BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155F14
Chromosome19 (Build37)
Map Location 49,493,217 - 49,616,047
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneSorcs3, LOC100042896
Downstream geneLOC629448, Siah1-ps1, EG433251, Sorcs1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155F14.bB6Ng01-155F14.g
ACCDH950157DH950158
length1,0661,170
definitionDH950157|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155F14, 5' end.DH950158|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155F14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(49,493,217 - 49,494,296)(49,614,863 - 49,616,047)
sequence
gaattctcctcaaaatgcttttcagttcaaatttattcaacaataaatgc
ctaggataattactccctggttggaattaatttcattcaactaacattta
ctttatgcttagagtaggcttaaataagtttcttgtttaaagtaaattca
aaggcacagcatttaaattaatttttcctaggttctgcaagcccacagta
gagggttaatgctaccacaagtgttatgatggattgtcaacagagatcct
gtaactgtgtgtctgaaaaatgaatgaaaggaagacatacgagcttcgcc
tgttttgttacatatgcccattatcagatgcagaaccacaaatttcgaat
ttttggaagaatcaatcctagtatcgaagtctctcctttctttctctgtt
ctatccttccaatgttatgcattgaacgcatcagactatgtatgtcttac
atgtttcccttataattatgcagctttaacctttacacatgcatgcttct
atgtgggagtggtaagacagctaaactgcactgccattacagaacaaata
tagtaaacagagcagcacaatgacttaaacactttacattttctcaaatg
gcttttctgttgtgcttacatcagaacaagtgcccagaacagattgcaga
tacccttgttggccacagttgcctttcttccttgcttaaggaagctgaga
tttctaaatctcatcggcaagggtttgtatagcaggacttcctcttttta
taaatgaatagccataagacatttatttgatcagtgagcacttctaaact
gaataaatataacaaccaaagaagctatccctttcatgtgtgtttggtgc
atgtagaagtcacatgacaagatttgctatcaactctaggagctttccac
tttacttttccaaacagggcctccttcagtctccaactcactgggttgac
taggctagccaggccgctgccctgtgtctgcttgtcatgctggcatacac
cctacttttacatgagtctgtgatagtgtttagtcctcactatgcaagca
tgctttacaaagtttt
gaattctttaattcccatctagctagagaaatgaaaactcactgctacca
actgttaagacacagaggtccattggagtatcttcttttctaagtacttc
acggaaccattttgggtagaccaatgggcaggtgctgtcattggggacca
ctgatattttccgtgttgtgaggcaccaaatttactttgttcttcaaaca
tgcaatcaacagtatgggaataggtttacataggaattgattagagaaag
gcaaatgaaaccgcaattaaattgaatcaattggctctacctcatccatt
gtcgttcactcctcacagctagagtcttcagagattaagtatagggcaca
gaaaccatttccttgccctgcttaaagaagagcttcagaaatgagtatta
tggtgtctttgagtaaactgcaccacagaagcagtgtaaacatggctaca
tatgggaatgtcaaccatactacagaaaagatcttcagctctacacatta
cagggtcacatgacactgatcaggaaaggttgaacatagcagaatatgtc
taattcctgaaatcatagagtgagtacctttttatattccattttaaaca
ctgttaatttcaagccagatactagataccctgtacttgtggaagcaaaa
taagtttgtaactacactaaatgagacaagggtatcagtctctctatcag
attgaataagaaaaaaatgatttttaagtattggaaggctctcttaatag
ataagagctgggtgactcagtctacgttttcctactataatagaatctca
caggctgtcttatttataaagaaaataaacaggtttctcacagttttgag
agctaagaagtcctttgtcgaattttcaggctccaaacccttttcagatg
ctatgagagaggacatcagtaaggatagaatgagatgaccttgttctagt
ttctctttgactatatacacactaatctatcatagaggttctatactcat
ttaacttctaagtacttccagaggtcccacctcaggtgcatcatatgagt
tttagagtaagtttctagttcatgaattgtgggaatttactgaaggacgg
ataggaaatcaggacgtatattctaatttcggtaacctacagctcccagc
ttccggaactcctattctat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_49493217_49494296
seq2: B6Ng01-155F14.b_45_1110

seq1  GAATTCTCCTCAAAATGCTTTTCAGTTCAAATTTATTCAACAATAAATGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTCAAAATGCTTTTCAGTTCAAATTTATTCAACAATAAATGC  50

seq1  CTAGGATAATTACTCCCTGGTTGGAATTAATTTCATTCAACTAACATTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGATAATTACTCCCTGGTTGGAATTAATTTCATTCAACTAACATTTA  100

seq1  CTTTATGCTTAGAGTAGGCTTAAATAAGTTTCTTGTTTAAAGTAAATTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATGCTTAGAGTAGGCTTAAATAAGTTTCTTGTTTAAAGTAAATTCA  150

seq1  AAGGCACAGCATTTAAATTAATTTTTCCTAGGTTCTGCAAGCCCACAGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCACAGCATTTAAATTAATTTTTCCTAGGTTCTGCAAGCCCACAGTA  200

seq1  GAGGGTTAATGCTACCACAAGTGTTATGATGGATTGTCAACAGAGATCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGTTAATGCTACCACAAGTGTTATGATGGATTGTCAACAGAGATCCT  250

seq1  GTAACTGTGTGTCTGAAAAATGAATGAAAGGAAGACATACGAGCTTCGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTGTGTGTCTGAAAAATGAATGAAAGGAAGACATACGAGCTTCGCC  300

seq1  TGTTTTGTTACATATGCCCATTATCAGATGCAGAACCACAAATTTCGAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTGTTACATATGCCCATTATCAGATGCAGAACCACAAATTTCGAAT  350

seq1  TTTTGGAAGAATCAATCCTAGTATCGAAGTCTCTCCTTTCTTTCTCTGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGAAGAATCAATCCTAGTATCGAAGTCTCTCCTTTCTTTCTCTGTT  400

seq1  CTATCCTTCCAATGTTATGCATTGAACGCATCAGACTATGTATGTCTTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCCTTCCAATGTTATGCATTGAACGCATCAGACTATGTATGTCTTAC  450

seq1  ATGTTTCCCTTATAATTATGCAGCTTTAACCTTTACACATGCATGCTTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTCCCTTATAATTATGCAGCTTTAACCTTTACACATGCATGCTTCT  500

seq1  ATGTGGGAGTGGTAAGACAGCTAAACTGCACTGCCATTACAGAACAAATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGGAGTGGTAAGACAGCTAAACTGCACTGCCATTACAGAACAAATA  550

seq1  TAGTAAACAGAGCAGCACAATGACTTAAACACTTTACATTTTCTCAAATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAAACAGAGCAGCACAATGACTTAAACACTTTACATTTTCTCAAATG  600

seq1  GCTTTTCTGTTGTGCTTACATCAGAACAAGTGCCCAGAACAGATTGCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTCTGTTGTGCTTACATCAGAACAAGTGCCCAGAACAGATTGCAGA  650

seq1  TACCCTTGTTGGCCACAGTTGCCTTTCTTCCTTGCTTAAGGAAGCTGAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCTTGTTGGCCACAGTTGCCTTTCTTCCTTGCTTAAGGAAGCTGAGA  700

seq1  TTTCTAAATCTCATCGGCAAGGGTTTGTATAGCAGGACTTCCTCTTTTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTAAATCTCATCGGCAAGGGTTTGTATAGCAGGACTTCCTCTTTTTA  750

seq1  TAAATGAATAGCCATAAGACATTTATTTGATCAGTGAGCACTTCTAAACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGAATAGCCATAAGACATTTATTTGATCAGTGAGCACTTCTAAACT  800

seq1  GAATAAATATAACAACCAAAGAAGCTATCCCTTTCATGTGTGTTTGGTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAATATAACAACCAAAGAAGCTATCCCTTTCATGTGTGTTTGGTGC  850

seq1  ATGTAGAAGTCACATGACAAGATTTGCTATCAACTCTAGGAGCTTTCCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGAAGTCACATGACAAGATTTGCTATCAACTCTAGGAGCTTTCCAC  900

seq1  TTTACTTTTCCAAACAGGGCCTCCTTCAGGTCTCCAACTCACTGGGTTGA  950
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTTTCCAAACAGGGCCTCCTTCA-GTCTCCAACTCACTGGGTTGA  949

seq1  CTAGGCTAGCCAGGCCGCCTGCCCTGTGTCTGCTTGTCAATGGCTGGCAT  1000
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||
seq2  CTAGGCTAGCCAGGCCG-CTGCCCTGTGTCTGCTTGTCA--TGCTGGCAT  996

seq1  ACACCCTACCTTTTTACATGAGTTCTGGTGAATAGTGTTTAAGTCCTCAC  1050
      |||||||||  ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||
seq2  ACACCCTAC--TTTTACATGAG-TCT-GTG-ATAGTGTTT-AGTCCTCAC  1040

seq1  TATTGCAAAGCAATGCTTTACAAAAGTTTT  1080
      || ||| |||| ||||||||| ||||||||
seq2  TA-TGC-AAGC-ATGCTTTAC-AAAGTTTT  1066

seq1: chr19_49614863_49616047
seq2: B6Ng01-155F14.g_67_1236 (reverse)

seq1  ATAGAATAGGGAAGTT-CGGGAGCTGGGAGCTGCTGAGTAAACGGAATTA  49
      ||||||||||  |||| ||| |||||||||||| |  || | || |||||
seq2  ATAGAATAGG--AGTTCCGGAAGCTGGGAGCTG-TAGGTTACCGAAATTA  47

seq1  GAATATACGTTCCTGATTTCTAATACAGTCTTTCAAGTACATTCCCACAA  99
      ||||||||| ||||||||||  || | ||| ||| |||| |||||||| |
seq2  GAATATACG-TCCTGATTTCCTAT-CCGTCCTTC-AGTAAATTCCCAC-A  93

seq1  AGTCATGAACTAGAAACTTACTCCTAAAACTCATATTGATGGCACCTGGA  149
      | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||
seq2  ATTCATGAACTAGAAACTTACT-CTAAAACTCATA-TGAT-GCACCT-GA  139

seq1  GGTGGGGCCTCTGGGAGGTACTTAG-AGTTAAATGAGGTATAGAACCTCT  198
      |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||
seq2  GGTGGGACCTCT-GGAAGTACTTAGAAGTTAAATGA-GTATAGAACCTCT  187

seq1  ATGATAAGATTAGTGGTGTTATATAAGTCAAAGAGAAACTAGAACAAGGT  248
      ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAT-AGATTAGT-GTG-TATAT-AGTCAAAGAGAAACTAGAACAAGGT  233

seq1  CATCTCATTCTATCCTTACTGATGTCCTCTCTCATAGCATCTGAAAAGGG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCATTCTATCCTTACTGATGTCCTCTCTCATAGCATCTGAAAAGGG  283

seq1  TTTGGAGCCTGAAAATTCGACAAAGGACTTCTTAGCTCTCAAAACTGTGA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAGCCTGAAAATTCGACAAAGGACTTCTTAGCTCTCAAAACTGTGA  333

seq1  GAAACCTGTTTATTTTCTTTATAAATAAGACAGCCTGTGAGATTCTATTA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCTGTTTATTTTCTTTATAAATAAGACAGCCTGTGAGATTCTATTA  383

seq1  TAGTAGGAAAACGTAGACTGAGTCACCCAGCTCTTATCTATTAAGAGAGC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAGGAAAACGTAGACTGAGTCACCCAGCTCTTATCTATTAAGAGAGC  433

seq1  CTTCCAATACTTAAAAATCATTTTTTTCTTATTCAATCTGATAGAGAGAC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAATACTTAAAAATCATTTTTTTCTTATTCAATCTGATAGAGAGAC  483

seq1  TGATACCCTTGTCTCATTTAGTGTAGTTACAAACTTATTTTGCTTCCACA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATACCCTTGTCTCATTTAGTGTAGTTACAAACTTATTTTGCTTCCACA  533

seq1  AGTACAGGGTATCTAGTATCTGGCTTGAAATTAACAGTGTTTAAAATGGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACAGGGTATCTAGTATCTGGCTTGAAATTAACAGTGTTTAAAATGGA  583

seq1  ATATAAAAAGGTACTCACTCTATGATTTCAGGAATTAGACATATTCTGCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAAAAGGTACTCACTCTATGATTTCAGGAATTAGACATATTCTGCT  633

seq1  ATGTTCAACCTTTCCTGATCAGTGTCATGTGACCCTGTAATGTGTAGAGC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCAACCTTTCCTGATCAGTGTCATGTGACCCTGTAATGTGTAGAGC  683

seq1  TGAAGATCTTTTCTGTAGTATGGTTGACATTCCCATATGTAGCCATGTTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGATCTTTTCTGTAGTATGGTTGACATTCCCATATGTAGCCATGTTT  733

seq1  ACACTGCTTCTGTGGTGCAGTTTACTCAAAGACACCATAATACTCATTTC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGCTTCTGTGGTGCAGTTTACTCAAAGACACCATAATACTCATTTC  783

seq1  TGAAGCTCTTCTTTAAGCAGGGCAAGGAAATGGTTTCTGTGCCCTATACT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCTCTTCTTTAAGCAGGGCAAGGAAATGGTTTCTGTGCCCTATACT  833

seq1  TAATCTCTGAAGACTCTAGCTGTGAGGAGTGAACGACAATGGATGAGGTA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCTCTGAAGACTCTAGCTGTGAGGAGTGAACGACAATGGATGAGGTA  883

seq1  GAGCCAATTGATTCAATTTAATTGCGGTTTCATTTGCCTTTCTCTAATCA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAATTGATTCAATTTAATTGCGGTTTCATTTGCCTTTCTCTAATCA  933

seq1  ATTCCTATGTAAACCTATTCCCATACTGTTGATTGCATGTTTGAAGAACA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTATGTAAACCTATTCCCATACTGTTGATTGCATGTTTGAAGAACA  983

seq1  AAGTAAATTTGGTGCCTCACAACACGGAAAATATCAGTGGTCCCCAATGA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAAATTTGGTGCCTCACAACACGGAAAATATCAGTGGTCCCCAATGA  1033

seq1  CAGCACCTGCCCATTGGTCTACCCAAAATGGTTCCGTGAAGTACTTAGAA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACCTGCCCATTGGTCTACCCAAAATGGTTCCGTGAAGTACTTAGAA  1083

seq1  AAGAAGATACTCCAATGGACCTCTGTGTCTTAACAGTTGGTAGCAGTGAG  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGATACTCCAATGGACCTCTGTGTCTTAACAGTTGGTAGCAGTGAG  1133

seq1  TTTTCATTTCTCTAGCTAGATGGGAATTAAAGAATTC  1185
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCATTTCTCTAGCTAGATGGGAATTAAAGAATTC  1170