGAATAGAAGGGAAAAGAGATAAAGGACATATATCCTAAACCCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGGAATAGAAGGGAAAAGAGATAAAGGACATATATCCTAAACCCAA  750

seq1  GAAATGCATGCATAAGGAAAAAGTGTTAGCTTTCATTATGGTACACCAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGCATGCATAAGGAAAAAGTGTTAGCTTTCATTATGGTACACCAAC  800

seq1  CAGAGTTTTAGCAATTGAAATGAACTGCTTAACAACAAGAAGACTATAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTTTTAGCAATTGAAATGAACTGCTTAACAACAAGAAGACTATAAA  850

seq1  GACCTTCTTTCTGCTATTAACTTTGTACAACTTCATGGTCAAACTGAATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTCTTTCTGCTATTAACTTTGTACAACTTCATGGTCAAACTGAATA  900

seq1  AGTTTCTGATCTCTTGTTTTTCTTATCATTGTTTCCAATGGACAATTATC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AGTTTCTGATCTCTTGTTTTTCTTATCATTGTTTCCAATGGACAA-TATC  949

seq1  TCCCTACTTGCTCTAGAATGGAGTCTGAATGAAGAATAAAATACTACTCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||
seq2  TCCCTACTTGCTCTAGAATGGAGTCTG-ATG-AGA--TAAATACTACTCT  995

seq1  GAAGGTGTATTGAATGAAAAATGAATAGACAACTAGAGGATGGATCTGAA  1050
      ||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
seq2  GA--GTGTATTGAATG-AAAATGAATAGAC-ACTAGAGGATGGATCTG-A  1040

seq1  TCTTTGATGATGAGAAAG-AGAACAGAATGGTACCACAGAGA-AGGGAGT  1098
      |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||
seq2  TCTTTGATGATGAGAAAGAAGAACAG-ATGGTACCACAGAGAGAGGGAGT  1089

seq1  AGATGCTTCTTGTGTAAACCAGCCTCTGCAAAAACATCACATGAACAAAT  1148
      || |||||||||  |||||||||   |||||| | |||||||  ||||  
seq2  AG-TGCTTCTTGGTTAAACCAGCTCTTGCAAACA-ATCACATTGACAA--  1135

seq1  TGTGTCCTTTAAAATTGTGTGCTAATTGAAAATCTTCACTCCTTGTTAAG  1198
      ||||||  ||||| | ||| ||| ||||  || ||||||||| |||| ||
seq2  TGTGTC--TTAAATTGGTG-GCT-ATTG--AACCTTCACTCC-TGTT-AG  1177

seq1  AATAGAAGGCACCAATTAGGAACAG  1223
      ||||||    ||||| |||||||||
seq2  AATAGA---GACCAA-TAGGAACAG  1198

seq1: chr19_49496781_49497875
seq2: B6Ng01-092A14.g_68_1159 (reverse)

seq1  GCTGTCCTAATCAATAAACACCAGT-GAGATTTACACTTCCGAAACGATT  49
      ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||
seq2  GCTGTCCTAATCAATAAACACCAGTAGAAATTAACACCTCCGAAACGATT  50

seq1  CTGAATAT-ACAGCTCAACTTTAATGTGCTATAGAGCTTGCTGGGAACAC  98
      |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||
seq2  CTGAATATAACAGCTC-ACCTTAATGTGCTAAAGAGCTTGCT-GGAACAC  98

seq1  TATGCTATGAACAAACAGTGATGTGAAGATGTTAATTTGATGAAACTGTG  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTATGAACAAACAGTGATGTGAAGATGTTAATTTGATGAAACTGTG  148

seq1  CAAAAGGAAGAGCAGGAGGCAGCCAAGAGACATGAGGTAAGGCACAGGCA  198
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C-AAAGGAAGAGCAGGAGGCAGCCAAGAGACATGAGGTAAGGCACAGGCA  197

seq1  CGAGTGCTTTGTCTTTAAAAACTCTCATAACCTCCCTGCTATCTAGAAAG  248
      |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
seq2  CGAGTGCTTTGTCTTTAAAAACTCTCAT-ACCT-CCTGCTATCTAGAAAG  245

seq1  AATCTGAGTTCTCCAATTATTTGAAGGCCTGATGTTCCATGCATTGCTAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGAGTTCTCCAATTATTTGAAGGCCTGATGTTCCATGCATTGCTAA  295

seq1  CAGAAGGTTGCTTTTCACTGGATCGTAAGGATGCTGTGAGGCCCCTGGTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGGTTGCTTTTCACTGGATCGTAAGGATGCTGTGAGGCCCCTGGTG  345

seq1  CTGTGCGGATGGTACCAGATACCTGTGGATGGATCTGGAAGAGAAGAACA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCGGATGGTACCAGATACCTGTGGATGGATCTGGAAGAGAAGAACA  395

seq1  GGACCAGGTGGCAAACTACCCAGATATATATTTTTGCCAAGGACACATCC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCAGGTGGCAAACTACCCAGATATATATTTTTGCCAAGGACACATCC  445

seq1  CTGATTCTGAACACCATTAGCCTCAGTCCACATTAATTAAGAGTGAGTTT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTCTGAACACCATTAGCCTCAGTCCACATTAATTAAGAGTGAGTTT  495

seq1  GCTTGCTGTTTCTGCTGTCTGAGCTAGACAACATTTTCCCCTATTTTGTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCTGTTTCTGCTGTCTGAGCTAGACAACATTTTCCCCTATTTTGTT  545

seq1  TTTATTACAGGAGGATTCTGTGGAAGAGAATTTGTTTTGTTGTGTAAAAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTACAGGAGGATTCTGTGGAAGAGAATTTGTTTTGTTGTGTAAAAG  595

seq1  TGCTTAGCTGGCAAGCAAGTCCCCTCTCTGTCTGCTTCTCACAAGCACCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTAGCTGGCAAGCAAGTCCCCTCTCTGTCTGCTTCTCACAAGCACCA  645

seq1  TAATCATAAGGACCAAAAGAGTCAAATTTTACCAAACTAACTTATTCCAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCATAAGGACCAAAAGAGTCAAATTTTACCAAACTAACTTATTCCAT  695

seq1  CAGCCAGCTCTTCCCAAAGATTGCCATGTTATTGCAAAATTAGACTTTTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGCTCTTCCCAAAGATTGCCATGTTATTGCAAAATTAGACTTTTT  745

seq1  TATTACTGGAATAAATACTGTGCAGTCTTTGTAGCCGGCACTTAATGAAT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACTGGAATAAATACTGTGCAGTCTTTGTAGCCGGCACTTAATGAAT  795

seq1  TCCTTTGCTAATTCCACTGAATAACAAGGATTCCTTGTGAAAATAAAAGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTGCTAATTCCACTGAATAACAAGGATTCCTTGTGAAAATAAAAGC  845

seq1  AGACAAGGTAGAGTAAACCAGCAATTTCATATAATGTGCTGCTGTTAGGC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAGGTAGAGTAAACCAGCAATTTCATATAATGTGCTGCTGTTAGGC  895

seq1  TGCCAAGGCGGTTCATAAACCCAGCAGGAAAAGACTGGGGCATTTTTCAG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAAGGCGGTTCATAAACCCAGCAGGAAAAGACTGGGGCATTTTTCAG  945

seq1  GGCTTTCACCCCAATGGCTTCACTGAAAACCTCCTCCTTGGTGAGCTGTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTCACCCCAATGGCTTCACTGAAAACCTCCTCCTTGGTGAGCTGTT  995

seq1  TACATGGAGGTGAATAGATCTTGCAGCTGTTCCATTCTGCAGCTTACTAG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGGAGGTGAATAGATCTTGCAGCTGTTCCATTCTGCAGCTTACTAG  1045

seq1  GAAGCCTTTATTACCTTCCTGCCTTGTTTCCTCTCCTGAGAGAATTC  1095
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCCTTTATTACCTTCCTGCCTTGTTTCCTCTCCTGAGAGAATTC  1092