BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-184B05
Chromosome19 (Build37)
Map Location 10,232,465 - 10,429,205
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040227, Fads1, Fen1, 1810006K21Rik, Gm98, Dagla
Upstream geneEG621699, LOC100040104, LOC623810, Pcna-ps2, LOC100040130, LOC100040137, LOC100040143, LOC100040152, Stxbp3b, LOC623688, LOC100040178, LOC100040192, 6720475J19Rik, LOC100040203, Incenp, LOC100040215, Fth1, Best1, Rab3il1, Fads3, Fads2
Downstream geneSyt7, Gm705, 4930579J09Rik, 0610038F07Rik, 5730453I16Rik, 2810441K11Rik, Tmem138, Cybasc3, Dak, Ddb1, Vwce, Pga5, 2210404E10Rik, Vps37c, Cd5, Cd6, Slc15a3, Tmem132a, Tmem109, Prpf19, Zp1, Gpr44, Ccdc86, Ms4a10, E530011F12Rik, 5033428B15Rik, AW112010, Ms4a8a, Gm336, LOC624395, 1700025F22Rik, Ms4a13, Ms4a12, Ms4a1, Ms4a5, Gm1276, Ms4a7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-184B05.bB6Ng01-184B05.g
ACCGA009543GA009544
length1,1651,105
definitionB6Ng01-184B05.b B6Ng01-184B05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(10,428,036 - 10,429,205)(10,232,465 - 10,233,572)
sequence
gaattcacctaatcctaccagtccccatgccaaggcgatggtgctgtttt
gtaggtgggactgagacgttgatggtgcacactggtctacagctggagag
gacttgaatccaagctcttgggctccagaccccatacacttaactattac
tctatgccccgtgtaagaagcaaacaagtgtcgggtggtggtagagctcg
tctttaatcccagcactcaagaggcagagaggtacctggacctctgtgag
ttcaaggccagcctggtctacagagtgagttccaggacagccagggctac
acagagaaaccctgtctctaaaaaccaaaaagaaaaacaaaaaacaaaaa
acaacaacaacaaaacaaaaggagcaaacaagaggttaaaaatctacagg
tccactcagagaaagaaccaagtattctttccaaaacaacctggtcatga
aacaccttccttttgaggagaccattcatggctccgttttccaaatccaa
gcttcctcacctggcacacaaaggacacccccatccacccacctacctgc
ttctcaccctgctgcagctacaaagaaccagccagtggtgagtgaggcag
aaaggctgagctgagctagcatacctgttttgccgcttatgagtgtgact
tctgaccctggtacttcacactcaaggtaggaataggaccagggcaccat
agctgaggcacggctggtggagtttcaggctgatcttgatctgctggcaa
gtctccctgctgctgtttacccatgcctgtgactagacacctttcccaga
atgctctgctctccttcagcatccacctggagggatcctctgttcgggtt
cttctcctcagcagtccccacaccagggcctctcagggatatctcccagc
ttagagactcatctactggacatgttatatctattaccccatcctttcct
cttgggacagcagctgttggcacatagggatcttgcctcagtttacctca
gtttagctccatggtatagcgtgcctagtaaaaatatctctacctctgct
ccactgcttttatcatttgtcatctgcctctggctggtctcaatggtcct
gccacctctgttcaagcatgacctcagcaagggaatgggcatggcaacct
cctctctttactgac
gaattccctgtcacttcagcatctgtaggtgtgctcaggaggaagccagt
gggacagtgagattcactttgtctgcttccattccaccaaggttcacagt
ttctctctgtttactcatgatgcccatcaatggttttacatattttgtcc
agtttgacagtgattatggctttgcatccctgggaaggttgtcagccatg
aggaaaaatgtaagatgtcagctactgcctcagaacttgtcttggaaagc
acatgagatgccgtctgtgaaatgcttaggattccttctgggaaatgata
agtcctcaaacttgtgaggtctttttttttttttttttttttaaagactt
atttatttatatgtaggtacactgtagctatcttcagacactccagaaga
gggagtcagacctcgttacggatggttgtgagccaccatgtggttgctgg
gatttgaactccggaccttcggaagagcagttgggtgctcttacccactg
agccatctcaccagcccaacttgtgaggtcttaaactattacttatatat
gattgatatcctcactgttacaaatagcacaatagtgagcagtctagaat
ctatttgcttgcaatttgtgtgtgagtttatccttggaaatcttgactta
ttgactagaggccttcttatttattttgctttgtgagttttacttattgc
tgtggatgtatgattgtgtggctgtgcacatggatgtcagaggacagctt
tgtagagttcattcttctcattggccttatgtgtttatatgtgatcttgg
gctggaactcagtttcatatgcatgcgaagcaagtgctttactggccgtt
gaagcctggccaacccatgttgttaattgtttccttgtccataaatttct
tttagaatgtattccctttgagaaaagctcctcctgtagccctgggctgg
ccttgtgttcactgtgtagccaaagaagctagtgacgactcctgatcctc
tgcctctacttccgagtgtttggatgcaagcgcacaatgacatgtctgat
gaatctgactttcacaaatcttttcttcacctagacatttaatggccctg
tttta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr19_10428036_10429205
seq2: B6Ng01-184B05.b_43_1207 (reverse)

seq1  GTCAGGTAAAGAGAGGAGGTTGCCCCTTCCCCATCCCCTGCTGAGGTCAT  50
      |||| ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||||||
seq2  GTCA-GTAAAGAGAGGAGGTTG-CCATGCCCATTCCCTTGCTGAGGTCAT  48

seq1  GCTTGACAGGAGGTGGCAGGACCATGGAGACCAGCCAGAGGGCAGATGGA  100
      ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||
seq2  GCTTGAACAGAGGTGGCAGGACCATTGAGACCAGCCAGA-GGCAGAT-GA  96

seq1  CAAATGATAAAAGGCAGTGGAAGCAGAGGTAGAGATA-TTTTACTAGGCA  149
      |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CAAATGATAAAA-GCAGTGG-AGCAGAGGTAGAGATATTTTTACTAGGCA  144

seq1  CGCTATACCATGGAGCTAAACTGAGGTAAACTGAGGCAAGATCCCTATGT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTATACCATGGAGCTAAACTGAGGTAAACTGAGGCAAGATCCCTATGT  194

seq1  GCCAACAGCTGCTGTCCCAAGAGGAAAGGATGGGGTAATAGATATAACAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAACAGCTGCTGTCCCAAGAGGAAAGGATGGGGTAATAGATATAACAT  244

seq1  GTCCAGTAGATGAGTCTCTAAGCTGGGAGATATCCCTGAGAGGCCCTGGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGTAGATGAGTCTCTAAGCTGGGAGATATCCCTGAGAGGCCCTGGT  294

seq1  GTGGGGACTGCTGAGGAGAAGAACCCGAACAGAGGATCCCTCCAGGTGGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGACTGCTGAGGAGAAGAACCCGAACAGAGGATCCCTCCAGGTGGA  344

seq1  TGCTGAAGGAGAGCAGAGCATTCTGGGAAAGGTGTCTAGTCACAGGCATG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAAGGAGAGCAGAGCATTCTGGGAAAGGTGTCTAGTCACAGGCATG  394

seq1  GGTAAACAGCAGCAGGGAGACTTGCCAGCAGATCAAGATCAGCCTGAAAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAACAGCAGCAGGGAGACTTGCCAGCAGATCAAGATCAGCCTGAAAC  444

seq1  TCCACCAGCCGTGCCTCAGCTATGGTGCCCTGGTCCTATTCCTACCTTGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCAGCCGTGCCTCAGCTATGGTGCCCTGGTCCTATTCCTACCTTGA  494

seq1  GTGTGAAGTACCAGGGTCAGAAGTCACACTCATAAGCGGCAAAACAGGTA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGAAGTACCAGGGTCAGAAGTCACACTCATAAGCGGCAAAACAGGTA  544

seq1  TGCTAGCTCAGCTCAGCCTTTCTGCCTCACTCACCACTGGCTGGTTCTTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAGCTCAGCTCAGCCTTTCTGCCTCACTCACCACTGGCTGGTTCTTT  594

seq1  GTAGCTGCAGCAGGGTGAGAAGCAGGTAGGTGGGTGGATGGGGGTGTCCT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTGCAGCAGGGTGAGAAGCAGGTAGGTGGGTGGATGGGGGTGTCCT  644

seq1  TTGTGTGCCAGGTGAGGAAGCTTGGATTTGGAAAACGGAGCCATGAATGG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTGCCAGGTGAGGAAGCTTGGATTTGGAAAACGGAGCCATGAATGG  694

seq1  TCTCCTCAAAAGGAAGGTGTTTCATGACCAGGTTGTTTTGGAAAGAATAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTCAAAAGGAAGGTGTTTCATGACCAGGTTGTTTTGGAAAGAATAC  744

seq1  TTGGTTCTTTCTCTGAGTGGACCTGTAGATTTTTAACCTCTTGTTTGCTC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTCTTTCTCTGAGTGGACCTGTAGATTTTTAACCTCTTGTTTGCTC  794

seq1  CTTTTGTTTTGTTGTTGTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTCTTTTTGGTTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGTTTTGTTGTTGTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTCTTTTTGGTTT  844

seq1  TTAGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCT  894

seq1  GTAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCACAGAGGTCCAGGTACCTCTCTGCCT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCACAGAGGTCCAGGTACCTCTCTGCCT  944

seq1  CTTGAGTGCTGGGATTAAAGACGAGCTCTACCACCACCCGACACTTGTTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGTGCTGGGATTAAAGACGAGCTCTACCACCACCCGACACTTGTTT  994

seq1  GCTTCTTACACGGGGCATAGAGTAATAGTTAAGTGTATGGGGTCTGGAGC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTTACACGGGGCATAGAGTAATAGTTAAGTGTATGGGGTCTGGAGC  1044

seq1  CCAAGAGCTTGGATTCAAGTCCTCTCCAGCTGTAGACCAGTGTGCACCAT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAGCTTGGATTCAAGTCCTCTCCAGCTGTAGACCAGTGTGCACCAT  1094

seq1  CAACGTCTCAGTCCCACCTACAAAACAGCACCATCGCCTTGGCATGGGGA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACGTCTCAGTCCCACCTACAAAACAGCACCATCGCCTTGGCATGGGGA  1144

seq1  CTGGTAGGATTAGGTGAATTC  1170
      |||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTAGGATTAGGTGAATTC  1165

seq1: chr19_10232465_10233572
seq2: B6Ng01-184B05.g_64_1168

seq1  GAATTCCCTGTCACTTCAGCATCTGTAGGTGTGCTCAGGAGGAAGCCAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTGTCACTTCAGCATCTGTAGGTGTGCTCAGGAGGAAGCCAGT  50

seq1  GGGACAGTGAGATTCACTTTGTCTGCTTCCATTCCACCAAGGTTCACAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACAGTGAGATTCACTTTGTCTGCTTCCATTCCACCAAGGTTCACAGT  100

seq1  TTCTCTCTGTTTACTCATGATGCCCATCAATGGTTTTACATATTTTGTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTCTGTTTACTCATGATGCCCATCAATGGTTTTACATATTTTGTCC  150

seq1  AGTTTGACAGTGATTATGGCTTTGCATCCCTGGGAAGGTTGTCAGCCATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGACAGTGATTATGGCTTTGCATCCCTGGGAAGGTTGTCAGCCATG  200

seq1  AGGAAAAATGTAAGATGTCAGCTACTGCCTCAGAACTTGTCTTGGAAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAAATGTAAGATGTCAGCTACTGCCTCAGAACTTGTCTTGGAAAGC  250

seq1  ACATGAGATGCCGTCTGTGAAATGCTTAGGATTCCTTCTGGGAAATGATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAGATGCCGTCTGTGAAATGCTTAGGATTCCTTCTGGGAAATGATA  300

seq1  AGTCCTCAAACTTGTGAGGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGACTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTCAAACTTGTGAGGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGACTT  350

seq1  ATTTATTTATATGTAGGTACACTGTAGCTATCTTCAGACACTCCAGAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATTTATATGTAGGTACACTGTAGCTATCTTCAGACACTCCAGAAGA  400

seq1  GGGAGTCAGACCTCGTTACGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGTCAGACCTCGTTACGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGG  450

seq1  GATTTGAACTCCGGACCTTCGGAAGAGCAGTTGGGTGCTCTTACCCACTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGAACTCCGGACCTTCGGAAGAGCAGTTGGGTGCTCTTACCCACTG  500

seq1  AGCCATCTCACCAGCCCAACTTGTGAGGTCTTAAACTATTACTTATATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATCTCACCAGCCCAACTTGTGAGGTCTTAAACTATTACTTATATAT  550

seq1  GATTGATATCCTCACTGTTACAAATAGCACAATAGTGAGCAGTCTAGAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGATATCCTCACTGTTACAAATAGCACAATAGTGAGCAGTCTAGAAT  600

seq1  CTATTTGCTTGCAATTTGTGTGTGAGTTTATCCTTGGAAATCTTGACTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTGCTTGCAATTTGTGTGTGAGTTTATCCTTGGAAATCTTGACTTA  650

seq1  TTGACTAGAGGCCTTCTTATTTATTTTGCTTTGTGAGTTTTACTTATTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTAGAGGCCTTCTTATTTATTTTGCTTTGTGAGTTTTACTTATTGC  700

seq1  TGTGGATGTATGATTGTGTGGCTGTGCACATGGATGTCAGAGGACAGCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGATGTATGATTGTGTGGCTGTGCACATGGATGTCAGAGGACAGCTT  750

seq1  TGTAGAGTTCATTCTTCTCATTGGCCTTATGTGTTTATATGTGATCTTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAGTTCATTCTTCTCATTGGCCTTATGTGTTTATATGTGATCTTGG  800

seq1  GCTGGAACTCAG-TTCATATGCATGCGAAGCAAGTGCTTTACTGGCCG-T  848
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GCTGGAACTCAGTTTCATATGCATGCGAAGCAAGTGCTTTACTGGCCGTT  850

seq1  GAAGCCTGGCCAACCCATGTTGTT-ATTGTTT-CTTGTTCATTAA-TTCT  895
      |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||
seq2  GAAGCCTGGCCAACCCATGTTGTTAATTGTTTCCTTGTCCATAAATTTCT  900

seq1  TTTAG-ATGTATT-CTTTTGAGAAAAGCT-CTCCTGTAG-CCTGGGCTGG  941
      ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  TTTAGAATGTATTCCCTTTGAGAAAAGCTCCTCCTGTAGCCCTGGGCTGG  950

seq1  CCTTGTGTTCACTGTGTAGCCAAGGAGGCTAGTGACGACTCCTGATCCTC  991
      ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| 
seq2  CCTTGTGTTCACTGTGTAGCCAAAGAAGCTAGTGACGACTCCTGATCCT-  999

seq1  CTGCCTCTACTTCCCAAGTGTTGGGTTTGCAAGCGCAC-ATGACCATGTC  1040
      |||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||
seq2  CTGCCTCTACTT-CCGAGTGTTTGG-ATGCAAGCGCACAATGA-CATGTC  1046

seq1  TGGATTGATTCTTGACCTTTCACCAAATCTTTCTTTCAGCCCCAGGACAT  1090
      ||   ||| || ||| |||||| |||||||||  ||||   ||  |||| 
seq2  TG--ATGAATC-TGA-CTTTCA-CAAATCTTTTCTTCA---CCTAGACA-  1087

seq1  TTTAATGGCCCTGTTTTA  1108
      ||||||||||||||||||
seq2  TTTAATGGCCCTGTTTTA  1105