BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-138G19
Chromosome19 (Build37)
Map Location 48,342,477 - 48,479,774
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSorcs3
Upstream geneSh3pxd2a, Obfc1, Slk, Col17a1, 6330577E15Rik, D19Ertd652e, LOC677174, Gsto1, Gsto2, BC063749, Gm969, LOC670576
Downstream geneLOC100042896
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-138G19.bB6Ng01-138G19.g
ACCDH937689DH937690
length1,021692
definitionDH937689|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-138G19, 5' end.DH937690|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-138G19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(48,478,753 - 48,479,774)(48,342,477 - 48,343,168)
sequence
gaattccaccaaggaattgggtgagcagctgcagaaggaaggaagcatat
aaataaatcatgagtgtcattaaaatttgtaaactaataacttctgggaa
gtcttagcaatcatcgtcagggttttcttggcaaacagaaaattaataaa
tccaaaaggtctccattttatatttaaaaagcagcatccctgagaaaggt
cactgacagaacaattagagaggaaataaatggttcagacaactgcttgc
gaagcagatgaaaaggcacggattcccaagaggcaagagaatgagacaac
tcaatacatagaagggggcagtgaggaggggttggggtgaggcttggctc
gaggctcctggaagctccacttgtgaatctctaagcctttataagatgca
atttaaatacgtatgcatggaaaacccagaaacacctaaggcacgtggtc
caggatcagagaagctcatagtctgaggatagcatcagtgaaggataaca
gtgcaaggctgagcatgaacagagaggggtcaacccaggcagcaatatcc
aggtctccagcaggatgtgcctggtaggtaagcaggctccttccataagc
ttcctaaccgggaatcctcacgctgtcccaggtactcagaaggcagactc
tcaggaggaaagcccgtactctaagagcttttctatgaagagaatggctc
ccattctgcaagggagtagttgaaataaagctagagagaagatgaagatc
aaatgtccatcaaatgtttatgggatatttatttattcattcattcatta
tttcttggatctttttatgcctagataactacaagttcatgtatctctga
gaacccctaacatgatacccagaagaaagcttttatggacaaaccacaat
tgtggtgaccccaggcttttggagatctcacatgtatgagaacctcactc
atgcctgtatgtttatctgaggctaaacgctcagggacctttgtcaaaaa
ctacattaaggatggacaaat
gaattctactgtgtaacttgcatttcctcccatttgttttcataggacac
cactttaggcatttatatacataatatacatatacatatatatatataca
cacacacatgtatatatatacatacatacatatatatatatatatacata
cacacacatatgtatatatatacatacatacatatatatatacatacaca
catatgtatatatatatacatacatatatatatacatacacacatatgta
tatatatatacacatacatatatatatatatacatatatatatatatata
tacacatgcacatattatttgcttacttctttctttttaagccctgtgtg
cactattccactgaacagctaaggtttatttacaatcacctgcactgcat
tgctcacagtagttgagatacgagctgacacgcgccctggtgggcgaatg
gatgtagaagctgtggtccatgcatgcaatgaaatattttttcagttata
aaataaaagaaacatccaagttgttgcaaaatgggtggaactggaggact
tgccactaaattaagtaagccaaactgaataataaatgctctgtgaatct
taaaatgctgaactcacaggatagcagaacggtggctgccagggcagagt
tgggaagaacaacgaggagggtcgggatgggggtgggggatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_48478753_48479774
seq2: B6Ng01-138G19.b_51_1071 (reverse)

seq1  ATTTGTCCATCCTTAGTGTAGTCTCTGACAAAGGTCCCTGAGCGTTTAGC  50
      ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTCCATCCTTAATGTAGTTTTTGACAAAGGTCCCTGAGCGTTTAGC  50

seq1  CTCAGATATACATACAGGCATGAGTGAGGTTCTCATACATGTGAGATCTC  100
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGATAAACATACAGGCATGAGTGAGGTTCTCATACATGTGAGATCTC  100

seq1  CAAAAGCCTGGGGTCACCACAATTGTGGTTTGTCCATAGAAGCTTTCTTC  150
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CAAAAGCCTGGGGTCACCACAATTGTGGTTTGTCCATAAAAGCTTTCTTC  150

seq1  TGGGTATCATGTTAGGGGTTCTCAGAGATTACATGAACTTGTAGTTATCT  200
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTATCATGTTAGGGGTTCTCAGAGA-TACATGAACTTGTAGTTATCT  199

seq1  AGGCATAAAAAGATCCAAGAAATAATGAATGAATGAATAAATAAATATCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATAAAAAGATCCAAGAAATAATGAATGAATGAATAAATAAATATCC  249

seq1  CATAAACATTTGATGGACATTTGATCTTCATCTTCTCTCTAGCTTTATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAACATTTGATGGACATTTGATCTTCATCTTCTCTCTAGCTTTATTT  299

seq1  CAACTACTCCCTTGCAGAATGGGAGCCATTCTCTTCATAGAAAAGCTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTACTCCCTTGCAGAATGGGAGCCATTCTCTTCATAGAAAAGCTCTT  349

seq1  AGAGTACGGGCTTTCCTCCTGAGAGTCTGCCTTCTGAGTACCTGGGACAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTACGGGCTTTCCTCCTGAGAGTCTGCCTTCTGAGTACCTGGGACAG  399

seq1  CGTGAGGATTCCCGGTTAGGAAGCTTATGGAAGGAGCCTGCTTACCTACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGAGGATTCCCGGTTAGGAAGCTTATGGAAGGAGCCTGCTTACCTACC  449

seq1  AGGCACATCCTGCTGGAGACCTGGATATTGCTGCCTGGGTTGACCCCTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACATCCTGCTGGAGACCTGGATATTGCTGCCTGGGTTGACCCCTCT  499

seq1  CTGTTCATGCTCAGCCTTGCACTGTTATCCTTCACTGATGCTATCCTCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCATGCTCAGCCTTGCACTGTTATCCTTCACTGATGCTATCCTCAG  549

seq1  ACTATGAGCTTCTCTGATCCTGGACCACGTGCCTTAGGTGTTTCTGGGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGAGCTTCTCTGATCCTGGACCACGTGCCTTAGGTGTTTCTGGGTT  599

seq1  TTCCATGCATACGTATTTAAATTGCATCTTATAAAGGCTTAGAGATTCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATGCATACGTATTTAAATTGCATCTTATAAAGGCTTAGAGATTCAC  649

seq1  AAGTGGAGCTTCCAGGAGCCTCGAGCCAAGCCTCACCCCAACCCCTCCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGAGCTTCCAGGAGCCTCGAGCCAAGCCTCACCCCAACCCCTCCTC  699

seq1  ACTGCCCCCTTCTATGTATTGAGTTGTCTCATTCTCTTGCCTCTTGGGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCCCCTTCTATGTATTGAGTTGTCTCATTCTCTTGCCTCTTGGGAA  749

seq1  TCCGTGCCTTTTCATCTGCTTCGCAAGCAGTTGTCTGAACCATTTATTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGTGCCTTTTCATCTGCTTCGCAAGCAGTTGTCTGAACCATTTATTTC  799

seq1  CTCTCTAATTGTTCTGTCAGTGACCTTTCTCAGGGATGCTGCTTTTTAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTAATTGTTCTGTCAGTGACCTTTCTCAGGGATGCTGCTTTTTAAA  849

seq1  TATAAAATGGAGACCTTTTGGATTTATTAATTTTCTGTTTGCCAAGAAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAATGGAGACCTTTTGGATTTATTAATTTTCTGTTTGCCAAGAAAA  899

seq1  CCCTGACGATGATTGCTAAGACTTCCCAGAAGTTATTAGTTTACAAATTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGACGATGATTGCTAAGACTTCCCAGAAGTTATTAGTTTACAAATTT  949

seq1  TAATGACACTCATGATTTATTTATATGCTTCCTTCCTTCTGCAGCTGCTC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGACACTCATGATTTATTTATATGCTTCCTTCCTTCTGCAGCTGCTC  999

seq1  ACCCAATTCCTTGGTGGAATTC  1022
      ||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAATTCCTTGGTGGAATTC  1021

seq1: chr19_48342477_48343168
seq2: B6Ng01-138G19.g_67_758

seq1  GAATTCTACTGTGTAACTTGCATTTCCTCCCATTTGTTTTCATAGGACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACTGTGTAACTTGCATTTCCTCCCATTTGTTTTCATAGGACAC  50

seq1  CACTTTAGGCATTTATATACATAATATACATATACATATATATATATACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTAGGCATTTATATACATAATATACATATACATATATATATATACA  100

seq1  CACACACATGTATATATATACATACATACATATATATATATATATACATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACATGTATATATATACATACATACATATATATATATATATACATA  150

seq1  CACACACATATGTATATATATACATACATACATATATATATACATACACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACATATGTATATATATACATACATACATATATATATACATACACA  200

seq1  CATATGTATATATATATACATACATATATATATACATACACACATATGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGTATATATATATACATACATATATATATACATACACACATATGTA  250

seq1  TATATATATACACATACATATATATATATATACATATATATATATATATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATACACATACATATATATATATATACATATATATATATATATA  300

seq1  TACACATGCACATATTATTTGCTTACTTCTTTCTTTTTAAGCCCTGTGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACATGCACATATTATTTGCTTACTTCTTTCTTTTTAAGCCCTGTGTG  350

seq1  CACTATTCCACTGAACAGCTAAGGTTTATTTACAATCACCTGCACTGCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATTCCACTGAACAGCTAAGGTTTATTTACAATCACCTGCACTGCAT  400

seq1  TGCTCACAGTAGTTGAGATACGAGCTGACACGCGCCCTGGTGGGCGAATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCACAGTAGTTGAGATACGAGCTGACACGCGCCCTGGTGGGCGAATG  450

seq1  GATGTAGAAGCTGTGGTCCATGCATGCAATGAAATATTTTTTCAGTTATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTAGAAGCTGTGGTCCATGCATGCAATGAAATATTTTTTCAGTTATA  500

seq1  AAATAAAAGAAACATCCAAGTTGTTGCAAAATGGGTGGAACTGGAGGACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAAGAAACATCCAAGTTGTTGCAAAATGGGTGGAACTGGAGGACT  550

seq1  TGCCACTAAATTAAGTAAGCCAAACTGAATAATAAATGCTCTGTGAATCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACTAAATTAAGTAAGCCAAACTGAATAATAAATGCTCTGTGAATCT  600

seq1  TAAAATGCTGAACTCACAGGATAGCAGAACGGTGGCTGCCAGGGCAGAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGCTGAACTCACAGGATAGCAGAACGGTGGCTGCCAGGGCAGAGT  650

seq1  TGGGAAGAACAACGAGGAGGGTCGGGATGGGGGTGGGGGATG  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAGAACAACGAGGAGGGTCGGGATGGGGGTGGGGGATG  692